research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Expression Of Xylose Reductase Enzyme From Spathaspora passalidarum In Saccharomyces cerevisiae.
كلونة وتعبير إنزيم Xylose Reductase من passalidarum في Saccharomyces cerevisiae

Loading...
Loading...
Abstract

Baker’s yeast (Saccharomyces cerevisiae) has been genetically engineered to ferment the pentose sugar xylose present in lignocellulosic biomass. One of the reactions controlling the rate of xylose utilization is catalyzed by xylose reductase (XR).The current study describes xylose reductase from Spathasporapassalidarum with NADH preference. According to JGI site the gene coding for this enzyme contains 954 nucleotides and it consists of 317 amino acids. The restriction sites for the enzymes SacII and NotI located on the 5´ termini for both the forward and reverse specific primers were designed using Lasergen 9.0 program. The genomic DNA was isolated and purified from S .passalidarum. Polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify this gene. The amplified gene was cloned into pSN303 plasmid resulting of the pYIM1 plasmid and then transformed into Escherichia coli. This plasmid was reisolated from E. coli, sequenced,and finally transformed into S. cerevisiae. The yeast transformants carrying pYIM1 plasmid named YJTY1. The specific activity of enzyme was 1.55 and 0.48 U/mg on NADH and NADPH respectively for YJTY1. This enzyme has a natural preference for NADH which makes it a good candidate for combination with NAD+ dependent xylitol dehydrogenase which may enable S. cerevisiae to utilize xylose under anaerobic conditions and convert it to ethanol.

خميرة الخبزSaccharomyces cerevisiae حورت وراثيا لتخمر الزايلوز السكر الخماسي الموجود في الكتلة الحيوية اللكنوسيليلوزية. احد التفاعلات المسيطرة على استغلال الزايلوز يتم بواسطة إنزيم Xylose Reductase .الدراسة الحالية توصف إنزيم Xylose Reductaseمن Spathaspora passalidarum مع تفضيل للNADH . طبقا لموقع JGIفان الجين المشفر لهذا الانزيم يحتوي 954 قاعدة نايتروجينية ويحتوي على 317 حامض اميني. صممت مواقع القطع للانزيمين SacII و NotI الواقعة في الطرف النهائي 5 لكل من البادئ الأمامي والخلفي بواسطة برنامج Lasergen 9.0 . عزل الدنا الجينومي ونقي من S. passalidarum. ضخم هذا الجين بواسطة PCR . كلون الجين المضخم في البلازميد pSN303 لينتج البلازميدpYIM1 وحول الى بكتيريا Escherichia coli. عزل البلازميد مرة اخرى من E.coli وحدد تعاقبه واخيرا حول الى S. cerevisiae . المتحولات التي تحمل البلازميد pYIM1 سميت YJTY1. الفعالية النوعية للإنزيم كانت 1,55و 0,48 وحدة/ملغم على NADH وNADPH على التعاقب للسلالة. YJTY1 هذا الانزيم له تفضيل طبيعي للNADH الذي يجعله مرشح جيد لمزجه مع xylitol dehydrogenase المعتمد على NAD+ الذي يمكن أن يجعل cerevisiae S. قادرة على استغلال الزايلوز في الظروف اللاهوائية وتحويله إلى ايثانول


Article
The Effect of Static Magnetic Field on Growth and Biochemical Indices of Five Fungal Genera
تأثير المجال المغناطيسي الثابت على النمو والمؤشرات البايوكيميائية لخمسة أجناس فطرية

Loading...
Loading...
Abstract

The effect of static magnetic field (MF) on the growth and biochemical indices of five fungal genera were studied. Exposing the above genera to the northern pole, southern pole and both poles and their influences were compared with the control treatment (without MF energy). The static MF of 10 gauss was applied to the above fungal genera for seven days at 28°C. The effect of static MF energy on the growth of fungal genera on solid media Sabouraud Dextrose Agar (SDA) and Potato Dextrose Agar (PDA) was classified as stimulatory, inhibitory and no observable effect on growth of fungal genera. The effects of MF poles (southern, northern and both) inhibited the growth of Fusarium oxysporum, while the MF poles stimulated the growth of fungal genera (Aspergillus niger, Alternaria alternate and Penicillium chrysogenium) and had no observable effect of southern pole and both poles on growth of Rhizopus oryzae, while the northern pole inhibited the growth of R. oryzae compared with control group by measuring the growth diameter (cm). The effects of MF poles on the biochemical indices of the fungal genera were performed by filtering the growth and measuring the enzyme activity in the filterate. Exposing the fungal genera to the northern pole, southern pole. The fungal genera were influenced by MF energy for 3 days at 28°C and pH6.5 showed increased in the activities of amylase and protease due to northern pole at significant difference (at the 0.05 levels), the northern pole increased amylase activity (U/ml) in the culture medium filteratedof P. chrysogenumup to (0.246 U/ml) higher than other mentioned genera, A. niger, F. oxysporum, R. oryzae and A. alternata 0.172, 0.146, 0.116, 0.105U/ml respectively. The northern pole increased protease activity (U/ml) in the culture filterate of P. chrysogenumup to (0.081 U/ml) higher than other mentioned genera, A. niger, A. alternata , R. oryzae and F. oxysporum 0.08, 0.074, 0.056,0.054U/ml respectively and decreased when treated with southern pole however it was higher than the control treatment under optimum condition.

تم دراسة تأثير المجال المغناطيسي الثابت على النمو والمؤشرات البايوكيميائية لخمسة أجناس فطريةعائدة لأنواع مختلفة. تم تعريض هذه الأجناس الفطرية الخمسة إلى القطب الشمالي والجنوبي والاثنين معا (على جانبي طبق التنمية)، ثم قورن تأثير أقطاب المجال المغناطيسي على نمو الفطريات مع معاملة السيطرة على الوسط الصلب (Sabauroud Dextrose Agar (SDA) and Potato Dextrose Agar (PDA) ولمدة 7 أيام وبدرجة م. صنف تأثير المجال المغناطيسي على النمو (بالمحفز، المثبط، وبدون ملاحظة أي تغيير واضح على النمو باعتبار قطر النمو على الطبق) للأجناس المذكورة، وأظهرت الدراسة أن المجال المغناطيسي (الشمالي والجنوبي والاثنين معا) ثبطا النمو للفطر Fusarium oxysporum وحفزا النمو للفطريات Aspergillus niger, Alternaria alternate and Penicillium chrysogenum ولم يلاحظ أي تغييرمعنوي واضح في النمو على الفطرRhizopus oryzae نتيجة لتأثير القطب الجنوبي وكلا القطبين بينما ثبط النمو بتأثير القطب الشمالي للفطر نفسه مقارنة مع معاملة السيطرة. درس تأثير أقطاب المجال المغناطيسي (الشمالي والجنوبي) على الاميليز والبروتييز انزيم للأجناس الفطرية الخمسة من خلال ترشيح النمو وذلك قياس الفعالية الإنزيمية (وحدة/مل) في الراشح. عرضت الأجناس الفطرية الخمسة إلى المجال المغناطيسي لمدة 3 ايام بدرجة حرارة 28م، وأظهرت الدراسة انه الفعالية الإنزيمية للاميليز و البروتييز تزداد بتأثير القطب الشمالي وبفروق معنوية، حيث ازدادت فعالية الاميليز في راشح الزرع P. chrysogenum لتصل الى 0.246 وحدة/مل، واكثر من بقية الانواع A. niger, F. oxysporum, R. oryzae and A. alternate o.105٬0.116٬0.146،o.172 وحدة/مل على التوالي. اما الفعالية الانزيمية للبروتييز ازدادت بتأثير القطب الشمالي في راشح الزرع P. chrysogenum لتصل الى 0.081 وحدة/مل وأكثر من بقية الاجناس A. niger, A. alternate, R. oryzae , F. xoysporum ،0.054,0.056,0.074,0.08 وحدة/مل على التوالي. وقلت بتأثير القطب الجنوبي على الرغم من انه كان اعلى من معاملة السيطرة تحت الظروف نفسها.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2014 (1)

2013 (1)