Fulltext

Using ISSR markers to build a phylogenetic of Barley Genotypes

استخدام مؤشرات التفاعل الضمني البسيط لبناء الشجرة الوراثية لأصناف الشعير

Zeina S. M. Al_Hadeithi زينه سيف الدين محمد الحديثي

Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم
ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 2C Pages: 1682-1688
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Abstract

This study is attempts to build a phylogenetic between nine Iraqi barley genotypes based on ISSR-PCR analysis by determine the level of genetic similarity among them. Nine issr primers used in this study produced 41 bands across nine studied varieties. Of these bands, 28 bands were polymorphic and the remaining monomorphic bands were 13. The average polymorphic rate was 70.5% ranged between 25%-100% , and average of polymorphic bands /primer was 4.5.The size of the amplified bands ranged 140-1600 bp. It was generated a 5 unique bands in this study, these bands can be used as a DNA profiling of all studied genotypes. The results were showed Genetic distances ranged between (0.0854-0.9897) among barley varieties. Based on phylogenic tree, a dendrogram were constructed among studied barley varieties, cluster analysis grouped the nine varieties into two main clusters depending on their ancestors and their morphological traits. The use of cultivars from various clusters and sub clusters offer the possibility of obtaining an appropriate genetic variability in hybrid population.

هدفت الدراسه الحاليه الى محاولة بناء شجرة السلالات الوراثية اعتماداً على تسعة مورثات لنبات الشعير العراقي, حيث استعملت المؤشرات الوراثية للتتابع الضمني لتحديد مستوى التشابه الوراثي للأصناف المدروسة. استعملت تسع بادئات ولوحظ ظهور 41 حزمه للأصناف المدروسه, كانت 28 حزمة متباينه في الحجم الجزيئي و 13 حزمة متماثله. وتراوحت نسب التباينات الوراثية بين 25%-100% وبمتوسط 70.5 % وكان معدل الحزم المتباينه لكل بادئ 4.5. تراوح الحجم الجزيئي للحزم المضخمه بين 140-1600 زوج قاعدي, وقد لوحظ ظهور خمس حزم فريده في هذه الدراسه يمكن استخدامها كمؤشر وراثي لدراسة اصناف الشعير المختلفه. اظهرت النتائج قيم البعد الوراثي اذ تراوحت بين (0.0854- 0.9897) لأصناف الشعير المدروسه. واعتمادا على شجرة تطور الطرز الجينية فقد تم بناء التحليل العنقودي لأصناف الشعير والذي جمع الأصناف التسع في مجموعتين رئيستين اعتمادا على اسلافهم وسماتهم الشكليه. استخداما لأصناف من مجاميع متنوعه ومجموعات فرعية توفر إمكانية الحصول على التباين الوراثي المناسب في المجتمع الهجين لنبات الشعير.

Keywords

Barley --- Phylogenetic --- ISSR --- Molecular markers