research centers


Search results: Found 4

Listing 1 - 4 of 4
Sort by

Article
Association of Genetic Polymorphisms in a Sample of Iraqi Patients with Type2 Diabetes Mellitus

Author: Ruaa H. Abdul Ridha, Nuha J. Kandala
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 3 Pages: 78-84
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Type 2 Diabetes (T2D) is a progressive condition that is characterized by high blood sugar (hyperglycemia)‚ with T2D the body either resist the effect of insulin or does not produce enough insulin. In order to underline the role of the genes involved in this study‚ we investigate ‚using PCR-RFLP for CTLA-4 gene ‚ PCR-RFLP and sequencing for VDR gene. Polymorphisms of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) belonging to both genes in 60 T2D patients and 30 healthy control from Iraqi population. The present local study demonstrated that VDR FoK-I‚ FF genotype (P = 0.04) and F‚f alleles (P=0.07) frequencies were significantly associated while VDR Bsm-I was significantly non-associated. CTLA-4 -1722(T>C) and +49 (A>G) shows non-significant association. These result suggest the involvement of VDR gene in the genetic susceptibility to T2D. Interestingly FoK-I‚ contributes to increasing the risk to the disease in our population. However‚ Further studies are require to confirmed this finding.


Article
The Molecular Detection of HPV Infection in samples of Iraqi Women with Abnormal cervical Smears

Authors: Mais N. Abdul-samad --- Nuha J. Kandala
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2018 Volume: 59 Issue: 4B Pages: 1995-2004
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Human papillomavirus (HPV) types 16 and 18 cause almost 70% of cervical cancer cases worldwide. Recently, testing for high-risk HPV types have been adopted by clinical practices for the early detection of cervical cancer in conjunction with cytology tests. Cervical swab samples were collected at the Outpatient Gynecology department of Baghdad Teaching Hospital. These samples consisted of a patient group of 50 samples, and a healthy control group of 10 samples. A papanicolaou test (abbreviated as a Pap test) was also performed for each woman to examine the epithelial cells of both the endocervix and the upper vaginal region. Total DNA (genomic, mitochondrial, and viral) was extracted from cervical swab samples for molecular studies. HPV DNA testing was first done by using Real-Time PCR technology to target the L1 region of HR-HPV with specifically designed primers. This was followed by using AmpliSens kit for specific detection and genotyping of HPV16 and 18 with multiplex Real-Time PCR. The results of RT-PCR detection revealed that out of 16 samples detected with high-risk HPV, 5 samples were shown to be infected with HPV-16 and 5 samples were shown to be infected with HPV-18. These results show a significant relationship between the histological outcome of the patient and persistent HPV infection.


Article
Genotyping of Staphylococcus aureus Isolates Based on Methicillin-Resistance Genes and its Relatedness to some Putative Virulence Factors
التنميط الوراثي لعزلات بكتريا المكورات العنقودية الذهبية على اساس الموروثات المشفرة للمقاومة للمثيسلين وعلاقتها ببعض عوامل الضراوة الشائعة

Authors: Nuha. J. Kandala نهى جوزيف قندلا --- Mahammad Abdulateef محمد عبد اللطيف --- Nadia Imad ناديه عماد
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2017 Volume: 58 Issue: 2A Pages: 626-638
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The emergence and spread of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) was a public health problem worldwide that causes nosocomial and community infections. Forty three isolates (71.66%) were characterized as S.aureus, were isolated from 60 different clinical specimens (blood, nose, wound, urine and vaginal) collected from patients from different hospitals of Baghdad. All isolates were resistant (100%) to Aztreonam, Carbenicillin, Cifixime, Cefoxitin, Ceftazidime, and showed high resistance to each of Methicillin, Oxacillin, Ampicillin and Penicillin . the MRSA isolates were typed based on (SCCmec) typing ,the result revealed that SCCmecIVa was the most common in isolates (41.86%), following type IVc (20.93%), type II(16.27%). Virulence factors were identified to detect genes encoding for Hlg,Pvl,ClfA,Tsst-1 and Eta, and the result showed the most prevalent gene was hlg (65.11%), following pvl (53.48%), clfA (51.16%), tsst-1(18.60%),eta (11.62%). The virulence genes profiles were observed, and the most frequent was clfA-hlg-pvl (23.25%), clfA-hlg-pvl-tsst-1 (6.97%),clfA-hlg-tsst-1(4.65%).Analysis of genetic similarity relationship, showed the isolates of S.aureus were classified into two main clusters . This result indicates that there a diversity in virulence genes profiles among MRSA isolates according to SCCmec types, and SCCmec IVa carried hlg, pvl , clfA genes was the most prevalent in Baghdad hospital isolates .

يعد انتشار العزلات المقاومة للمثسيلين من بكتريا المكورات العنقودية الذهبية مشكلة صحية خطيرة في العالم مسببة ظهور اصابات في المستشفيات والمجتمع تم الحصول على 43 %(71.66) عزلة بكتيرية تعود الى بكتريا S. aureus من مجموع 60 عينة, جمعت من عينات سريريه مختلفة شملت (الدم, الانف, الجروح, الادرار, المهبل) وبنسب تواجد مختلفة كانت % (60, 66.66, 71.42, 77.77, 90) على التوالي, من مستشفيات مدينة بغداد .أجري اختبار فحص الحساسية لبكتريا S. aureus تجاه 19 مضادﺁ حيويآ , اظهرت النتائج أن جميع العزلات كانت مقاومة (%100) للمضادات Aztreonam Carbenicillin, Cifixime Cefoxitin, Ceftazidime, . واظهرت هذة العزلات مقاومة عالية لكل من المضادات الاتية Methicillin, Oxacillin, Ampicillin Penicillin . أجري التحليل الجزيئي لانواع SCCmec لعزلات MRSA باستخدام 8بادئات متخصصة وقد أظهرت النتائج أن النوع SCCmecIVa (% 41.86)هو أكثر شيوعآ في عزلاتMRSA ويتبعه النوع type IVc (% 20.93) (%16.27) type II,والانواع type III, type IVd, typeVبنسبة (%2.32) , بينما لم يتم الكشف عن النوع typeI والنوع typeIVd في عزلات MRSA. أجري التحليل الجزيئي للمورثات المشفرة لعوامل الضراوة ا باستخدام 5 بادئات متخصصة للمورثات المشفرة إلى Pvl, Hlg, Eta, ClfA, Tsst-1 . أنتجت هذة البادئات حزمة واحدة ذي وزن جزيئي(433bp) للمورث المشفر pvl و535bp)) hlg eta (190bp), clfA(292bp), و 559bp)) TSST-1.أوضحت النتائج أن المورث المشفر hlg هو اكثر انتشارآ (%65.11)مقارنة مع المورثات المشفرة لعوامل الضراوة الاخرى (pvl clfA,,TSST-1 eta) حيث اظهرت انتشارآ بنسب 11.62, 18.60, 51.16, 53.48)) %على التوالي. تم التحري عن العلاقة بين الانواع SCCmec لعزلات MRSA والمورثات المشفرة لعوامل الضراوة , أوضحت النتائج بأن انتشار المورثات المشفرة لعوامل الضراوة كان مختلفآ ضمن انواع عزلات SCCmec واكثر الانواع شيوعا clfA-hlg-pvl (23.25%), clfA-hlg-pvl-tsst-1 (6.97%),clfA-hlg-tsst-1(4.65 . أوضحت نتائج التحليل الوراثي لعلاقة التشابه بين العزلات والتي قسمت الى مجموعتين اساسية بأن هنالك تنوع في المورثات المشفرة لعوامل الضراوة ضمن عزلات MRSA اعتمادآ على الانواع SCCmec , حيث وجدت أن معظم عزلات النوع SCCmec Iva تحمل أكثر من مورث مشفر للضراوة وأن معظم عزلات النوع SCCmec IVc تحمل مورثآ واحدآ , بينما معظم عزلات النوع SCCmec II لم تحمل مورثات مشفرة للضراوة .أشارت النتائج بأن النوع أكثر أنتشارآ كان النوع SCCmec Iva الحامل للمورثات المشفرة لعوامل الضراوة hlg, pvl, clfA في عزلات مستشفيات بغداد.


Article
The genetic inhibition of some pathogenic bacterial isolates related to Enterobacteriaceae by using Different leaves extracts of Cider (Nabag) Zizyphus spina-christa
التثبيط الوراثي لبعض الممرضات البكترية التابعة للعائلة المعوية Enterobacteriaceaeبا ستخدام مستخلصات اوراق نبات السدر (النبق) Zizyphus spina-christa

Authors: Ramina M. Khoshaba رامينا ميخائيل --- Ibtehal. Abdul-Hade ابتهال عبد الهادي --- Nuha J. Kandala نهى جوزيف قندلا
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2012 Volume: 9 Issue: 1 Pages: 93-103
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The plant Zizyphus spina-christa grows wildly in the middle and southern of Iraq locally named Nabag. In this study the antibacterial activity of several different plant extract (alcoholic hot and cold extract 80%, aqueous hot and cold extract) was tested against some gram negative bacteria that related to Enterobacteriacea as follow; Pseudomonas aeruginosa, Escherchia coli Proteus mirabilis, Serratia mercesence,. Aeromonas sp, Klebsiella pneumoniae ,Shigella sp, Salmonella enteritidis (134), S. typhi(97), S. typhimurium (300) , S. typhi, . The results showed that efficient method of extract was alcoholic hot extract from other extract methods that are used in this study. The detection of active compound in crude extracts of the leaves showed positive reaction for alkaloids, flavonoides, saponin,peptides, tannins and carbohydrates , while the aqueous hot and cold extract did not give any reaction against terpenes ,resins and coumarins . Minimum inhibitory concentration (MIC) of the ethanolic hot extracts of plants was determined and the results showed that MIC of S.typhi was 25 mg / ml and 250 mg/ml aganist Klebsiella pneumoniae Serratia mercesence , Pseudomonas aeruginosa , while other isolates showed variety in their inhibitory action. the ethanolic hot extracts of plants did not show any bacteriocidal effect against all bacteria that included in this study within concentration that used except S. typhi in concentration 50 mg/ml . The effect of Sub – MIC of the ethanolic hot extract of plant on the production of some virulence factors from selective isolates S. typhi ,showed an inhibitory effect on production of H2S but no effect on others characteristic such, mannitol and glucose fermenter at 20 mg / ml . The electrophoresis of plasmid DNA isolated from bacterial cell treated with, alcoholic hot extract at sub-MIC concentrations had a curing effect on the plasmid of S. typhi .Using infrared spectroscopy spectrum indicates the possible effect of alcoholic hot extract on the conformation of the DNA molecules affecting some of its biological functions.

ينمو نبات السدر Zizyphus spina-christa بشكل واسع في جنوب ووسط العراق والذي يعرف محلياً النبق او النبك Nabag . في هذه الدراسة اختبرت الفعالية ضد البكترية لمستخلصات مختلفة لاوراق هذا النبات والتي شملت (الاستخلاص بالكحول الحار والبارد 80% ، ,الاستخلاص المائي الحار و البارد) ضد العزلات البكتيرية السالبة لصبغة كرام التي تعود للعائلة المعوية والتي شملت Pseudomonas aeruginosaو Escherchia coli و,mercesence Serratia. و. Aeromonas sp و KlebsielLa pneumoniae , Shigella sp و S. entritidis (134), Salmonella typhi(97), Salmonella. Typhimurium (300), S. typhi..و Proteus mirabilis. وأظهرت النتائج كفاءة طريقة الاستخلاص بالكحول الحار لأوراق نبات السدر عن باقي طرق الاستخلاص المستخدمةتم في هذه الدراسة التحري عن محتوى المركبات الفعالة للمستخلصات المختلفة لاوراق نبات السدر وقد لوحظ من الكشوف النوعية للاوراق احتوائها على الفينولات والتانينات والقلويدات والفلافونات والببتيدات والكاربوهيدرات والصابونيات, في حين لم يظهر كل من المستخلص المائي الحار والمستخلص المائي البارد اختبارا ايجابيا تجاه الراتنجات والتربينات والكومارينات . وشملت الدراسة أيضاً تحديد التركيز المثبط الادنى والقاتل للمستخلص الكحولي الحار لاوراق نبات السدرتجاه جميع عزلات بكتريا الاختبار, اذ بلغ التركيز المثبط الادنى 25 ملغم/مل تجاه العزلة البكترية S. typhi في حين بلغ اعلى تركيز مثبط ادنى 250 ملغم/ مل تجاه العزلاتKlebsiella pneumonia و mercesence Serratia .وPseudomonas aeruginosa في حين تباينت قابلية باقي العزلات في تثبيطها. ولم يبدي المستخلص الكحولي الحار لاوراق هذا النبات تاثير قاتل ضد جميع العزلات البكترية المشمولة في هذه الدراسة ضمن التراكيز المستخدمة باستثناء بكتريا S. typhi عند تركيز 50 ملغم/ مل .كما درس تاثير المستخلص الكحولي الحار في التركيز تحت التركيز المثبط الادنى (20) ملغم تجاه بعض عوامل الضراوة لبكتريا . S. typhi. وكان مثبطاً لاانتاج الـ H2S ولم يكن له تأثير في تخمير المانتول والكلكوز, كما اظهر تاثيرا محيد لبلازميد بكتريا S.typhi.. وعند تحليل الدنا باستخدام الاشعة تحت الحمراء وجد ان المستخلص الكحولي الحار عند التركيزاعلاه قد احدثا تغييراً في الوضعية العامة لجزيئة الـ DNA من ناحية التركيب الثانوي وبالتالي على بعض ادواره الوظيفية الحيوية.

Listing 1 - 4 of 4
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (4)


Language

English (4)


Year
From To Submit

2018 (1)

2017 (1)

2016 (1)

2012 (1)