research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
تحديد الانواع الوراثية [P] و G لفيروس روتا الانسان في اطفال محافظة بابل باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل التقليدي conventional – PCR

Authors: يونس عبد الرضا --- حوراء جواد كاظم
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2017 Volume: 25 Issue: 1 Pages: 81-88
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Rapid test device technique and conventional - PCR technique was used in this study for detection of rotavirus genotypes in stool samples which were collected from children who were living in different area of Babylon governorate with symptoms of acute gastroenteritis such as diarrhoea , fever and vomition for the period from October 2011 to March of 2012 , Their age range from 0 – 60 months , 470 diarrhoea stools sample from children was tested by using rapid stripe , then 80 sample which gave positive result by rapid test device were used to know G and [P] type by using specific G and [P] primer .After extraction of viral RNA and its convertion to cDNA . The results detected that the prevalent G – genotypes was G1 , G4 , G2 and G8 respectively , whereas P[8] , P[4] and P[6] was the most dispersal P – genotypes .

استعملت في هذه الدراسة تقنية الشريط السريع و تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل المعكوس التقليدي (conventional reverse transcriptase – PCR) بغية معرفة الأنواع الوراثية لفيروس الروتا في عينات براز أخذت من أطفال مخمجين من مناطق متفرقة في محافظة بابل , أظهروا بعض الأعراض المُميزة لالتهاب المعدة والأمعاء الحاد مثل الإسهال والحمى والتقيؤ للمدة من تشرين الأول و تشرين الثاني و كانون الأول من العام 2011 وكانون الثاني و شباط و آذار من العام 2012 , تراوحت أعمارهم من 0- 60 شهراً, إذ اختبر 470انموذجا من عينات براز الاطفال باستعمال الشريط السريع , وبعدها اخذ 80 نموذجا اعطى نتيجة موجبة باستعمال الشريط السريع لمعرفة الانواع الوراثية السائدة وباستعمال بوادئ خاصة Specific primers للأنواع الوراثية P]] و G وبعد استخلاص الحامض النووي الريبي RNA لفيروس الروتا من النماذج وتحويله إلى الدنا المتمم complementary DNA وجد أن أكثر الأنواع الوراثية المشخصة من النوع G انتشاراً في المحافظة هي G1 و G4 و G2 و G8 , بينما لوحظ أن الأنواع P[8] و P[4] و P[6] هي الأكثر انتشاراً بالنسبة للنوع الوراثي P]] .


Article
Molecular detection of Rotavirus type A in diarrheic calves of Mid-Euphrates governorates Iraq
في عينات براز عجول مصابة بالإسهال في محافظات حوض A الكشف الجزيئي عن فايروس الروتا نوع الفرات الأوسط العراق

Authors: Hamed Abbas Hassan حامد عباس حسن --- Qassim Haleem Kshash قاسم حليم كشاش
Journal: The Iraqi Journal of Veterinary Medicine المجلة الطبية البيطرية العراقية ISSN: 16095693 Year: 2017 Volume: 41 Issue: 2 Pages: 48-53
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Four hundred fecal samples from diarrheic calves of both sexes (1-60 days old) from four Iraqi Mid-Euphrates governorates (Babylon, Al-Najaf, Karbala and Al-Qadissiyiah) were collected to investigate rotavirus type A infection by using Real-Time Polymerase Chain Reaction technique. The results showed that infection rates were (14%), while the high rate (20%) was found in age of (1-30 days), however non-significant values were related to animal gender. Moreover, a high infection was recorded at January (29.5%) and the rotraviral infection was recorded in four provinces but the higher was in Babylon (23%). The clinical examination of infected calves showed voluminous watery diarrhea, profound weakness and mild depression; the body temperature, respiration and heart rates were decreased significantly and appetite was changeable towards loss or anorectic

تضمنت الدراسة فحص أربعمئة عينة براز جمعت من عجول مصابة بالإسهال تراوحت أعمارها مابين (1-60 يوم) من أربع محافظات من الفرات الأوسط في العراق وهي (بابل، النجف، كربلاء، القادسية) خلال مدة سبعة أشهر (تشرين ثاني 2013-نيسان 2014) باستعمال تقنية تفاعل انزيم البلمرة المتسلسل الفائق السرعة للتحري عن فايروس الروتا البقري نوع A. أظهرت النتائج إن نسبة الخمج المئوية كانت (14%) وقد سجلت أعلى نسبة إصابة (20%) في العجول بعمر (1-30 يوم) ولم يظهر للجنس أي تأثير على نسبة الإصابة والتي سجلت بأعلى مستوياتها في شهر كانون الثاني (29.5%) وكانت الإصابة بالعجول في محافظة بابل هي الأعلى (23%). أما الفحص ألسريري للعجول المصابة بفيروس الروتا البقري نوع A حيث أظهر علامات تتضمن الإسهال المائي مع الضعف والنحول مع درجات متوسطة الشدة من الخمول، في حين كانت معدلات درجات الحرارة، التنفس، النبض منخفضة معنوياً أما شهية العجول متغيرة من قلة الشهية إلى انعدامها


Article
The differences in sensitivity and specificity between three different kits for the detection Rotavirus
الفروقات في الحساسية والخصوصية بين ثلاث مجموعات كشف عن الفَيروسَات العَجَلِيَّة (الروتا)

Loading...
Loading...
Abstract

Rotavirus is the common key etiologic agents of attained diarrhea in infant, young children and neonatal calves globally. It is very important to early diagnose the disease in purpose of effective patient treatment. This study was conducted by using three different kits for detecting Rotavirus in calves in five Iraqi governorates (Al-qadissiya, Babel, Kerbala, Missan, Wassit). A total of 125 stool specimens were examined, they were collected from calves in the (period from November 2015 to February 2016). The ages ranged from 1 to 16 weeks. Stool samples were collected and examined using Chromatographic Immunoassay, enzyme-linked immunosorbent assay and Polymerase-chain reaction. The results obtained by chromatographic immunoassay were 44% positive, ELISA 42% positive, and 38% Polymerase-chain reaction positive. Chromatographic immunoassay was easy, simple, economic, and rapid and showed high sensitivity with accepted specificity while ELISA permit quantitative estimation of Rotavirus antigens. These results indicate that ELISA is as sensitive and specific assay as the chromatographic immunoassay, and it could be applied on a large scale for screening stool specimens in suspected rotavirus diarrhea. Conventional Polymerase-chain reaction demonstrated more sensitivity and highest specificity.

الفَيروسَات العَجَلِيَّة (الروتا) هي إحدى العوامل الرئيسة الأكثر شيوعاً المسببة للإسهال في الرضع والأطفال الصغار والعجول حديثي الولادة على مستوى العالم. من المهم جداً تشخيص المرض مبكراً لغرض علاج المرضى المصابين بشكل فعّال. لقد أجريت هذه الدراسة باستعمال ثلاث طرائق مختلفة للكشف عن فيروس الروتا في خمسة محافظات عراقية (القادسية، بابل، كربلاء، ميسان، واسط). جُمع و فُحِصَ ما مجموعه 125 عينة من براز عجول تراوحت أعمارها ما بين 1 أسبوع إلى 16 أسبوع في المدة من تشرين الثاني 2015 إلى شباط 2016، باستعمال المُقايَسَةٌ المَناعِيَّة الكروماتوغرافيّة ومُقَايَسَةُ المُمْتَزِّ المَناعِيِّ المُرْتَبِطِ بالإِنْزِيْم )الألايزا) واختبار تَفاعُلٌ البلمرة التسِلْسِلِيّ. كانت النتائج التي حُصلَ عليها باستعمال المُقايَسَةٌ المَناعِيَّة الكروماتوغرافيّة44% ومُقَايَسَةُ المُمْتَزِّ المَناعِيِّ المُرْتَبِطِ بالإِنْزِيْم 42% وتَفاعُلٌ البلمرة التسِلْسِلِيّ 38%حيث كانت الأولى سهلة، بسيطة وسريعة وأظهرت حساسية عالية مع خصوصية مقبولة في حين سمحت مُقَايَسَةُ المُمْتَزِّ المَناعِيِّ المُرْتَبِطِ بالإِنْزِيْم بتقدير كمي لمستضدات الفيروس العجلي بينما أظهر اختبار تَفاعُلٌ البلمرة التسِلْسِلِيّ حساسية أكثر وخصوصية عالية جداً. وتشير هذه النتائج إلى أن الالايزا حساس ومحدد مثل المُقايَسَةٌ المَناعِيَّة الكروماتوغرافيّة، وأنه يمكن تطبيقهما على نطاق واسع لفحص عينات البراز في الحالات التي يشتبه اصابتها بالإسهال الناجم عن الفَيروسَةُ العَجَلِيَّة. وكانت الفحوصات الثلاثة موثوقة عموما للكشف عن فيروس الروتا، وبالتالي، يمكن تطبيقهما بنجاح للتشخيص الروتيني.

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

English (2)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2017 (3)