research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Conventional and Molecular Typing of Salmonella enterica serotype Typhi Locally Isolated In Baghdad
دراسةالتنميط الجيني و التنميط المظهري لبكتريــــــا Salmonella enterica serotype Typhi في بغـــداد

Authors: Kawthar R. Latif كوثر رياض لطيف --- Wafaa H. Salih **وفاء حازم صالح --- Ashna J.Faik *آشنا جمال فائق
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2012 Volume: 9 Issue: 4 Pages: 632-639
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Phenotypic And genotypic characteristics of Salmonella enterica serotype Typhi have been determined for 29 isolates, from Baghdad in 2007. Conventional typing methods were performed by biochemical tests, and antimicrobial susceptibility test. Molecular typing performed by analysis plasmid DNA beside using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD-PCR). For the latter, two universal primers that have selected for the high discriminatory power were used for RAPD analysis. All isolates were belong one biotype according to the differention by their ability to decarboxylat lysine, 29(100%) were lysine (+). All the isolates were susceptible to the Antibiotics used. However, all the strains free of plasmids. RAPD was capable of grouping the strains in 6 genotypic patterns using primer 784, in 4 genotypic patterns using primer 787. Conventional phenotypic typing methods, as well as the DNA plasmid analysis, presented non significant discriminatory power; however, RAPD-PCR analysis showed discriminatory power, reproducibility, easy interpretation and can be considered as a promising alternative typing method for S. Typhi.

اجريت هذه الدراسة لايجاد مميزات التنميط المظهري و التنميط الجيني لـ 29 عزلة لبكتريا Salmonella enterica serotype Typhi جمعت في عام 2007 . شمل التنميط المظهري:التنميط الحيوي ( (Biotype والتنميط للمضادات الحياتية .التنميط الجيني وقد شمل:المحتوى البلازميدي (plasmid content) و استخدام احدى مؤشرات الدنا (DNA Markers) المعتمدة على الـ PCR وهي مؤشرات التفاعل التضاعفي العشوائي المتعدد الاشكال لسلسلة الدنا او الـ (RAPD) Random Amplified Polymorphic DNA حيث اختير لهذا الغرض بادئان (primer (لتحديد الحزم المتباينة Polymorphic bands. أظهرت الفحوص الكيموحياتية للسالمونيلا التايفي29 % 100)) تحت نمط واحد باستعمال نظام API-20E اعتمادا على قابلية البكتريا لاختزال مجمو عة الكربوكسيلية لـــ لايسين و كان جميعها (+) و اعتمادا على حساسية العزلات للمضادات الحياتية، وجد أن 29 100%)) عزلة كانت حساسة لجميع مضادات الحياة المستعملة .كذلك عند استخدم الترحيل الكهربائي لل DNA البلازميدي حيث أظهرت جميع العزلات المدروسة عدم امتلاكها للبلازميدات , عند إجراء التجارب الأولية لإيجاد الظروف المثلى لتفاعلات الـ PCR باستخدام دنا القالب والبادئات تم الكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل عزلة (اعدادها واحجامها الجزيئية) عند ترحيل نواتج التضاعف للعينات على هلام الاكاروز بعد تصبيغها ببروميد الاثيديوم. اعطت النتائج PCR-RAPD عند استخدام لبادئ 784 ستة أنماط جينية مختلفة و عند استخدام البادئ787 اظهرت النتائج أربعة أنماط جينية مختلفة . لم يظهرالتنميط المظهري و كذلك تحليل المحتوى البلازميدي(plasmid profile) إمكانية التفريق بين العزلات لغرض المقارنة وتحديد الانماط بين العزلات المدروسة. بينما أظهرت طريقة PCR-RAPD وجود القدرة التمييزية لتحديد الانماط الجينية بين العزلات المدروسة وبهذا اثبتت هذه الطريقة فاعليتها كوسيلة تنميط وبائية مقارنة بالطرق الاخرى مثل التنميط الحيوي ( (Biotype والتنميط للمضادات الحياتية و طريقة الكشف على المحتوى البلازميدي .

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2012 (1)