research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
Isolation of extracellular phytase producing Bacillus species from local soil samples
عزل بعض انواع بكتريا Bacillus spp المنتجة لانزيم الفايتيز الخارجي من نماذج لترب محلية

Authors: خلود عبد الاله محمد --- وعمار محمد جواد --- عبد القادر هادي علوان
Journal: journal of kerbala university مجلة جامعة كربلاء ISSN: 18130410 Year: 2014 Issue: المؤتمر العلمي الثاني لكلية العلوم Pages: 77-82
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

Phytate is considered as one of the antinutritional factors exist mainly in different plants; it chelates many nutrition factors and denaturing many proteins. Recent research dealed with the isolation of extracellular phytase producing Bacillus species from local soil samples; the effect of phytase on different sources of phytate. Twenty five bacterial isolates of Bacillus species produced extracellular phytase on pikovaskaya agar or phytase screening medium( PSM). The clear zone around bacterial growth indicated for enzyme production. Soil samples were collected from many agricultural region includes Baghdad, Karballa, Babylon, Basrah, Emarah and al- Sulaimania. Five bacterial isolates had the ability to digest phytate extracted from different sources such as wheat bran, barly, rice bran, chick bea, mung bean, grass bea and phasolias. Other bacterial isolates could digest some of phytate sources. Extracellular phytase activity were determined at different pHs buffer for five chosen isolates using sodium phytate. Enzyme activity reached to 23 and 22.7 unit/ml for Bacillus KP9.1 and Bacillus KA7 at pH 6 buffer; different activities were seen for other isolates at pHs used. No activity detected at the pH7 for all tested isolates.

تعد الفايتات (( phytate احد المواد المضادة للتغذية والمتواجدة بكثرة في مختلف النباتات حيث يؤدي وجودها في الاغذية الى سحب العديد من العناصر التغذوية لها تاثير ضار على بعض البروتينات كما تعد الفايتات مخزن لعنصر الفسفور في النباتات. هدف البحث الحالي الى عزل بكتريا Bacillus من نماذج الترب المحلية والتحري عن انتاجها لانزيم الفايتيز الخارجي ومدى تأثير الانزيم على هضم الفايتات المستخلصة من مصادر نباتية مختلفة. تم عزل 25 عزلة بكتيرية تعود لجنس Bacillus لها القدرة على هضم الفايتات في وسط التحري Pikovaskaya agar بدليل ظهور هالة شفافة حول النمو البكتيري وقد شملت نماذج التربة التي عزلت البكتريامنها, ترب لمناطق زراعية لمحافظات بغداد وكربلاء وبابل والبصرة والعمارة والسليمانية . وجد ان خمس عزلات بكتيرية لها القدرة على تحليل الفايتات المستخلصة من نخالة الحنطة والشعير وسحالة الرز والحمص والماش والهرطمان والفاصوليا بينما تفاوتت قابلية العزلات الاخرى على هضم المصادر المختلفة من الفايتات. قدرت الفعالية الانزيمية لراشح مزارع خمس عزلات منتخبة باستخدام فايتات الصوديوم وفي محاليل دارئة ذات ارقام هيدروجينية مختلفة لتقدير الفعالية الانزيمية للفايتيز الخارجي للعزلتين Bacillus KP9.1 و Bacillus KA7 بعدد وحدات وصلت الى 23 و 22.7 وحدة/ مل على التتابع في محلول داريء ذي الرقم الهيدروجيني 6 وتفاوتت فعالية الانزيم بين العزلات في الارقام الهيدروجينية الاخرى بينما انعدمت فعالية انزيم الفايتيز في الرقم الهيدروجيني7 ولجميع العزلات المنتخبة.كلمات دالة: بكترياBacillus , انزيم الفايتيز, تحديد فعالية, ارقام هيدروجينية

Keywords

Bacillus --- phytate enzyme --- unit --- pH


Article
Evaluation of some solid and liquid media to screening local bacterial isolates for solubilizing inorganinc phosphate
تقييم كفاءة بعض من الاوساط الزرعية الصلبة والسائلة في غربلة عزلات بكتيرية محلية مذيبة للفوسفات اللاعضوي

Authors: خلود عبد الاله محمد --- وصفاء عبد الرحيم محمود --- ومحمد عبد الرحيم محمود --- حازم جاسم عبد الوهاب
Journal: journal of kerbala university مجلة جامعة كربلاء ISSN: 18130410 Year: 2017 Issue: المؤتمر العلمي الخامس لكلية العلوم Pages: 22-29
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

This research aimed to determine the efficiency of some agar media and broth for screening of inorganic phosphate solubilizing bacterial isolates. Sixty bacterial isolates were screened for their ability to solubilize phosphate using five culture agar media, differences were recognized upon agar media in which 50% of total isolates gave halo zone on AYG agar plate after 72 hours while only 26%, 20% and 13% of bacterial isolates solubilized phosphate for PVK, NBRIP and NBRIY respectively. Bromophenol blue dye caused only easer detecting for halo zone without change the percentage of solubilizing bacteria. This research indicated a difference between agar media and broth in which 100% of bacterial isolates gave detectable soluble phosphorous on AYG broth with decreasing in pH of broth which reached to3.6 for KP6.5. Soluble phosphorous determined to 62- 320 ppm for the best solubilizing isolates.

يهدف البحث الحالي الى تحديد كفاءة عدد من الاوساط الزرعية الصلبة والسائلة في قابليتها على غربلة وانتخاب عدد من العزلات البكتيرية المحلية لاذابة الفوسفات اللاعضوي. تمت غربلة 60 عزلة بكتيرية مختلفة لقابليتها على اذابة الفوسفات اللاعضوية وباستخدام خمس اوساط زرعية صلبة مختلفة, وقد أظهرت النتائج وجود اختلافات من حيث كفاءة العزلات البكتيرية على اذابة الفوسفات اللاعضوية حيث تبين ان 50% من العزلات البكتيرية تعطي هالة شفافة مقاسة على الوسط AYG الصلب خلال 72 ساعة بينما انخفضت النسبة المئوية للعزلات المذيبة للفوسفات على الاوساط الصلبة الاخرى حيث اعطى وسط بيكوفيسكايا PVK نسبة 26% ووسط NBRIYP نسبة 20% ونسبة 13% لوسط NBRIY. لم يلاحظ تغيير في عدد العزلات المذيبة للفوسفات عند اضافة صبغة البروموفينول الزرقاء بينما ادت الى وضوح وسهولة في التحري عن العزلات المذيبة. كما اوضحت الدراسة الى ان هناك اختلافا كبيرا في نتائج الغربلة بين الوسط AYG الصلب وبين الوسط AYG السائل حيث ظهر ان 100% من العزلات البكتيرية هي مذيبة للفوسفات اللاعضوي على الوسط السائل مع انخفاض ملحوظ في الارقام الهيدروجينية للوسط لتنخفض من 6.8 الى 3.6 لاحد العزلات البكتيرية, وقدر الفوسفات الذائب للعزلات بين 320-36 جزء بالمليون لافضل العزلات البكتيرية المنتخبة.


Article
Determination of Heavy Metals Tolerance and their Damaging Effects on a Local Soil Thermophilic Isolate Bacillus stearothermophilus
تحديد مقاومة عزلة محلية للبكتريا المحبة للحرارة Bacillus stearothermophilus والمعزولة من التربة لبعض العناصر الثقيلة وتأثيراتها الضارة

Loading...
Loading...
Abstract

This research aimed to detect the tolerance of a local soil thermophilic isolate to some heavy metals (HM) and determine of minimal inhibition concentration (MIC). Also, plasmid profile was studied and its relationship with HM resistant. Deleterious effect of mercury (Hg), chromium (Cr) and Cobalt (Co) were evaluated on bacterial shape, growth and DNA scan between 200-40nm. Mutation effect was also studied. Local thermophilic Bacillus stearothermophilus was resist zinc, molbidium, silver at a concentration reached 80mM; it is sensitive to Hg, Cr and Co with MIC reached 0.004, 0.03 and 0.007 respectively. Plasmid profile revealed the absence of plasmid from B. stearothermophilus. Some of bacterial shapes were changed to short bacilli, coccobacilli and cocci; many bacterial cell fragment were seen after treatment with Hg, Cr and Co. Bacterial growth decreased when treated with Hg and Cr after 18h while, little effect was seen with Co treatment with Hg and Co induced heat sensitive mutation with 200-300 mutated cfu /ml from 104 cfu/ml; no heat sensitive mutation were detected for Cr treatment. DNA UV scan 200-400nm showed no changes with Hg while, curve shape changed for Cr and cobalt.

يهدف البحث الحالي الى التحري عن مقاومة عزلة محلية محبة للحرارة تعود للنوع Bacillus stearothermophilus لبعض العناصر الثقيلة وتحديد التركيز المثبط الادنى لها و درس المحتوى الوراثي لتحديد وجود عناصر وراثية خارج كروموسومية (البلازميدات) وعلاقتها مع المقاومة للعناصر الثقيلة. تم تقييم التأثيرات الضارة لعناصر الزئبق والكروم والكوبلت على شكل ونمو البكتريا وحصول تغييرات على طيف امتصاص الدنا للاطوال الموجية 200-400 نانومتر, كما درس التأثير المطفر لهذه العناصر. وجد ان العزلة المحلية المحبة للحرارة تقاوم تركيز يصل الى 80 ملي مولاري لعناصر الخارصين والمولبيديوم والفضة واظهرت العزلة حساسية تجاه عناصر الزئبق والكروم والكوبلت وقد قدرت قيم التركيز المثبط الادنى للزئبق بتركيز0.004 ملي مولاري وللكروم بتركيز 0.03 ملي مولاري وللكوبلت بتركيز0.007 ملي مولاري وقد بين الترحيل الكهربائي بهلام الاكاروز خلو العزلة المحلية من البلازميدات. ادت تنمية البكتريا بوجود الزئبق والكروم والكوبلت الى حصول تغييرا في اشكال بعض من الخلايا الحية اذ ظهرت الخلايا بشكل كروي او كروي عصوي كما ظهرت بعض الخلايا متكسرة بشكل كبير, وقد تأثر نمو البكتريا بشكل كبير لعناصر الزئبق والكروم حيث لوحظ انخفاض في النمو البكتيري بعد 18 ساعة مقارنة مع مزروع السيطرة بينما ظهر تأثر نمو المزروع المعامل بالكوبلت بصورة اقل وقد ادى استخدام الزئبق والكوبلت الى الحصول على طفرات حساسة للحرارة وبعدد وصل الى 200- 300 خلية بكتيرية طافرة/ مل على التتابع لكل 104 خلية/ مل وعدم ظهور طفرات لمعاملات الكروم. أظهر طيف امتصاص مستخلص الاحماض النووية للاطوال الموجية 200- 400 نانومتر عدم تغير طيف الامتصاص عند استعمال الزئبق وحصول تغير في شكل وامتداد منحني الدنا عند اخذ طيف الامتصاص للمزارع المعاملة بالكروم والكوبلت.


Article
ISOLATION AND IDENTIFICATION OF PHYTOHORMONE PRODUCING BACTERIA FROM RHIZOSPHERE OF SORGHUM (sorghum bicolor)
عزل وتشخيص البكتريا المنتجة للهرمونات النباتية من محيط جذور الذرة البيضاء

Loading...
Loading...
Abstract

This research was aimed to isolate and identify rhizospheric bacteria capable for producing indole acetic acid and indole butric acid. However, quantification of IAA choose the best producing isolate. Two nitrogen free media and modified minimal medium (MS) with tryptophan were used in bacterial isolation. Different bacterial isolates (non spore forming and spore forming) were screened for IAA production. Qualitative screening of bacteria indicated that only six isolate out of thirty two produced red zone around the bacterial growth after treatment with Salkawski's reagent. The radius of zone reached to 30 mm with KM2 isolate culture, whereas, five non spore forming isolates and two spore forming isolates produced red zone appeared restricted to the growth. Quantitative determination indicated that KM2 produced 15 microgram/ml IAA followed by B2 which produced 11 microgram/ ml. The identification tests indicated that the isolate KM2 is belong to Pseudomonas spp and B2 to Bacillus spp. Analysis by HPLC depending on standard phytohormones showed that indole acetic acid (IAA) and indole butric acid (IBA) were produced by both isolates.

تهدف الدراسة الحالية الى عزل وتشخيص البكتريا من محيط جذور الذرة البيضاء والتحري عن قابليتها لانتاج الهرمونات النباتية من مواد الاندول اسيتك اسيد والاندول بيوتريك اسيد وتحديد العزلة الاكثر انتاجاً. استعملت اوساط انتخابية مختلفة منها وسطين خاليتين من النتروجين ووسط ادنى MS (minimal salt) المحور، ويحتوي على التربتوفان وقد عزلت اشكال مختلفة من العزلات البكتيرية غير المكونة للسبورات والمكونة لها على هذه الاوساط. وقد وجد ان ست عزلات من مجموع 32 عزلة تكون هالات حمراء اللون حول النمو البكتيري بعد اضافة كاشف سالكاوسكي عند غربلة العزلات لانتاج الاندول اسيتك اسيد ووصلت اقطار الهالات الى 30 ملم في العزلةKM2 بينما ظهر اللون الاحمر للكشف مقتصراً على النمو البكتيري في خمس عزلات غير مكونة للسبورات وعزلتين مكونتين للسبورات. اظهر التقدير الكمي انتاج العزلة KM2 لتركيز 15 مايكروغرام/ مل من الاندول اسيتك اسيد تبعتها العزلة B2 بانتاجها لتركيز 11 مايكروغرام/مل. شخصت العزلة KM2 لجنس Pseudomonas والعزلة B2 لجنس Bacillus وذلك اعتمادا على الشكل المظهري وبعض الفحوص الفسلجية. اظهر التحليل بواسطة HPLC واعتماداً على الهرمونات القياسية انتاج العزلتين KM2 و B2 لمادتي الاندول اسيتك اسيد والاندول بيوتريك اسيد.

Keywords


Article
Detection of Siderophores Production and Inorganic Phosphate Solubilization by Local Isolates of Fluorescent Pseudomonas
التحري عن انتاج بعض عوامل السايدروفورات واذابة الفوسفات اللاعضوية من قبل عزلات محلية لبكتريا Pseudomonas المتألقة

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to detect pyrovidene production and siderophore characterization from local isolates of fluorescent Pseudomonas which were isolated from rhizospheric region of sorghum. The isolates were tested for inorganic phosphate solubilization and biofilm formation. All isolates produced pyrovidene and other siderophores on King B broth comparing with pseudomonas broth, nutrient broth enriched with 10% egg white and succinate broth. Characterization of siderophores indicated the presence of hydroxymate siderophores from all isolates while only two isolates produced catechole siderophore. All isolates showed an ability of solubilized inorganic phosphate with release of 1795 ppm by 2nf isolate as comparing with minimum release 89 ppm by 6nf isolate. Biofilm could be detected on broth when bacterial biofilm adhering to the glass tube, black color formed at top of bacterial growth with Congo red stain on solid medium and on the bottom of liquid medium.

تهدف الدراسة الحالية الى التحري عن انتاج صبغات البايروفدين وتشخيص السايدروفورات المنتجة من قبل عزلات محلية لبكتريا Pseudomonas المتألقة والمعزولة من جذور الذرة البيضاء وقابلية هذه العزلات على اذابة الفوسفات اللاعضوية وتحديد العزلة الاكفأ في الاذابة وتكوين الاغشية الحيوية من قبلها. اشارت النتائج ان العزلات البكتيرية تقوم بانتاج البايروفدين وانواع مختلفة اخرى من السايدروفورات على وسط KingB السائل مقارنة مع كميات ضئيلة على اوساط السيدوموناس والمرق المغذي المدعم ببياض البيض ووسط السكسنيت. شخصت انواع السايدروفورات باستخدام المطياف الضوئي لتكون العزلات الاربع منتجة لنوع الهيدروكسميت سايدروفور بينما انتجت العزلتين 4nf و6nf نوعا اخر من السايدروفورات شخص بانه كاتيكول سايدروفور. استطاعت العزلات جميعها من اذابة الفوسفات اللاعضوي وبكفاءة متفاوتة لتعطي العزلة 2nfتركيز 1795 جزء بالمليون فسفور ذائب مقارنة مع العزلة 6nf اذ اعطت 89 جزء بالمليون فوسفات ذائب. عملت تلك العزلات البكتيرية في تكوين الاغشية الحيوية والتحول من الشكل المتحرك الطافي في الوسط السائل الى الشكل الملتصق على جدار انبوب التنمية, كما ادى استخدام صبغة الكونغو الاحمر الى ظهور راسب اسود على اجزاء من النمو البكتيري في الوسط الصلب وظهور راسب اسود في قعر انبوب التنمية للوسط السائل.


Article
Isolation and Identification of Bacterium Bacillus thuringiensis from Iraqi Soil and Itʼs Uses against Larvae of Ephestia cautella (Welker)
عزل وتشخيص بكتريا Bacillus thuringiensis من الترب العراقية واستخدامها ضد يرقات حشرة عث التين (Welker)Ephestia cautella

Loading...
Loading...
Abstract

The fig moth Ephestia cautella(Welker) is one of the most insect that cause damage to the stored date, the aim of this research is to isolate Bacillus thuringiensis from Iraqi soil, screening of the most efficient biological control isolate against Ephestia cautella larvae. Twenty out isolates belong to Bacillus spp., from pretreatment larvae of E. cautella by suspension of soil samples, 8 out of isolates identified as B. thuringienisis these 8 isolates appeared to be hydrolytic enzymes (protease, lipase, gelatinase and hemolysin) able to form biofilm. Seven isolates showed penicillin resistant and only one isolate was resisted chloramphenicol while all remaining isolates were sensitive for tetracycline, nalidexic acid and enoxane. Different range of their insecticidal percentage was found against larvae of E. cantella with appearance of darkening of their body. B. thuringiensis KS3 was the most efficient caused 80% killing, gave 3.7 mg ml-1 of LC50 comparing with 4.6 mg ml-1 for commercial B. thuringiensis kurstaki. SDS PAGE electrophoresis showed similar pattern of protein with the commercial strain.

تعد حشرة عثة التين (Welker) Ephestia cautella احدى اهم الحشرات المخزنية التي تصيب يرقاتها التمور المخزونة لذا هدف البحث الى عزل بكتريا Bacillus thuringiensis من الترب المحلية وتشخيصها وغربلة العزلات ذات الكفاءة في المقاومة الاحيائية من يرقات حشرة عثة التين. عزلت 20 عزلة تعود الى جنس Bacillus من يرقات حشرة عثة التين المعاملة بعالق سبورات التربة وشخصت 8 عزلات بانها تعود لبكتريا B. thuringiensis. وقد تبين انها منتجة لانزيمات البروتيز واللايبيز والجيلاتينيز والهيمولايسين وتتميز بقابليتها على تكوين الاغشية الحيوية وان 7 من العزلات المحلية تقاوم المضاد الحيوي البنسلين واظهرت عزلة واحدة مقاومة المضاد الحيوي الكلورامفينكول واظهرت بقية العزلات حساسية تجاه الكلورامفينكول والتتراسايكلين والنالديكسيك اسيد والاينوكسين. بينت غربلة عزلات B. thuringiensis تفاوت في نسب قتل يرقات حشرة عث التين حيث اعطت العزلة المحلية B. thuringiensis KS3 نسبة قتل تصل الى 80 % من يرقات الحشرة مع اسودادها نتيجة فعالية السم البكتيري. وتبين ان التركيز القاتل النصفي هو 3.7 ملغم مل-1 مقارنة مع 4.6 ملغم مل-1 للعزلة التجارية كما اوضح نمط الترحيل الكهربائي بهلام متعدد الاكريل امايد بوجود SDS نمطا من البروتينات مشابه لنمط بروتينات العزلة التجارية.

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

Arabic (3)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2017 (2)

2016 (1)

2015 (1)

2014 (2)