TY - JOUR ID - TI - Isolation and Identification of Acinetobacter baumannii Clinical Isolates using Novel Methods AU - Zuhair Sadiq Al Sehlawi AU - Ali Muhsin Almohana AU - Azhar Ammran Al Thahab PY - 2014 VL - 22 IS - 3 SP - 1041 EP - 1050 JO - Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل SN - 19920652 23128135 AB - Acinetobacter baumannii has emerged over the last decade as a significant opportunistic pathogen. Although it is generally associated with benign colonization of hospitalized patients. The purpose of this study was undertaken to isolate and identify of A. baumannii from clinical infections using different laboratory methods. A total of 520 clinical samples (wound pus, urine, respiratory secretion, blood) were collected from February to June, 2011. A. baumannii isolates were preliminary identified according to the morphological characteristics and traditional biochemical test. Then confirmed by using API 20E and API 20 NE multi-test system. Isolates were further identified on molecular level using 16S rRNA specific gene by polymerase chain reaction (PCR). All PCR positive isolates were examined to grow on CHROMagar Acinetobacter/MDR medium and their antibiotics susceptibility. A total of 335 Gram negative bacilli isolates were obtained according to the morphological characteristics and traditional biochemical test. Only 23(6.8%) were identified as suspected A. baumannii. Ten (43.4%) isolates revealed very good identification level by API 20E system. While, API 20 multi-test system for non enteric bacteria identified only 12(52.1%) isolates belonged to A. baumannii. The same isolates harbored positive bands in PCR experiments with specific primers for16S rRNA gene. A. baumannii isolates were distributed as 6(50% ) recovered from urine, 4(33.3%) from lower respiratory secretion and only two (25%) were obtained from wound pus, no A. baumannii isolates were isolated from blood samples in this study. Hence, 6 (50%) of isolates were gave overnight pure growth on CHROMagar Acinetobacter/MDR medium with resistant to representatives of three or more classes of antibiotics. The present findings suggest that the PCR using16S rRNA gene CHROMagar were gold standard method for detection of multi-drug resistant A. baumannii isolates among patients in Najaf hospitals.

هدفت الدراسة إلى عزل وتشخيص بكتريا Acinetobacter baumannii من إصابات سريريه مختلفة باستخدام الطرق المختبرية التقليدية والجزيئية والعزل على الأوساط الخاصة. جمعت 520 عينة سريريه (مسحات الجروح, الادرار, افرازات المجاري التنفسية, الدم) خلال الفترة من شباط إلى حزيران من العام 2011 من المرضى الراقدين والمراجعين لثلاث مستشفيات رئيسية في النجف . تم التشخيص الأولي لعزلات بكتيريا A. baumannii اعتمادا على الخصائص المظهرية للبكتريا وفعاليتها الكيموحيوية . كما تم إجراء الفحوصات التأكيدية للتشخيص باستخدام أنظمة التشخيص للاختبارات الكيموحيوية المتعددة API 20E و API 20 NEالخاصة بالبكتريا المعوية وغير المعوية . تم تشخيص بكتريا A. baumannii ولأول مرة على المستوى الجزيئي باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR للتحري عن وجود ألجين الوراثي المشفر للجزء الرايبوسومي S16 من الحامض النووي rRNA الخاص بهذه البكتريا. زرعت العزلات الحاملة للجين على الوسط التشخيصي CHROMagar Acinetobacter/MDR كطريقة تأكيدية وتشخيصية للعزلات المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية بالمقارنة مع طريقة الاقراص. تم عزل 335 عزلة بكتيرية سالبة لصبغة غرام حسب نتائج الفحوصات المظهرية والكيموحيوية . كان من بينها 23 (6.8%) عزلة مشتبه بها تابعة لبكتريا A. baumannii . أبدت نتائج التشخيص باستخدام نظام API 20E إن 10 (43.4 %) كانت تابعة لنفس البكتريا وبمستوى تشخيصي عالي , في حين أظهرت 12(52 %) عزلة نتائج موجبة باستخدام نظام API 20NE. كما كشفت تجربة PCR للتحري عن ألجين الوراثي 16S rRNA إن العزلات الموجبة لفحص API 20NE كانت حاملة لهذا الموروث. ستة عزلات (50%) منها كانت مقاومة لاكثر من ثلاث اصناف من المضادات الحياتية ,كما و أعطت نموا واضح على الوسط التشخيصي CHROMagar Acinetobacter/MDR . خلصت الدراسة إلى وجود بكتريا A. baumannii كمسبب مرضي بين المرضى في مستشفيات النجف, و اعتبر كل من تقنيتي PCR و CHROMagar طرق مثلى لتشخيص بكتريا A. baumannii المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية. ER -