TY - JOUR ID - TI - Species Identification and Strain Differentiation of Dermatophyte by (GACA)4-Primer based PCR تشخيص انواع الفطريات الجلدية وتمايز سلالاتها باستخدام التفاعل التسلسلي (GACA)4للبوليمراز المعتمد على البادئ AU - Asra J. Al-Hashemi اسراء جبار شمخي AU - Mona H. Al- Jibouri منى حمودي الجبوري AU - Zafir Hassan Ghali ظافر حسن غالي AU - Bara'a Jawad Kdhim براء جواد كاظم PY - 2014 VL - 55 IS - 3B SP - 1249 EP - 1254 JO - Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم SN - 00672904 23121637 AB - Dermatophytes are a group of morphologically and physiologically related molds some of which cause well defined infections: dermatophytoses (tineas or ringworm). The present study aims at identification of dermatophytes species and varieties from patients in Wasit province-Iraq using molecular approach based PCR fingerprint.The short oligonucleotide (GACA)4 is a microsatellite primer was used in this study for identification of dermatophyte isolates. The results identified different species and varieties among dermatophytes. The numbers of resulting PCR bands ranged from 1 to 4 (size range, 600bp to 1600bp) for each species. The resulting patterns were distinct for Trichophyton and Microsporum species and varieties. Trichophyton soudanense and Trichophyton verrucosum revealed distinguishable profiles with four largest bands (800bp to 1900bp) among Trichophyton species. (GACA)4 is able to amplify all species of Microsporum producing intraspecies variation which is observed with Microsporum canis (rough strain) and Microsporum canis (smooth strain), all of which had different band pattern. We conclude that (GACA)4-based PCR has utility as a rapid method for identification of dermatophytes species as well as its utility for differentiation of Trichophyton and Microspmoru species and varieties.

تعد الفطريات الجلدية اعفان مرتبطة من الناحيتين الشكلية والوظيفية ويسبب بعضها أصابات واضحة منها القوباء الحلقية. تهدف هذه الدراسة الى تشخيص انواع وضروب الفطريات الجلدية المعزولة من مرضى محافظة واسط في العراق باستخدام طريقة البصمة الوراثية المعتمدة على التفاعل التسلسلي للبوليمراز. اظهر التشخيص الوراثي على المستوى الجزيئي باستخدام البصمة الوراثية انماط للحامض النووي منقوص الاوكسجين DNA لكل نوع من الفطريات الجلدية: أستخدم البادئ القصير قليل النيوكليوتيدات (GACA)4 لإيجاد البصمة الوراثية بوصفه بادئا لتشخيص عزلات الفطريات الجلدية. شخصت بهذه الطريقة انواع وضروب مختلفة بين الفطريات الجلدية وتراوح عدد حزم التفاعل التسلسلي للبوليمراز الناتجة من 1-4 حزمة لكل نوع ومدى حجم تراوح ما بين 600 زوج قاعدي الى 1600 زوج قاعدي. كانت نماذج الحزم الناتجة متميزة لأنواع وضروب الـ Trichophytonو Microsporumالتي شخصت بهذه الطريقة. أظهر الـنوعين soudanense Trichophyton و Trichophyton verrucosumطرز متميزة بأربع حزم كبيرة (800 زوج قاعدي الى 1900 زوج قاعدي)بين أنواع الـ .Trichophyton وتمكن البادئ (GACA)4 من تضخيم جميع انواع الـ Microsporum وادى ذلك الى ظهور اختلافات ضمن النوع الواحد والذي لوحظ في النوع M. canis بين سلالته الخشنة والملساء والتي اظهر كل منها حزم مختلفة. نستنتج ان طريقة البصمة الوراثية باستخدام البادئ (GACA)4 طريقة سريعة لتشخيص الفطريات الجلدية كما لها الفائدة في التمايز بين انواع وضروب الجنسين .Trichophyton, Microsporum ER -