@Article{, title={Molecular characterization of Pseudomonas aeruginosa Isolates Isolated from Clinical Patients by Using RAPD-PCR Technique. التوصيف الجزيئي لعزلات Pseudomonas aeruginosa معزولة من مرضى سريرين باستخدام تقنية RAPD-PCR}, author={Akeel H. AL-Assie عقيل حسين العاصي and Adnan F. Al-azawy عدنان فاضل العزاوي and Wakas S. Al-Dori وقاص سعدي الدوري}, journal={Journal of university of Anbar for Pure science مجلة جامعة الانبار للعلوم الصرفة}, volume={6}, number={3}, pages={27-35}, year={2012}, abstract={The aim of the present study was the molecular characterization and the evaluation of variability and genetic relationship of six Pseudomonas aeruginosa isolates using PCR-based Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. A total number of 86 samples were collected from patients that hospitalized in Tikrit Teaching Hospital in Tikrit city. These samples were taken from patients basing on the sources of infections, the isolates were taken from: wounds, ear, burns, urine, sputum, and eyes infections. Using enrichment, selective media, and biochemical tests, that characterized and identified as P. aeruginosa. Genomic DNA was extracted from six P. aeruginosa isolates isolated from these different sources. These genomic DNA samples were found to have a suitable concentration and purity for RAPD-PCR analysis. RAPD-PCR technique was performed using 15 different Operon random primers. Eleven primers gave successful amplification results in repeated experiments. As a result, the total number of amplified bands was 270 and the total number of polymorphic bands was 234. The highest number of polymorphic bands (39 bands) was produced by primer OPX-01. The primer efficiency ranged from 3.70 (primer OPA-11) to 14.44 (primer OPX-01) and the discriminatory value ranged from 1.70% (primer OPA-11) to 16.66% (primer OPX-01). In addition, genetic distance and cluster analysis among different P. aeruginosa isolates were estimated by using UPGMA computer program basing on RAPD-PCR banding patterns that obtained in this study. These results suggesting that possible and frequent occurrence of mutations in DNA sequencing P. aeruginosa bacteria from different sources and locations. This study has proved existence genetic differences (DNA polymorphism) among the six P. aeruginosa isolates isolated from different sources. Therefore, we can say that RAPD technique could be an efficient technique for studying the molecular characterization and the epidemiology of P. aeruginosa bacteria.
هدفت هذه الدراسة إلى إجراء التوصيف الجزيئي وتقييم درجة التباين والعلاقة الوراثية لست عزلات من بكتريا Pseudomonas aeruginosa باستخدام تقنية RAPD-PCRالمعتمدة على التضخيم العشوائي المتعدد الأشكال لسلسة ألدنا. جمعت 86 عينة من المرضى الوافدين إلى مستشفى تكريت التعليمي في مدينة تكريت. أخذت هذه العينات من مصادر مختلفة واعتمادا" على مصدر الإصابة أخذت العزلات من الجروح،الأذن،الحروق،البول،البلغم والعيون. عزلت وشخصت بكتريا P. aeruginosa باستخدام الأوساط الاغنائية والانتخابية بالإضافة إلى الاختبارات الكيموحيوية. تم عزل ألدنا المجيني بنجاح من عزلات P. aeruginosaالستة المعزولة من مصادر مختلفة بتركيز ونقاوة مناسبة لاستعماله في تفاعلات تقنية .RAPD-PCR أنجزت تقنية RAPD-PCR باستخدام 15 بادئ عشوائي مختلف وأظهرت النتائج أن 11 بادئا" أعطت نتائج ناجحة من التجارب المتكررة.كنتيجة، العدد الكلي للحزم المتضاعفة كان270 والعدد الكلي للحزم المتباينة كان 234 حزمة. أعلى عدد من الحزم المتباينة أنتج من قبل البادئ OPX-01(39 حزمة)، تراوحت كفاءة البادئات مابين 3.7 للبادئ OPA-11 إلى 14.44 للبادئ OPX-01، أما قوة التباين فتراوحت مابين 1.7% للبادئ OPA-11 إلى 16.66% للبادئ .OPX-01 بالإضافة إلى، تحديد البعد الوراثي والتباين العرقي لعزلات P. aeruginosa باستخدام برنامج UPGMA الحاسوبي اعتمادا" على أنماط التضاعف المستحصلة من هذه الدراسة باستخدام تقنية التضاعف العشوائي متعدد الأشكال لسلسة ألدنا (RAPD-PCR ).تقترح هذه النتائج حدوث تغيرات وطفرات وراثية محتملة ومتكررة في تسلسل ألدنا لبكتريا P. aeruginosa من المصادر والمناطق المختلفة. أثبتت هذه الدراسة بوضوح وجود اختلافات وراثية على مستوى ألدنا بين عزلات P. aeruginosa الستة المعزولة من المصادر المختلفة. لذلك يمكن القول أن تقنية RAPD-PCR تقنية فعالة لدراسة التوصيف الجزيئي ووبائية بكتريا P. aeruginosa.} }