research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis to investigation of genetic diversity, and relationships among a set of clinical Aspergillus fumigatus isolates
استخدام مؤشرات ال RAPD في تشخيص التغايرات الوراثية والعلاقة بين عزلات سريرية من الرشاشيات الدخناء

Loading...
Loading...
Abstract

This study is an attempt to determine the genetic diversity and relationships among fourteen local isolate isolated from patients with Aspergillosis (Aspergillus fumigatus) by using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. Twelve universal primers used in this study produced 94 bands across fourteen isolates. Of these bands, 67 bands or 71.2% were polymorphic. The size of the amplified bands ranged between 100-2000 bp. The genetic polymorphism value of each primer was determined and ranged between 33-100%. In terms of unique banding patterns, determine the finger print for six isolates the most characteristic banding pattern was for the (AFU1, AFU2, AFU3, AFU4, AFU8 and AFU14) with primer (OP F-16 , OP I-06, OP F-16, OP X-01, OP X-01and OP A-06). Genetic distances ranged from 0.12419 to 0.64404 among A. fumigatus isolates. Cluster analyses were performed to construct a dendrogram among studied A. fumigatus isolates. The cluster analysis places most of the A.fumigatus isolates isolated from patient come from yhe same area into a close relation (subcluster) showing a high level of genetic relatedness and were distinct from isolates from another area (the other subcluster). Interestingly, a number of isolates originating from the same sources did form well defined groups, indicating association between the RAPD patterns and the geographic origin of the isolates. The information generated from this study can be used in the future for controlling of Aspergillosis programs.

في هذه الدراسة محاولة لتحديد التغايرات الوراثية والقرابة الوراثية بين 14 عزلة من الرشاشيات الخضراء معزولة من مرضى يعانون من داء الرشاشيات باستخدام مؤشرات مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا المتعدد الأشكال وقد استخدم 12 بادئ في هذه الدراسة وانتجت 94 حزمة رئيسية للعزلات الأربعة عشر من هذه الحزم 67 حزمة متباينة ويترواح الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة بين 100-2000 زوج قاعدي قيمة التغايرات الوراثية تراوحت بين 33-100% نمط الحزمة الفريدة استخدم لتحديد بصمة الدنا وفي دراستنا استطعنا تحديد البصمة لستة عزلات والتي تحمل الرمز AFU1,AFU2,AFU3, FU4,AFU8 and AFU14)) وكانت البادئات التي أعطت الأكثر تمييزا هي OP I-06, OP F-16, OP X-01, OP X-01and OP A-06) (OP F-16, . البعد الوراثي تراوح بين 0.12419 - 0.64404 بين عزلات الرشاشيات الدخناء المدروسة وقد تجمعت العزلات الأربعة عشر في المخطط الشجري في ثلاث مجموعات رئيسة،ضمت المجموعة الاولى اعتمادا على مكان سكن المريض الذي تم عزل الفطر منه وقد تجمت العزلات المعزولة من مرضى من مناطق متقارب في مجموعات متقاربة ، المعلومات التي حصلنا عليها في دراستنا ممكن أن تستخدم في السيطرة على المرض .

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2014 (1)