research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
MOLECULAR AND MORPHOLOGIGAL CHARACTERIZATION FOR SOME CARNATIONSPECIES(Dianthusspp.).
التوصيف الجزيئي والمظهري لبعض انواع القرنفل

Author: Janan K. Hussein جَنان قاسم حسين
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2015 Volume: 46 Issue: 5 Pages: 793-801
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The study includedtwo phases, the first one was carried out at one of Baghdad nurseries on 15/9/2013 sowing the seeds of 12 species ofDianthusspp.( D.caryophyllus, D. chinensis, D. gratianopolitanus, D. barbatus, D. balbisii, D. repens, D. alpinus, D. monspessulanus, D. pavonius, D. deltoids, D. japonicas and D. seguieri)to study some of the qualities phenotypic, and the second phase was carried out atbiotechnology and tissue culture laboratories /College of Agriculture/University ofRazi/Kermanshah/Iran . TheAmplified Fragment Length Polymorphism(AFLP) based on Polymerase Chain Reaction (PCR) with seven primers was implemented. The results of the phenotypic characteristics of the species studied, and there are considerable differences between them where the variation coefficient (C.V.)was very high in all the traits and reached the top rated 85.09 for a number of branches /plant , 57.66 for the number of flowers / plant, 45.08 flower diameter, 32.51 for plant height and 28.66 dry weight of vegetative part . DNA analysis showed that the primers gave a 397 bands including 324 polymorphic bandsand 81.59% polymorphic bands, this confirms the existence of Genetic Distance between the species of Dianthus studied . High Genetic Distance 0.28% D. barbatu and D. caryophyllusand lowest Genetic Distance0.08% betweenD. chinensis and D. japonicas.

تضمنت الدراسة مرحلتين الاولى حقلية نفذت في احد مشاتل بغداد بتاريخ 013-9-152 بزراعة بذور 12نوع من القرنفلspp.Dianthus(D. caryophyllus,D. chinensis, D. gratianopolitanus, D. barbatus, D. balbisii, D. repens, D. alpinus , D. monspessulanus , D. pavonius , D. deltoids ,D. japonicasوD. seguieri)لدراسة بعض الصفات المظهرية لها, والمرحلة الثانية مختبرية نفذت في مختبرات الزراعة النسيجية والتقانات الاحيائية-كلية الزراعة-جامعة الرازي-كرمنشاه-ايران.استخدمت تقانة تبايناتاطوال القطعالمتضاعفة (AFLP)Amplified Fragment Length Polymorphism المعتمدة على تقانة PCRPolymerase Chain Reactionوبسبعة توليفات من البادئات. بينت نتائج الصفات المظهرية للأنواع المدروسة وجود اختلافات كبيرة فيمابينها حيث كان معامل التغاير(C.V.)عالي جدا في جميع الصفات المدروسةوبلغ اعلاها 85.09 لعدد الافرع الرئيسة, 57.66لعدد الازهار-نبات, 45.08قطر الزهرة , 32.51لارتفاع النبات و 28.66للوزن الجاف للمجموع الخضري. اظهر تحليل البصمة الوراثية ان توليفة البادئات السبعة المعتمدة اعطت397 حزمة كان منها 324حزمة متباينة وبنسبة تباين 81.59% وهذا يؤكد وجود تباعد وراثي بين انواع القرنفل المدروسة اذ بلغ اعلاها0.28% بين النوعين D. barbatusوD.caryophyllusفي حين اعطى النوعين D. chinensis و D. japonicas اقل نسبة للبعد الوراثي وبلغت 0.08%.


Article
Genetic Diversity of Some Tomato Lycopersicon esculentum Mill Varieties in Iraq Using Simple Sequence Repeat (SSR) Markers
التنوع الوراثي لبعض أصناف الطماطم اسكولينتوم مطحنة في العراق عن طريق بسيط تسلسل كرر (SSR) علامات

Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2015 Volume: 7 Issue: 1 Pages: 64-80
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to evaluate the genetic diversity among 19 tomato varieties (determinate and indeterminate) cultivated in Iraq using polymerase chain reaction based DNA marker (PCR based DNA markers Simple Sequence Repeats (SSRs). To achieve PCR reactions ,total genomic DNA was isolated from fresh leaves (2 weeks old). The average yields of DNA were in the range of 100-295 ng/μl with a purity ranging between 1.8-1.9.A total of 21 alleles were detected among the tested varieties using 5 SSRs loci distributed on 4 chromosomes of tomato. The molecular size of bands obtained from amplification of SSR products ranged from 121 to 247 bp. Alleles ranged from one in (Tom 8-9, Tom 41-42 and Tom 67-68 loci) to twelve in Tom 49-50 locus. The values of heterozygosity for each locus ranged between 0.63 for Tom 31-32 and 0.89 for Tom 49-50 with a mean value of 0.30. The polymorphic information content (PIC) values for the SSR loci ranged from 0.45 in Tom 31-32 to 0.58 in Tom 49-50 loci with an average of 0.21. Each one of (Tom 8-9, Tom 41-42 and Tom 67-68 loci) produce 0.0 value for both heterozygosity and PIC.The study revealed that, The lowest genetic distance was (0.3244) between varieties Kenanh (lane5) and Warda (lane10), while,the highest genetic distance was (0.9177) between varieties Helam (lane3) and Super marimond (lane 16). The genetic similarity values ranging from (0.0823 to 0.6756) depending upon the genetic distance values that ranging from (0.3244 to 0.9177), indicating the largest diversity with percentage of (32 to 91%) among the tested varieties. The analysis of the obtained results from genetic distances and Neighbor-joining dendrogram (unrooted tree) revealed that, the 19 tested tomato varieties can be grouped into two major groups: first cluster include 9 varieties distributed in two subgroups.The second major cluster include 10 varieties which in turn divided into two subgroups.

أجريت الدراسة الحالية لتقدير التنوع الوراثي ل 19 صنف من اصناف الطماطة ( المحدودة وغير المحدودة النمو) المستزرعة في العراق باستخدام مؤشرات الدنا (DNA Markers) المعتمدة على تفاعلات البلمرة المتسلسلة Polymerase Chain Reaction (PCR ) وهي التكرارات المتسلسلة البسيطة Simple Sequence Repeats (SSRs ). لتنفيذ تفاعلات ال PCR تم عزل دنا المجين (Genomic DNA) من أوراق الطماطة الفتية (بعمر أسبوعين) و الحصول على كمية من الدنا تراوحت بين 100-295 نانوغرام/مايكروليتر وبنقاوة تراوحت بين 1.8-1.9.تم الكشف عن 21 من الأليلات بين الأصناف باستعمال 5 من المواقع الوراثية ذات التتابع المتكرر البسيط (SSR) Simple Sequence Repeat والمنتشرة على اربعة من كروموسومات الطماطة. وتراوح الحجم الجزيئي للحزم الناتجة من تضاعف المواقع الوراثية للـ SSR من 121 إلى 247 زوج قاعدي. وتباين عدد الأليلات في المواقع الوراثية من أليل واحد في كل من (Tom 8-9 , Tom 41-42 ,Tom 67-68) إلى اثني عشرأليل في الموقع الوراثي ( (Tom 49-50. ووجد أن قيم التغاير الزايكوتي heterozygosity لكل موقع تراوح من0.63 في (Tom 31-32) إلى0.89 في (Tom 49-50) وبمعدل قدره 0.30. تراوحت قيم محتوى المعلومات متعددة الأشكال (PIC) polymorphic information content لكل موقع وراثي بين 0.45 في الموقع الوراثي (Tom 31-32) إلى 0.58 في الموقع الوراثي ( (Tom 49-50، وبمعدل قدره 0.21. اعطى كل من المواقع الوراثية (Tom 8-9, Tom 41-42, Tom 67-68) قيمة 00. لكل من قيم التغاير الزايكوتي و محتوى المعلومات متعددة الأشكال.توصلت الدراسة من خلال هذا المؤشر الجزيئي إلى أن أقل بعد وراثي هو(0.3244) بين الصنفين Kenanh (رقم 5) والصنف Warda (رقم 10)، بينما كان اعلى بعد وراثي هو (0.9177) بين الصنفين Helam (رقم 3) و Super marimond (رقم 16). وعلى أساس قيم البعد الوراثي تم إيجاد قيم التشابه الوراثي التي تراوحت من 0.0823 الى 0.6756، والتي تشير الى التنوع الكبير الذي نسبته (32 إلى 91%) بين الأصناف المدروسة. اظهر تحليل النتائج التي تم الحصول عليها من البعد الوراثي وشجرة العلاقة الوراثية Neighbor-joining dendrogram إلى أن كل الأصناف المدروسة توزعت إلى مجموعتين رئيسيتين: المجموعة الاولى ضمت 9 أصناف وقسمت هذه بدورها الى مجموعتين فرعيتين اما المجموعة الرئيسية الثانية فتضمنت 10 أصناف قسمت بدورها الي مجموعتين فرعيتين. أظهر التحليل العام للنتائج أن العلاقات الوراثية بين أصناف الطماطة لا علاقة لها بالصفات المظهرية و المنشأ الأصلي

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (1)

English (1)


Year
From To Submit

2015 (2)