research centers


Search results: Found 7

Listing 1 - 7 of 7
Sort by

Article
Molecular Detection of Some β-lactamases Genes in Uropathogenic Escherichia coli
التحري الجزيئي عن مورثات البيتالاكتاميز في الممرضة البولية ايشريكيا القولون

Authors: Ali H. Hammadi علي حسون حمادي --- Najlaa N. Yaseen نجلاء نبهان ياسين --- Harith J. F. Al-Mathkhury حارث جبار فهد المذخوري
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 3A Pages: 1925-1931
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Around fifty Escherichia coli isolates were isolated from sixty midstream urine specimens collected from patients visiting hospitals in Baghdad city. Approximately, 52% of all isolates were identified as extended spectrum beta lactamases (ESBL) producer. Results demonstrated that 92% of these isolates were sensitive to carbapenems. Only four β-lactamase coding genes were detected; blaTEM, blaPER, blaVIM and blaCTX-M-2. As a conclusion, this work revealed that local E. coli isolates harboured ESBL coding genes which may contribute in its pathogenicity.

عزلت خمسون عزلة من الايشريكية القولونية من ستين عينة ادرار وسط المجرى جمعت من مرضى يزورون مستشفيات مدينة بغداد. شخص ما نسبته 52% من العزلات على انها منتجة لانزيمات بيتا- لاكتاميز موسعة الطيف. كما اظهرت النتائج ان 92% من هذه العزلات كان حساسا لمضادات الكاربابينيمات. تم التعرف على اربعة مورثات من مورثات البيتالاكتاميز و هي blaTEM و blaPER و blaVIM و blaCTX-M-2. و يمكن ان نخلص الى ان عزلات الايشريكية القولونية المحلية تحمل جينات البيتالاكتاميز موسعة الطيف.


Article
PHENOTYPIC & MOLECULAR CHARACTERIZATION OF AMPC Β-LACTAMASES AMONG ESCHERICHIA COLI, KLEBSIELLA SPP. & ENTEROBACTER SPP. ISOLATED FROM AL-HUSSEIN TEACHING HOSPITAL IN THI-QAR GOVERNORATE
الصفات المظهرية والجزيئية لإنزيمات اﻟﺑﻳﺗﺎﻻﻛﺗـــﺎﻣﻳز ﻣـــن ﻧـــوع AmpC في جراثيم الاشرشيا القولونية والكلبسيلا والانتيروباكتر والمعزولة من مستشفى الحسين التعليمي في محافظة ذي قار

Authors: Hakeem Ghani Hassan حكيم غني حسن --- Falah Salim Manhal فلاح سالم منهل
Journal: AL-TAQANI مجلة التقني ISSN: 1818653X Year: 2015 Volume: 28 Issue: 2 Pages: E20-E32
Publisher: Foundation of technical education هيئة التعليم التقني

Loading...
Loading...
Abstract

In this study,101 Escherichia coli, Klebsiella spp. and Enterobacter spp. isolated from clinical and hospital environment specimens of Al-Hussein Teaching Hospital in Dhi-Qar governorate, were analyzed for AmpC B-lactamase using phenotyping methods and polymerase chain reaction(PCR). The purpose of this study was to detect and characterize AmpC β-lactamases in these isolates were not study in Al-Hussein Teaching Hospital by another researchers. AmpC β-Lactamase was initially detected by phenotyping methods. Out of 101 of isolates, 80 (79.2%) were β-lactam resistant, 32 (31.6 %) isolates were deemed resistant and intermediate to cefoxitin were suspected as AmpC producer, 23 (22.7 %) of isolate were identified as AmpC β- lactamase producer, whereas, 5 (4.9 %) isolates were identified as inducible AmpC β- lactamase . Plasmid mediated AmpC genes were detected by conventional PCR. Only 11 (10.9 %) of Escherichia coli, 2 (1.9 %) of Klebsiella spp. and 5 (4.9 %) of Enterobacter spp. gave positive results with AmpC gene. Results of antibiotic susceptibility revealed that AmpC carrying isolates had high resistance to Cefotaxime, Aztreonam, Amoxiclave, Carbencillin, Pipercilin, Nalidixic acid, Ampicillin, Cotrimethoxazole, Ciprofloxacin and Levofloxacin. The study also revealed that Norfloxacin, Amikacin, Ciprofloxacin and Levofloxacin was found to be effective against 100% of the AmpC harboring Enterobacter spp. Additionally, Imipenem and Meropenem were found to be effective against 60% of the AmpC harboring E. coli, 50% of Klebsiella spp. and 80% of Enterobacter spp.

تضمنت هذه الدراسة101 عزله لبكترياEscherichia coli Klebsiella spp. وال Enterobacter spp. تم عزلها من مرضى وبيئة مستشفى الحسين التعليمي في محافظة ذي قار وتم الكشف عن AmpC β - Lactamase بالطرق المظهريه وال conventional PCR .الهدف من هذه الدراسة هو الكشف ودراسة خصائص جينات AmpC β –Lactamase في هذه العزلات والتي لم تدرس سابقا من قبل الباحثين من محافظة ذي قار في مستشفى الحسين التعليمي.أبتداءا تم الكشف عن AmpC β -Lactamaseبالطرق المظهريه وظهر من مجموع 101 عزله ان هنالك(79.2%) 80 من تلك العزلات تبدي مقاومه للبيتالاكتاميز وأن 32 (31.6 %) من تلك العزلات نكون مقاومه ومتوسطة المقاومه لل cefoxitin وان هناك 23 (22.7 %) من تلك العزلات هي منتجه للAmpC B - lactamase كذلك أظهرت النتائج بأنه هنالك 5 (4.9 %) هي Inducible AmpC β- lactamase .تم الكشف عن المتوسط البلازمي لجينات AmpC في العزلات المشتبه بها باستخدام conventional PCR ووجد ان هناك11 (10.9 %) من عزلات Escherichia coli و 2 (1.9 %) من عزلات Klebsiella spp.و5 (4.9 %) من عزلات Enterobacter spp. تمتلك AmpC B-lactamase.تم اختبار حساسية جميع العزلات الحامله AmpC genesتجاه المضادات الحياتيه وأظهرت هذه الدراسة مقاومه عاليه من قبل العزلات التي تمتلك AmpC B-lactamase باتجاه كل من Cefotaxime Aztreonam , Amoxiclave , Carbencillin , Pipercilin , Nalidixic acid Ampicillin , Cotrimethoxazole , Ciprofloxacin وال Levofloxacin. كذلك اظهرت هذه الدراسة فعاليه عاليه من المضادات , Norfloxacin Amikacin, Ciprofloxacin وال Levofloxacinضد عزلات Enterobacter spp والمضادات, Imipenem Meropenem ضد العزلا ت Escherichia coli Klebsiella spp., وال Enterobacter spp .


Article
Detection of Genes Encoding of Extended-Spectrum and AmpC β-Lactamases in Klebsiella pneumoniae Isolates from Clinical Specimens

Authors: Kifah A. Jasem --- Hula Y. Fadhil --- Ghusoon A. Abdulhasan
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2015 Volume: 18 Issue: 2 Pages: 125-132
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Klebsiella pneumoniae is an important pathogen of nosocomial infections and has rapidly become the most common producing beta lactamases that resistance for many antimicrobial agents. Thus, our study aimed to identify K. pneumoniae isolates harboring SHV, TEM, CTX-M and AmpC β-lactamase genes and the relation between them and with some antimicrobial resistance to avoid treatment failure. Sensitivity disc test and PCR technique were done on 24 clinical isolates of K. pneumoniae. The PCR results showed that blaSHV, blaTEM, blaCTX-M and blaAmpC genes were present in 91.67% of the isolates. Significance appearance of resistance genes was 75% for each blaSHV and blaCTX-M, 62.5% for blaTEM, while blaAmpC in 16.7%. Finding pointed out that blaAmpC gene present with highly significant in bacterial isolates which lacking the blaSHV and blaCTX-M. Moreover, blaSHV and blaTEM occurred on significant correlation with blaCTX-M. Antimicrobial discs (CTX, CDZ, CRO and CL) correlating with resistance genes (blaCTX-M, blaSHV and blaTEM). Remarkably, 41.67% of bacterial isolates have three of cephalosporine β-lactamase genes due to the common used of cephalosporine third generation for treatment.

تعتبر بكتريا Klebsiella pneumoniae من الممرضات السريرية المهمة لتسببها بالعديد من الالتهابات وسرعان ما اصبحت الاكثر شيوعا في انتاج انزيمات البيتا لاكتاميز المقاومة للعديد من المضادات الحيوية. لذلك هدفت هذه الدراسة الى الكشف عن عزلات K. pneumoniae الحاملة لجينات مقاومة بيتا لاكتاميز SHV و TEM و CTX-M و AmpC وعلاقة هذه الجينات مع بعضها ومع المقاومة لبعض المضادات الحيوية لتجنب فشل العلاج.اختبار الحساسية بواسطة اقراص المضادات الحيوية وتقنية تفاعل سلسلة البلمرة PCR قد استخدمت على 24 عزلة من K. pneumoniae. اظهرت نتائج PCR ان جينات المقاومة blaSHV و blaTEM و blaCTX-M و blaAmpC موجودة بنسبة 91.67% من العزلات. اظهرت النتائج ان75% من جينات المقاومة عائدة لجيناتblaSHV و blaCTX-M و62.5% لجين blaTEM بينماblaAmpC 16.7%. لوحظ ان جين blaAmpC موجود في العزلات التي تفتقر لجينات blaSHV و blaCTX-M اضافة الى وجود ارتباط كبير بين جينات blaSHV و blaTEM مع جين blaCTX-M, كما ان اقراص المضادات الحيويةCTX, CDZ, CRO and CL)) اظهرت ارتباط مع جينات المقاومة (blaCTX-M, blaSHV, blaTEM). من اللافت للنظر ان 41.67% من العزلات كانت حاملة لثلاتة من جينات البيتا لاكتاميز المقاومة للسيفالوسبورين نتيجة للاستخدام الشائع للجيل الثالث من السيفالوسبورين.


Article
Study of Efficiency Some of Antibiotics from different originates on S.aureus bacteria that is isolated from different clinical origins
دراسة كفاءة بعض المضادات الحيوية ذات المناشئ المختلفة على بكترياaureus S. المعزولة من مصادر سريرية مختلفة

Author: Layla A. Khazaal1 , Najdat B. Mahdi2 ليلى عاصي خزعل1 ، نجدت بهجت مهدي2
Journal: kirkuk university journal for scientific studies مجلة جامعة كركوك - الدراسات العلمية ISSN: 19920849 / 26166801 Year: 2015 Volume: 10 Issue: 4 Pages: 26-43
Publisher: Kirkuk University جامعة كركوك

Loading...
Loading...
Abstract

S.aureus bacteria is considered one of the most important types of human diseases . It causes many types of diseases like , Inflammation of the skin and acute infection in different organs of the body . The pathogenesis of this bacteria comes from factors of intensity that it own , and it helps to cause the injury . The study included the collection (278) included the same clinical samples of urinary tract infections and swabs of wounds and burns, and blood samples and swabs from ear from Kirkuk General Hospital and Tuz . General hospital in period from April until October 2013. Total diagnosed 30 clinical isolation form Staphylococcus aureus bacteria . They are distributed as : 7 isolates (Urinary tract infection) From 100 isolation ,as ratio 7%, 5 isolates ( Wound infections) form 60 isolation , as ratio 8.3% , 8 isolates (burns infections) form 40 isolation ,as ratio 1.20% , 3 isolates ( ear infections ) form 25 isolation ,as ratio 12%, 7 isolates (blood sampling )from 53 isolation , as ratio 13.2%, confirmed diagnosis using the API Staph system. The study included examination of sensitivity using discs toward the 15 antibiotic and the results were : Anti Chloramphenicol was the more influence on S.aureus bacteria , All isolates were Sensitive to it,100% ratio. And were resistant high to Anti Ampicillin to 100% ratio . Sensitivity isolates had been tested toward 5 antibiotics (Amoxicillin ,Augmantine,Cefotaxime, Tetracyclin , Ciprofloxacin) , concentrations of certain and several different origins, The results showed that Emirates originate has more efficient than the rest of other origins , The isolates showed resistant lesses to these the originate, while Iraqi originate has more efficient toward Anti Tetracyclin , the results showed that (27) isolation have to produce enzymes Beta-Lactamase from the total (30) isolation rate (90%),to detect broad-spectrum Beta-Lactamase enzymes and the results showed that there are (12) isolation of the total (27) is positive for examination rate (44.44%) .

تعد بكتريا Staphylococcus aureus من أهم الأنواع المرضية للإنسان إذ أنها تسبب العديد من الأمراض ما بين الالتهاب الجلدي إلى الخمج الحاد في الأجهزة المختلفة من الجسم ، إن إمراضية هذه البكتريا تأتي من عوامل الضراوة التي تمتلكها والتي تساعدها على إحداث الإصابة ، شملت الدراسة جمع 278عينة سريرية تضمنت نماذج من اخماج المجاري البولية ومسحات الجروح والحروق وعينات الدم ومسحات الاذن من مستشفى كركوك العام ومستشفى طوز العام وللفترة من شهر نيسان ولغاية شهر تشرين الأول 2013 . شخصت 30عزلة من بكتريا Staphylococcus aureus توزعت على7 عزلات من أخماج المجاري البولية من مجموع 100 عزلة بنسبة 7% و5 عزلات من اخماج الجروح من مجموع 60 عزلة بنسبة 8.3% و8 عزلات من اخماج الحروق من مجموع 40 عزلة بنسبة 20 % و 3 عزلات من اخماج الاذن من مجموع 25 عزلة بنسبة 12% و 7 عزلات من عينات الدم من مجموع 53 عزلة بنسبة 13.2 %، وأكد التشخيص باستخدام نظام API staph . تم دراسة فحص الحساسية باستخدام الأقراص تجاه 15مضاداً حيويا وكان مضاد Chloramphenicolهوالأكثر تأثيراً على بكتريا S.aureus إذ كانت جميع العزلات حساسة له بنسبة 100% اما اعلى مقاومة فكان لمضاد Ampicillin بنسبة 100% ، اختبرت حساسية العزلات تجاه 5 مضادات حيويةAmoxicillin, Augmantine, Cefotaxime, Ciprofloxacin, Tetracyclin) ) بتراكيز معينة ومن مناشئ مختلفة ، وقد تبين من النتائج أن المنشأ الاماراتي هو الأكثر كفاءةً من بقية المناشئ الاخرى حيث أظهرت العزلات اقل نسبة مقاومة لهذا المنشا، اما بالنسبة لمضاد Tetracyclin فكان المنشأ العراقي هو الأكثر كفاءة ، أظهرت النتائج قابلية 27 عزلة على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز من مجموع 30 عزلة بنسـبة 90% ، تم الكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف وقد اظهرت النتائج أن 12 عزلة من مجموع 27 موجبة للفحص بنسبة 44.44% .


Article
Evaluation of multi drug resistance among extended spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli causing urinary tract infection in Erbil City
تقييم المقاومة المتعددة للأدوية بين الإشريكية القولونية الممتدة المنتجة للطيف والمنتجة للكتاماز والتي تسبب عدوى المسالك البولية في مدينة أربيل

Authors: Sayran Hamad Haji --- Safaa Toma Aka
Journal: Zanco Journal of Medical Sciences مجلة زانكو للعلوم الطبية ISSN: 19955588/19955596 Year: 2015 Volume: 19 Issue: 2 Pages: 998-1004
Publisher: Hawler Medical Univeristy جامعة هولير الطبية

Loading...
Loading...
Abstract

Background and objective: Bacterial resistant to broad spectrum β-lactams, which is mediated by the extended spectrum beta lactamase enzyme, has emerged recently as increasing problem. Extended spectrum beta lactamase producing strains can also displaying multi-drug resistance. Thus, increased number of infections due to these strains is a public health issue associated with high morbidity, mortality, high health-care costs and prolonged hospitalization. Therefore, this study aimed to evaluate multi-drug resistance among extended spectrum beta lactamase producing E. coli causing urinary tract infections. Methods: A total of 400 mid-stream urine specimens were collected from patients with urinary tract infection. Disk diffusion agar method on Muller-Hinton agar plates was carried out. Double Disc Synergy Test was used for detection of extended spectrum beta lactamase producer. All the isolates that were screened out for extended spectrum beta lactamase production were also subjected to confirmation by using the Phenotypic Confirmatory Combination Disc Diffusion Test.Results: The urinary tract infection cases were mainly due to Gram negative bacteria (87%). E. coli was isolated from 195 (48%) specimens. Sixty isolates of E. coli (31%) were found to be extended spectrum beta lactamase producers. The resistance to antibiotics tested was significantly higher (P <0.001) among extended spectrum beta lactamase producing isolates. Conclusion: The prevalence of multi-drug resistance to the antibiotics among extended spectrum beta lactamase producing E. coli isolates was established. Imipenems are recommended for the treatment of serious infections caused by these organisms.


Article
Bacteriological and Genetic study of some genus for bacterial gram-negative resistant to β-lactam , isolated from urinary tract infections
دراسة بكتريولوجية وجزيئية لبعض الاجناس البكتيرية السالبة لملون غرام المقاومة لمضادات البيتالاكتام والمعزولة من اخماج المجاري البولية

Loading...
Loading...
Abstract

This study included collection 300 samples from patients suffering from urinary tract infection from Baaquba Teaching Hospital and Al –Batool Hospital in Baaquba city for the period from 1/09/2013 to 1/01/2014.The results refer that 66 isolates are belonging to bacteria of Gram negative (57.4%), 25 (37.78 %) Escherichia coli , 22(33.33%) Proteus mirabilis ,by using diagnostic phenotypic ,biochemical tests and confirm the diagnosis using regular API20E.The production of -lactamase by Eschrichia coli and Proteus mirabilis was (60%) , (40.9%) respectively, also the isolated had the ability to produce the Extendended spectrum β-Lactamase enzyme by using disc Approximation ,The production from each ofEschrichia coli and Proteus mirabilis (12%), (31.8 %)respectively.The results of Metalloβ-Lactamase by using the Imp-EDTA combination inducted that E.coli and P.mirabilis were (12%) and (13.6%) respectively.The results of molecular detection of ESBL genes (bla TEM and bla SHV) by using PCR technique ,(9) samples from (10) total , divided into 3(100%) E.coli and 6(85.7%) P.mirabilis were harboring bla TEM gene based on the presence of 950 bp bands in 1% agarose gel. while results detect that the isolates of Escherichia coli and Proteus mirabilis not harboring bla SHV gene.

شملت الدراسة 300عينة ادرار جمعت من المرضى المصابين باخماج المجاري البولية من اجناس واعمار مختلفة وتم جمع العينات من مستشفى البتول للولادة والاطفال ومستشفى بعقوبة التعليمي، للمدة بين 2013/9/1 ولغاية 1/1/2014. أظهرت نتائج الزرع البكتيري على أوساط أكار الماكونكي وأكار الدم ووسط المثيلين الازرق والتشخيص المظهري والفحوصات الكيموحيوية وتأكيد التشخيص باستخدام نظام api 20E أن (66) عزلة سالبة لصبغة كرام وبنسبة (%57.4) من مجموع العينات البالغة 115عينة موجبة للنمو المايكروبي ومن هذه العينات المرضية تم تشخيص (25) عزلة تعود لبكتريا Escherichia coli وبنسبة(37.87%)، و(22)عزلة تعود لبكتريا Proteus mirabilis بنسبة (33.33 %). أما بخصوص إنتاج أنزيم البيتالاكتاميز فقد أظهرت كل من Escherichia coli و Proteus mirabilis نسب إنتاج (0%6) , (40.9%) على التوالي. كما أختبرت قابلية العزلات على إنتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف بأستخدام طريقة الاقراص المتاخمة ( Disc Approximation ) وقد أعطت كل من Escherichia coli و Proteus mirabilis نسب انتاج (12%) , (31.8%) على التوالي.فضلا عن ذلك اختبرت قابليه العزلات على إنتاج أنزيمات البيتالاكتميز المعدنية Metallo -Lactamase وباستخدام طريقة IMP-EDTA combination disc ، أعطت كلا من Escherichia coli و Proteus mirabilis نسب إنتاج (%12) , (%13,6) على التوالي. بينت نتائج التشخيص الجيني لأنزيمات ESL باستخدام تقنية PCR إن هنالك 9عزلات من أصل 10 عزلات مقسمة الى 3 عزلات E.coli وبنسبة (100%) و 6 عزلات P.mirabilis من أصل 7عزلات وبنسبة (85.7%) كانت تحوي جين bla TEM واعتمادا على ظهور حزمة بحجم 950 زوج قاعدة في هلام الاكاروز 1% ،وأن جميع العزلات كانت غيرحاوية على جين bla SHV.


Article
Pathogenicity Study of a Number of Gram- Negative Bacilli Isolated from Clinical Samples
دراسة امراضية بعض البكتريا العصوية السالبة لصبغة كرام المعزولة من بعض الحالات السريرية

Loading...
Loading...
Abstract

Fifty isolates from different clinical samples (urine and wounds) were collected from Al-Nu'man General Hospital in Baghdad city. Sampling activates were carried out from 23April to 23June 2014. The age of patient range between 40- 70 years . The Gram-negative isolates were subjected to antibiotic susceptibility, β-lactamase production (86%), biofilm formation (84%), hemolysin production (48%).The resalt appered that Escherichia coli (54%) was the most common followed by Proteus vulgaris (18%), Enterobacter aerogenes (8%), Proteus mirabilis (6%), Enterobacter cloacae (4%), Acinetobacter baumannii (4%) and (2%) for each Klebsiella oxytoca, Enterobacter gergaviae and Pseudomonas mendocina. Gram negative isolates were observed resistance (100%) for Ampicillin, Carbenicillin, Cefalothine, Cefotaxim and Meropenem. Most isolated bicteria showed less resistance to Amoxicillin / clavulanic acid and Ceftazidime, also they showed sensitivity to Imipenem.Plasmid profile analysis, Proteus vulgaris isolates showed one large plasmid only.

تم جمع 50 عينة من حالات سريرية مختلفة (شملت التهابات المجاري البولية والتهابات الجروح) من من مستشفى النعمان العام في بغداد للفترة من 23 نيسان لغاية 23 حزيران 2014 وكانت اعمار المرضى تتراوح بين 40-70 سنة ؛ وكانت جميع العزلات التي تم الحصول عليها من انواع البكتريا السالبة لصبغة كرام حيث اظهرت (54%) تعود الى بكتريا Escherichia coli تليها بكتريا (Proteus vulgaris (%18 و (Enterobacter aerogenes (%8 و (6%) Proteus mirabilis تليها كل من Enterobacter cloacae وبكتريا Acinetobacter baumannii وبنسبة (4%) لكل منهما ؛ واظهرت (2%) لكل من ,Klebsiella oxytoca و Enterobacter gergaviae و .Pseudomonas mendocina. تم الكشف عن انتاج البكتريا لانزيمات البيتالاكتاميز وبلغت (86%) ؛ وانتاج انزيمات الهيمولايسين وبلغت (48%) ؛ وقابلية البكتريا على تكون الغشاء الحيوي وبلغت (84%).

Listing 1 - 7 of 7
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (7)


Language

English (5)

Arabic (2)


Year
From To Submit

2015 (7)