Table of content

Rafidain journal of science

مجلة علوم الرافدين

ISSN: 16089391
Publisher: Mosul University
Faculty: Science
Language: Arabic and English

This journal is Open Access

About

A Scientific and evaluated journal published by the college of Science, University of Mosul,
Date of first issue (1976)
No. of Issue per year (4)issues till the end of 2012 and 6 issue from 2013.
No. of paper per Issue (~250)
No. of Issue published between 1976-2012 (69)

Loading...
Contact info

Phone number: 07703325996
e. mail: rafjoursci@alrafidensciencejournal.com

Table of content: 2010 volume:21 issue:1A

Article
Detection of E.coli O157:H7 Strain Among Bacteria Contaminated Drinking Water in Nineveh Province
التحري عن السلالةO157:H7 E. coli ضمن الجراثيم الملوثة لمياه الشرب في محافظة نينوى

Loading...
Loading...
Abstract

This research, was dealt with the isolation and identification of bacteria caused contamination in drinking water, and detection on the virulent pathogen E. coli O157: H7 strain in contaminated drinking water samples, the results indicated that most isolated bacteria belong to Enterobacteriaceae and the higher percent was E. coli (%32) , in addition to other bacteria ,found among there were Enterobacter cleacae (%19.3), E. sakazakii (%5.9), Citrobacter braakii (%8.8), Citrobacter freundii (%3.0), Proteus mirabilis (%7.4), Shigella sonni (%0.7), Salmonella (%5.2), Serratia plymuthica (%1.5), pseudomonae aeruginosa (%5.2) and Enterococcus faecalis (%10.4) . E. coli serotypes were diagnosed in drinking water samples, to detect O157: H7 strain the result showed that (47.7 %) from all E. coli strains and (%15.6) from all other bacteria, while O157 strain formed (%22.7) percent and (%7.40) were most bacteria Isolated from drink water. تناول هذا البحث عزل وتشخيص الجراثيم الملوثة لمياه الشرب في محافظة نينوى و محاولة التحري عن السلالة E. coli O157:H7 المعروفة بخطورتها في هذه المياه ، وبينت النتائج أن معظم الجراثيم المعزولة تابعة للعائلة المعوية Enterobacteriaceae وأن اعلى نسبة كانت لجرثومة E.coli (32%) فضلاً عن مجموعة أخرى من الجراثيم منها Enterobacter cloacae بنسبة (19.3%) و E.sakazakii (5.9%) و Citrobacter BRAAKII (8.8%) و Citrobacter freundii (3.0%) و Proteus mirabilis (7.4%) و Shigella Sonni (0.7%) و Salmonella (5.2%) و Serratia Plymuthica بنسبة (1.5%) فضلاً عن جرثومة Pseudomonas aeruginosa بنسبة (5.2%) وجرثومة Enterococcus faecalis بنسبة (10.4%) . وعند تشخيص الأنماط المصلية التابعة لجرثومة E.coli في عينات مياه الشرب للتحري عن السلالةH7 : O157 اظهرت النتائج أثبات وجودها، وشكلت نسبة عالية (47.7%) من مجمل عزلات E.coli ونسبة( %15.6) من الجراثيم الكلية المعزولة اضافة الى ان السلالة 157O قد شكلت نسبة (22.7%) من بين عزلات E.coli وبنسبة(7.40%) من الجراثيم الكلية المعزولة من مياه الشرب .


Article
Curing of Plasmid DNA Content of Bacteria Isolated from Urinary Tract Infection
تحييد محتوى إﻟـ DNA البلازميدي في البكتريا المعزولة من خمج المجاري البولية

Loading...
Loading...
Abstract

Twenty-five bacterial isolates were collected from patients with urinary tract infection from Hospitals in Mosul city. The isolates were identified by the morphological, cultural and biochemical tests . The results showed that 18 isolates belong to Escherichia coli, 3 Klebsiella pneumoniae, 3 Proteus mirabilis and 1 Pseudomonas aeruginosa. The resistance of these bacterial isolates was tested against antibiotics and heavy metals such as mercuric chloride, cadmium chloride and nickel chloride. Four isolates belonging to different genera; E. coli, K. pneumoniae, Pr. mirabilis and P. aeruginosa chosen to eliminate their plasmid DNA content by using different curing agents; the antimicrobial agents Erythromycin, Nalidixic acid, Methoprim and Chloramphenicol were used at one half and one quarter of the minimum inhibitory concentration(MIC). Nalidixic acid was the most effective one in curing antibiotic and heavy metal resistance in K. pneumoniae in a frequency ranged between (4-100). The acidic pH at a value of 5.5 was used to cure the bacterial isolates resistance and P. aeruginosa was the most effected one and it showed a ratio of (11-96%) while E. coli revealed curing of studied traits by elevated temperature 44 °C in a ratio of( 4-100%) . The effect of these curing agents on some other phenotypic traits was studied and mucus production of K. pneumoniae cured at a frequency of 40% by Nalidixic acid.تم جمع 25 عزلة بكتيرية من المرضى المصابين بالتهاب المجاري البولية من مستشفيات مدينة الموصل. شخصت العزلات بالاختبارات الشكلية ، والمزرعية ، والكيموحيوية . كانت 18عزلة منها تعود إلى النوع Escherichia coli و 3 منها Klebsiella pneumoniae و 3 منها Proteus mirabilis وواحدة فقط Pseudomonas aeruginosa. اختبرت مقاومة العزلات البكتيرية لمضادات مايكروبية ومعادن ثقيلة مثل كلوريد الزئبق، كلوريد الكادميوم وكلوريد النيكل وأختيرت 4 عزلات ، لكل من E. coli، K. pneumoniae، Pr. mirabilis و P. aeruginosa لإجراء تحييد محتوى الـ DNA البلازميدي لها باستخدام عوامل محيدة مختلفة شملت المضادات المايكروبية Erythromycin ،Nalidixic acid، Methoprim و Chloramphenicol بنصف تركيزها المثبط الأدنى وربعه وكان المضاد المايكروبي Nalidixic acid الأكثر تأثيراً في تحييد مقاومة المضادات المايكروبية والمعادن الثقيلة في بكتريا K. pneumoniae بنسب تراوحت بين (4-(%100 واستخدم الأُس الهيدروجيني الحامضي بقيمة 5.5 لتحييد مقاومة العزلات وكانت P. aeruginosa الأكثر تأثراً و بنسب مئوية %(96-11) ودرس تأثير المحيدات على الصفات المظهرية الأخرى فتم تحييد صفة المستعمرات المخاطية لبكتيريا K. pneumoniae بنسبة 40% بفعل المضاد Nalidixic acid .

Keywords


Article
Histopathological Study of Placenta in Cases of Hypertension During Pregnancy
دراسة نسجية مرضية للسخد في حالات فرط الضغط عند الحمل

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out in order to investigate the histopathological changes in the placenta of hypertensive pregnant women. A collection of forty placenta samples from hypertensive pregnant women associated with forty placenta samples from normal pregnancy selected as control group. The pregnant women were admitted to Al-Khansaa Maternity hospital in Mosul. The histopathological changes in hypertensive placenta included fibrosis with stenos is of maternal arteries, shedding and discontinuation of syncytial border in the decidua, hemorrhage inflammatory exudates and necrosis in the decidua basalis. Accumulation of huge amount of fibrinoid deposits was present in maternal decidua and large amount of collagen fibers surrounded the villous stroma and maternal decidua. A possible explanation for the results of this study is that the hypertension in pregnancy have enormous affect on inducing histopathological changes in the placenta of hypertensive pregnant women أجريت الدراسة الحالية في مستشفى الخنساء للولادة في الموصل لمعرفة التغيرات المرضية على السخد في حالات فرط الضغط عند النساء الحوامل. اشتملت الدراسة على أربعين امرأة حامل من ذوات فرط ضغط الدم عند الحمل من مراجعات مستشفى الخنساء للولادة في الموصل، كما وشملت أربعين امرأة من الحوامل ذوات ضغط الدم الطبيعي والتي اتخذت كمجموعة سيطرة. أظهرت دراسة التغييرات المرضية النسجية في السخد عند فرط الضغط وجود بؤر نخرية بيضاء مختلفة الأحجام فضلاً عن حدوث تليف جدار الأوعية الدموية الأمية، تضيق تجويف الأوعية الدموية الشعرية الأُمية والجنينية وسقوط الخلايا المخلاوية وتوسفها من حافة الزغابات ونزف دموي مع نضحه التهابية، كما لوحظ وجود بؤر نخرية عند الغشاء الساقط وتراكم كميات كثيرة للألياف الغراوية في متن الزغابات والغشاء الساقط. إن التفسير المحتمل لنتائج هذه الدراسة هو ان لفرط الضغط عند النساء الحوامل تأثير كبير في إحداث تغيرات نسجية مرضية في سخد هؤلاء الحوامل.

Keywords


Article
Application of Low pH as a Curing Agent of Plasmid DNA in Streptomyces as Compared with other Agents
الأس الهيدروجيني المنخفض محيدا لمحتوى الـ DNA البلازميدي لجرثومة Streptomyces مقارنه بمحيدات أخرى

Loading...
Loading...
Abstract

Fourteen strain of Streptomyces were obtained from a previous study and their identity was ascertained by using slide culture method that showed their aerial and earthy hyphae. Antibiotic susceptibility of the strains towards Nalidixic acid, Ampicillin, Chloramphenicol, Cefalexin, Rifamycin and Gentamycin were tested and the four most resistant were selected for subsequent analysis. Spontaneous curing was obtained as a control sample and we noticed (0-4%) curing percentage, after treatment of the isolates with acidic pH we noticed (22-100%) curing percentages towards the antibiotics understudy .Then we used various chemical and physical curing agents to compare them with acidic pH treatment. We found that elevated temperature, acridine orange (50g/ml), (100g/ml), SDS (50g/ml) and (100g/ml) had the ability to cure the isolates at various percentages (4-60%), (0-20%), (0-12%), (0-6%), (4-20%) respectively. This indicated that using the acidic pH has an effective curing ability to cure the plasmid DNA of Streptomyces much better than other well known curing agents .Low pH is also much easier and safer to handle as compared with chemical compounds that can be mutagenic to chromosomal DNA and harmful to the researcher himself .أخذت 14 سلالة من جرثومة Streptomyces من دراسة سابقة وجرى التأكد من التشخيص ثانيةً بإعادة زرعها على مزرعة الشريحة لملاحظة شكل الغزل الهوائي والأرضي لها، أختبر مقاومتها تجاه المضادات الحيوية حامض النالدكسيك والامبسلين والكلورامفينيكول والسيفالكسين والريفامايسين والجنتامايسين واستناداً لاختلاف المقاومة تم اختيار 4 سلالات الأكثر مقاومة للمضادات قيد الدراسة. أجري التحييد التلقائي لهذه السلالات كنموذج سيطرة وكانت نسبة التحييد (0 – 4%) ثم أجري التحييد باستخدام الأس الهيدروجيني ألحامضي(pH) إذ حصلنا على نسب تحييد (22 – 100%) تجاه المضادات الحيوية قيد الدراسة ثم استخدم محيدات فيزياوية وكيمياوية لإجراء مقارنة مع التحييد بالأس الهيدروجيني ألحامضي إذ استخدمت درجة الحرارة والاكردين البرتقالي بتركيز 100 µg/ ml , 50 µg/ ml ومادة الـ SDS بتركيز 100 µg/ ml , 50 µg/ ml إذ حصلنا على نسب تحييد (4 – 60%) و (0 – 20%) و (0 – 12%) و (0 – 6%) و (4 – 20%) على التوالي مما يثبت بأن استخدام الأس الهيدروجيني الحامضي له تأثير تحييدي أقوى في تحييد محتوى الـ DNA البلازميدي لجرثومة Streptomyces من بقية المحيدات شائعة الاستخدام بالإضافة إلى سهولة التعامل معه مقارنة بالمحيدات الكيمياوية التي بعضها يكون مطفراً للـ DNA الكروموسومي للبكتريا وفيه مخاطر أيضا على الباحث نفسه.

Keywords


Article
A qualitative and A quantitative Study of Free Pool Amino Acids in Redia and Cercariae , (Furcocercous) which Infect Lymnaea aurcularia Snials
دراسة نوعية وكمية للاحماض الامينية الحرة في ريديا ومذنبة مشطورة الذنب التي تصيب القوقع aurcularia Lymnaea

Loading...
Loading...
Abstract

Thin layer Chromatography technique was used to determine the free pool amino acids in rediae and cercariae (Furcocercous) wich were obtained from Lymnaea aurcularia snials, collected from Tigris river (Al-Rashedeya area) in Mosul city. The qualitative analysis suggested presence of free amino acids : alanine, leucine, lysine, histidine and valine in the redia, while: alanine and histidine were found in the cercariae, by using nihydrine reagent as to the quantitative determination for these free amino acids they were 0.002-0.005 μg/ml in both redia and cercarie.استخدمت طريقة التحليل الكروماتوغرافي للصفائح الرقيقة thin layer chromatography (TLC) في التحديد النوعي لبعض الاحماض الامينية الحرة في طوري الريديا والمذنبة المشطورة الذنب التي تم الحصول عليها من القواقع المصابة L.aurcularia ، والتي جمعت من ضفاف نهر دجلة المار بكورنيش الرشيدية في مدينة الموصل. يشير التحليل النوعي إلى وجود الأحماض الامينية الحرة الالنين، لايسين، لوسين، هستدين، والفالين في الريديا، والحامضين الامينيين الحرين الالنين والهستيدين في المذنبات وباستخدام كاشف الننهايدرين. أما التقدير الكمي لهذه الأحماض الامينية الحرة فتراوحت بين 0.002 و 0.005 مايكروغرام/مل في الريديات والمذنبات.

Keywords


Article
Diagnosis of Autoimmune Hepatitis By ELISA and Indirect IF
تشخيص التهاب الكبد المناعي الذاتي باستخدام اختبار الـ ELISA والفلورة المناعية IF غير المباشرة

Loading...
Loading...
Abstract

The diagnosis of Autoimmune hepatitis type-1 was studied in 167 blood samples which collected from Aleppo university and Zahi Azrak Hospitals in Aleppo, patients were complain in symptoms of hepatitis during the period from 4 – 2008 to 4 - 2009 . By determining special auto antibodies existence and in the comparison technique will be used the (ELISA), and the (IFA) technique. The results did not showed any infection with autoimmune hepatitis type-2, while the disease percentage in the type-1(AIH) 27.0%, the ANA was 13.33%, ASMA percentage 33.33%, and the AMA , 13.33%, The results did not show LKM-1 & SLA. (LKM-1 special in the Autoimmune hepatitis type-2) of the studied patients. تم فحص 167 عينة دم لتشخيص التهاب الكبد المناعي الذاتي من النمط الأولType-1 ، والتي جمعت من المرضى الذين يشتكون من أعراض التهاب كبد والمراجعين لعيادات مستشفى حلب الجامعي ومستشفى زاهي ازرق (مستشفى الحميات) في حلب، وذلك خلال الفترة بين 4-2008 و 4-2009 بغية التحري عن الاضداد الذاتية الخاصة بالتهاب الكبد وذلك باستخدام تقنية ELISA وتقنية الفلورة المناعية غير المباشرة.IFA لم يتم إثبات وجود النمط الثاني Type-2 من التهاب الكبد المناعي الذاتي بالتقنيات المستخدمة. وقد كانت نسبة الإصابة بالنمط الأول 27.0%، كما تبين أن نسبة الاضداد الذاتية للنواةANA 13.33%، أما نسبة الاضداد الذاتية للعضلات الملساءASMA فكانت 33.33%، ولأضداد الميتوكوندريا AMA 13.33%، ولم تظهر الاضداد الذاتية من نوع SLA للنمط الأول، وكذلك أضداد LKM-1 والخاصة بالنمط الثاني من التهاب الكبد المناعي الذاتي أي ايجابية لدى العينات المفحوصة .


Article
Using Monte Carlo Method for Calculating Phonon Images
استخدام طريقة مونتي كارلو في حساب الصور الفونونية

Loading...
Loading...
Abstract

In this paper a Monte Carlo method has been used to calculate the phonon images of a number of semiconductor cubic crystals from III-V and II-VI groups (higher symmetry) and orthorhombic crystals (lower symmetry). An algorithms a MATLAB codes has been prepared for the calculation of phase velocities, slowness surfaces and group velocities and the formation of the phonon images which required a large number of points in the reduced Brillion zone, these points has been transformed to the group velocity space by solving the Christoffel equation for each of these points, a projection in a given direction is obtained, each incident pluses is transformed to gray level to form the final image. A comparison between the Monte Carlo and systematic methods has been done for the calculated images.تم في هذا البحث استخدام طريقة مونتي كارلو لحساب الصور الفونونية لعدد من بلورات أشباه الموصلات المكعبة من المجموعة الثالثة-الخامسة والمجموعة الثانية-السادسة التي تملك تناظر عالي وبلورات من نظام المعين القائم ذات التناظر الواطئ, كما تم إعداد خوارزميات وإعداد برامج بلغة الـMATLAB لحساب سرع الطور وسطوح التوهين وسرع المجموعة ثم تكوين الصور الفونونية وذلك بتكوين عدد كبير من النقاط في منطقة بريليون المختزلة وتحويل هذه النقاط إلى فضاء سرعة المجموعة بحل معادلة كريستوفل لكل نقطة من هذه النقاط, ثم إجراء عمليات الإسقاط في اتجاه معين يتم تحديده وتحويل النبضات الساقطة إلى سويات رمادية للحصول على الصورة النهائية. وقد أجرينا مقارنة بين طريقة مونتي كارلو والطريقة النظامية لحساب الصور الفونونية في هذه البلورات.

Keywords


Article
The Effect of the ِAcid HCl Concentration on the Optical Properties of P-Crystal Violet
تأثير تركيز حامض HCl على الخواص البصرية لشبه الموصل العضوي p-Crystal violet

Loading...
Loading...
Abstract

Experimental study has been presented for calculation the optical properties of organic semiconductor crystal violet in the range(300-1000)nm .This material has high absorption in the visible range, so it can be used as solar cell. Also the study gave the result that this material is opaque in the visible range . The energy gap is (2.51eV) in the range (300-440) nm. The optical conductivity was increased by increasing the incident photon energy .It appeared that by adding HCl to the crystal violet, the band gap value was affected and it was (2.2 eV). The crystal violet has optical activity property with rotatory coefficient 5.2*10. في هذا البحث تمت دراسة الخواص البصرية لشبه الموصل العضوي Crystal violet ضمن المدى من (300-1000) nm. وقد أوضحت الدراسة ان هذه المادة لها امتصاصية عالية في منطقة الطيف المرئي وهذا يعطي إمكانية استخدام هذه المادة كخلية شمسية. من خلال دراسة معامل الانكسار الحقيقي مع الطول الموجي يتضح ان هذه المادة معتمة في منطقة الطيف المرئي.ان لهذه المادة فجوة طاقة ضمن المدى 440)nm (300- مقدارها(eV 2.51). أما التوصيلية البصرية فكانت تزداد بزيادة طاقة الفوتون الساقط. كذلك اتضح ان حامضHCl له اثر على فجوة الطاقة وكانت قيمتها (2.2 eV) أيضا تبين ان لهذه المادة صفة النشاط البصري ولها معامل تدوير ( ) والتدوير يساري.

Table of content: volume:21 issue:1A