TY - JOUR ID - TI - Molecular characterization of Cryptosporidium spp. in sheep and goat in Al-Qadisiyah province/ Iraq التشخيص الجزيئي للأبواغ الخبيئة في الأغنام والماعز في محافظة القادسية/ العراق AU - Mansoor Jadaan Ali Alkhaled منصور جدعان علي الخالدي AU - Weam Abbas Hamad وئام عباس حمد PY - 2017 VL - 41 IS - 2 SP - 31 EP - 37 JO - The Iraqi Journal of Veterinary Medicine المجلة الطبية البيطرية العراقية SN - 16095693 24107409 AB - The present study was conducted during the period from September 2015 until February 2016. 100 fecal samples were collected from 60 sheep and 40 goats for diagnosis of Cryptosporidium parasite from diverse areas in Al-Qadisiyah province. The study amid to know the genetic characters of Cryptosporidium spp. parasite by using a molecular technique such as the nested polymerase chain reaction and DNA sequencing analyzed by phylogenetic tree to identify the parasite species. This study was done on the sheep and goat at first time in the middle region of Iraq and the identified species were recorded in NCBI-Genbank database. In sheep, the results of positive infected samples was (40%) while, in the goats were (32.5%), the DNA sequencing and phylogenetic analysis method based on small ribosomal RNA gene (18s rRNA) for Cryptosporidium species typing. The results were conducted by Neighbor-Joining phylogenetic tree analysis method and the 18s rRNA gene sequences were confirmed by using NCBI-BLAST data analysis in order to compare with NCBI submitted selected references isolates of (18s ribosomal RNA) gene in Cryptosporidium spp. parasites. Our finding in present study appeared to follow spp. (C. parvum, C. hominis, C. andersoni, C. ubiquitum, C. xiaio and C. suis). These identified species which primary affected sheep and goats as mentioned in previous studies when compared with newly Iraq isolates strains.

أجريت الدراسة الحالية خلال المدة من شهر أيلول 2015 ولغاية شهر شباط 2016 حيث جُمعت 100 عينة براز وبواقع 60 عينة من الأغنام و40 عينة من الماعز للتحري عن طفيلي الأبواغ الخبيئة من مختلف مناطق محافظة القادسية، صُممت هذه الدراسة لمعرفة صفات الطفيلي باستعمال بعض التقنيات الجزيئية والتي تضمنت تفاعل السلسلة المتبلمرة المتداخل كذلك استعمال طريقة تحليل ترتيب النيوكليتيدات. وحُدّدِت العلاقات الوراثية التطورية (التحليل الشكلي) للأنواع السائدة وللمرة الأولى في المنطقة الوسطى من العراق وتسجيلها عالميا" في بنك الجينات العالمي، في هذه الدراسة كانت نسبة الإصابة في الأغنام والماعز 40% 32.5% على التوالي باستعمال تفاعل السلسلة المتبلمرة المتداخل. كذلك استعملت الدراسة الحالية تحليل وقراءة ترتيب النيوكليتيدات عشرين نموذج DNA بعد استخلاصها وتنقيتها من هلام الأكاروز للحصول على الترتيب النيوكلوتيدي لجين (18s rRNA) وقد تم مطابقة نتائج تحليل الترتيب النيوكلوتيدي عن طريق الاتحاد الدولي للتقنيات الاحيائية عبر الانترنيت وفُحِصَت وأكِدَت مع عتر الطفيلي المسجلة عالميا" في بنك المورثات العالمي والتي تضمنت أنواع طفيلي الأبواغ الخبيئة وهي C.parvum، C.hominis، C. andersoni ، C.ubiquitum، C.xiaio وC.suis . ER -