Fulltext

Numerical classification of Rhodococcus equi strains

التصنيف العددي لسلالات النوع Rhodococcus equi

Bassima A. Abdulla باسمة احمد عبد الله

Tikrit Journal of Pure Science مجلة تكريت للعلوم الصرفة
ISSN: 18131662 Year: 2010 Volume: 15 Issue: 2 Pages: 194-200
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Abstract

Fifteen isolates received as Rhodococcus spp. marker as pure culture from nose, ear, throat & sputum of patients infected with pneumonia depending on clinical symptoms observed by specialist physicians , and also from soil.Classification was based upon the morphological, biochemical, ecological, environmental and sensitivity to selected antibiotics characteristics using conventional numerical taxonomy, cluster analysis and average linkage method. The similarity level between strains were determined and compared using simple matching coefficient Ssm.The results indicated that (34) isolates are belongs to species Rh. equi and were differentiated into three main clusters within the hierachical dendrogram. The cluster A and B include 15 strains for each of them & the remaining four strain divided into clusler C due to difference in sensitivity to selective antibiotics.

استلمت(50) مزرعة بكتيرية تابعة لجنس Rhodococcus spp. معزولة ونقية من الانف والاذن والحنجرة والقشع لاشخاص مصابين بالتهابات رئوية ومشخصين من قبل الطبيب الاختصاص وكذلك من التربة.خضعت الصفات الشكلية والفسلجية والكيموحيوية وكذلك الحساسية لمضادات حيوية منتخبة للتصنيف العددي بالتحليل العنقودي وباستخدام الربط بالمعدل average وتطبيق معامل التشابه البسيط Simple matching coefficient (Ssm).اوضحت النتائج ان (34) عزلة هي تابعة للنوع Rh. equi حيث توزعت السلالات على عنقودين رئيسين A وB بالتساوي وبواقع (15) سلالة لكل منهما وفصلت اربعة سلالات فقط في عنقود منفصل C نتيجة للاختلاف في الحساسية للمضادات الحيوية المنتخبة قيد الدراسة على الاغلب .