research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
Isolation And Identification of Pseudomonas aeruginosa from Some Clinical And Environmental Samples And Study It,s Activity for The Production of Pyocyanin And Protease
عزل وتشخيص جرثومة Pseudomonas aeruginosa من بعض العينات السريرية والبيئية ودراسة فعاليتها لإنتاج صبغة البايوسيانين وانزيم البروتييز

Authors: Nazar Mohammed Hassan Al-mamari --- Adeba Younes Sharif Al-Numa,an
Journal: JOURNAL OF EDUCATION AND SCIENCE مجلة التربية والعلم ISSN: 1812125X Year: 2019 Volume: 28 Issue: 4 Pages: 93-107
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The study includes isolation and identification of Pseudomonas aeruginosa from different sources as (90) samples were collected during a period from November (2017) to February (2018), including (wounds, suckers, urine, drinking water), Twinty five isolates of Pseudomonas aeruginosa were identified depending on morphological and biochemical tests at a rate of (27.77%) from total samples including (13) isolates from suckers used for sucking solutions from respiratory tract, (7) isolates from wounds, (3) isolates from urine and (2) isolates from drinking water. The isolates from sucker formed the highest rate reached (14.44%) of total samples and (52%) of total Pseudomonas aeruginosa isolates, whereas the lowest rate was from drinking water (2.22%) of total samples and (8%) of total Pseudomonas aeruginosa isolates. The results showed that (92%) of total isolates were pyocyanin producer on King A agar medium, It was also found that all isolates of this bacteria have the ability to produce protease.


Article
Genotyping of Pseudomonas Aeruginosa Isolated from Different Clinical Samples by Using ERIC Method
التنميط الجيني لبكتيريا الزوائف الزنجارية المعزولة من حالات سريرية مختلفة باستخدام طريقة ERIC

Authors: Abbas Falih Al-arnawtee عباس فالح الأرنؤطي --- Rana M. Abdullah رنا مجاهد عبد الله
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2019 Volume: 15 Issue: 02 Pages: 107-117
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

This study included 100 clinical samples collected as following: 33, 27, 15, 14 and 11 samples from patients with otitis media, burn infections, urinary tract infections, wound infections, and bacteremia, respectively, during the period from September to December, 2014. Seventy-five Pseudomonas aeruginosa isolates were identified. To determine the genetic relatedness of different isolates, Pseudomonas aeruginosa has been typed using Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR) and dendrogram analysis. Results showed that there was a genetic relatedness among Pseudomonas aeruginosa isolates in 19 clones, while 8 isolates contained different genotyping. In conclusion. The results inducted that ERIC-PCR is a practical, useful and easy method for typing Pseudomonas aeruginosa isolates.

شملت هذه الدراسة 100 عينة تم جمعها من مصادر سريرية مختلفة شملت 33 عزلة من المرضى الذين يعانون من التهاب الأذن الوسطى و 27 عزلة من المرضى المصابين بالتهابات الحروق و 15 عزلة من مرضى التهابات المسالك البولية و 14 عزلة من المرضى المصابين بالتهابات الجروح و 11 عزلة من مرضى تجرثم الدم خلال الفترة من سبتمبر إلى ديسمبر 2014. بعد اجراء تشخيص العينات تم الحصول على 75 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa . استخدمت طريقة (ERIC-PCR). لتحديد علاقة الانماط الوراثيه لعزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa. أوضحت النتائج وجود علاقة وراثية بين عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa في 19 نسيلة، بينما كانت 8 عزلات تحتوي على أنماط وراثية مختلفة ، بينت النتائج ان طريقة التنميط الوراثي باستخدام طريقة ERIC-PCR هي عملية مفيدة وسهلة لدراسة العلاقات الوراثية بين عزلات Pseudomonas aeruginosa.


Article
DNA Sequences of qacE∆1 Gene in Pseudomonas Aeruginosa Isolated from Wounds and Burns Infections.
التحليل التتابعي لجين qacE∆1 لبكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من التهابات الجروح والحروق

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 69 isolates of Pseudomonas aeruginosa were obtained from different clinical samples including wounds 24 (35%) and burns45 (65%)، the genes that responsible for Pseudomonas aeruginosa resistance isolates was detected, the results showed that quaternary ammonium compound delta 1 (qacE∆1) gene was 97.1% in Pseudomonas aeruginosa isolation. 24 (35%) in the wounds and 43 (62.31%) in burns, the size of the gene showed 285 bp, the results of the qacE∆1 analysis showed a single mutation of the mutation type.The results of genetic analysis tree were showed after comparing presence of genetic variations of the qacE∆1 gene with their relatives from the nucleotide sequences as containing variations occurring at one distance and equally in Pseudomonas aeruginosa and other bacterial species.

تم عزل 69 عزلة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa المعزولة من حالات سريرية تضمنت 24 عزلة من الجروح (%35) و 45 عزلة من الحروق (%65). وتم عزل الجين المسؤول عن مقاومة بكتريا Pseudomonas aeruginosa وبينت النتائج ان %97.1 من بكتريا Pseudomonas aeruginosa تمتلك الجين qacE∆1 وكانت 24 (%35) من الجروح و 43 (%62.31) من الحروق وكان حجم الجين 285 زوج قاعده واظهرت نتائج التحليل التتابعي لجين qacE∆1 حصول طفره مفرده . واظهرت نتائج تحليل الشجره التطورية ان هنالك تنوع وراثي للجينqacE∆1 في تسلسا النكيوتيدات وكانت تمتلك نفس البعد بين الانواع الاخرى من عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa والانواع الاخرى من البكتريا.


Article
Antibiotic Susceptibility and Molecular Detection of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Bovine Mastitis
الحساسية للمضادات الحياتية والتحديد الجزيئي لجرثومة الزوائف الزنجارية المعزولة من الابقار المصابة بالتهاب الضرع

Loading...
Loading...
Abstract

This study aimed to isolate Pseudomonas aeruginosa from cattle (bovine) milk with mastitis to characterize its antimicrobial susceptibility against some antibiotics, and to identify aminoglycoside acetyltransferase (aac-3-Ib) gene.A total of 100 bovine milk samples were collected randomly from different local cow farms at districts of Wasit governorate, Iraq. Six P. aeruginosa isolates were obtained using bacterial culture method and further identified by Analytical Profile Index (API-20E). The antibiotic sensitivity test was performed by disc diffusion methods. Among the 5 antibiotics used, the highest resistance (100%) was found with Nalidixic acid andtetracycline, follow by gentamicin (50%) and the lowest resistance rate (16.6%, and 33.3%) was to the ciprofloxacin and cephalothin respectively. PCR was performed for all the gentamicin resistant isolates that be among the aminoglycoside family. The where the frequency of aac(3)-Ib gene have product (530bp) was to 3 of P. aeruginosa isolates. From the finding of present study we concluded that P.aeruginosa thatisolated from mastitic bovinehave been developed resistance against aminoglycosides through presence of aac(3)-Ibgene and the ciprofloxacin and cephalothin can be taken as good choice of treatment.

تهدف هذه الدراسة إلى عزل جرثومة الزائفة الزنجارية من حليب الأبقار المصابة بالتهاب الضرع وذلك لتوصيف قابلية مضادات الميكروبات ضد بعض المضادات الحيوية ، ولتحديد موروث أمينوغليكوزيد أسيتيل ترانسفيراز aac-3-Ib)). ولذلكتم جمع ما مجموعه 100 عينة من حليب الأبقار بشكل عشوائي من مختلف مزارع الأبقار المحلية في مناطق محافظة واسط ، العراق. تم الحصول على ستة عزلات من نوع P. aeruginosa باستخدام طريقة استنبات البكتريا وتم تحديدها بواسطة مؤشر الملف التحليلي (API-20E). تم اختبار فحص الحساسية للمضادات الحياتية باستعمال طريقة نشر الاقراص وكانت اعلى نسبة مقاومة من بين خمسة انواع من المضادات الحياتية ل (ناليدكس اسد و تتراسايكلين) 100% يتبعها الجنتامايسين 50% بينما كانت اقل نسبة مقاومة ل سبروفلوكساسين والسيفالوثين (16.6% و 33.3%) على التوالي.واظهرت نتائج تقنية سلسلة التفاعل البلمرة التي اجريت لجميع عزلات الزائفة الزنجارية ان هناك3عزلات المقاومة لمضاد الجنتامايسين ضمن عائلة الامينوكلايكات كونها تمتلك جين المقاومة الدوائية (ا ي اي سي 3- اب) ذات الوزن الجزيئي 530 زوج قاعدي. من نتائج الدراسة الحالية ، استنتجنا إلى أن P. aeruginosa المعزولة من الأبقار الضارية قد طورت مقاومة ضد الأمينوغليكوزيدات من خلال وجود الموروث aac (3) -Ib وان سيبروفلوكساسين و السيفالوثين يمكن ان يؤخذ كخيار جيد للعلاج.


Article
Effect of D-Mannose on Gene Expression of Neuraminidase Produced from Different Clinical Isolates of Pseudomonas aeruginosa
تاثير دي- مانوز على التعبير الجيني للنيورامينيديز المنتج من بعض العزلات السريرية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa

Authors: Zina Hashem Shehab زينة هاشم شهاب --- Bahaa Abdullah Laftaah AL-Rubaii بهاء عبدالله لفته الربيعي
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2019 Volume: 16 Issue: 2 Pages: 291-298
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The present work aimed to investigate the neuraminidase (nan1) gene expression in 32 different clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa to explore the role of the enzyme in different types of infection and might give a better understanding of host cell-pathogens interaction. In addition, the effect of monosaccharide D-mannose on neuraminidase gene expression in eight isolates was studied by utilizing a reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). The results demonstrated that the highest expression of nan1 gene was in otitis samples (208,913.81) which were significantly higher than that from other infections (P < 0.01). While, the concentrations of gene copies obtained from urine, sputum and burns samples were 93,535.34, 92,254.64 and 74,029.63respectively. While the least expression in wound samples (32,017.06). This suggests that neuraminidase in ear samples might be more virulent and invasive followed by that from urine, sputum, burns and wounds samples. The considerable interest of addition D-mannose significantly reduced the rate of neuraminidase activity reached fivefold in some isolates. This indicates that D-mannose down regulates nan1 gene expression. Hence, this sugar could be used in the development of potential new antibacterial agents where it acts as a competitive neuraminidase inhibitors.

هدفت الدراسة الحالية الى التحري عن التعبير الجيني لانزيم النيورامينيداز nan1 في 32 عزلة سريرية مختلفة من بكتريا Pseudomonas aeruginosa لفهم دور الإنزيم في أنواع الاصابات المختلفة والذي يمكن أن يعطي فهما أفضل للتفاعل بين الكائن الممرض والخلية المضيفة. وكذلك دراسة تأثيرالسكر الاحادي D-mannoseعلى التعبير الجيني للنيورامينيداز في ثمانية عزلات بطريقة الاستنساخ المعاكس الكمي- تفاعل انزيم البلمرة المتسلسل (RT-qPCR). أظهرت النتائج الحالية أن أعلى تعبير لجين nan1 زاد معنويا في عينات التهاب الأذن وكان ( (208,913.81بينما كانت التراكيزلنسخ الجين 93,535.34 , 92,254.64 و 74,029.63 التي تم الحصول عليها من عينات الادرار ,القشع والحروق على التوالي وكان أقل تعبيرللجين في عينات الجروح ( (32,017.06.هذا يشير إلى أن دور النورامينيداز في عينات الأذن قد يكون أكثرضراوة واجتياحا متبوعًا بدوره في عينات الادرار و القشع وغيرهامن العينات. إن الفائدة الكبيرة من إضافة سكر D-mannose كانت معنوية في تقليل معدل فعالية النورامينيداز الذي انخفض الى خمسة أضعاف في بعض العزلات . هذا يشير إلى أن D-mannose قلل من تعبير الجين nan1 الذي يمكن استخدامه في تطوير عوامل جديدة محتملة مضادة للجراثيم التي تعمل كمثبطات تنافسية للنيورامينيديز.


Article
Extraction, Purification and Characterization of Peroxidase from Pseudomonas aeruginosa and Utility as Antioxidant and Anticancer
استخلاص , تنقية, توصيف انزيم البيروكسيديز من بكتريا الزوائف الزنجاريه واستخدمها كمضاد للاكسده ومضاد للسرطان

Authors: Entesar H. Ali انتصار حسين علي --- Karrar R. Mohammed كرار رياض محمد
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2019 Volume: 16 Issue: 4 Pages: 824-830
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Peroxidase is a class of oxidation-reduction reaction enzyme that is useful for accelerating many oxidative reactions that protect cells from the harmful effects of free radicals. Peroxidase is found in many common sources like plants, animals and microbes and have extensive uses in numerous industries such as industrial, medical and food processing. In this study, P. aeruginosa was harvested to utilize and study its peroxidases. P. aeruginosa was isolated from a burn patient, and the isolate was verified as P. aeruginosa using staining techniques, biochemical assay, morphological, and a sensitivity test. The gram stain and biochemical test result show rod pink gram-negative bacteria, and ensure that the isolate was that of P. aeruginosa. Optimization for bacterial growth were done by used more than pH (5,7,9) and temperatures (32,35,37°C), and it was found that the best growth conditions were at pH 5.5, producing (4.5x108cells), and a temperature of 37°C, with (5.25x108cells) being produced. Intracellular enzymes were extracted by ultra-sonication that used frequencies of ultrasound 30 kHz for 20 min in 4 °C, and was centrifuged at 13000×g for 5min. The supernatant was then re-used as a crude enzymatic extract and the cell pellet was discarded. Purification of peroxidase was accomplished by using salt precipitation, dialysis, gel filtrations and ion exchange chromatographic techniques. The result shows that gel filtration has optimal specific activity and purification fold at (61 U/ml), purification fold 6 times and then the improvement enzyme was applied as H2O2 scavenging activity antioxidant by used three concentration of enzyme (10,40,60 µg/ml), and show higher scavenging activity at 60 µg/ml, which reached to 45% scavenging activity. The enzyme was also used as anticancer agent, which was verified by using three concentration of enzyme (10,15,20 µg/ml) which show a significant kill for Mcf-7cells at (15µg/ml), with cytotoxicity activity reaching (45%).

يصنف انزيم البيروكسيديز من انزيمات التي تحفز تفاعل الاكسدة والاختزال والذي يحمي الخلايا الحيه من التاثير الضار من الجذور الحرة. يوجد البيروكسيديز في مصادر مختلفه مثل النباتات,الحيونات والمايكروبات.يمتلك البيروكسيديز تطبيقات واسعه في مجال الصناعه والطب وصناعة الاغذيه. في دراستنا الحالية , تم استخدام بكتريا الزوائف الزنجاريه لانتاج انزيم البيروكسيديز.تم عزل البكتريا من مرضى الحروق وتشخيصها باستخدام طرق التصبيغ والفحوصات البايوكميائيه وفحص الحساسية وعن طريق شكل البكتريا حيث اظهرت النتائج بكتريا عصوية سالبة لصبغة كرام اما الفحوصات البايوكميائية فاكدت ان العزلات تعود لبكتريا الزائفة الزنجارية .تم دراسة الظروف المثلى لانتاج الانزيم ووجد ان افضل دالة حامضية هي بحدود 5,5 ودرجة حراره 37 درجه مئوية. تم تنقية الانزيم باستخدام الترسيب بالاملاح, الديلزة, المبادل الايوني, الترشيح الهلامي وكانت اعلى فعالية نوعيه قد اظهرت في خطوة المبادل الايوني بحدود (61وحدة/ملغم). تم استخدام الانزيم المحسن لكبت الجذور الحرة (مضاد للاكسدة) حيث حصلت اعلى نسبة كبت عد فعالية 60 بالمئة وكذلك استخدمه كمثبط للخلايا سرطان الثدي حيث سجلت اعلى نسبة كبح للخلايا السرطانية عند تركيز (15ملغم/مل).

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

English (5)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2019 (6)