TY - JOUR ID - TI - Molecular diagnosis of Pneumocystis jirovecii pneumonia by using External PCR in immunocompromised patients . التشخيص الجزيئي لداء ذات الرئة بالمتكيسات الرئوية لفطر Pneumocystis jirovecii باستخدام PCR الخارجي في مرضى العوز المناعي AU - Arkan A. Al-Qaisi اركان عبدالله القيسي AU - Alaa A. Al-Khafaji علاء عباس الخفاجي AU - Hameed I. Al-Zagroot حميد ابراهيم الزكروط PY - 2014 VL - 8 IS - 1 SP - 1 EP - 7 JO - Journal of university of Anbar for Pure science مجلة جامعة الانبار للعلوم الصرفة SN - 19918941 27066703 AB - Pneumocystis jirovecii is an opportunistic eukaryotic pathogen causing life threating pneumonia ( PJP) in immunosuppressed patients.Detection of Pneumocystis jirovecii Pneumonia in immune suppressed patients like hematological cancer with or without chemotherapy, patients on corticosteroid therapy, other malignancy like bronchogenic cancer by using External Polymerase Chain Reaction (External PCR) and to compare the results with other control group (patients who are immunocompetent suffer from pneumonia).A total of 220 specimens were obtained from patients admitted to Al- Ramadi Teaching Hospital, Clinic excitability of respiratory disease in Al- Ramadi and Oncology Teaching Hospital in Baghdad during the period from February to July 2013. This number composed of 71(32%) specimens were from female while the male specimens were 149(68%). A total of 184 (84%) were immunocompromised patients, They were considered immunocompromised patients because they have ( hematological cancer with or without chemotherapy, patients on corticosteroid therapy, other malignancies like bronchogenic cancer). The other 36 (16%) patients with pneumonia were included as immunocompetent patients (No hematological cancer, No chemotherapy, No immunosuppressive drug like corticosteroid therapy and No malignancy like bronchogenic cancer). A total of 220 specimens which were collected, (consisting of 115 blood, 65 sputum, 40 BAL Specimens )the total 220 specimens (115 blood, 65 sputum and 40 BAL Specimens ) were examined PCR technique ( External and Nested PCR ) to identify Pneumocystis Jirovecii DNA based on the amplification of specific primers. The result of agarose gel electrophoresis revealed that small DNA diagnostic bands were detected at 346 bp for External PCR in all positive specimens. Out of 220 specimens 26 (11.8%) were detected by the mtLSU rRNA External PCR. Regarding the use of External PCR technique for sputum specimens 8 (12.3%) were positive, While BAL 8 (20%) and Blood 10 (8.7%) . PCR is more accurate and better indicative for the presence of Pneumocystis jirovecii Pneumonia. In addition this technique can use specimens which were not stored properly and became non suitable for microscopy.

درس مرض ذات الرئة بالمتكيسات الرئوية لفطر Pneumocystis jirovecii الذي هو مرض انتهازي يصيب كثير من المرضى ضعيفي المناعة.للكشف عن وجود مرض ذات الرئة بالمتكيسات الرئوية لفطر Pneumocystis jirovecii في مرضى العوز المناعي (سرطان الدم مع أو بدون العلاج الكيميائي ، والمرضى على العلاج كورتيكوستيرويد ، والأورام الخبيثة الأخرى مثل سرطان قصبية المنشأ ) . باستخدام تقنية ال PCRالخارجية ومقارنة النتائج مع نتائج الاصابة بمرض ذات الرئة بالمتكيسات الرئوية في مرضى المناعة الكاملة.جمعت 220 عينه من المرضى الراقدين في مستشفى الرمادي التعليمي والعيادة الاستشارية للإمراض الصدريه في الرمادي و مستشفى الأورام التعليمي في بغداد خلال الفترة من فبراير حتي يوليو 2013. وهذا العدد يتكون من 71 ( 32 ٪ ) من العينات من الاناث بينما كانت عينات الذكور 149 ( 68 ٪ ) . اخذت 184 ( 84 ٪ ) من مرضى العوز المناعي (سرطان الدم مع أو بدون العلاج الكيميائي ، والمرضى على العلاج كورتيكوستيرويد ، والأورام الخبيثة الأخرى مثل سرطان قصبية المنشأ ) . اما مرضى المناعة الكاملة كانت نسبتهم 36 ( 16 ٪ ) من المرضى المصابين بالالتهابات الرئوية ويتميزون بأنه ليس لديهم سرطان الدم ، العلاج الكيميائي ، الادوية المثبطة للمناعة مثل العلاج كورتيكوستيرويد ، اورام مثل سرطان قصبي المنشأ . قسمت العينات الكلية (220 عينة) الى 115 عينة دم ، 65 عينة قشع ، 40 عينة غسيل قصبي حويصلي).فحصت جميع العينات (220 عينة) المتمثلة بالإعداد التالية 115 عينة دم ، 65 عينة قشع ، 40 عينة غسيل قصبي حويصلي بواسطة تقنية PCR (الخارجية و المتداخلة ) لتحديد الحامض النووي للمتكيسات الرئوية الفطرية اعتمادا على تضخيم اجزاء معينه من الحامض النووي لفطر Pneumocystis jirovecii. كشفت نتائج الترحيل الكهربائي عن حزم صغيره من الحامض النووي في 346 زوج قاعدة باستخدام PCR الخارجية في جميع العينات الإيجابية. فيما يتعلق بصبغة. العينات الكلية (220 عينة) 26 ( 11.8 ٪ ) كشف عنها بواسطة جين mtLSU rRNA باستخدام PCR الخارجية. لم تكن هناك فروق معنوية ( قيمة P> 0.05) في التوزيع بين الجنسين. فيما يتعلق باستخدام تقنية PCR الخارجية لعينات القشع 8 ( 12.3 ٪ ) كانت ايجابية ، في حين عينات الغسيل القصبي الحويصلي 8 ( 20 ٪ ) وكانت عينات الدم 10 ( 8.7 ٪ ) عينات إيجابية. خلاصة النتائج المذكورة أعلاه أن PCR هو أكثر دقة من طرق الصبغ المباشر وأفضل مؤشرا لوجود مرضى ذات الرئة بالمتكيسات الرئوية. بالإضافة هذه التقنية يمكن استخدام العينات التي لم يتم تخزينها بشكل صحيح و أصبحت غير مناسبة للفحص المجهري ER -