Table of content

Al-Nahrain Journal of Science

مجلة النهرين للعلوم

ISSN: (print)26635453,(online)26635461
Publisher: Al-Nahrain University
Faculty: Science
Language: Arabic and English

This journal is Open Access

About

ANJS(Al-Nahrain Journal of Science) has been published by College of Science since 1996. This Journal consists of the latest researches in both English and Arabic Languages within the Specializations of the scientific departments in the College.

Loading...
Contact info

Al-Nahrain Journal of Science
P.O. Box: 64055, Al-Jadriah, Baghdad, Iraq .
Email: alnahrain-sci@hotmail.com
Webmaster Email: webmaster@jnus.org

Table of content: 2016 volume:19 issue:3

Article
Estimate of JAK 2 V617F Mutation and Activity of Catalase Enzyme in Myeloproliferative Neoplasm

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Myeloproliferative neoplasms (MPNs) are a range of clonal hematological diseases with overlapping features, a specific mutation in the JAK2 gene, which encodes a tyrosine Kinase has been shown to be associated with the myeloproliferative phenotypes (PV, ET and PMF). Aim: Estimate the proportion of JAK2 V617F mutant gene and estimate the significance of antioxidant enzyme (Catalase) is mainly associated with increased oxidative stress this is resulting increase of the free oxygen radicals and relate it with suspected myeloproliferative neoplasms (MPNs) in Iraqi patients. Materials and Methods: Total of (51) patients with suspected myeloproliferative neoplasms (MPNs) and 20 healthy individuals were analyzed for the JAK2 V617F mutation. After DNA extraction, detection of the mutation was done using (ARMS) PCR amplification, activity of Catalase was measured spectrophotometrically. Results: Of 51 patients, the JAK2 V617F mutation (V617F) was detected in 33 out of 42, with PV (81%), and four of patients with ET and PMF (40% and 50%, respectively). The prevalence of this mutation is more associated with male than female about (62%). Catalase activity was found highly significant (P< 0.01) among suspected MPN patients when compared with control group. Conclusion: JAK2 V617F mutation screening can be incorporated in the initial estimate of patients suspected of having MPNs. Catalase enzyme used a biomarker of enzymatic alteration in MPN Iraqi patients.اورام التكاثر النقيي (MPNs) هي سرطانات تعرف باضطربات نسليه لانتاج الخلايا الدمويه مع زيادة إنتاج نوع واحد او اكثر من خلايا الدم الناضجة من انساب الدم النخاعي, و التي يمكن تصنيفها إلى: زيادة انتاج الكريات الحمراء الاولي (PV)، زيادة الاقراص الدمويه الأساسية (ET)، وتليف نخاع العظم الاولي (PMF). تهدف هذه الدراسة الى دعم تشخيص المرض بطريقة دقيقة وذلك بتقدير نسبة الطفرة الجينيه (JAK2 (V617F و قياس انزيم مضاد الاكسدة (الكاتليز) المرتبط بصورة اساسيه مع زيادة الاكسدة الاجهادية والناتجة من زيادة جذور الاوكسجين الحرة للمرضى المصابين بورم التكاثر النقيي (MPNs) وعند مقارنتهم مع الاشخاص الاصحاء, حيث تم تقدير نسبة الطفرة الجينية (JAK2 (V617F وقيمة انزيم الكتاليز عند (51) مريضا بورم التكاثر النقيي و(20) من الاشخاص الاصحاء. أظهرت نتائج الدراسة عند المرضى المصابين حديثا ان الطفرة الجينية( JAK2 (V617F هي إيجابية في 90٪ من مرضى زيادة كريات الدم الحمراء الاولي و 50٪ من مرضى تليف نخاع العظم الاولي و 40٪ من مرضى زيادة الاقراص الدموية الاساسيه. وظهر لدينا بوجود فرق معنوي عالي لمعدل قيم انزيم الكتاليز (0.01P<) عند المرضى بالمقارنة مع الاشخاص الاصحاء. استنتجت الدراسة الحالية ان طفرة الجين( JAK2 (V617F وجدت في 82% عند مرضى ورم التكاثر النقيي (MPN) وان المشتقات التفاعلية للاوكسجين له دور اساسي في التسرطن وتطور اورام التكاثر النقيي (MPNs).


Article
Synthesis and Bacterial Evaluation of The V(IV), Cr(III), Fe(III) and Co(II) Ions Complexes with Mixed Ligands (2-hydroxybenzaldine)-4- Aminoantipyrine and 8-Hydroxyquinoline

Loading...
Loading...
Abstract

The primary ligand (2-hydroxybenzaldine)-4-aminoantipyrine (L)was prepared as achelating ligand, Which was treated with V(IV), Cr(III), Fe(III) and Co(II) ions in alcoholic medium in order to prepare series of new metal complexes in the presence of the Co-ligand 8-hydroxyquinoline. These complexes were prepared by convential method and characterized by available techniques, FT-IR, UV-Visible, magnetic susceptibility, flame atomic absorption technique as well as elemental analysis and conductivity measurements. From these studiesmeasurements, asquare pyramidal structure proposed for V(IV) while octahedral geometry for Cr(III), Fe(III) and Co(II) complexes. Thebacterial activity of the prepared complexes have been determine and compared with the ligands. تم تحضير معقدات جديده بالطريقه التقليديه لليكاند (2- هايدروكسي بنزيلدين) -4- امينوانتيبايرين مع بعض ايونات عناصر الفناديوم الرباعي، الكروم الثلاثي، الحديد الثلاثي والكوبلت الثنائي بوجود الليكاند المشارك 8- هايدروكسي كوينولين في وسط كحولي. شخصت المركبات المحضره بواسطة تقنيات الاشعه تحت الحمراء والاشعه فوق البنفسجيه – المرئيه والحساسيه المغناطيسيه والامتصاص الذري اللهبي وكذلك التحليل الدقيق للعناصر والتوصيليه الكهربائيه. من خلال هذه الدراسات تم اقتراح الشكل الهندسي لمعقد الفناديوم هرم مربع القاعده والشكل ثماني السطوح لكل من المعقدات الكروم، الحديد والكوبلت. كما تم تقييم البكتريا للمعقدات المحضره ومقارنتها مع الليكاندات المستخدمة.


Article
Evaluation and Comparison between Crude Oil Straight Run Fractions and Its Commercial Fractions (Gasoline, Kerosene and Gas Oil) at Dura Oil Refinery

Authors: Wedad H. Al-Dahhan
Pages: 18-27
Loading...
Loading...
Abstract

Atmospheric distillation according to ASTM-D 2892 and ASTM-D 86 distillation methods was carried out to one selected crude oil at Dura oil refinery. Its straight run fractions (Gasoline, Kerosene and Gas Oil) were tested using the physical properties: Boiling point, Density, Pour point, Surface tension and Aniline point in addition to the calculated results: API gravity, Kw factor and Correlation index to make a comparison with commercial fractions (refinery final products): Gasoline, Kerosene and Gas Oil. A special distillation curves were obtained for crude oil to determine the straight run fractions and for the commercial fractions to establish their characteristics and support the preliminary results of the physical properties with valuable data which enhanced the comparison. Distillation of commercial gasoline shows that it is heavier than straight run ones, while there were matching in the characteristics for kerosene. Commercial gas oil was lighter than straight run due to the presence of kerosene.تم اختيار احد النفوط الخام من مصفى الدورة واجراء التقطير عليه بموجب الطريقة (ASTM-D2892) للحصول على المشتقات النفطية الرئيسية محور البحث (كازولين، كيروسين وكاز اويل). اجريت عمليات تقطير على نماذج من المشتقات النفطية التجارية (منتج نهائي من مصفى الدورة) بموجب الطريقة (ASTM-D86). المشتقات النفطية المستحصلة من تقطير النفط الخام مع المشتقات التجارية اجريت عليها الفحوصات الفيزيائية: درجة الغليان، الكثافة، درجة الانسكاب، الشد السطحي ودرجة الانلين اضافة الى الخواص التي تم حسابها (Kw,API,CI) للوقوف على نقاط الاختلاف والمقارنة بينهما. تمت الاستعانة بمنحنيات التقطير للنفط الخام والمشتقات النفطية لدعم النتائج المستحصلة من الخواص الفيزيائية. تبين من خلال المقارنه بين المشتقات التجارية طي البحث والمنتجات المستحصلة مباشرة من عملية التقطير ان الكازولين التجاري اثقل من المقطر بينما تطابقت النتائج بالنسبة للكيروسين وعلى عكس الكازولين فان الكاز اويل التجاري كان اخف من الكاز اويل المنتج مباشرة من عملية التقطير.


Article
Synthesis and Characterization of New Heterocyclic Schiff's Bases from Methyl 4-Hydroxybenzoate

Authors: Saja S. Abbood --- Jawad K. Shneine --- Ahmed Ahmed
Pages: 28-33
Loading...
Loading...
Abstract

New Schiff's bases with 1,2,4-triazole ring (3a-j) have been synthesized from 4-(4'-amino-5-mercapto-4H-1, 2, 4-triazol-3-yl) phenol (2) which is obtained from 4-hydroxybenzohydrazide (1) by a cyclization reaction. Infrared spectroscopy and 1H NMR spectroscopy were used to characterize the structure of synthesized compounds. All the final products are indicated as keto-enol and thione-thiol tautomers. تم تخليق قواعد شف جديدة تحوي في تركيبها حلقة 1,2,4- ترايازول الخماسية (3a-j) من المركب4,4 -امينو-5- مركابتو4H- 1,2,4-- ترايازول 3-- ايل (2) والذي بدوره حضر من تفاعل الحولقة لمركب 4- هيدروكسي حامض البنزويك هايدرازايد (1). تم تشخيص المركبات بواسطة طيف الاشعة تحت الحمراء وطيف الرنين النووي المغناطيسي للبروتون.


Article
Pharmaceutical Compounds as Photostabilizers

Loading...
Loading...
Abstract

In this paper, some pharmaceutical compounds were used and their impact on the photostability of polymer poly (vinyl chloride) (PVC) was study. The PVC films containing a variant concentration of compounds 0.25, 0.5, 1% by weight were produced by casting method from tetrahydrofuran (THF) solvent. The photostabilization activities of these compounds were determined by calculating the photodegradation rate constant for photostabilizer (kd). The stabilizing efficiency of pharmaceutical compounds is attributed to the replacement of the labile chlorine atoms on the PVC chains by a relatively more stable moiety of the pharmaceutical stabilizer. The Photostabilization activity of these compounds is determined by weight loss method with irradiation time.في هذا البحث, استخدمت بعض المركبات الدوائية ودراسة تأثيرها على الاستقرارية الضوئية لمتعدد كلوريد الفينيل. تم انتاج الرقائق البلاستيكية التي تحتوي على تراكيز مختلفة 0.25% و %0.5 و 1% وزناً من المركبات بطريقة الصب من مذيب رباعي هيدرو فيوران. وحددت فعالية الاستقرارية الضوئية للمركبات عن طريق حساب ثابت سرعة التحلل الضوئي للمثبت الضوئي. سبب كفاءة التثبيت بالمركبات الدوائية هو استبدال ذرات الكلور في سلاسل متعدد كلوريد الفينيل بمجموعة اكثر استقرارا نسبة للمثبت المستخدم. وتم تحديد فعالية التثبيت الضوئي لهذه المركبات بطريقة فقدان الوزن مع وقت الشعيع.


Article
Synthesis and Characterization of IZO Composite Prepared by Sol-Gel Method

Loading...
Loading...
Abstract

Indium oxide and indium zinc oxide composite (IZO) were prepared by sol-gel method and deposited on quartz substrate by dip coating technique. Two annealing temperatures (200 and 400◦C) and compositions were done. The structure and surface morphology of particles were characterized by X-ray diffraction (XRD), Atomic Force Microscope (AFM), FT-IR measurements. The XRD and AFM indicate decreasing in the particle size and improve of optical and electrical properties of composite with increasing of zinc oxide addition. The results of Hall measurements show that the In2O3 and its composite (IZO) have n-type.تم تحضير جسيمات اوكسيد الأنديوم وجسيمات متراكبة من اوكسيدي الأنديوم/خارصين (IZO) بواسطة طريقة محلول- جيلاتين ومن ثم رسبت على ركائز من الكوارتز بواسطة تقنية التغطية بالغمر. لدنت النماذج بدرجات حرارية مختلفة (200, 400 س◦) وكذلك الحال للمتراكبات. تم تشخص التركيب البلوري وهيئة السطح للجسيمات بواسطة تقنيـــــة حيــــود الاشعـــــة السينيــــة (XRD), مجهـــــر القـــــوة الذرية(AFM) وقياسات الأشعة تحت الحمراء (FT-IR). اظهرت نتائج XRD و AFM تناقص الحجم الحبيبي للمتراكب وتحسن الخصائص البصرية والكهربائية مع زيادة اضافة اوكسيد الخارصين. بينت قياسات تاثير الفجوة ان اوكسيد الأنديوم والأوكسيد المتراكب (IZO) من نوع (n-type).

Keywords

Indium oxide --- zinc oxide --- composite --- sol-gel --- XRD --- AFM


Article
Photochemical Study of Cobalt (II) in Dimethyl Sulfoxide, Simethylformamide and Chloroform Solvents

Loading...
Loading...
Abstract

The photochemistry of chelate complex 2-(6-methoxynaphthalen-2-yl) propanoic acid cobalt (II) Co(L)2 was studied in three polar aprotic solvents: Dimethyl sulfoxide (DMSO), Dimethylformamide (DMF) and chloroform (CHCl3). Monochromatic light of wavelength 311 nm was used for the irradiation process at 25oC. Uv-visible spectral changes indicated an intra oxidation-reduction reaction occuring during the photolysis of Co(L)2 complex, with homolytic scission of Co-L bond. The quantum yield (d), rate of photodecomposition and reactivity ratio (k2/k-1) was determined in each solvent. These values always increase as the polarity of the solvent increases and follow the order: DMSO > DMF > CHCl3 The mechanism of photodecomposition of this complex under the applied conditions was proposed. تم دراسة الكيمياء الضوئية لمعقد الكوبلت الثنائي مع الليكاند ثنائي السن: methoxynaphthalen-2-yl)propanoic acid- 2-(6 في ثلاث مذيبات قطبية لا بروتونية هي: ثنائي مثيل سلفواوكسايد وثنائي مثيل فورم امايد والكلوروفورم. وتم استخدام ضوء أحادي وبطول موجي قدره 311 نانوميتر وبدرجة حرارة 25هم. لقد دلت التغيرات الطيفية الحاصلة على حصول تفاعل أكسدة-اختزال داخلي خلال عملية 2 مع انفصام متجانس للآصرة .Co-Lلقد تم حساب الناتج الكمي (Qd وسرعة التفكك الضوئي ونسبة الفعالية K2/K-1 في كل مذيب من المذيبات أعلاه ووجد ان هذه القيم تزداد بزيادة قطبية المذيب ووفق الترتيب الآتي: DMSO > DMF > CH3Cl ووفقا للنتائج العملية المستحصلة، تم أقتراح ميكانيكية التفكك الضوئي لمعقد الكوبلت الثنائي.

Keywords

Photodecomposition --- Co(II) --- DMSO --- DMF --- Chloroform


Article
Interpretation of the q-Deformed 1-D Quantum Harmonic Oscillator

Authors: A. S. Mahmood --- M. A. Z. Habeeb
Pages: 53-69
Loading...
Loading...
Abstract

The interpretation of the q-deformed 1-D quantum harmonic oscillator is investigated for two definitions of q-deformation. This investigation is achieved by using Zaslavskii’s method to obtain the Heisenberg equations of motion (quantum Liouville equations) in the undeformed phase space. These quantum Liouville equations exhibit a non-commutative geometry produce from the existence of the dilatation operator which is inherent in the q-deformation process. The classical limits of these equations are obtained by applying a special classical limiting condition to produce the classical Liouville equations of the q-deformed oscillator. These classical Liouville equations are solved by using the method of characteristics in order to obtain the classical probability distribution functions for this system. The 2-D and 3-D behaviors of these functions were then investigated using a computer visualization method. The results of the mathematical derivations together with the computer visualization method show that the classical limit of the quantum Liouville equations for the q-deformed 1-D quantum harmonic oscillator are statistical in nature where the nonlinearity parameter for the q-deformed oscillator is connected with . This result conforms to that obtained by Ghosh et al. for the undeformed 1-D quantum harmonic oscillator. The obtained classical probability distribution functions exhibit whorl shapes that evolve with time in phase space that are similar to the shapes obtained for the 1-D classical q-deformed oscillator. These whorl shapes in phase space are similar to those introduced by Milburn for the 1-D classical anharmonic oscillator. This similarity results from the fact that the anharmonicity itself represents a kind of deformation with a frequency that is a function of amplitude.تم تقصي التفسير الفيزيائي للتشوه من نوع “q” في المتذبذب التوافقي الكمي ذي البعد الواحد لحالتين من تعريف التشوه. تمت هذه العملية بأستخدام طريقة (Zaslavskii’s) لغرض الحصول على معادلات الحركة لهايزينبيرك (معادلات ليوفل الكمية) بدلالة التمثيل غير المشوه لفضاء الطور. أظهرت معادلات ليوفل الكمية هذه هندسة ذات طبيعــة لاتبادليـــــة ناتجـــــة عـــن وجــــود مؤثـــــر التمــــدد (Dilatation Operator) والذي يكون متأصل في التشوه “q”. تم أيضا الحصول على الغاية الكلاسيكية لمعادلات ليوفل الكمية بواسطة تطبيق شروط حدودية معينة لهذه المعادلات للحصول على معادلات ليوفل الكلاسيكية للمتذبذب ذي التشوه من النوع “q”. تم حل معادلات ليوفل الكلاسيكية هذه بأستخدام طريقة الخصائص للحصول على دوال توزيع الأحتمالية الكلاسيكية لهذا النظام, ثم تقصي السلوك ثنائي البعد وثلاثي البعد لهذه الدوال بأستخدام طريقة حاسوبية مرئية، حيث تم بناء برنامج حاسوبي لهذا الغرض باستخدام حزمة برمجيات Mathematica®. كشفت النتائج بأن الغاية الكلاسيكية لمعادلات ليوفل الكمية للمتذبذب التوافقي الكمي ذي التشوه من النوع “q” في البعد الواحد هي ذات طبيعة أحصائية. هذه النتيجة تتوافق مع النتيجة التي حصل عليها (Ghosh et al.) للمتذبذب التوافقي الكمي غير المشوه ذي البعد الواحد حيث يرتبط معامل اللاخطية للمتذبذب المشوه من النوع “q” بالثابت . أظهر السلوك المستحصل لدالة توزيع الأحتمالية الكلاسيكية اشكال لولبية تتطور مع الزمن في فضاء الطور مشابهة لتلك الاشكال المقدمة من قبل (Milburn) للمتذبذب اللاتوافقي الكلاسيكي ذي البعد الواحد. هذا التشابه ناتج من الحقيقة التي تنص على أن اللاتوافقية نفسها تمثل نوع من أنواع التشوه حيث التردد دالة للسعة.


Article
Using Gaussian Basis-Sets with Gaussian Nuclear Charge Distribution to Solve Dirac-Hartree-Fock Equation for 83Bi-Atom

Authors: Bilal K. Jasim --- Ayad A. Al-Ani --- Saad. N. Abood
Pages: 70-76
Loading...
Loading...
Abstract

In this paper, we consider the Dirac-Hartree-Fock equations for system has many-particles. The difficulties associated with Gaussians model are likely to be more complex in relativistic Dirac-Hartree-Fock calculations. To processing these problem, we use accurate techniques. The four-component spinors will be expanded into a finite basis-set, using Gaussian basis-set type dyall.2zp to describe 4-component wave functions, in order to describe the upper and lower two components of the 4-spinors, respectively. The small component Gaussian basis functions have been generated from large component Gaussian basis functions using kinetic balance relation. The considered techniques have been applied for the heavy element 83Bi. We adopt the Gaussian charge distribution model to describe the charge of nuclei. To calculate accurate properties of the atomic levels, we used Dirac-Hartree-Fock method, which have more flexibility through Gaussian basis-set to treat relativistic quantum calculation for a system has many-particle. Our obtained results for the heavy atom (Z=83), including the total energy, energy for each spinor in atom, and expectation value of give are good compared with relativistic Visscher treatment. This accuracy is attributed to the use of the Gaussian basis-set type Dyall to describe the four-component spinors.في هذا البحث تم الاخذ بنظر الأعتبار معادلة ديراك هارتري فوك لنظام متعدد الالكترونات . وان الصعوبات التي ترافق نموذج جاوس ستكون اكثر تعقيدا مع حسابات ديراك هارتري فوك، ولمعالجة هذه التعقيدات سنستخدم تقنيات ذات مرونه لحل هذه التعقيدات. سنقوم بتوسيع مركبات البرم النسبية الاربعة الى مجموعة اسس محددة. أن مجموعة أسس جاوس النسبية من نوع dyall. 2zp استخدمت لوصف دوال الموجه النسبية ذات المركبات الاربعة وأن مركبات دوال أسس جاوس النسبيه الصغيره يمكن توليدها من مركبات دوال أسس جاوس الكبيره باستخدام دالة التوازن الحركية. وتم تبني نموذج توزيع كاووس لوصف توزيع شحنة النواة وطبقت هذه التقنية على عنصر ذري ثقيل وهو (Bi, Z=83). للحصول على حسابات اكثر دقة للخصائص الذريه. تم استخدام طريقة ديراك هارتري فوك مع مجموعه أسس جاوس النسبية لمعالجة الحسابات الكمية النسبية لنظام متعدد الذرات. ان النتائج التي حصلنا عليها كانت اكثر دقه من نتائج معالجة Visscher النسبية ويعزى ذلك لاستخدامنا مجموعة أسس جاوس النسبية من نوع Dyall لوصف المركبات الاربعة النسبيه ونموذج توزيع جاوس.


Article
Structure and Optical Properties of ZnCdO Thin Films Prepared by Spray Pyrolysis

Authors: Jabbar H. Khlaief
Pages: 77-86
Loading...
Loading...
Abstract

ZnCdO films were compounded by spray pyrolysis on glass substrates at temperature of 250Co, using solution of zinc acetate and cadmium acetate salts with various additions concentrations of Zn (25, 50, 75)%. Structure and optical properties have been analyzed using XRD and UV-Vis spectroscopy. XRD analysis premiered that thin films were of polycrystalline nature with face centered cubic structure. The crystallinity increases when the Zn additions increases. Film additions with 75% Zn has minimum value of dislocation density and strain which confirm the improved crystallinity of the film. The optical results featured the transparency of the ZnCdO films is greater than 80% in the visible region, and we found when the concentration of Zn additions increase the optical band gap increasing from (2.49 to 2.9eV). اغشية اوكسيد الكادميوم-الزنك تم تحضيرها بطريقة الرش الكيميائي الحراري على قواعد من الزجاج وبدرجة حرارة 250 درجة مئوية، باستخدام محاليل لاملاح الكادميوم والزنك وبنسب اضافة مختلفة لمادة الزنك (%25,50,75). الخصائص التركيبية والبصرية تم تحليلها باستخدام حيود الاشعة السينية ومطياف الاشعة المرئية – فوق البنفسجية. واظهرت نتائج حيود الاشعة السينية أن الاغشية الرقيقة ذات طبيعة متعددة التبلوروبتركيب الوجه المركزي المكعب. وبينت نتائج النفاذية البصرية بأن اغشية اوكسيد الكادميوم زنك ذات نفاذية عالية اكبر من 80% للمنطقة المرئية. وقد وجدنا عند زيادة تركيز اضافة الزنك ان فجوة الطاقة تزداد من (2.49 الى 2.9 الكترون فولت).


Article
Transfer of Metal Thin Films by Laser Induced Forward Technique

Authors: Iman H. Hadi
Pages: 87-91
Loading...
Loading...
Abstract

In this work preparation and characterization of Aluminum thin films by laser induced forward transfer has been studied. These thin films were deposited by thermal evaporation on glass substrates as donor substrates. These thin films were irradiated by a single pulse and transferred to a silver (Ag) and silicon (Si) receiver substrates. The laser source used for LIFT process was a Nd-YAG Q-Switching second harmonic generation (SHG) Pulsed Laser with a wavelength 532nm, repetition rate 1-6 Hz ,and pulse duration 10ns. Deposited size, morphology and adhesion to the receiver substrate as a function of the applied laser fluence are investigated. في هذا العمل تم تحضير ودراسة خصائص الألمنيومِ بطريقة الانتقال المحتث المباشر بالليزر. تم تحضير اغشية الالمنيوم بطريقة التبخير الحراري كأغشية واهبة. تم تسليط نبضات منفردة على هذه الاغشية وتم نقلها الى قواعد من الفضة والسليكون. مصدر الليزر المستخدم في هذه الدراسة هو ليزر النيديميوم- ياك يعمل بنمط التولد التوافقي الثاني (بطول موجي 532 نانومتر و تكرارية 1-6 هرتز وآمد نبضة 10 نانوثانية). حجم الغشاء المرسب على القاعدة المستلمة, طوبوغرافية السطح, وقوة الالتصاق بين الغشاء والقاعدة المستلمة تم دراستها كدالة لكثافة طاقة الليزر المستخدم.


Article
Proton Momentum Distributions and Elastic Electron Scattering form Factors for Some Even-A 1f-2p Shell Nuclei

Authors: Ahmed N. Abdullah
Pages: 92-100
Loading...
Loading...
Abstract

The proton momentum distributions (PMD) and elastic charge form factors, F(q), of the ground state for some even mass nuclei in the 1f-2p shell, such as 56Fe, 62Ni and 68Zn nuclei have been calculated in the framework of the Coherent Density Fluctuation Model (CDFM) and expressed in terms of the fluctuation function (weight function) (|f(x)|^2 ). The fluctuation function has been related to the charge density distribution (CDD) of the nuclei and obtained from the theory and experiment. The feature of the long-tail behavior at high momentum region of the proton momentum distributions has been determined by both the theoretical and experimental fluctuation functions. The observed electron scattering form factors for 56Fe, 62Ni and 68Zn nuclei are in very good agreement with the present calculations throughout all values of momentum transfer q.تم حساب توزيعات زخم البروتون (PMD) وعوامل التشكل للاستطارة الالكترونية المرنة للحالة الارضية لبعض النوى الزوجية ( 56Fe، 62Ni و 68Zn) الواقعة ضمن القشرة النووية 1f-2p وفقا لانموذج تموج الكثافة المترابط الذي يعبر عنه بدلالة دالة التموج (|f(x)|^2 ). لقد تم التعبير عن دالة التموج بدلالة توزيعات كثافة الشحنة وتم حسابها من النتائج النظرية والعملية. تميزت نتائج توزيعات زخم البروتون (المستندة على دالة التموج النظرية والعملية) بخاصية الذيل الطويل عند قيم الزخوم العالية. أظهرت هذه الدراسة بان عوامل التشكل النظرية تتفق مع النتائج العملية للنوى (56Fe، 62Ni و 68Zn) ولكل قيم الزخم المنتقل.


Article
Detection of Norovirus and Rotavirus in Children under Five Years During Winter 2012-2013 in Mosul Province

Loading...
Loading...
Abstract

The identifying the viral agents such as norovirus genogroup I (NVGI), norovirus genogroup II (NVGII) and rotavirus (RV) is critical to the development of effective preventive measures. This study aimed to determine the prevalence of common enteric viruses in children <5 years old presented with diarrhea in Mosul Governorate. Due to the lack of recent reports on surveillance of ro¬tavirus and norovirus infection in, One hundred fecal samples were collected between December 2012 to March 2013 from children <5 years of age who presented with acute gastroenteritis in the Al-Salam hospital and Al-Madena clinical laboratory in Mosul .All samples were tested for rotavirus using latex agglutination test, and norovirus using (RT-qPCR) for NVGI and NVGII. Enteric viruses were detected in 42 out of the 100 (42%) children who presented with acute diarrhea. In that 42 samples positive for enteric viruses, at least one viral agent was found. NVGII was the most frequent virus identified in 24cases (57.14%), followed by rotavirus in 14 cases (33.33%), and NVGI in 4 cases (9.52%). The result demonstrated a high prevalence infection with the both viruses in age group under 1years with high incidence of 22 Bottle-Feed 22 cases (52.37%).Norovirus and Rotavirus co-infection was occurred in 9 cases presented 21.24% of all cases.أن تحديد العوامل الفيروسية مثل فيروس النورو النمط الأول (NVGI) والنمط الثاني (NVGII) والفيروس ألعجلي (RV) أمر بالغ الأهمية لوضع تدابير وقائية فعالة. هذه الدراسة تهدف إلى تحديد مدى انتشار الفيروسات المعوية الشائعة في الأطفال دون 5 سنوات من العمر الذين يعانون الإسهال في محافظة الموصل ونتيجة لعدم وجود تقارير على مراقبة عدوى فيروس النورو والفيروس ألعجلي في الموصل، تم جمع مائة عينات البراز بين ديسمبر 2012 إلى مارس 2013 من الأطفال دون الخامسة من العمر المصابين بالتهاب المعدة والأمعاء الحاد في مستشفى السلام و ومختبر المدينة في الموصل والتحري عن الفيروس ألعجلي باستخدام اختبار تراص اللاتكس، والتحري عن فيروس النورو بنمطيه NVGI و NVGII بتقنية تفاعل البلمرة التسلسلي الآني وتم الكشف عن الفيروسات المعوية في 42 عينة من أصل 100 (42٪) في الأطفال المصابين بالإسهال الحاد في 42 عينة موجبة بوجود احد الفيروسات المعوية. كان النمط الفيروس NVGII الأكثر شيوعا بينهم أذ تم تحديده في 24 حالة (57.14٪)، تلاه الفيروس ألعجلي في 14 حالة (33.33٪)، وNVGI في 4 حالات (9.52٪.( أظهرت نتيجة العدوى انتشار عالي للفيروسات على حد سواء في الفئة العمرية أقل من 1 سنة مع ارتفاع معدل الإصابة في تغذية الزجاجة 22 حالة (52.37٪) وقد وجدت الإصابات المشتركة بكلا الفيروسين ألعجلي والنورو في 9 حالات (21.24٪) من جميع الحالات.


Article
Comparison between Two Different DNA Extraction Techniques Taken from Buccal Swabs Suitable for Genetic Analyzer

Authors: Halah Khalid Ibrahim Al-Sammarraie
Pages: 108-113
Loading...
Loading...
Abstract

This study aimed to validate two DNA extraction methods collected from buccal cells to gain a genomic DNA and to determine the effect of process time (from collection time to amplification). Total number of 116 buccal swab samples from unrelated healthy volunteers were subjected to DNA extraction by using two methods: modified (phenol chloroform) (Organic) and Prep Filer Forensic DNA Extraction kit. DNA was evaluated according to the: quantity, integrity and suitability for genetic analysis. The DNA yield and purity were measured by Nano drop Spectrophotometer. Organic method was modified from the classical method (addition Dithiothreitol to lysis buffer), The purity average values increased from 1.4 to 1.6 and it had the highest average concentration (73.3ng/µl) while the highest purity was observed in Prep Filer Forensic DNA Extraction kit with average (1.82). Delayed in sample processing effect both quantity and integrity of the extracted DNA. All samples were genetically analyzed at 16 STR with amelogenin (DNA markers) included in the Amp FlSTR® Identifiler™ PCR Amplification Kit panel from Applied Biosystems. Buccal cell swabs were very good source of genomic DNA especially for large population studies.هدفت هذه الدراسة الى تقييم تقنيتين مختلفتين لاستخلاص الحمض النووي الجينومي من خلايا الظهارية المبطنة للفم ولتحدديد تاثير الوقت (من جمع العينة الى تضخيمها). جمعت 116 عينة ظهارية من بطانة الفم من اشخاص متطوعين لا تربطهم صلة قرابة اذ استخلصت بطريقيتن: العضوية (فينول كلورفورم) المحورة وعدة مختبرية متخصصة وهـــي: Prep Filer Forensic DNA Extraction kit تـم تقييم الحمض النووي وفق الكمية والنوعية وامكانية استخدامه لاغراض التحليلات الوراثية. تم قياس حصيلة ونقاوة الحمض النووي باستخدام جهاز الطيف المرئي ((Nano drop. حورت الطريقة العضوية عن الطريقة التقليدية باضافة مادة Dithiotheritol الى محلول بفر التحليل. زادت معدل النقاوة المستحصلة من 1.4 الى 1.6 ومعدل التركيز 73.3 نانوغرام/ مايكروليتر بينما اعلى قيمة نقاوة كانت باستخدام العدة التجارية وبمعدل 1.82. ان تاخير عملية استخلاص العينة اثر على تركيزها وتكاملها. كل العينات المستخلصة تم تحليلها وراثيا باستعمال عدة تضخيمية لمؤشرات جسمية خاصة لتحديد التتابعات الوراثية الجنائية. اظهرت الدراسة ان عينات الخلايا الظهارية المبطنة للفم تعتبر مصدرا فعالا للحصول على حمض نووي جينومي خاصة للدراسات المجتمعية الكبيرة.


Article
Effect of Histidine on Sensetivity of Some Pathogenic Bacteria

Authors: Fatima A. Abd Al-Jabar --- Ali S. Ahmed
Pages: 114-118
Loading...
Loading...
Abstract

The purpose of this study was to determine the antibacterial effect of the amino acid histidine against two pathogenic bacteria Escherichia coli and Staphylococcus aureus. No antibacterial activity was observed for histidine at all tested concentrations. The sensitivity test for E.coli and S. aureus was performed against ten types of antibiotics. The antibiotics used for E.coli were Levofloxacin(Lev), Streptomycin(S), Rifampicin(Rp), Metronidazole(Mz), Cloxacillin(Cx), Ciprofloxacin(Cip), Tetracycline(T), Nalidixic acid(Na), Penicillin(P) and Vancomycine(Va) and the results of inhibition zones were 44, 14,8, 0,0, 35, 24, 28, 16 and 14 mm respectively. When the Histidine added at concentration 10 mg/ml to Mueller hintone agar, the inhibition zones became 24, 12, 18, 0, 0, 24, 32, 25, 13 and 14 mm for each antibiotic respectively. The antibiotics used forStaph. aureus areLevofloxacin (Lev), Gentamicin(Gm), Rifampicin(Rp), Metronidazole(Mz), Cloxacillin(Cx), Ciprofloxacin(Cip), Tetracycline(T), Clarithromycin(Cla), Vancomycine (Va) and Chloramphenicol (C). Result of inhibition zones were 40, 30, 0, 0, 0, 22, 10, 0, 10 and 22 mm when the Histidine added at concentration 10 mg/ml to the mueller hinton agar, the inhibition zones became 30, 20, 16, 0, 0, 26, 15, 0, 10 and 22 mm. Applicable experiment of the histidine effect was conducted on resistant and sensitive isolates against Histidine of Mycobacterium tuberculosis (TB) in Pulmonary Institute in Baghdad. It was found that mixing of Histidine with Rifampicin changed the response of resistant isolate against Rifampicin and turned into sensitive. This results may encourage mixing antibiotics and Histidine instead of using the more effective and harmful antibiotics against the resistant isolates.الهدف من الدراسة الحالية هو لمعرفة تأثير الحامض الاميني الهستدين على استجابة نوعين من البكتريا المرضية Escherichia coli و Staphylococcus aureus. لم يلاحظ تأثير مباشر لإضافة تراكيز مختلفة من الحامض الاميني الهستدين على كلا النوعين من البكتريا. تم اجراء فحص الحساسية على نوعي البكتريا باستعمال عشرة انواع من المضادات الحياتية لكل نوع من انواع البكتريا اذ استعملت المضادات التالية لل E.coli وهي (ليفوفلوكساسين, ستريبتومايسين, ريفامبسين, ميترانيدازول, كلوكساسلين, سبروفلوكساسين, تيتراسايكلين, نالديكسك اسيد, بنسلين, فانكومايسين) وكان قطر هالة التثبيط على التوالي هو 44, 14, 8, 0 ,0, 35 , 24 , 28 , 16 , 14 ملم وبعد اضافة الحامض الاميني الهستدين الى الوسط الزرعي مولر هينتون بتركيز 10 ملغم لكل مل لوحظ تغيير قياس هالة التثبيط 24, 12 , 18 , 0 ,0 , 24 , 32 , 25 , 13, 14 ملم. اما بالنسبة للـ Staph. aureus فقد تم استعمال المضادات التالية ليفوفلوكساسين, جينتامايسين, ريفامبسين, ميترانيدازول, كلوكساسلين, سيبروفلوكساسين, تيتراسايكلين, كلاريثرومايسين, فانكومايسين, كلورامفينيكول وكان قطر هالة التثبيط على التوالي هو 40 , 30 , 0 ,0 , 0 , 22 , 10, 10، 0 , 22 ملم وبعد اضافة الحامض الاميني الهستدين الى الوسط الزرعي مولر هينتون اكار بتركيز 10 ملغم لكل مل لوحظ تغيير قطر هالة التثبيط الى الاتي 30 ، 20 , 16 , 0 , 0 , 26 , 15 , 0 ، 10 , 22 ملم. بعد ذلك انجزت التجربة التطبيقية على عزلات حساسة ومقاومة للريفامبسين لبكتريا السل Mycobacterium tuberculosis في معهد التدرن الرئوي في بغداد. وجد ان خلط الهستدين مع المضاد قد غير من استجابة العزلة المقاومة وتحولت الى حساسة. هذه النتائج قد تشجع على عدم استعمال مضادات حياتية اكثر فعالية وضارة ضد العزلات المقاومة.


Article
Antioxidant and Antimicrobial Activities of Nerium Oleander Plant

Authors: Buthaina Abdul-Hamza Hasoon
Pages: 119-123
Loading...
Loading...
Abstract

The green synthesis of Ag nanoparticles was prepared biologically in the presence of Nerium oleander extract and examined by UV-Vis spectrophotometer, Infrared (IR) spectroscopy and scanning electron microscopic (SEM) to characterize Ag nanoparticles. The effect of alcoholic extract alone, Ag nanoparticles determined on some pathogenic microorganisms. The alcoholic extract showed no considerable influence on the growth of tested strains, while the synthesised Ag nanoparticles show different effect on the growth of the microbial species. .The highest inhibition zone was shown on E.coli reaching (31mm) followed by P. aeroginosa (30 mm), S. aurous with inhibition zone reached to (23mm), K. pneumonia (22mm), and C.albicans (20mm). The effect of antibiotic (Gentamycin) has been studied alone on microbial growth with inhibition zone (17 mm) on C. albicans followed by E.coli with (13mm), and finally in S.aurous inhibition zone reached (15mm). The antimicrobial effect of (alcoholic extract- Gentamycin) was tested after mixing togathor which showed variotion with the highest effect on C. albicans in (19 mm), followed by S. aurous, and E.coli in (13 mm, 15 mm). respectively, K. pneumonia,, P. aeroginosa showed no inhibiting effect by alcoholic extract- Gentamycin complex. The ability of crude alcoholic extract to remove free radicals was determined by estimating antioxidant activity. The activity of the plant extract on the DNA molecules in vitro showed low absorbance values related to the increase in the concentration of ethanolic extract.تمت دراسة تاثير المستخلص الكحولي ودقائق الفضة النانوية المتكونة بواسطة اوراق نبات الدفلة وقد استخدم المجهري الإلكتروني الماسح SEM)) لتوصيف دقائق الفضة النانوية كما تمت دراسة تاثيرهما على نمو الاحياء المجهرية قيد الدراسة لم يظهر المستخلص الكحولي تاثيرا كبيرا في نمو الاحياء المجهرية المستخدمة في التجربة, في حين تباين تاثير المستخلص النانوي حيث سجلت اعلى منطقة تثبيط للمستخلص النانوي على نمو البكتريا المعويةE.coli بقطر (31) ملم تليها بكتريا P. aeroginosaبقطر (30) ملم تليها بكتريا المكورات العنقودية بمنطقة تثبيط بلغت (23) ملم ثم في بكترياK.pneumonia بقطر (22) ملم واخيرا في الخميرة C. albicans (20) ملم. درس تاثير المضاد الحيوي (Gentamycin) على نمو الاحياء المجهرية قيد الدراسة وقد اعطى اعلى منطقة تثبيط في الخميرة C. albicans (17) ملم تلاها في ذلك البكتريا المعوية E.coli بمنطقة تثبيط بلغت (13) ملم واخيرا المكورات العنقودية بمنطقة تثبيط بلغت (15) ملم, وفيما يخص معقد المستخلص الكحولي والمضاد الحيوي Gentamycin فقد تباين تاثيره على الاحياء المجهرية فقد لوحظ بان هنالك تاثير في نمو الخميرة C. albicans بمنطقة تثبيط بلغت (19) ملم و S. aurous, E.coli بمنطقة تثبيط بلغت (15,13) ملم على التوالي ولكن لم يظهر اي تاثير يذكر على نمو كل من البكتريا K. pneumonia , P. aeroginosa. كما تم التحري عن قابلية هذا المستخلص الكحولي الخام لازاحة الجذور الحرة المتحررة من التحلل الضوئي من خلال انخفاض قيم الامتصاصية, وزيادة تركيز المستخلص المستخدم في هذه الدراسة باستخدام محلول الدنا القياسي.


Article
Results Concerning the Trace of Some Biadditive Mappings of Prime and Semiprime Rings

Authors: Eqbal Jabur Harjan
Pages: 124-130
Loading...
Loading...
Abstract

The purpose of this paper is to present some results concerning the trace of symmetric (الهدف من هذا البحث تقديم بعض النتائج المتعلقة بالدوال ثنائيــــــة المشتقــــــــــــات-(


Article
Efficiency of Engaging Python in Teaching Discrete Mathematics: Case Study

Authors: Lamya A. Omer Alani
Pages: 131-137
Loading...
Loading...
Abstract

This study describes how the subject of discrete mathematics can be integrated with programming techniques for the purpose of teaching. Achieving such integration which can be understood easily by the students reminds that this subject is usually taught to the first years of the academic study. Python is one of such programming language which can be easily understood and practiced compared to other language such as C++, java etc. for instance using Python does not require such effort in designing the structure of program. By providing students with a python language they could use to understand both discrete mathematics and programming effectively and efficiently in the most appropriate manner, this reduce difficulties of imagining the logical way of writing programs also give a brilliant way to rise programming skills and give a simple way to study mathematics practically not only theoretically. This paper represent a case study for teaching discrete mathematics using Python programming language to second year students at computer science department - faculty of science, University of Duhok were given practical lectures for inserting python with their theoretical discrete mathematic study.توضح هذه الدراسة كيف يمكن الدمج بين موضوعي الرياضيات المتقطعة وتقنيات البرمجة من خلال اثراء الخلفيه العلمية لطالب علوم الحاسبات وفهم كلتا المادتين بشكل يساعد على كسب مهارات جيدة وقابليه لتطوير التفكير العلمي والمنطقي للطالب وهذا يحد من الصعوبات التي تواجه الطالب المبتدئ في تخيل كيفية كتابة البرامج ويساعد في إعطاء وسيلة رائعة لزيادة مهاراته كما يهيئ طريقة بسيطة لدراسة الرياضيات عمليا لا نظريا حيث اعتاد الطالب دراسة الرياضيات باسلوب نظري فقط. علما ان كلتا المادتين تدرس في السنوات الأولى من الدراسة الأكاديمية لقسم علوم الحاسبات. وقد اجريت تجربة تدريس الرياضيات الممتقطعة باستخدام لغة البرمجة بايثون وهي احدى لغات البرمجة العليا الحديثة والتي تمتاز بسهولة ايعازاتها وتعتمد على اسلوب البرمجة الشيئيه لطلاب السنة الثانية في قسم علوم الحاسوب/ كلية العلوم بجامعة دهوك أعطيت المحاضرات العملية على عينة من الطلاب وخلال فصل دراسي متكامل تم فيه أدراج امثلة من مواضيع الرياضيات المتقطعة وكتابتها بلغة البايثون.


Article
Pattern Recognition Using Particle Swarm Optimization with Proposed a New Conjugate Gradient Parameter in Unconstrained Optimization

Authors: Ban Ahmed Mitras --- Suhaib Abdul-Jabbar
Pages: 138-147
Loading...
Loading...
Abstract

In this paper, we present modified conjugancy coefficient for the conjugate gradient method. This modification using the extention Dai and Yuan Method to solve non-linear programming problems. The algorithm of particle swarm optimization (PSO) is applied in this work, to coefficients extracted by features extraction techniques. The sufficient descent and the global convergence properties for the proposed algorithm are proved. The numerical results of our finding for the large scale optimization problem are very encouraging comparison with standard methods The experimental results showed that PSO can generate excellent recognition results with the minimal set of selected features. Finally, the algorithm PSO based approaches are proposed and the influence of PSO parameters on the performance is evaluated. تم في هذا البحث اشتــــقاق معامل ترافق محسن لطريقة المتــــجهات المترافقة. هذا التحسين استخدام توسيع طريقة (Dai and Yuan Method) الحل مسائل البرمجة غير الخطية، كما تم تطبيق خوارزمية الطيور في هذا العمل، لتحديد المعاملات باستخدام مميزات التقنيات المحددة. تم إثبات خاصية الانــــحدار الكافي (sufficient descent) وخاصية التقارب الشامل للخوارزمية المقترحة، تم الحصول على نتائج عددية مشجعة جدا لمسائل الأمثلة ذات القياس العالي مقارنة مع الطرق القياسية. النتائج التجريبية وضحت ان طريقة خوارزمية الطيور كانت نتائجها مميزة مع اقل خطأ في المميزات المختارة، أخيرا طريقة خوارزمية الطيور المقترحة التي اعتمده التقريبات ومعاملات أداء الطريقة قد قيمت.


Article
Message Authentication Using New Hash Function

Loading...
Loading...
Abstract

In cryptography, hash functions have very important effects when it’s used in the message integrity, digital time stamping, and digital signature. Hash functions compute hash value by a set of logical (primitive) operations that perform on a (32) bit words for authentication. Authentication process becomes very important especially manipulated message undetected that can have disastrous effects in Network Management and E-Commerce. In this paper, a proposal for new hash function based on MD5 is developed. The length of message digest is 224-bit through (4) rounds that each round has a pair of (16) steps. The final number of steps is (128) that make stronger function against collision attests and more secure than MD5.تمتلك دوال المزج المستخدمة في التشفير, تاثيرات مهمة اذ تستخدم هذه الدوال في تكامل الرسائل, بصمة الوقت الرقمية و التوقيع الرقمي. تقوم دوال المزج باحتساب قيم المزج المعتمدة على مجموعة بسيطة من العمليات المنطقية التي تطبق على 32 بت لاغراض التخويل. وقد اصبحت عملية التخويل مهمة جدا في الوقت الحاضر, خصوصاً في حالة عدم اكتشاف التلاعب بالرسائل اذ يكون له تاثير سيء في التجارة الالكترونية وادراة الشبكات. تم في هذا البحث, اقتراح طريقة مزج جديدة ومطورة تعتمد على طريقة مزج الرسالة (نسخة الاصدار الخامسة) MD5اذ ان طول الرسالة الممزوجة يكون 224 بت خلال 4 دورات بحيث تحتوي كل دورة على زوج من عدد من الخطوات والبالغة 16 خطوة. بذلك, يكون المجموع النهائي للخطوات هو 128 خطوة هذا ما يجعل الدالة اقوى ضد احتمالية وجود رسالتين لهما قيمة مزج واحدة واكثر امناً من طريقة MD5.

Table of content: volume:19 issue:3