Table of content

Jornal of Biotechnology Research Center

مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية

ISSN: 18151140
Publisher: Al-Nahrain University
Faculty: Presidency of the university or centers
Language: Arabic and English

This journal is Open Access

About

The Biotechnology Research Center (BRC) in a Al-Nahrain University issued in 2007 the first edition of a tightly seasonal scientific journal named as the journal Biotechnology Research Center (JBRC) which got authorization in 2005 and held an impact number ISSN: 1815-1140.The journal accepts scientific researches in Arabic and English.
JBRC’s main interest is Biotechnology researches in the Medical, Molecular, Agriculture and environmental fields which have an important impact on the public and private sectors in Iraq.
JBRC’s structure consists of editing committee (headed by the manger of the BRC and the editor in chief), consulting committee (contains a well- known iraqi scientists in biotechnology) and editing secretary.
All researches are submitted to the JBRC’s regulations which is mainly is that they must be according to the journal directions and instructions , then the researches will be evaluated by three well-known scientists in the field and after that reviewing occurred by the editing committee to ensure and verify all JBRC’s instructions and regulations are taken into consideration .
A special edition of JBCR is issued to cover all researches that presented to the BRC’s scientific conferences which subjected to all regulations and instructions of publishing in JBCR.

Loading...
Contact info

brcn2012@yahoo.comيتم الاتصال عبر البريد الالكتروني لمجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية


0096407707766148او للاتصال تلفونيا
بسكرتارية التحرير
م.م. سعاد محمد مجيدب
محمد منير حسين

Table of content: 2019 volume:13 issue:2

Article
Green synthesized of silver nanoparticles and study their properties and applications
التصنيع الاخضر لجزيئات الفضة النانوية ودراسة خواصها وتطبيقاتها

Loading...
Loading...
Abstract

Nanoparticles mightsynthesized from prokaryote and eukaryote . Silver nanoparticles (AgNPs) are increasingly used in various fields, including food, medicine, health care, consumer and industrial applications.Properties of nanoparticles various depended on size,the high surfacetovolume ratio thus allow the nanoparticles showed remarkable properties.Nano materials have a wide range of applications in medical and biological sciences due to their many specific physical and chemical properties .Nanomaterials have a wide range of applications in medical,nanoparticles are an effective antimicrobial agent against common pathogenic microorganisms and therefore some nanoparticles, such as silver, titanium dioxide and zinc oxide, receive considerable attention as antimicrobials and additives in consumer, health and industrial products.الجزيئات النانوية ممكن تصنع من بدائية النواة وحقيقية النواة ،جزيئات الفضة النانوية تستعمل بمجالات متعددة من ضمنها الاغذية والطب والرعاية الصحية والتطبيقات الاستهلاكية والصناعية ، خصائص الجزيئات النانوية تختلف اعتمادا على الحجم ونسبة حجم المساحة السطحية التي ثؤثر على خصائص الجزيئات النانوية ، تحتوي المواد النانوية على تطبيقات طبية وبايولوجية بسبب الخصائص الفيزيائية والكيميائية وللمواد النانوية لها مدى واسع من التطبيقات في الطب، الجزيئات النانوية لها فعالية ضد المايكروبات والاحياء المجهرية الممرضة لذلك بعض الجزيئات النانوية مثل الفضة وثنائي اوكسيد التيتانيوم واوكسيد الزنك تلقي اهتماما واسعا ضد المايكروبات والمواد المضافة ضد المنتجات الاستهلاكية والصناعية


Article
The clinical aspect of overweight on rheumatoid arthritis and disease activity
الحالات الحادة وزيادة الوزن في مرضى التهاب المفاصل الروماتيدي

Loading...
Loading...
Abstract

Objective: To investigate the influence of obesity on disease activity in rheumatoid arthritis patients and to determine a probable connection with the acute phase response. Materials & Methods: The recruited patients satisfied the criteria from the American College of Rheumatology (ACR). To evaluate the body mass index (BMI), anthropometric tests were carried out at the Rheumatology Department at Baquba Teaching Hospital, which has a consultation unit. The serum levels of anti-cyclic citrullinated peptide antibodies (anti-CCP) were measured from blood samples taken through the particle-enhanced (latex) immunonephelometry assays on the genius analyser (CO, Ltd. China) and test kits from IMTEC-CCP-Antibodies. RF screen and serological tests (latex) were carried out to determine the C-reactive protein (CRP), measure Hb and the total WBCs count, the erythrocyte sedimentation rate (ESR) was also carried out. Results: The current study findings from the sample of RA patients showed that the proportion of patients falling into the overweight classification (BMI 25-29) was 80.6% while the obese classification (BMI 30-35) was 33.33%. Among the RF and ACCP-positive cases, a marginally stronger relationship between the development of RA and the history of obesity was found. Additionally, a significant correlation between acute phase response and free mass was found in RA patients (anti-CCP p-value≤ 0.00021 ESR p≤ 0.00072 Hb p≤ 0.00054, and W.B.C p =≤ 0.000.94, CRP p≤1). Conclusion: The present study’s findings show an elevated prevalence of high body mass among the RA patients. Furthermore, a linear association existed between the fat free mass and the acute phase response. الهدف : تهدف الدراسة التحقق من تأثير السمنة على زيادة الحالات الحادة لمرض التهاب المفاصل لدى المرضى المصابين. طرق العمل : استوفى المرضى الذين تحت الدراسة كل معايير التشخيص المعتمدة لأمراض الروماتيزم المتبعة عالميا من قبل الكلية الأمريكية (ACR). وكذلك تمت احتساب مؤشر كتلة الجسم (BMI) حيث أجريت اختبارات الأنثروبومترية في قسم أمراض الروماتيزم في مستشفى بعقوبة التعليمي ، الذي يضم وحدة استشارية لمعالجة الروماتزم وتم قياس المستويات المصلية للأجسام المضادة للببتيد المضاد للسيترولين (مضاد لـ CCP) من عينات الدم المأخوذة وهي من الفحوصات المناعية المتطورة على جهاز(genius analyser CO، Ltd. China) ومجموعات الاختبار من IMTEC-CCP وكذلك تم إجراء اختبارات مصلية مثل وجود عامل الروماتزم RF بطريقة (لاتكس) والتحقق من الحالات الحادة بمتابعة مستوى البروتينات التفاعلية (CRP) ، وقياس نسب الهيموغلوبين Hb وإجمالي عدد كرات الدم البيضاء ، ومعدل ترسيب كرات الدم الحمراء (ESR). النتائج: أظهرت نتائج الدراسة الحالية ان مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي الذين يدخلون في تصنيف زيادة الوزن (BMI 25-29) كانت 80.6 ٪ في حين أن تصنيف السمنة (BMI 30-35) كان 33.33 ٪. بين الحالات لإيجابية لفحص كل من RF وACCP، بالإضافة إلى ذلك تم العثور على علاقة قوية بين تطور التهاب المفاصل وتاريخ السمنة ، حيث كان الارتباط كبير بين استجابة الحالات الحادة وزياد الوزن في مرضى التهاب المفاصل الروماتويدي ESR p≤ 0.00072 و Hb p≤ 0.00054 و W.B.C p≤ 0.000.94 و CRP p = 1 (القيمة المضادة لـ(ACCP p ≤ 0.00021


Article
Determination of Brucella. abortus Biovars infected human in the middle and southern of iraq
تحديد الضروب الحيوية للبروسيلا المجهضة في الانسان لوسط وجنوب العراق

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Brucella abortus (B. abortus) is a zoonotic bacterium causes both health and economic losses in Iraq. Objective: The isolation and detection of species and subspecies is very important to understand how the outbreak occurs and to improve vaccine. Materials and methods: To determine the dominant Biovars (bv) in Iraq (150) blood samples were collected from patients suspected with brucellosis from (Baghdad, Wasit, Babil, Karbala, Al Najaf, Al-Qadisiyah, Maysan, Al-Muthanna and Al Basrah) hospital’s from June 2015 to February 2016. Serum was separated and tested using Rose Bengal Plate Test (RBPT) and Enzyme Linked Immune Sorbent Assay (ELIDA), then positive samples to ELISA were cultivated on Brucella agar. Bacteria were tested to biotyping using both conventional methods include (CO2 requirement, urease test, H2S production, and growth on dyes), and Non-conventional methods include AMOS-ERY using set of primers (PIS711, PBa, ERY1, ERY2 and DEL569). Results: Ninety six samples were found positive and (54) samples were found negative that tested by RBPT. The ELISA specific for B. abortus infected human was conducted on the positive RBPT only (38) samples were found positive and (15) samples were found negative and (43) samples were marked undetermined. The result of biochemical showed B. abortus bv (1, 3, 4, 5, 6 and 9) and B. meletensis (bv2) very closed to the AMOS-ERY test results that showed groups of biovars (1, 3, 5, 6 and 9). Conclusion: The Molecular diagnostics have proven its effectiveness in determining the Biovars of these bacteria. البروسيلا المجهضة هي جرثومة تسبب مرض بكتري مشترك في الانسان و الحيوان و يسبب خسائر اقتصادية وصحية في العراق. العزل والتحري عن البروسيلا المجهضة وانواعها الحيوية و تحديدها مهم جدا لفهم اندلاع المرض وتحسين اللقاحات واثبات كيفية انتقال البروسيلا المجهضة الى الانسان وتحديد أي من انماطها في العراق. تم جمع 150 عينة دم من مرضى يشتبه بإصابتهم بداء البروسيلا من مستشفيات (بغداد، واسط، بابل، كربلاء، قادسية، نجف، ميسان، البصرة) للفترة الممتدة من حزيران 2015 الى شباط 2016. تم فصل المصل وفحصه بواسطة اختبار الوردية البنغالية وفحص الاليزا. العينات الموجبة لفحص الاليزا تم تنميتها على وسط البروسيلا ، البكتريا المعزولة فحصت بالطرق التقليدية (احتياجها لثاني أوكسيد الكاربون وفحص اليوريز وفحص انتاج كبريتيد الهايدروجين وفحص النمو على الصبغات) اما الطرق غير التقليدية AMOS ERY باستعمال مجموعة من البرايمرات (PIS711, ERY1 , ERY2 Del 569). كانت 96 عينة إيجابية و54 عينة سلبية بفحص الوردية البنغالية . العينات الموجبة للوردية البنغالية فحصت بالاليزا المتخصص للبروسيلا المجهضة وكانت النتائج 38 عينة موجبة و15 سالبة و43 مشكوك بها. البكتريا المفحوصة بالطرق التقليدية البايوكيمائية كانت النتائج هي البروسيلا المجهضة و البايوفرات ( 1 و 3 و 5 و 6 و 9) و البروسيلا المالطية الضرب الحيوي (2). اما الطرق الغير تقليدية كانت النتائج بطريقة AMOS ERY هي تحديد مجموعة من الضروب الحيوية دون اثبات ضرب حيوي محدد وهي (1 , 3 , 5, 6, 9.(


Article
Studying the candida resistance and sensitivity for some antifungals
دراسة مقاومة المبيضات و حساسيتها لبعض المضادات الفطرية

Loading...
Loading...
Abstract

Back ground: The current study included 150 samples from patients with Candida from a hospital of Medical City / education labs - Baghdad, and ranged in age from (10 – 65(years for both sexes, all isolates taken from different sources (Lower respiratory tract, Urine, Skin, Vaginal and Oral thrux), where the number of males (55(as a percentage (37%) while the number of females (95) as a percentage (63%). The objective: The objectives of this study are studying resistance and sensitivity of candida spp to some antifungals. Material and methods: All the required material which used for the study, and the direct examination was conducted using potassium hydroxide KOH 10%, As well as microscopic examination and laboratory transplantation for all samples, for the purpose of investigating the candidiasis. Also Vitek System examination was conducted on all positive samples for microscopy and laboratory culturing; and so to be diagnosed on the species level, and this study included using (3) anti-fungal equipped from Himedia (India), an (Fluconazole, Clotrimazole and Nystatin), anti-fungal used by standard disk Diffusion to know the resistance of Candida and its sensitivity toward used anti-fungal. The results: The results of direct examination were vaginal swab (50), Sputum (28), Oral swab (34), Urine (21) and Skin swab (17). Conclusion: Candidiasis was more common in female patients as well as from medical units, where the rate of infection in females more than in males, Candida species were identified by the manual and automated methods and we found that the automated method by using VITEK2 YST Card was the best for species identification. الخلفية عن الموضوع : تضمنت الدراسة الحالية 150 عينة مرضية من مرضى مصابين بداء المبيضات Candida spp من مدينة الطب – المختبرات الطبية / بغداد ولأعمار تراوحت بين (10-65) سنة، ولكلا الجنسين، تم جمعها من مصادر مختلفة (القناة التنفسية السفلى، القناة المهبلية، الجلد، البول، والفم)، حيث كان عدد الذكور 55 وبنسبة 37%، بينما كان عدد الاناث 95 وبنسبة 63%. الهدف: كان الهدف من الدراسة الحالية هو معرفة مقاومة و حساسية الكانديدا لبعض المضادات الفطرية. المواد وطرق العمل: حيث تم اجراء الفحص المباشر باستخدام هيدروكسيد البوتاسيوم KOH بتركيز 10% ، كما تم اجراء الفحص المجهري والزرعي الختبري لجميع العينات. بعد ذلك تم فحص العينات التي اظهرت زرعا موجبا بواسطة جهاز الفايتك لتحديد العينات على مستوى النوع. كما تم اختبار 3 انواع من المضادات الفطرية وهي (الفلوكونازول بتركيز 25 مايكروغرام، الكلوتريمازول بتركيز 10 مايكروغرام والنستاتين بتركيز 100 UN)) حيث اجرى الاختبار باستخدام الاقراص الجاهزة المصنعة من الشركة الهندية Himedia. النتائج: كانت النتائج متباينة ، اظهرت النتائج ايضا وجود (50) عينة للمسحة المهبلية، (28) من القناة التنفسية السفلى، (34) مسحة من السلاق الفموي، (21) عينة بول و(17) مسحة جلد. كما وتبين من خلال النتائج 90 عينة مقاومة للمضادات المستخدمة وبنسبة 60% ، بينما كانت العزلات الاخرى حساسة للمضادات الفطرية المستخدمة وبلغ عددها 40 عينة وبنسبة 27%، وذلك بالمقارنة مع المعايير العالمية. الاستنتاجات: المبيضات أكثر شيوعًا في المرضى الإناث، حيث كان معدل الإصابة في الإناث أكثر من الذكور، تم التعرف على أنواع المبيضات من خلال طرق التشخيص الاولية والكيميائية ووجد أن الطريقة الحديثة باستخدام الفايتك كانت الأفضل لتحديد الأنواع.


Article
Synergistic effect of tea tree oil on fungi causing vaginal thrush in pregnant women
التأثير التآزري لزيت شجرة الشاي على الفطريات المسببة لمرض بالسُلاق المهبلي عند النساء الحوامل

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Vulvovaginal candidiasis(VVC), or Vaginal thrush, is a vaginitis caused by the overgrowth of some opportunistic yeasts of the genus Candida spp. Australian Tea Tree Oil (TTO) is one of the most important essential oils that contain many compounds that are effective against many bacteria and fungi, which may match the effect of common antibiotics. Objective: The aim of this study was to isolate and diagnose fungi that causing vaginal thrush, in pregnant women and to study the effect of (pregnancy and pregnancy sequence and age) on the rate of infection compared to non-pregnant, as well as to study the drug sensitivity of isolates towards a number of antifungal and compared that with the inhibitory effectiveness of tea tree oil. Material and Methods: 75 vaginal swabs from pregnant women and 50 from non-pregnant women were collected at ages ranging from 17-65 years. The isolates were diagnosed using several methods, including the Vitek2 Compact system. 17 isolates were selected to study the inhibitory effect of ten antifungal agents, six of them were automatically tested by the Vitek 2 compact system, which contains a sensitivity test kit (AST-YS07 Card). The essential oil (TTO) was analyzed by GC-MS to detect its content of active compounds. The inhibitory effect of TTO was studied according to "Broth dilution" method to determine minimum inhibitory concentration (MIC) for it, the inhibitory effect of four concentrations of TTO (100%, 50%, 25%, 12.5 %) was also tested according to "well diffusion" method. This investigation also included a study of the mechanism of action (TTO). RESULTS: The rate of infection among pregnant women was (41%) with the highest rate of infection during the third trimester of pregnancy, while the percentage of non-pregnant women was only 8%. Vaginal infection was also prevalent in the age group ranged between (17-29 years).The isolates showed resistance to (Ketoconazol, Terbinafine) while they were sensitive to (Nystatin, clotrimazol), as well as sensitive to all antifungal of (AST-YS07 Card). The analysis of the TTO using chromatogram showed that it contains 32 chemical compounds, most of them are monoterpene like (Terpinen-4-ol, 1, 8-Cineol). The MIC of TTO ranged between (4 - < 2 µl/ ml). The function of TTO is to destroy the structural structure of the cell membrane and change its permeability, thereby leakage of cellular components and cell death. Conclusion: Pregnancy increases the rate of vaginal candidiasis in women, especially during the third trimester. TTO is highly effective in inhibiting the growth of opportunistic candida yeasts. خلفية عن الموضوع: داء المبيضات الفرجي المهبلي المعروف أيضآ بالسُلاق المهبلي، هو إلتهاب المهبل الناجم عن فرط نمو بعض الخمائر الإنتهازية التابعة لجنس Candida spp. يعد زيت شجرة الشاي الأسترالية (TTO) Australian Tea tree من أهم الزيوت الأساسية التي تحتوي على العديد من المركبات الفعَّالة ضد العديد من انوع البكتريا والفطريات والتي قد تضاهي تأثير المضادات الحيوية الشائعة. الهدف من البحث: هدفت الدراسة إلى عزل وتشخيص الفطريات المسببة للسُلاق المهبلي عند النساء الحوامل ودراسة مدى تأثير (الحمل وتسلسل الحمل والعمر) في إرتفاع معدل الإصابة بالمبيضات المهبلية مقارنة بغيرالحوامل، وكذلك دراسة الحساسية الدوائية للعزلات تجاه عدد من المضادات الفطرية ومقارنة ذلك بالفعَّالية التثبيطية لزيت شجرة الشاي TTO. المواد وطرق العمل: جمعت (75 مسحة لنساء حوامل) و (50 مسحة لنساءغير الحوامل) تراوحت أعمارهنَّ مابين (17-65 سنة). شُخصَّت عزلات الخمائر بإستخدام عدة طرق بضمنها نظام Vitek2 Compact. أختيرت (17) عزلة ضمت جميع الأنواع المعزولة لدراسة التأثير المثبط لــ (10انواع) من المضادات الفطرية (6) منها اختبرت بشكل آلي بواسطة نظامVitek 2 compact الذي يحتوي عُدة خاصة بأختبار الحساسية والمتمثلة ببطاقة (AST-YS07 Card). حُلل الزيت العطري (TTO)`بواسطة جهاز (GC-MS) للكشف عن محتواه من المركبات الفعالة. كماُ حُدد التركيز المثبط الادنى للزيت (MIC)، وفقاً لطريقة"Broth dilution" . فضلاً عن ذلك درس التأثير المثبط لأربع تراكـيز من TTO (100% و50% و25% و12.5%) وفقاً لطريقة الإنتشار في الحفر‘well diffusion’ method وحُددت فعَّالية كل تركيز بقياس قطر منطقة التثبيط . تضمَّن البحث أيضاً دراسة آلية عمل (TTO) التي يعمل من خلالها على تثبيط نمو عُزلات الخمائر. النتائج: تم الحصول على (34) عزلة موجبة لخمائر المبيضات. بلغت نسبة الاصابة بين الحوامل (41%) مع تسجيل اعلى نسبة للاصابة خلال الثلث الثالث للحمل. في حين كانت النسبة (8%) فقط بين فئة النساء غير الحوامل. اصابة المهبل كانت سائدة ايضآ في الفئات العمرية ما بين (17-29 سنة). اظهرت العزلات مقاومة لـ (Ketoconazol ، Terbinafine) في حين كانت حساسة لـ (Nystatin ، clotrimazol)، كذلك كانت حساسة لجميع مضادات بطاقة (AST-YS07 Card). اظهر كروماتوغرام تحليل الزيت العطري TTO احتواءه على 32 مركب كيميائي اغلبها من التربينات الاحادية Monoterpene مثل (1,8-Cineol and Terpinen-4-ol). اظهرت النتائج تأثير واضح لـ (TTO) على جميع العزلات التي شملها الإختبار وبـ MIC تراوح مابين (4-< 2 مايكرولتر/ مل). (TTO) تسبب بتدمير بنية الغشاء الخلوي وتغيير نفاذيته و بالتالي تسرب المكونات الخلوية وموت الخلية. الإستنتاجات: يزيد الحمل من معدل الإصابة بداء المبيضات المهبلي لدى السيدات خصوصاً خلال الثلث الثالث من الحمل. الزيوت الطيَّارة من المكونات الفعَّالة في النبات ولها فعالية جيدة في تثبيط نمو انواع المبيضات Candida spp.. وان (TTO) له كفاءة عالية في تثبيط نمو خمائر المبيضات الإنتهازية.

Table of content: volume:13 issue:2