TY - JOUR ID - TI - Association between Leukemia and Exon 2 CD19 Gene Variants in a sample of Iraqi Patients العلاقة بين مرضى ابيضاض الدم والتغيرات الوراثية على منطقة التشفير الثاني لجين في المجاميع البغدادية / العراق CD19 AU - Yasameen Ali Hadi ياسمين علي هادي AU - Saad M. Nada سعد محمد ندا AU - Zeina S. M. Al –Hadeithi زينة سيف الدين محمد AU - Najwa Sh. Ahmed نجوى شهاب PY - 2014 VL - 56 IS - 4 SP - 390 EP - 394 JO - Journal of the Faculty of Medicine Baghdad مجلة كلية الطب SN - 00419419 24108057 AB - Background: The human CD19 (Cluster Differentiation) antigen is a 95 kd transmembrane glycoprotein belonging to the immunoglobulin superfamily. CD19 gene located on the short arm of chromosome 16p11.2 (P: petit). CD19 is a member of the Ig immunoglobulin superfamily expressed on the surface of B lymphocytes, and may play a pivotal role in B-cell differentiation and activation. Research suggests that mutations in a gene CD19 leads to a lack of expression of CD19 membrane and result in an antibody deficiency syndrome. Objective: The aim of this work is to study the mutations in Exon 2 CD19gene in leukemia patients in Baghdad/Iraq.Patients and Methods: This cross sectional study was performed in the National Center of Hematological Diseases/Al Mustanisyria University. Blood samples were collected from 50 leukemia patients including (25 acute lymphocyte leukemia ALL and 25 chronic lymphocyte leukemia CLL) and 50 samples of apparently healthy individuals. DNA was isolated and the CD19 gene was amplified by using specific primers for exon2 of this gene. The nucleotide sequences of CD19 gene was according to Macro gene company, USA. Analysis was done using BLAST program which is available online at (http:// www.ncbi.nlm.nih.gov) and BioEdit program.Results: The DNA sequencing results of flank sense of CD19 gene from healthy individual was found to be compatible 100% with wild type of Homo sapiens from the Gene Bank, while 99% compatibility was found for that gene of all ALL and CLL patients with wild type of gene. The difference was attributed to insertion of 1900 C nucleotide in position +48 of exon 2 of CD19 gene resulted in the replacement of a serine (TCC) residue into isoluseine (ATC), and deletion 1904 C in position + 49 of exon 2. This mutation resulted in change of codon from GCA to GCC but there was no changes in the amino acid (Alanine to Alanine). The second mutation (Deletion nucleotide) amended the first mutation effect (Insertion nucleotide) and did not lead to a change of all the amino acid sequence (framshift). The results showed that the incidence of insertion and deletion mutation at position +48 and +49 in exon 2 of CD19 gene and leukemia was highly significant (X2 = 15.75, P<0.01).Conclusion: This study suggests that the ploymrphism in exon 2 of the CD19 gene is strongly associated with leukemia patient of Baghdad population.Keywords: Framshift mutation, acute lymphocyte leukemia ALL, chronic lymphocyte leukemia CLL, CD Cluster Differentiation.

الخلاصة : يتكون مستضد CD19البشري من 95 كيلودالتون من سكريات البروتين عبر الغشاء. والعائد الى عائلة الكوبيولين المناعي يقع وجين CD19 يقع على الذراع القصير من كروموسوم 16 ,وهو عضو في عائلة الكوبيولين المناعي على سطح الخلايا اللمفاوية بيتا , ويلعب دورا محوريا في تمايز الخلايا B وتنشيطها . وتقترح البحوث بان الطفرات الوراثية في الجين CD19 تؤدي الى فقدان التعبير الغشائي لل CD19 وبالتالي يؤدي الى متلازمة نقص الأجسام المضادة. الهدف : الهدف من هذا العمل هو دراسة الطفرة الوراثية في منطقة التشفير الثاني لجين CD19من مرضى ابيضاض الدم الحاد والمزمن في بغداد / العراق .المرضى وطرائق العمل :أجريت هذه الدراسة في المركز الوطني لأمراض الدم التابع الى الجامعة ألمستنصريه. تم جمع 50 عينة دم من مرضى ابيضاض الدم (25 عينة من مرضى ابيضاض الدم الحاد و25 عينة من مرضى ابيضاض الدم المزمن) و50 عينة دم من الأصحاء كمجموعه سيطرة . استخلص الحمض النووي الدنا من جميع العينات وتم مضاعفه منطقة التشفير الثاني من جين CD19 باستخدام بادئات متخصصة لهذة القطعة وتم تحديد تتابعها البالغة من قبل شركة ماكروجين في الولايات المتحدة الأمريكية باستخدام برنامج BLAST في الموقع الالكتروني www.ncbi.nlm.nih.go وبرنامج BioEdit . النتائج : أظهرت نتائج تتابع الحمض النووي الدنا للجين عند أفراد السيطرة والذي تتطابق بنسبة 100% مع الحمض النووي الدنا في البنك الجيني العالمي , من حيث كانت نسبة التطابق 99% لأحد خيوط الدنا بالاتجاه (5-3) في جميع مرضى ابيضاض الدم الحاد والمزمن وهذا جاء نتيجة غرس قاعدة السايتوسين (C) في الموقع 1900 ضمن الموقع 48 + لمنطقة التشفير الثاني لجين CD19 والتي سببت تغير الحامض الاميني سيرين (TCC) الى الحامض ايزوليوسين (ATC), كما حذفت القاعدة النتروجينية (C) في الموقع 1904 والتي هي ضمن منطقة 49+ من منطقه التشفير الثاني والتي سببت تغيير الشفرة الوراثية GCA الى GCC واللتان تشفران لنفس الحامض الاميني الأدنين وهي من نوع الطفرة الصامتة Silent mutation كما ان هذة الطفرة ألغ تتأثير الطفرة الأولى ولم تسبب ظهور إزاحة نسق القراءة Framshift , وقد اظهر التحليل الإحصائي لهاتين الطفرتين في الموقع 48+ و 49+ لشفره التشفير الثاني من جين CD19 في مرضى ابيضاض الدم تأثير عالي المعنوية P< 0.01 . الاستنتاجات : وتشير الدراسة إلى أن التغايرات الوراثيه في منطقة التشفير الثاني لجين CD19 يرتبط بقوة مع مرضى ابيضاض الدم من سكان بغداد.الكلمات المفتاحية : إزاحة نسق القراءة , ابيضاض الدم الحاد , ابيضاض الدم المزمن , مجاميع التمايز ER -