TY - JOUR ID - TI - Study genetic diversity between trichophyton rubrum isolates using ISSR and RAPD markers دراسة التغايرات الوراثيه بين عزلات الفطر Trichophyton rubrumبواسطه مؤشرات الـ ISSR و RAPD AU - Sanaa Hussein Mohammad سناء حسين محمد AU - Milad A. Mezher ميلادعدنان مزهر AU - Khalil Muoload Wahab خليل مولود وهاب AU - ZainabAnas Salman زينب أنس سلمان AU - Suzan Adil Rashid سوزان عادل رشيد AU - Bilal Abdulrahman Tuama بلال عبدالرحمن طعمه PY - 2018 VL - 12 IS - 2 SP - 5 EP - 13 JO - Journal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية SN - 18151140 27081370 AB - The present study included detection of genetic variability, and identification of genetic relationship and finding a fingerprint of the ten clinical isolates related to Trichophyton rubrum using RAPD and ISSR markers. The experiment was carried out and the results performed using six primer of the RAPD markers these primers showed 239 amplified band , out of these band 90 of them was considered as a main band, and 149 was Polymorphic band , the largest number of bands was 30 in the isolate TR6 and less number of bands in the isolate TR7. The results clear the value of genetic diversity based on RAPD analysis the lowest value of genetic diversity (0.13005) between the isolate TR3 and TR9while the highest genetic diversity (0.55941) was between the isolates TR5 and TR8. The analysis of the relationship shows that there are three main groups: the first group include isolate TR8, while the second group included three isolates are isolate TR2, isolate TR10 and isolates TR3, The third group included three subgroups included the first isolate TR1,isolates TR4 and second isolate TR3 and isolate TR9 and the third included the isolate TR5 and isolates TR6.The results of ISSR experiments: the use six a primers in the of the ISSR showed 192 bands, in the isolate of Trichophyton rubrum, two of these primers showed monomorphic bands (in number and location) and six primers showed monomorphic and polymorphic bands, while one showed only polymorphic bands among Trichophyton rubrum isolates. And the largest number of bands was 24 in the TR5 and less number of bands 16 in isolate TR3 and isolate TR8 were finding DNA fingerprint to isolate TR1, isolate TR5, and isolate TR3. The ISSR markers showed lowest genetic polymorphism was (0.05561) between the isolates TR2 and isolate TR7 and the largest genetic distance was (0.40501) between the isolate TR4 and isolate TR8. The analysis of the relationship of genetic showed that there are three groups key first included isolates and only one isolate TR8 and the second involving isolates TR2 and isolate TR7, isolate TR4 and isolate TR3, while the group included three sub-groups, the first included isolate TR1 and isolate TR6, and the second involving isolate TR5, isolate TR10 and isolate TR9. The results confirmed the efficiency markers of the RAPD and ISSR in contrast, find a genetic fingerprint to the isolates of Trichophyton rubrum, and these markers differ in mechanical detection contrast, and coverage is Genome. Therefore Complementary to each other, although the ISSR markers were more efficient in terms of the number of binding sites in each type of the isolates of Trichophyton rubrum and so can the initiator of the discovery of a much larger area from Genome.

تم في هذه الدراسة تحديد العلاقة الوراثية ، تحديد البعد الوراثي، وإيجاد البصمة الوراثية لعشرة عزلات من الفطر Trichophyton rubrum باستخدام مؤشرات RAPD وISSR. حيث درست تفاعلات الـ RAPD باستخدام 6 بادئات واظهرت البادئات 239 حزمة، منها 90 حزمة رئيسيهmain band و 149 حزمة متباينة Polymorphic band , وكان اكبر عدد من مواقع الارتباط 30 موقع في العزله (6)، وأقل عدد من كان 20 موقع في العزله (7) . واستثمرت تلك النتائج لدراسة التباين الوراثي بين العزلات الداخلة في الدراسة.ظهر من خلال نتائج البعد الوراثي لتفاعلات الـ RAPD ان اقل قيمة كانت (0.13005) بين العزله (3) و (9) ،وأعلى قيمة كانت (0.55941) بين العزلات (5) و (8) .بينما اظهر تحليل العلاقة الوراثية ان هناك ثلاث مجاميع رئيسة ضمت الاولى العزله رقم (8) ،اما المجموعة الثانية فقد ضمت ثلاثة عزلات من الفطر هي (2) و(10) و(7)، وشملت المجموعة الثالثة ثلاث مجاميع فرعية ضمت الاولى العزله (1) و(4)، والثانية العزلات (3) و(9)،والثالثة العزلات (5) و (6) . اما نتائج تفاعلات الـ ISSR والتي استخدام فيها 6 بادئات أظهرت 192 حزمة، حزماً متماثلة في البادئين ISSR2وISSR9، واربع أظهرت حزم متباينة ومتماثلة، بينما اظهر البادئ ISSR10 حزما متباينة فقط بين انواع عزلات الفطرTrichophyton rubrum. واكبر عدد من الحزم ظهر كان 24 في العزله (5) واقل عدد من الحزم 16 في العزلتين (3) و (8) ، وتم ايجاد البصمة الوراثية لـلعزله (1) (5) و (8). وأظهرت مؤشرات الـ ISSR ان اقل بعد وراثي كان (0.05561) بين العزلتين (2) و (7)، واكبر بعد وراثي كان (0.40501) بين عزلتي الفطرTrichophyton rubrum(4) و (8) . اما تحليل العلاقة الوراثية فأظهر ان هناك ثلاث مجاميع رئيسة ، الاولى ضمت عزله واحده فقط هي (8) ، والثانية ضمت (2) و(7) و (4) و (3) بينما ضمت المجموعة الثالثة مجموعتين فرعيتين ، الأولى ضمت العزلتين (1) و(6)، والثانية ضمت (5) و(10) و(9). وقد اكدت النتائج كفاءة مؤشرات الـ RAPD و ISSR في ايجاد التباين والبصمة الوراثية لعزلات الفطرTrichophyton rubrum، وان هذه المؤشرات تختلف في ميكانيكية اكتشاف التباين، وتغطية المجين ، لذلك تعـتبر مكملة لبعضها، بالرغم من ان بعض بادئات مؤشر الـ ISSR كانت اكثر كفاءة من حيث عدد مواقع الارتباط المتباينة بين عزلات الفطر Trichophyton rubrum. ER -