research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
تطبيق تقنية RAPD-PCR في تحديد التباين الوراثي للابقار المحلية في محافظة بابل

Author: محمد حسن دخيل
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2018 Volume: 26 Issue: 2 Pages: 176-183
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

The present study to find out the genetic distance between two breeds from Babylon cattle (Holstein crossbred with local breed and Restaky local breed). Polymer chain reaction DNA were used after DNA extraction from the blood of cattle, six primers were used in this study. The results of PCR were checked by used gel agaros, where taking the results of PCR and lowed on 0.8% from gel agaros to find out the quality and concentration of DNA. All the primers that used in RAPD-PCR technique for DNA extraction to two breeds were succeeded, (1.25±0.8). The overall average genetic distance was 1.25±0.8 between these two breeds, while the average percentage differences were estimated for all primers to these two breeds (63.3±1.33).

تهدف الدراسة الحالية لايجاد الابعاد الوراثية مابين سلالتين من الابقار العراقية الموجوده في محافظة بابل (سلالة الرستاكي المحلي و الفريزيان المهجن مع المحلي). استخدمت تقنية التضخيم العشوائي لجزيئات الDNA بعد عمل استخلاص لل DNA من دم الابقار المذكورة انفا، وتم استخدام ستة بوادئ في هذه الدراسة. تم فحص نواتج ال PCR والذي استعمل لتضخيم الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين بواسطة الترحيل الكهربائي على هلام الاكاروز (Agaros gel)، حيث اخذ ناتج ال PCR، وحل على هلام الاكاروز 0.8% وذلك لمعرفة نوعية الحزم وتركيزها. نجحت البوادئ المستخدمة في تقنية الRAPD-PCR في تضخيم اجزاء الDNA للسلالتين السابقة الذكر. مقدار البعد الوراثي مابين السلالتين (1.25±0.8)، في حين قدرت النسبة المئوية للاختلاف بين سلالة الهولشتاين فريزيان المهجن والرستاكي المحلي وباستخدام كل البوادئ فكانت (63.3±1.33).


Article
Application of Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Technique to Estimate Genetic Distance among Some Methicillin Resistant Staphylococcus aureus Isolated from Different Iraqi Hospitals
تطبيق تقانة مؤشرات التضاعف العشوائي المتعدد الاشكال لسلسلة الدنا لتقدير البعد الوراثي بين بعض عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين والمعزولة من مستشفيات عراقية مختلفة

Loading...
Loading...
Abstract

Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is one of the principal nosocomial causative agents. This bacterium has the capability to resist wide range of antibiotics and it is responsible for many diseases like skin, nose and wounds infection. In this study, randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR was applied with ten random primers to examine the molecular diversity among methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates in the hospitals and to investigate the genetic distance between them. 90 Isolates were collected from clinical specimens from Iraqi hospitals for a total of 90 isolates. Only 10 strains (11.11%) were found to be MRSA. From these 10 primers, only 9 gave clear amplification products. 91 fragment lines were generated from these primers across all isolates with an average of 10 fragment lines per primer. Of these, 90 (99%) were polymorphic. The size of the amplified bands ranged between 145-2109 bp. The polymorphism percentage for all primers was 100% except OP-X17 primer which gave 86% polymorphism. The genetic distances revealed from Jaccard similarity index was calculated for the 90 RAPD polymorphic fragment lines. The highest genetic distance value 0.959 was between isolate number (1) and (5) and between isolate number (3) and (10), while the lowest genetic distance value 0.218 was between isolate number (6) and (7). This study shows that RAPD-PCR technique assayed with nine primers can be successfully applied to reveal the genetic distances among methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates from different hospitals.

تعتبر سلالات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين واحدة من المسببات الرئيسية للإصابات الناتجة عن المستشفيات. هذه البكتيريا لها القدرة على مقاومة مدى واسع من المضادات الحيوية كما انها مسؤولة عن العديد من الامراض مثل اصابات الجلد, الانف والجروح. في هذه الدراسة تم استخدام تقانة مؤشرات التضاعف العشوائي لسلسلة (RAPD) DNA مع عشرة من البادئات العشوائية لفحص التنوع الجزيئي بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للمثيسيلين وللتحقق من البعد الوراثي بينهم. تم جمع (90) عزلة من عينات سريرية ومن مستشفيات عراقية مختلفة ، ووجد أن (10) سلالات فقط وبنسبة (11.11٪) كانت مقاومة للميثيسيلين. من هذه البادئات العشرة, تسعة فقط قد اعطت نواتج تضاعف واضحة. انتجت هذه البادئات 91 حزمة رئيسية لجميع العزلات وبمعدل (10) حزم رئيسية لكل باديء, كانت من ضمنها (90) حزمة متباينة وبنسبة (99%). تراوحت احجام الحزم المضاعفة ما بين (145-2109) زوج قاعدي. النسبة المئوية للتباين الوراثي لكل البادئات كانت بنسبة (100%) ماعدا الباديء OP-X17 الذي اعطى نسبة تباين (86%). تم حساب الابعاد الوراثية بالاعتماد على مؤشر (Jaccard similarity) ل (90) حزمة رئيسية متباينة. اعلى قيمة بعد وراثي(0.959) كانت بين العزلة رقم (1) والعزلة رقم (5) وما بين العزلة رقم (3) والعزلة رقم (10), بينما كانت ادنى قيمة بعد وراثي (0.218) بين العزلة رقم (6) والعزلة رقم (7). هذه الدراسة تظهر ان تقانة مؤشرات التضاعف العشوائي لسلسلة DNA والتي تم اختبارها مع 9 بادئات يمكن تطبيقها بنجاح للكشف عن الابعاد الوراثية بين عزلات المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين ومن مستشفيات مختلفة.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (1)

English (1)


Year
From To Submit

2018 (2)