research centers


Search results: Found 294

Listing 11 - 20 of 294 << page
of 30
>>
Sort by

Article
Molecular''Detection of''Coxiella burnitii Among''Aborted Women in Thi-Qar Province/ Iraq

Author: Hekmat K. Ateya
Journal: Univesity of Thi-Qar Journal مجلة جامعة ذي قار العلمية ISSN: 66291818 Year: 2017 Volume: 12 Issue: 4 Pages: 88-95
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

Coxiella burnetii''bacteria, an obligate''intracellular parasite with''a worldwide geographical distribution, are the causative''agent of Q fever in humans. In this study a total of 47 blood samples collected from aborted women in Bent Al Huda hospital in Thi- Qar province in southern Iraq. By a polymerase chain reactions (PCR) ''assay targeting''IS1111 and''com1 genes of this bacterium.The C. burnetii diagnosed in 8(17.02%) clinical samples and the frequent''association of the pathogen with cases of spontaneous abortion. This first study on this bacterium which remains not diagnosed as causative agents of abortion and its prevalence in Iraq is non-studied


Article
Polymorphism of growth hormone gene in the artificial insemination result of Madura cattle with Limousin semen as a reference for genetic selection
تعدد أشكال جين هرمون النمو في نتائج التلقيح الصناعي لأبقار مادورا الملقحة بمني اليموزين كمرجع للاختيار الوراثي

Authors: B. Utomo بودي اوتمو --- E. Safitri إيرما سفتاري
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894 Year: 2018 Volume: 32 Issue: 1 Pages: 113-118
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Research on genetic polymorphism of growth hormone (GH) and receptor growth hormone (rGH) has not been done in crossbred of Limousin cattle, so it is interesting to be examined. Blood samples were taken from 14 Madura calves were artificially inseminated with Limousin cement. DNA amplification is done by using Polymerase Chain Reaction (PCR) method, Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) method to determine the genotype. DNA sequencing was done to determine nucleotide sequences of GH unit genes. The results showed that identification of GH and rGH gene polymorphisms was done by breaking DNA fragments from 432 and 298 bp in Madura and Limousin cattle (Madrasin) ie, L and V alleles have a frequency of 0.67 and 0.33 for the GH gene, respectively. This proves that the crossed-breeding of Madrasin have V allele that is not owned by the Madura cattle. While in the rGH gene, the A allele is 0.92 and the G allele is 0.08, with the frequency of the A allele larger than the G allele. This research concluded: that GH and rGH undergo changes on polymorphisms in Madrasin cattle can be used as a basis for selection.

لم تجرأبحاث على تعدد الأشكال الوراثي لهرمون النمو (GH) وهرمون النمو المستقبلي (rGH) في الأبقار المهجنة من أبقار الليموزين، لذلك حاولنا في هذا البحث اجراء هذا الفحص. تم أخذ عينات دم من 14 من عجول مادورا تم تلقيحها اصطناعياً بمني اليموزين. تم إجراء تضخيم الحمض النووي باستخدام طريقة تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، طريقة تعدد الأشكال (RFLP) المقيد للطول لتحديد النمط الوراثي. تم إجراء تسلسل الحمض النووي لتحديد تسلسلات النوكليوتيدات من جينات الوحدة GH. أظهرت النتائج أن التعرف على تعدد الأشكال الجيني GH و rGH قد تم عن طريق تكسير شظايا الحمض النووي من 432 و 298 bp في ماشية Madura و Limousin (Madrasin) أي أن الأليلات L و V لها تردد 0,67 و 0,33 لجين GH، على التوالي. هذا يثبت أن التكاثر المتقاطع للمدرسين له أليل V غير مملوك من قبل الماشية Madura. بينما في الجين rGH، الأليل A هو 0,92 وأليل G هو 0,08، مع تواتر الأليل A الأكبر من الأليل G. وخلص هذا البحث: أن GH و rGH يخضعان لتغييرات في الأشكال في الماشية Madrasin يمكن استخدامها كأساس للاختيار.

Keywords

Polymorphism --- GH Gene --- rGH Gene --- Madrasin --- PCR --- RFLP --- V alleles


Article
Detection of clfA gene in Staphylococcus aureus isolated from tonsillitis patients
الكشف عن جين clfA في جرثومة المكورات العنقودية الذهبية المعزولة من مرضى التهاب اللوزتين

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract Staphylococcus aureus is an opportunistic pathogen and it was one of virulent causer of tonsillitis. The present investigation was aimed to the molecular detection of adhesion gene (clfA) was done by polymerase chain reaction (PCR) and DNA sequencing. Only 64 isolates (42%) were mannitol fermenter and recorded as S. aureus, these isolates recovered from 152 swabs were collected from tonsillitis patients in ENT department in Al–Habboby Teaching Hospital, Thi-Qar province, during the period from November 2016 to March 2017. Out of 64 isolates, 56 (87.5%) were harbored clfA gene. The sequencing of PCR products showed significant alignments identities (96-99%) to the S. aureus which are located in BLAST-NCBI Genbank. Phylogenetic analysis of S. aureus based upon the neighbour-joining of partial clfA gene sequences showed that these sequences were derived from Staphylococcus genes.

المستخلص: تعتبر بكتريا المكورات الذهبية احد الانواع البكتيرية الانتهازية و أحد المسببات الضارية للاصابة بالتهاب اللوزتين. وتهدف الدراسة الحالية للكشف الجزيئي عن جين الالتصاق (clfA ) باستخدام تقنية تفاعل البلمرة الجزيئية وتسلسل الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين. تم تحديد 64 عزلة مخمرة لسكر المانيتول وسجلت على انها مكورات عنقودية ذهبية تم عزلها من 152 مسحة قطنية تم جمعها من مرضى التهاب اللوزتين في شعبة الاذن والانف والحنجرة في مستشفى الحبوبي التعليمي ، محافظة ذي قار خلال الفترة من تشرين الثاني 2016 الى اذار 2017. 56 عزلة (87.5%) من اصل 64 عزلة تحتوي على جين clfA . ان تحديد التسلسل لنواتج تفاعل البلمرة الجزيئية التي بينت توافقا بنسبة (96-99%) لعينات المكورات العنقودية الذهبية الموجودة في بنك الجينات. ان الشجرة التطورية لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية للعينات الحالية بالاعتماد على تسلسل جين clfA بينت ان تسلسل هذا الجين مشتق من جينات بكتريا المكورات العنقودية الذهبية.


Article
Evaluation of Transfected HEP-2 Cell Line Using &#223;-Galactosidase Reporter Assay System
تقويم تحويل خط الخلايا الحنجرة السرطانية (Hep-2) باستعمال نظام تحليل الجين المخبر &#223;-GALACTOSIDASE

Author: Wisam H. Salo وسام حازم سلو
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2011 Volume: 8 Issue: 3 Pages: 728-735
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Liposome-mediated transfection of cancer cells provide a valuable experimental technique to study cellular gene expression and may also be adapted for gene therapy studies. However, the widely recognized advantage of liposome-mediated transfection is high efficiency. Therefore, this study were performed to optimize transfection techniques in human larynx carcinoma cell line Hep-2 using the commercial synthetic lipid TransFast™ Reagent and monitoring the expression efficiency by using the pSV-β-galactosidase Control Vector which encoded β-galactosidase, maximum transfection efficiency were achieved with TransFast™ Reagent used at the Charge ratios of 2:1 and 0.5 µg DNA/ml, this is indicate that TransFast™ Reagent can be used as an efficient transfection agent to deliver foreign DNA into human larynx carcinoma cell line Hep-2 and expression of the transgene efficiently.

تعتبر الية نقل الجينات الى الخلايا السرطانية باستعمال الجسيمات الدهنية تقنية تجريبة قيمة في دراسة التعبير الجيني والتي يمكن ان توظف في دراسات العلاج الجيني, تمتاز تقنية التحويل باستعمال الجسيمات الدهنية بالكفاءة العالية في النقل ولذلك اجريت هذه الدراسة لايجاد الظرؤف المثلى لعمليات النقل الجينات الى خط خلايا الحنجرة السرطانية (Hep-2) باستعمال الجسيم الدهني الصناعي التجاري TransFast™ Reagentومراقبة التعبير باستخدام الناقل pSV-β-galactosidase Control Vectorوالذي يشفر عن انزيم β-galactosidase وتم الحصول على اعلى تحويل عند استخدام TransFast™ Reagen بنسبة تحويل 2:1 وتركيز 0.5 µg DNA/ml مما يثبت كفاءة النقل والتعبير في خط خلايا الحنجرة السرطانية (Hep-2) باستعمال الجسيم الدهني TransFast™ Reagen.

Keywords

Reporter gene --- Hep-2 --- transfection


Article
التشخيص الجزيئي والتحري عن جين الضراوة rmp لبكتريا Neisseria gonorrhoeae المعزولة من المرضى العراقيين

Authors: مهند كريم عنيد --- نورية عبد الحسين علي
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2014 Volume: 17 Issue: 2 Pages: 30-40
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

تضمنت الدراسة جمع 80 عينة سريرية من مرضى مشكوك بأصابتهم بمرض السيلان (تضمنت عينة ادرار ومسحتان مباشرة من كل مريض) من مناطق بغداد المختلفة ومنطقة الكوت والصويرة والمختبرات الاهلية وعيادات الاطباء الخاصة، للمدة الواقعة بين تشرين الثاني/2011- حزيران/2012، تم تشخيص الاصابة بالمكورات البنية من خلال إيجاد بكتيريا النيسريا البنية (Neisseriagonorrhoeae) في العينات باستخدام كل أساليب الفحص المجهري والزرع على الاوساط الزرعية على العينات البالغة 80 عينة وشملت 17 (%21.25) عينة من النساء و63 ((%78.75 عينة من الرجال. اظهرت نتائج الفحص المجهري و الزرع أن هناك47 % 58.75)) عينة موجبة من مجموع العينات الكلي البالغ 80 عينة، اذ تم تحديد الاصابة لـ35 43.75) %) عينة عن طريق الفحص المجهري والزرع على وسط اكار الجكليت ووسط النسيريا ووسط ثاير- مارتن المحور، وتم تحديـد 9 (% 11.25) عينة بالفحص المجهري لوحـده (لم تنمـو على الاوسـاط الزرعيـة) و 3 (%3.75) عينة من الزرع على الاوساط الزرعية وحدها (الفحص المجهري كان سلبيا). اظهرت نتائج التشخيص الوراثي للتحري عن البكتيريا المسببة لمرض السيلان بأستعمال بوادئ متخصصة للجين rmp المصممة في هذه الدراسة عن وجـود 77 (% 96.25) عينة اعطت نتيجة موجبة للمسحات المباشرة و 75 (93.75 %) عينة اعطت نتيجة موجبة لعينات الادرار.

This study included 80 clinical samples from patients suspected to have gonorrhoea (a urine sample and two direct smears from each patient) from different areas of Baghdad, Kut and Suwairah regions, from private clinics and laboratories during November 2011 till June 2012. Cases caused by gonococci were diagnosed by finding the Neisseria gonorrhoeae bacteria in the samples using microscopic examination and culturing on cultures for all the 80 samples which included 17 (21.25%) women and 63 (78.75%) men. Microscopy and culture revealed that 47 out of the 80 (58.75%) samples were positive: 35(43.75%) of them diagnosed by both microscopy and culture on chocolate agar, Neisseria media and modified Thayer-Martin media; while 9 (11.25%) samples were diagnosed by microscopy alone (cultures were negative) and the remaining 3(3.75%) samples by culture alone (microscopy was negative). Results of the genetic diagnosis looking for the bacteria causing gonorrhoea using primers specific for the rmp gene which were specially designed for this study revealed that 77 (96.25%) of the direct smears and 75 (93.75%) of the urine samples were positive.


Article
Diagnosis of Mutations in Thyroid Stimulating Hormone Receptorgene (TSHR) of Thyroid Disorders Patients in Basra Province
تشخيص طفرات جين الهرمون المحفز للغدة الدرقية TSHRلدى مرضى الغدة الدرقية في محافظة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract: The study was conducted on 90 blood samples divided into 35 samples Hypothyroidism 35 samples hyperthyroidism (group of patients ) and 20samples from healthy people ( control group). DNA of two groups was extracted and exon 10 was amplified by using PCR. Mutations were diagnosed and analyzed by using Sequencing. The present study found seven novel mutations in exon 10, divided into five mutations among hypothyroidism patients compared to control (who did not appear to have any type of mutations diagnosed). All mutations diagnosed were substitution included transition or transversion depending on the nature of the mutant base, three missense mutation in three hypothyroidism patients with a proportion of 20% each. They are as follows c.1330 T>C, Y444H; c.1424 T>C, L475P and c.1435 T>C, S479P and two silent mutation in two hypothyroidism patients (c.1338G>A, L446L and c.2300 G>A Untranscrib).While the result showed two mutation in hyperthyroidism, one was missense mutation (c.1832 C>A, P610Q) and the other silent mutation (c.2103 C>A, R701R).The current study pointed out the occurrence of the disease linked with mutations in specific areas of linking stimulating hormone and the interaction between the protein receptor and α-subunit for G-protein.

الخلاصة: استخدمت الدراسة الحالية90 عينة دم مقسمة إلى 35عينة من مصابين بحالة القصور في نشاط الغدة و35 عينة من مرضى فرط نشاط الغدة ومثلت بمجموعة المرضى (Patients Group )) و20 عينة من أشخاص أصحاء تمثلت بمجموعة السيطرة (Control Group ). استخلص DNA للمجموعتين وضخمت المنطقة المشفرة العاشرة (Exons 10) لجين TSHR باستخدام تقنية Polymerase Chain Reaction ( PCR) بعدها تم تشخيص الطفرات وتحليلها بطريقة التتابعSequencing . وجدت الدراسة الحاليةسبعة طفرات جديدة Novel Mutations في المنطقة المشفرة موزعة الى خمسة طفرات لدى مصابين بحالة القصور مقارنة بمجموعة السيطرة (الذين لم تظهر لديهم أي نوع من الطفرات المشخصة ) وان جميع الطفرات المشخصة هي طفرات نقطية تعويضية استبدالية Substitution أما من نوع Transition أو Transversion اعتمادا على طبيعة القاعدة الطافره ثلاث منهاMissense Mutations في ثلاث مصابين بحالة القصورنسبة كل منها 20% وهي كالتالي c.1330 T>C , Y444H ; c.1424 T>C ,L475P and c.1435 T>C , S479Pو طفرتين صامتتين Silent Mutations في اثنين من مرضى بحالة القصور (c.1338 G>A, L446L and c.2300 G>A , Untranscribt ). بينما سجلت النتائج وجود طفرتين فقط في حالة الفرط في نشاط الغدة بنسبة 5.71% احدهما Missense (c.1832 C>A, P610Q ) والأخرى صامته (c.2103 C>A ,R701R ). أشارت الدراسة الحالية إلى احتمالية ارتباط الطفرات بحدوث المرض وذلك من خلال موقع الطفرات في المناطق الخاصة للارتباط بالهرمون المحفز ومنطقة التفاعل بين البروتين المستقبل و الوحدة الثانوية ألفا لكوانين- بروتين (G-protein ).


Article
Association of The T45G Polymorphism of Adiponectin Gene with Polycystic Ovary Syndrome in Women of Babylon Province/ Iraq

Author: Hawraa Sabah Al-Musawi
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2015 Volume: 12 Issue: 4 Pages: 1020 -1026
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Polycystic Ovarian syndrome (PCOS) is being the most frequent cause of anovulatory infertility, Adiponectin is the most abundantadipocytokine and may play a role in the regulation of insulin sensitivity and IR in PCOS and count for 0.01% or 3–30 μg/ml of total plasma proteinthe adiponectin gene contains 3 exons spans 16 kb on chromosome3q27.The aim of the present study was to evaluate the genetic influence of the adiponectin gene polymorphisms in the development of PCOS among women of Babylon Province/ Iraq. sixty three women were studied ,and were classified into two groups of : first group consists of 32 women infected with polycystic ovaries syndrome, the second consists of 31 healthy women to detect the presence of T45G polymorphism within the gene. From all subjects a whole-blood sample was taken and was used for isolation of peripheral blood leukocytes. The adiponectin T45G polymorphism, located in exon 2, was genotyped by amplification of genomic DNA.The present study included study of the relationship of this gene with PCOS women in reproductive age, A statistically significant difference was observed in the frequency of TT,TG and GG genotypes between women with PCOS and controls .


Article
Molecular detection of invA gene for Salmonella spp. isolates from poultry in Babil province-Iraq

Authors: Alaa Abdel-Kadhim Jawad --- Nafea Sabeeh Jasim --- Safaa Jabbar Hamzah
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 1 Pages: 60-63
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 150 poultry samples (age from 1 to 49 day) were collected from different locations at Babylon province ) Al-hashimiya , Al-madhatiya and Al-Qasim ) from November 2015 to April 2016. These samples were collected from different part of the body (Liver tissue, Yolk sac content, and cecal swab). Salmonella spp. was isolated and identified using bacterial culturing on selective media, in addition to, biochemical and Mini API 20E and serotyping by monovalent antisera. Polymerase chain reaction (PCR) was used to detect invA of Salmonella spp. The results revealed that the rate of Salmonella isolates from poultry specimens were (11) 7.3% using cultural and biochemical tests, the results of serotyping revealed these isolates belong to Salmonella spp. The PCR technique was used to detect invA gene, these Salmonella isolates appeared to contain this gene since DNA amplification showed one distinct band (size 389 bp) when electrophoresed on agarose gel. The results of this study revealed that the PCR technique had a high specific in detection of Salmonella spp. When compared with other conventional detection methods

Keywords

Poultry --- Salmonella --- PCR --- invA gene


Article
Detection of ( LasI ) Gene in Pseudomonas aeruginosa and its Role in Biofilm Formation.
الكشف عن جين (LsaI ) في بكتيريا الزوائف الزنجارية ودوره في تكوين الغشاء الحيوي

Loading...
Loading...
Abstract

The present study included the collection of 120 samples from various clinical sources. The samples collected from some hospitals in Baghdad city which included burns ,wound , cystic fibrosis, ear infections and urinary tract infections ( 52 ,28, 4, 23 and 13). Samples respectively. Samples were identified based on the morphological and microscopical characteristics of the colonies when they were culturing in a number of culture media as well as biochemical tests. The molecular detection was used to confirm diagnostic test for the isolates based on the 16SrRNA gene, as a detection gene, which has specific sequences for DNA of P.aeruginosa bacteria.The results of molecular detection showed that 51 isolates belong to target bacteria were distributed as follow 21 of burns, 14 isolates of wounds, 7 isolates of ear infection, 4 isolates of cystic fibrosis, 5 isolates of urinary tract infection. The results of phenotypic detection of biofilm formation showed that 44/51 (86.2%) of isolates differences in their ability to biofilm formation. The results of screed QS genes by Polymerase chain reaction (PCR) amplify based on specific sequences for lasI gene showed that 48 (94.1%) of isolates have lasI gene.

تضمنت الدراسة الحالية جمع 120 عينة من مصادر سريرية متنوعه لغرض التحري عن وجود بكتيريا P.aeruginosa في تلك المصادر ، حيث جمعت العينات السريرية من بعض مستشفيات بغداد وتضمنت اخماج الحروق والجروج والتهاب الاذن والتهاب المجاري البولية والتليف الكيسي بواقع ( 52 ,28 , 23 , 13, 4) عينة على التوالي. شُخصت العينات بالاعتماد على صفات المستعمرات المظهرية والمجهرية عند تنميتها في عدد من الاوساط الزرعية فضلا عن الفحوصات البايوكيميائية. تم استخدام التشخيص الجزيئي كتشخيص تأكيدي للعزلات على المستوى الجيني بالاعتماد على الجين التشخيصي 16SrRNAوالذي يحمل تتابعات خاصة ببكتيريا P.aeruginosa اظهرت نتائج النتشخيص النهائي ان 51 عزلة تعود للبكتيريا المستهدفة توزعت بواقع 21 من حالات الحروق 14 عزلات للجروح و7 عزلات لألتهاب الاذن و4 عزلات للتليف الكيسي و5 عزلات تعود لألتهاب المجاري البولية . وبينت نتائج الكشف المظهري لتكوين الغشاء الحيوي تبايناً في قابليتة العزلات على تكوينه حيث كانت العزلات المكونة للغشاء 44 عزلة (86.2%). واظهرت نتائج التحري عن جين تحسسس النصاب باستخدام تقنيه تفاعل البلمرة التسلسلي وبأستخدام بادئات خاصة بتسلسلات معينه لجين lasI ان 48 عزلة تملك جين lasI والتي تمثل نسبة (94%) من العزلات


Article
Polymorphism in promoters of TLR-2 gene in Iraqi patients with tuberculosis

Author: Awatif H. Issa , Mazin S. Salman
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 3 Pages: 116-121
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Despite the existence of Tuberculosis control programs globally, TB remains one of the major public health problems worldwide. It is one of the greatest challenges, which face health systems in the 21st century. A defect in the genes of the immune response is the most plausible explanation for susceptibility of some individuals and resistance of others to TB. TLR2(CD282) is one of the toll-like receptors and plays a role in the immune system. TLR2 is present on the surface of certain cells and it distinguishes foreign bodies, also it have role in passing of adequate signals to the cells of the immune system. The main goal of this study is to produce molecular analysis for promoter of TLR-2 genes in Iraqi patients with TB. Seventy-four blood specimens were collected from 74 patients in the Institute of the Tuberculosis and Chest Disease–Basra city's, blood specimens also collected from 74 healthy individuals as control. Extracted DNA was amplified using set of specific primers for promoter regions TLR-2 gene; amplified amplicons were sequenced and analyzed. Genotyping of TLR-2 gene promoter revealed that out of 74 found with TB, 38 (51.3%) patients found to possess C allele (T→C), while 36 (48.7%) possessed T allele. C allele presents only in heterozygous state in Iraqi society, and closely correlated with increasing susceptibility of some individuals to TB.

Listing 11 - 20 of 294 << page
of 30
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (294)


Language

English (220)

Arabic (40)

Arabic and English (32)


Year
From To Submit

2019 (35)

2018 (43)

2017 (51)

2016 (55)

2015 (34)

More...