TY - JOUR ID - TI - Genotypic Variations of Mutans Streptococci Isolated from Dental Caries by REP-PCR لتنوع الوراثي لانواع البكتريا ) mutans streptococci ) المعزولة من تسوس الاسنان عن طريق REP-PCR AU - Hamzah Abdulrahman Salman حمزة عبد الرحمن سلمان AU - R. Senthilkumar ر. سينذكلمار PY - 2020 VL - 17 IS - 4 SP - 1133 EP - 1138 JO - Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم SN - 20788665 24117986 AB - Mutans streptococci (MS) are a group of oral bacteria considered as the main cariogenic organisms. MS consists of several species of genus Streptococcus which are sharing similar phenotypes and genotypes. The aim of this study is to determine the genetic diversity of the core species of clinical strains of Streptococcus mutans, Streptococcus sobrinus and Streptococcus downei by using repitative extragenic palindromic (REP) primer. The DNA of the clinical strains of S. mutans (n=10), S. sobrinus (n=05) and S. downei (n=04) have been employed in the present study, which have been previously isolated from caries active subjects. The DNA of the clinical and reference strains was subjected to PCR amplification using REP primer. The phylogenetic dendrogram is constructed from the REP PCR banding profile by neighbour-joining method using PyElph 1.4 software. The size of the DNA amplicons generated by using REP primer were S. mutans (1500 bp to 250 bp), S. sobrinus (6000 bp to 250 bp) and S. downei (5000 bp to 400 bp). The results present common band at 480 bp in all the clinical strains of S. sobrinus. The current study is the first to demonstrate the genetic variety of S. sobrinus and S. downei by using REP primer. REP-PCR have been found to be a powerful method to study the molecular diversity of S. mutans, S. sobrinus and S. downei. Additionally, further studies are suggested to analyze the species specific bands and also to find the possibility to produce a new specific primer for S. sobrinus.Key words: Cariogenic bacteria, Molecular diversity, Neigh

المكورات العقدية هي مجموعة من البكتيريا التي توجد بالفم والمسببة لتسوس الاسنان. يتكون مرض تسوس الاسنان من عدة أنواعمن جنس Streptococcus التي تتقاسم أنماط وراثية مماثلة. الهدف من هذه الدراسة هو تحديد التنوع الوراثي للسلالات Streptococcus mutans, Streptococcus sobrinus و Streptococcus downei ، التي تعتبر الأنواع الرئيسية المسببة لتسوس الاسنان ، باستخدامطريقة البلمرة المتسلسل PCR والبادئ REP . تم استخدام الحمض النووي للسلالات S. mutans )عدد = 10 ، ) S. sobrinus )عدد = 5 )و S. downei )عدد = 4 ( ومقارنتها بمثيلاتها المعزولة سابقا من الاشخاص المصابين بتسوس الاسنان. تعرض الحمض النووي للسلالاتالسريرية والنموذجية لتضخيم PCR باستخدام REP primer . شيدت الشجرة التطويرية ) dendrogram phylogenetic ( لهذة الاصنافمن خلال حساب عدد القطع الطفرية المتكونة من البلمرة المتسلسلة عن طريق neighbour-joining method باستخدام برنامج PyElph 1.4 . واظهرت النتائج ايضا ان حجم قطع المادة الوراثية التي تمت مضاعفتها في الجل المنتج ) amolicons ( هي : S. mutans ( 1500 bpإلى 250 bp ، ) S. sobrinus ( 6000 bp إلى 250 bp ( و S. downei ( 5000 bp إلى 400 bp (. واظهرت النتائج ايضا وجود قطعةمميزة من المادة الوراثية المضاعفة بحجم 480 bp لكل عزلات البكتريا S. sobrinus بخلاف الانواع الاخرى. الدراسة الحالية هي الأولىالتي توضح التنوع الوراثي لكل من S. sobrinus و S. downei باستخدام REP primer . هذة الدراسة اثبتت ان REP-PCR لذلك تعتبرهذة الدراسة وسيلة قوية لدراسة التنوع الجزيئي لل S. mutans ، S. sobrinus و S. downei . بالإضافة إلى ذلك ، يُقترح إجراء مزيد منالدراسات لتحليل النطاقات الخاصة بالتفرقة بين الانواع وأيضًا لإيجاد إمكانية إنتاج بادئات جديد للكشف عن S. sobrinus و S. downei . ER -