research centers


Search results: Found 4

Listing 1 - 4 of 4
Sort by

Article
Genetic Polymorphisms of Interleukin -1 beta Gene in Association with Multiple Sclerosis in Iraqi Patients
تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة لجين إنترلوكين-1بيتا وعلاقته بالتصلب العصبي اللويحي المتعدد لدى المرضى العراقيين

Author: Ehab D. Salman إيهاب داود سلمان
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 1C Pages: 594-598
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Interleukin-1 β (IL-1 β) is considered to be one of the most important mediators in the pathogenesis of inflammatory diseases, particularly in neurodegenerative diseases such as multiple sclerosis (MS). MS is a chronic inflammatory disease characterized with demyelination in central nervous system (CNS). There was believe that single nucleotide polymorphisms (SNPs) in IL-1β gene can alter the structure and function of the IL-1β and consequently may have play role in MS disease. In this this study the IL-1β gene polymorphism (rs16944, rs1143634) and their association with MS in Iraqi patients were investigated. Two SNPs including IL-1β-511 (rs16944) in promoter and IL-1B+3962 (rs1143634) in encoding region, were studied using Polymerase Chain Reaction- Sequence Specific Primer (PCR-SSP) technique. The results revealed that IL-1β-511 SNP has three genotypes (CC,CT, TT) with non- significant difference in the SNP genotype and allele frequencies of MS patients compare with control group, it was also noticed that the risk allele was (C) with relative risk (RR=1.55) and higher frequency (60.77%) than T (39.23%) allele in RRMS patients. On other hand the three genotypes (CC,CT, TT) of IL-1B+3962 SNP it seem to have the same picture, that mean there was no significant difference in their frequencies between RRMS patients and control group , and the highest genotype frequency was for (CC) genotype (68.92%) and the lowest frequency was for( TT) genotype (2.88%) in patients, it was also noticed that the risk allele was (C) with odd ratio (2.44) and that the (T) frequencies were (16.98%vs. 33.33%) while (C) frequencies were (83.02 vs. 66.67%) in patients and control group respectively. Concerning with these findings, one can suggest that interleukin-1β gene polymorphisms may not be relevant to susceptibility to MS in Iraqi patients, this is probably due to many reasons such as ethnic diversity, the relevant of haplotype for this gene with other haplotype of cytokine encoding genes and finally the limitation of sample size which play critical role in SNPs studies.

يعتبر إنترلوكين – 1 بيتا (IL-1β) واحدا من أكثر المركبات الوسيطة ذات الأهمية والمسببة للأمراض الألتهابية خاصة الأمراض التي تصيب الجهاز العصبي مثل مرض التصلب العصبي اللويحي المتعددMultiple sclerosis والذي يعتبر من الأمراض العصبية الألتهابية المزمنة ويتميز بأزالة مادة المايلين demyelination)) من الغشاء العازل للعصبونات الجهاز العصبي المركزي . لقد لوحظ أن تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة لجين إنترلوكين – 1 بيتا قد يؤدي الى إحداث تغيرات تركيبية ووظيفية للأنترلوكين-1بيتا مما ينتج عنه تأثيرا في أحداث مرض التصلب العصبي اللويحي المتعدد , لذلك أجريت هذه الدراسة بهدف معــــرفة العـــــــلاقة بين تعدد أشكال النوكليوتيدات المــــفردة لجـــــــــــــين إنترلــــــــــوكين – 1 بيتــــــــا ومـــــــرض التصـــــــلب العصـــــبي اللويـــــحي المتـــــعدد لـــــــدى المرضى العراقيين. أختير نوعين من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة Single nucleotide polymorphisms (SNPs) للجين , النوع الأول IL-1β-511 (rs16944) واقع ضمن الحفاز بينما يقع النوع الثاني IL-1β +3962 (rs1143634) ضمن المنطقة المشفرة للجين , أستعملت تقنية التفاعــــل البلمـــرة المتسلسل ذات البادئ متخصص التتابــــــــع (PCR-SSP) لتحديد هذين النوعين من تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة للجين. أشارت النتائج للنوع الأول الى أن اليلات هذا النوع قد توزعت على ثلاث أنماط وراثية هي (CC,CT, TT) و أن التحليل الأحصائي لهذه الأنماط والنسبة المئوية لتكرار أليلاتها لم يشير الى فروقات معنوية بين مرضى التصلب العصبي اللويحي المتعدد ومجموعة السيطرة , ولوحظ أن الأليل(C) يمثل العامل النسبي المؤثر حيث بلغت قمته (RR=1.55) وكان الأكثر تكرارا (60.77 %) مقارن بأليل (T) والذي بلغت قيمته (39.23%) لدى مرضى التصلب العصبي اللويحي المتعدد, من الناحية الأخرى لوحظ أن الأنماط الوراثية للنوع الثاني قد أظهرت نفس الصورة أعلاه حيث شملت هذه الأنماط على الأنواع الثلاث (CC,CT, TT) ولم يلاحظ فرق معنوي لتكرار هذه الأنماط لمرضى التصلب العصبي اللويحي المتعدد مقارنة بمجموعة السيطرة , كذلك لوحظ أن أعلى تكرار كان للنمط (CC) وبلغت قيمته (68.92%) بينما كان النمط الوراثي (TT) أقـــل تكرارا (2.88 %) لدى مجموعة المرضى , كذلك وجد أن العامل النسبي المؤثر يرجع للأليل(C) وبنسبة أرجحية odd ratio =2.44)) وبلغت النسبة المئوية الكلية لتكراره (83.02% , 66.67%), بينما بلغت هذه النسبة للأليل (T) (33.33% , 16.98%) لكل من مجموعة المرضى والسيطرة على التوالي . على ضوء هذه النتائج يمكن القول أنه لا يوجد الى ما يشبر لعلاقة تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة لجين إنترلوكين -1 بيتا بالتصلب العصبي اللويحي المتعدد لدى المرضى العراقيين , و تفسير ذلك ربما يعود للعديد من الأسباب منها التنوع العرقي , طبيعة نمط جين إنترلوكين -1 بيتا haplotype)) وعلاقته بالأنماط الجينية المشفرة للأنواع الأخرى من الأنترلوكينات وأخيرا صغر حجم العينة التي تم دراستها والذي يعتبر من العوامل المهمة والمؤثرة في دراسات تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة للجين .


Article
The Significance of TP53 Gene Polymorphisms as A Risk Factor For Non-Hodgkin’s Lymphoma in Iraqi Patients

Authors: Maysoon Abdul-Ameer --- Ahmed Al-Salman
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2016 Volume: 13 Issue: 4 Pages: 778 -785
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Genetic factors including single nucleotide polymorphisms have been implicated as predisposing factors for large numbers of malignancies. When genetic disorders occur in a tumor suppressor gene, like TP53 gene, the results are expected to have devastating effects. The current study aimed to assess the effect of certain polymorphisms in TP53 genein the individual’s susceptibility to non- Hodgkin’s lymphomas among Iraqi patients. A total of 62 patients with these malignancies and 34 apparently healthy individuals were enrolled for this study. DNA was extracted from blood samples and fragment in TP53 corresponding for TP53 p.Arg72Pro, TP53 p.Pro47Ser and r.13494 G>A polymorphisms were amplified using specific primers. Genotyping was performed with restriction fragment length polymorphisms. The results revealed significant association of TP53 p.Arg72Pro polymorphism in both heterozygous and mutant homozygous genotypes with incidence of NHLs, while both TP53 p.Pro47Ser and r.13494 G>A polymorphisms had no such association. These results strongly indicate the importance of proline allele of TP53 p.Arg72Pro as a predisposing factor for NHLs.


Article
Effect of IL-17Single Nucleotide PolymorphismsGene on the Risk of Developing Colorectal Cancer in Iraqi Patients

Author: Haidar J. Muhammed1, Nassir N. Mohsun2,Aroub A.R. Al-Kaisi2
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 2 Pages: 51-58
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Interleukin -17 pathway plays an important role in development of inflammatory bowel diseases (IBD). Moreover it has been shown that this interleukin involved in anti-tumor or pro-tumor of colorectal cancer (CRC). This study determined (70) patients male to female (60% - % 40)inflicted with colorectal cancer,range aged (<16-80) years which were collected from Baghdad Teaching Hospitals/ Medical City.The patients detected for anti – IL17 by enzyme linked immune sorbent assay (ELISA)and compared with (10) individuals as a healthy control.The results showed significant differences (p<0.05). The gene encoding for the cytokine IL17 has genetically polymorphic, which has (30%) single nucleotide polymorphisms (SNPs) (12out of 40) patients by single strand conformation polymorphism technique (SSCP). In conclusion, polymorphic gene IL17 has been revealed to be associated with its susceptibility of colorectal cancer by showing there was a relationship between polymorphic gene IL17and the occurrence of colorectal cancer as well as the clinical features of the disease especially in agedpatients.


Article
The Impact of Genetic Variants in IL-10 and IL-12p40 on the Susceptibility to Non Hodgkin Lymphoma
تأثير التغايرات الوراثية في جيني IL-10 و IL-12p40 على الاستعداد للإصابة بالاورام اللمفاوية اللاهودجكينية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Non-Hodgkin lymphomas (NHLs) are a diverse group of mature lymphoid neoplasms with a wide range of cellular and histological presentations. Numerous environmental and genetic factors affect the incidence of these neoplasms; however the exact causes are beyond the current knowledge. Objective: to investigate the association of genetic polymorphisms in two single nucleotide polymorphisms, which are IL-10-1082A/G and IL-12p401188A/ C, with the incidence NHLs among Iraqi patients.Materials and Methods: Whole blood samples were collected from 55 confirmed patients with NHLs and from 40 family-unrelated, age-matched apparently healthy individuals to represent the control group. DNA was extracted from blood samples and allele specific polymerase chain reaction (AS-PCR) technique was used for genotyping of the two SNPs using specific primers. Results: The SNP IL-10-1082A/G appeared in three genotypes: AA, AG and GG which represented 36.36%, 45.45% and 18.18%% respectively in NHL patients compared to 32.5%, 35% and 32.5%% respectively with insignificant neither between genotypes nor alleles. Similarly, the SNP IL-12p401188A/C had three genotypes which were AA, AC and CC. These genotypes represented 32.73%, 38.18% and 29.09% respectively among NHL patients and 52.5%, 37.5% and 10% respectively among controls with significant difference for the homozygous mutant genotype (OR=4.667, 95%CI=1.319-16.512, P=0.017).Conclusion: IL-10-1082A/G polymorphism has no effect on the incidence of NHLs, while allele C of the SNP IL-12p401188A/C could be considered as a risk factor for these neoplasms.

خلفية الدراسة: الاورام اللمفاوية اللاهوجكينية هي مجموعة متباينة من اورام الخلايا اللمفاوية الناضجة والتي تتجلى بمدى واسع من المظاهر النسيجية والخلوية. لقد وجد ان هناك العديد من العوامل البيئية والوراثية التي تقترن مع حدوث هذه الاورام ، ومع ذلك فان الاسباب الدقيقة لهذه الاورام لا زالت غير معروفة. اهداف الدراسة: استقصاء وجود ارتباط بين التغايرات الجينية في موقعين جينيين هماIL-10-1082A/G و IL-12P40 1188A/C مع حدوث الاورام اللمفاوية اللاهوجكينية في المرضى العراقيين.المواد والطرائق : جمعت عينات دم كامل من 55 مريضا بالاورام اللمفاوية اللاهوجكينية اضافة الى 40 شخصا سليما ظاهريا ممن ينتمون الى عوائل مختلفة ولهم اعمار مقاربة لأعمار المرضى ليمثلوا مجموعة السيطرة. استخلص الحامض النووي DNA من عينات الدم باستخدام عدة جاهزة ،واستخدمت طريقة تفاعل سلسلة البلمرة للأليل الخاص Allele specific-PCR لغرض التنميط الجيني.النتائج: ظهر التغاير الجيني IL-10-1082A/G بثلاث انماط جينية وهي AA وAG و GG والتي مثلت على التوالي 36.36% و 45.45% و 18.18% في مجموعة المرضى و 32.5% و 35% و 32.5% في مجموعة السيطرة ، الا ان الفرق لم يكن معنويا سواء على مستوى النمط الجيني اوعلى مستوى الأليل. وعلى غرار ذلك ظهرالتغاير الجيني IL-12p40 1188A/C بثلاث انماط جينية هي AA و AC و CC والتي مثلت على التوالي 32.73% و 38.18% و 29.9% في مجموعة المرضى و 52.5% و 37.5% و 10% في مجموعة السيطرة وبفرق معنوي بالنسبة للنمط الجيني الطافر متماثل الزيجة(نسبة الارجحية =4.667 , فترة ثقة 95%=1.319-16.512 , احتمالية =0.017). وعلى مستوى الأليل فقد كان تكرار الأليل الطافر (C) في مجموعة المرضى(48.18%) اعلى من مجموعة السيطرة (28.75%) وبفرق معنوي عالي (نسبة الارجحية = 2.304 , فترة ثقة 95% = 1.25-4.249 , احتمالية = 0.007).الاستنتاجات: ليس للتغاير الجيني IL-10-1082A/G تأثيرا مهما على حدوث الاورام اللمفاوية اللاهوكجينية ولا على المستويات المصلية للسايتوكين IL-10 في حين ان الأليل C للتغاير IL-12p40 118A/C يمكن ان يعد عامل خطورة للاصابة بهذه الاورام.

Listing 1 - 4 of 4
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (4)


Language

English (3)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2016 (4)