research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
The Impact of Single Nucleotide Polymorphisms in the Gene of Toll-Like Receptor-4 in Prostate Cancer
تأثير التغييرات الجينية المنفردة في جين المستقبل الشبيه للتول 4 في سرطان البروستات

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Prostate cancer is one of the major medical problems in male population. Chronic inflammation has an important role in many human cancers and could be involved in the etiology of prostate cancer. Toll-like receptors are important tolls in innate immunity to pathogens. Many environmental factors could predispose for this cancer, however, genetic background of the population cannot be neglected. Objective: To explore the hypothesis that genetic variation in TLR4 gene can influence the individual's susceptibility to prostate cancer. Patients and Methods: A total of 95 outpatient men with histologically-proven prostate cancer as well as 45 apparently healthy men were recruited for this study. Blood samples were taken from each participant from which genomic DNA was extracted and TLR4 gene was PCR-amplified, using specific primers. PCR products were genotyped by direct sequencing.Results: Asp299gly and Thr399Ile SNPs had only two genotypes; the distributions of these genotypes were statistically not significant between prostate cancer patients and controls. At allele levels, the control group had significantly higher frequency in the mutant allele of Thr399Ile SNP (allele T) than prostate cancer patients. On the other hand, the rs11536889 had three genotypes with the mutant homozygous genotype (CC) and the mutant allele were more prevalent in PCa than controls with significant difference (OR=3.433, 95%CI=1.107-10.645, P= 0.033 and OR=2.730, 95%CI= 1.095-6.803, P=0.031 respectively). Conclusion: Allele T of Thr399Ile SNP may have a protective role, while allele C of rs11536889 SNP might increase the risk of prostate cancer.

خلفية الدراسة: يعد سرطان البروستات احد المشاكل الصحية لدى الذكور. الالتهاب المزمن يلعب دورا رئيسيا في العديد من السرطانات في البشر ومنها سرطان البروستات. المستقبلات الشبيهة للتول تلعب دورا هاما في المناعة ضد مسببات الامراض. عدد من العوامل البيئية لها تاثير مباشر في احداث السرطان بالاضافة الى العوامل الجينية. الهدف من الدراسة: ايجاد نظرية التغايرات الجينية في جينات مستقبل التول 4 الذي قد يؤتر في قابلية توليد سرطان البروستات لدى الرجال.المرضى وطرائق العمل: تم جمع 95 مريض مصاب بسرطان البروستات و 45 رجل غير مصاب بالمرض تم استخدامها كمجموعة سيطرة. تم سحب عينة دم من كل المشمولين بالدراسة واستخلاص الحامض النووي الرايبوزي (الدنا) من جميع العينات باستخدام تقنية تفاعل البلمرة للكشف عن جين مستقبل التول 4 بعدها تم تحديد انواع التغايرات الجينية لهذا المستقبل باستخدام السيكونسر المباشر (لتحديد تسلسل الجينات في هذا المستقبل)النتائج: اظهرت نتائج الدراسة انتشارا ذو دلالة غير احصائية في كل من الرضى والسيطرة بخصوص الجينان لمستقبل التول 4 (Asp299gly و Thr399Ile) وعلى مستوى المزدوجات فقد ظهر في مجموعة السيطرة نسبة عالية في التغاير الجيني اكثر مما في سرطان البروستات. (OR=3.433, 95%CI=1.107-10.645, P= 0.033 and OR=2.730, 95%CI= 1.095-6.803, P=0.031).الاستنتاج: بعض المزدوجات تظهر دورا حاميا ضد السرطان اما البعض الآخر يزيد نسبة الخطورة للاصابة بسرطان البروستات.


Article
The Impact of Genetic Variants in IL-10 and IL-12p40 on the Susceptibility to Non Hodgkin Lymphoma
تأثير التغايرات الوراثية في جيني IL-10 و IL-12p40 على الاستعداد للإصابة بالاورام اللمفاوية اللاهودجكينية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Non-Hodgkin lymphomas (NHLs) are a diverse group of mature lymphoid neoplasms with a wide range of cellular and histological presentations. Numerous environmental and genetic factors affect the incidence of these neoplasms; however the exact causes are beyond the current knowledge. Objective: to investigate the association of genetic polymorphisms in two single nucleotide polymorphisms, which are IL-10-1082A/G and IL-12p401188A/ C, with the incidence NHLs among Iraqi patients.Materials and Methods: Whole blood samples were collected from 55 confirmed patients with NHLs and from 40 family-unrelated, age-matched apparently healthy individuals to represent the control group. DNA was extracted from blood samples and allele specific polymerase chain reaction (AS-PCR) technique was used for genotyping of the two SNPs using specific primers. Results: The SNP IL-10-1082A/G appeared in three genotypes: AA, AG and GG which represented 36.36%, 45.45% and 18.18%% respectively in NHL patients compared to 32.5%, 35% and 32.5%% respectively with insignificant neither between genotypes nor alleles. Similarly, the SNP IL-12p401188A/C had three genotypes which were AA, AC and CC. These genotypes represented 32.73%, 38.18% and 29.09% respectively among NHL patients and 52.5%, 37.5% and 10% respectively among controls with significant difference for the homozygous mutant genotype (OR=4.667, 95%CI=1.319-16.512, P=0.017).Conclusion: IL-10-1082A/G polymorphism has no effect on the incidence of NHLs, while allele C of the SNP IL-12p401188A/C could be considered as a risk factor for these neoplasms.

خلفية الدراسة: الاورام اللمفاوية اللاهوجكينية هي مجموعة متباينة من اورام الخلايا اللمفاوية الناضجة والتي تتجلى بمدى واسع من المظاهر النسيجية والخلوية. لقد وجد ان هناك العديد من العوامل البيئية والوراثية التي تقترن مع حدوث هذه الاورام ، ومع ذلك فان الاسباب الدقيقة لهذه الاورام لا زالت غير معروفة. اهداف الدراسة: استقصاء وجود ارتباط بين التغايرات الجينية في موقعين جينيين هماIL-10-1082A/G و IL-12P40 1188A/C مع حدوث الاورام اللمفاوية اللاهوجكينية في المرضى العراقيين.المواد والطرائق : جمعت عينات دم كامل من 55 مريضا بالاورام اللمفاوية اللاهوجكينية اضافة الى 40 شخصا سليما ظاهريا ممن ينتمون الى عوائل مختلفة ولهم اعمار مقاربة لأعمار المرضى ليمثلوا مجموعة السيطرة. استخلص الحامض النووي DNA من عينات الدم باستخدام عدة جاهزة ،واستخدمت طريقة تفاعل سلسلة البلمرة للأليل الخاص Allele specific-PCR لغرض التنميط الجيني.النتائج: ظهر التغاير الجيني IL-10-1082A/G بثلاث انماط جينية وهي AA وAG و GG والتي مثلت على التوالي 36.36% و 45.45% و 18.18% في مجموعة المرضى و 32.5% و 35% و 32.5% في مجموعة السيطرة ، الا ان الفرق لم يكن معنويا سواء على مستوى النمط الجيني اوعلى مستوى الأليل. وعلى غرار ذلك ظهرالتغاير الجيني IL-12p40 1188A/C بثلاث انماط جينية هي AA و AC و CC والتي مثلت على التوالي 32.73% و 38.18% و 29.9% في مجموعة المرضى و 52.5% و 37.5% و 10% في مجموعة السيطرة وبفرق معنوي بالنسبة للنمط الجيني الطافر متماثل الزيجة(نسبة الارجحية =4.667 , فترة ثقة 95%=1.319-16.512 , احتمالية =0.017). وعلى مستوى الأليل فقد كان تكرار الأليل الطافر (C) في مجموعة المرضى(48.18%) اعلى من مجموعة السيطرة (28.75%) وبفرق معنوي عالي (نسبة الارجحية = 2.304 , فترة ثقة 95% = 1.25-4.249 , احتمالية = 0.007).الاستنتاجات: ليس للتغاير الجيني IL-10-1082A/G تأثيرا مهما على حدوث الاورام اللمفاوية اللاهوكجينية ولا على المستويات المصلية للسايتوكين IL-10 في حين ان الأليل C للتغاير IL-12p40 118A/C يمكن ان يعد عامل خطورة للاصابة بهذه الاورام.


Article
Tumor Necrosis Factor-Alpha Gene Polymorphisms in Iraqi patients with Chronic Periodontitis
تعدد الأشكال في جين عامل نخر الورم ألفا ((TNF-α في المرضى العراقيين المصابين بمرض النساغ المزمن

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Chronic periodontitis is an inflammatory disease of bacterial etiology that results in the destruction of tooth supporting tissues, tooth mobility, and tooth loss. The inflammatory response of the periodontal tissues to infection is influenced by environmental and genetic factors. The polymorphism of tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) has been reported to influence the expression of TNF-α, thereby playing a role in the pathogenesis of periodontitis.Objective: To study the genotyping of tumor necrosis factor-α at position (-308) and to find out whether any associations exist between the severity of periodontitis and the gene polymorphisms.Patients and Methods: The study groups included 50 patients with chronic periodontitis and 20 healthy controls with clinically healthy periodontium with an age range of 25-50. Everyone were analyzed for polymorphism of TNF-α gene at position (-308). Periodontal parameters used in this study were plaque index (PLI), gingival index (GI), probing pocket depth (PPD), clinical attachment level (CAL) and bleeding on probing (BOP). Five ml of venous blood was collected from all patients and controls. DNA was extracted from blood samples, and then the results of electrophoresis of polymerase chain reaction (PCR) products for this cytokine were subjected for sequencing and to locate the positions of possible mutations.Results: The results of sequencing for the tumor necrosis factor-α gene showed higher frequency of mutations in patient samples as compared to healthy control samples. A highly significant difference was found in the frequency of mutations among the six samples (4 patients and 2 controls) p=0.0002.Conclusion: The results of this study indicates that the (-308) polymorphism in TNF-α gene is associated with the susceptibility to chronic periodontitis.

خلفية الدراسة: مرض النساغ المزمن هو مرض التهابي من المسببات البكتيرية التي تؤدي إلى تدمير الأنسجة الداعمة للأسنان ، حركة الأسنان، وفقدان الأسنان. الاستجابة الالتهابية لأنسجة الاسنان الداعمة للاصابة تتأثر بالعوامل البيئية والوراثية.أن تعدد الأشكال لعامل نخر الورم ألفا (TNF-α) له تأثير على التعبير عن TNF-α، وبالتالي تلعب دورا في التسبب في التهاب اللثة.اهداف الدراسة : قد أجريت هذه الدراسة لدراسة التنميط الجيني لعامل نخر الورم α في موضع (-308) ولمعرفة ما إذا كان هناك أي أرتباط موجودة بين شدة التهاب اللثة وتعدد الأشكال الجيني.المرضى والطرائق : شملت مجموعات الدراسة 50 مريض لديهم التهاب اللثة المزمن و 20 الاصحاء مع لثة صحية سريريا وكانت أعمارهم تتراوح ما بين25- 50 سنة. اما فيما يخص مؤشرات ما حول الاسنان التي تم قياسها في هذه الدراسة هي (مؤشر الصفيحة الجرثومية , مؤشر التهاب اللثة , عمق جيوب اللثة , مستوى الانسجة الرابطة سريريا و مؤشر النزف عند التسبير). تم جمع خمسة مل من الدم الوريدي من جميع المرضى والضوابط. تم استخراج الحمض النووي (DNA) من عينات الدم ثم بعد ذلك أُجري الترحيل الكهربائي من منتجات تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) ، وأُرسلت النتائج لمعرفة التتابعات وتحديد اماكن الطفرات المحتملة.النتائج: أظهرت نتائج الكشف عن تسلسلات القواعد النتروجينية لجين عامل نخر الورم ألفا ((TNF-α تردد أعلى من الطفرات في عينات المرضى مقارنة عينات من الأصحاء. تم العثور على اختلاف كبير جدا في تردد الطفرات بين العينات الست (4 مرضى و2 الضوابط) p=0.0002.الاستنتاجات: نتائج هذه الدراسة تشير إلى أن تعدد الأشكال في الجين TNF-α في موضع (-308) يمكن أن تسهم في زيادة القابلية لمرض النساغ المزمن.

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

Arabic and English (3)


Year
From To Submit

2017 (1)

2016 (1)

2015 (1)