TY - JOUR ID - TI - Detection of 16S rRNA Methylases and Co-Resistance with β-lactams among Klebsiella pneumoniae Isolates from Iraqi Patients تشخيص انزيمات مثيلة 16S rRNA و المقاومة المشتركة مع البيتالاكتام في عزلات Klebsiella pneumoniae من المرضى العراقيين AU - Mustafa Suhel Mustafa مصطفى سهيل مصطفى AU - Rana Mujahid Abdullah رنا مجاهد عبدالله PY - 2019 VL - 16 IS - 3 SP - 580 EP - 587 JO - Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم SN - 20788665 24117986 AB - Out of 150 clinical samples, 50 isolates of Klebsiella pneumoniae were identified according to morphological and biochemical properties. These isolates were collected from different clinical samples, including 15 (30%) urine, 12 (24%) blood, 9 (18%) sputum, 9 (18%) wound, and 5 (10%) burn. The minimum inhibitory concentrations (MICs) assay revealed that 25 (50%) of isolates were resistant to gentamicin (≥16µg/ml), 22 (44%) of isolates were resistant to amikacin (≥64 µg/ml), 21 (42%) of isolates were resistant to ertapenem (≥8 µg/ml), 18 (36%) of isolates were resistant to imipenem (4- ≥16µg/ml), 43 (86%) of isolates were resistant to ceftriaxone (4- ≥64 µg/ml), 42 (84%) of isolates were resistant to ceftazidime (16-64 µg/ml), and 40 (80%) of isolates were resistant to cefepime (4- ≥16µg/ml). Co-Resistance for both β-lactams and aminoglycosides were detected among 25 (50%) of K. pneumoniae isolates. The extended spectrum beta-lactamases (ESBLs) were detected among 25 (50%) of K. pneumoniae isolates. Screening of 16S rRNA methylases encoding genes revealed that armA was found in 5 (10%) of K. pneumoniae isolates, whereas rmtB was not found among K. pneumoniae isolates. DNA sequencing of armA revealed that the presence of missense mutations in which affected in the translation of protein by substitutions of amino acids, leading to increase the resistance values of MICs for gentamicin and amikacin. These variants were registered in NCBI at the accession number LC373258. The phylogenetic tree of armA variants showed a slight deviation of these variants from K. pneumoniae species.

تم الحصول على 50 عزلة من بكتريا Klebsiella pneumoniae من 150 عينة سريرية، اذ شخصت حسب الصفات المظهرية و الكيموحيوية. جمعت العزلات من حالات سريرية مختلفة شملت الادرار 15 (30%) و الدم 12 (24%) و القشع 9 (18%) و الجروح 9 (18%) و الحروق 5 (10%). اظهرت نتائج التراكيز المثبطة الدنيا MICs ان25 (50%) عزلة كانت مقاومة لمضاد gentamicin (≤16 مايكروغراممل) و 22 (44%) عزلة مقاومة لمضاد amikacin (≤64 مايكروغراممل) و 21 (42%) عزلة مقاومة لمضاد ertapenem (≤8 مايكروغراممل) و 18 (36%) عزلة مقاومة لمضاد imipenem (4 -≤16 مايكروغراممل) و43 (86%) عزلة مقاومة لمضاد ceftriaxone (4-≤64 مايكروغراممل) و 42 (84%) عزلة مقاومة لمضاد ceftazidime (64-16 مايكروغراممل) و40 (80%) عزلة مقاومة لمضاد cefepime (4-≤16 مايكروغراممل). تم تشخيص المقاومة المشتركة لكل من مضادات البيتالاكتام و الامينوكلايكوسيدات ضمن 25 (50%) من عزلات بكتريا K. pneumoniae . تم تشخيص انزيمات البيتالاكتميز واسعة الطيف ESBLs ضمن 25 (50%) من عزلات بكتريا K. pneumoniae . اظهرت نتائج التحري عن الجينات المشفرة لانزيمات مثيلة 16S rRNA ان الجين armA كان موجودا في 5 (10%) من عزلات بكتريا K. pneumoniae. من جهة اخرى اظهرت النتائج عدم وجود الجينrmtB في عزلات بكتريا K. pneumoniae . اظهر تحليل تتابع الحامض النوويDNA للجين armA وجود طفرات انحشار اثرت في ترجمة البروتين من خلال استبدال الاحماض الامينية بحيث ادى ذلك الى زيادة في قيم التراكيز المثبطة الدنيا MICs لكل من المضادين gentamicin و amikacin . تم تسجيل هذه التغايرات في موقع NCBI تحت الرقم التسلسلي LC373258. ان الشجرة التطورية لتغايرات الجين armA اظهرت ان هناك انحراف طفيف لهذه التغايرات عن النوع K. pneumoniae . ER -