research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Determination of optimal conditions for laccase production by Pleurotus ostreatus using sawdust as solid medium and its use in phenol degradation
تحديد ألظروف المثلى لأنتاج اللاكتيز من الفطر Pleurotus ostreatus بأستخدام نشارة ألخشب كوسط صلب و دور ألانزيم في تفكيك الفينول

Author: Abdulkareem jasim Hashim عبدالكريم جاسم هاشم
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2012 Volume: 9 Issue: 3 Pages: 491-499
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The ability of four local fungal isolates for extracellular laccase production has been tested with five grams 1:1(w/v) humidified sawdust as substrate in mineral salt medium. After 21 day of incubation at 25±1 ْ C and using one mycelial plug (5mm), higher level of laccase activity (0.15U/ml) and specific activity (15U/mg) were observed by Pleurotus ostreatus in comparison with other fungal isolates. The results of optimum conditions for laccase production from selected isolate showed that, the maximum laccase activity (0.55U/ml) and specific activity (55U/mg) were obtained at moisture ratio 1:3 (w/v), using 3 mycelial plugs (5 mm), after 15 days incubation period at 25±1 ْ C. The results of phenol degradation by crud laccase revealed that, 100% degradation of phenol occurred after 24 hr of incubation at 25 ْ C using shaking water bath except at 200mg/l, the remaining phenol was 10.13%.

أختبرت قابلية أربعة عزلات فطرية محلية على انتاج اللاكيز بأستخدام 5غم من نشارة ألخشب التي تم ترطيبها بمحلول معدني بنسبة 1:1 (وزن/ حجم) كوسط للانتاج خلال 21 يوم من الحضانة بدرجة 25 ±1 مْ وبعد تلقيح الوسط بقطعة واحدة من النمو المايسيلي للفطر بحجم 5ملم. أعلى مستوى للفعالية والفعالية النوعية (0.15 وحدة/ملم) ( 15وحدة/ملغم) كانت من الفطر Pleurotus ostreatus تم تحديد الظروف المثلى لانتاج الانزيم من العزلة الفطرية المنتخبة وكانت : 1: 3 (وزن/حجم) نسبة الترطيب، ثلاثة قطع من النمو الميايسيلي بحجم 5ملم، خلال 15 يوم من ألحضانة بدرجة 25 ±1 مْ حيث بلغت قيمة الفعالية والفعالية النوعية 0.55 وحدة/ملم 55 وحدة/ ملغم على التوالي. أعطت نتائج تحلل الفينول بأستخدام مستخلص ألانزيم ألخام نسبة 100 % بعد 24 ساعة من الحضانة بدرجة حرارة 25 ْم بأستخدام الحمام المائي الهزاز، عدا عند ألتركيز 200 ملغم/لتر فأن نسبة الفينول المتبقي كانت %10.13.


Article
PCR Detection of Aspergillus flavus Isolates for Aflatoxin B1 producer
المنتجه للافلاتوكسين Aspergillus flavus تشخيص عزلات للفطر B1 بأستخدام التفاعل التسلسلي لبلمرة الدنا

Loading...
Loading...
Abstract

The ability of five Aspergillus flavus that produce Aflatoxin B1 have been detected using coconut medium as substrate. Chromatographical analysis by TLC and HPLC revealed that, three out of five isolates were a good producer for the Aflatoxin B1. In this study, rapid assessment of five isolates of A. flavus was accomplished using an indigenously designed primer pair for the Aflatoxin regulatory gene aflR in polymerase chain reaction (PCR). Specificity was assayed in pure culture systems using DNA extracted from five different A. flavus isolates as PCR template. Positive amplification was achieved only with DNA from A. flavus that produce Aflatoxin B1.

هدفت الدراسه الى الكشف عن قابلية عزلات Aspergillus flavus لانتاج الافلاتوكسين B1 باستخدام جوز الهند كوسط زرعي بينت نتائج التحليل باستخدام تقنية الكروموتوغرافيه الطبقة الرقيقة و كروموتوغرافي السائل العالي الاداء ان ثلاث عزلات من بين خمسه كانت منتجه للافلاتوكسين B1. تم في هذه الدراسه الكشف السريع عن انتاج الافلاتوكسين B1 من العزلات المحليه الخمسه للفطر A. flavus و ذلك باستخدام زوجين من البوادئ متخصصه afl.R1 , afl.R2 لتحديد الجين المنظم لانتاج الافلاتوكسين aflR في تفاعل البلمره المتسلسل ( PCR ( باستخدام الدنا المستخلص من العزلات الخمسه كقالب.

Keywords

Aflatoxins --- Aspergillus flavus --- PCR --- aflR


Article
Cytotoxic Effect of Gliotoxin, Hemolysin, Protease and Melanin purified from Aspergillus fumigates on REF Cell Line, in vitro Study
التأثيرالسمي لسم الكلايوتوكسين و البروتيين المحلل للدم وانزيم البروتييز وصبغة الميلانين المنقاة من الرشاشيات الدخناء على خط الخلايا الليفية لجنين الجرذ، دراسة خارج الجسم الحي

Loading...
Loading...
Abstract

Aspergillus fumigates especially clinical isolate produces a series of toxic substances and proteinaceous hemolysin, protease and pigment like melanin which appear to act in an additive and synergic way on cells. In this study, gliotoxin, hemolysin, Protease, and Melanin were used in an experimental model to study their Cytotoxic activity by evaluating their effect on REF cell line (Rat embryonic fibroblast ), for exposure time of 24 hrs at three different concentrations of each compounds triplicate of each concentration were used, cytotoxicity of the purified compounds were active against REF cell line under study and a toxic effect was clear with a significant difference at the level of probability (p≤ 0.05) and this effect was contrasted among different concentrations for each purified compound growth inhibition of REF cell line was increase gradually with the increase of compound concentration.

الرشاشيات الدخناء وخصوصا العزلات السريرية تنتج سلسلة من المواد السامة والبروتينات المحلله للدم وانزيم البروتييز والصبغات مثل الميلانين والتي تبدوا أنها تعمل بصورة اضافية وطريقة تآزر على الخلايا. في هذه الدراسة تم استخدام سم الكلايوتوكسين, والبروتيين المحلل للدم وانزيم البروتييز والميلانيين في نموذج تجريبي لدراسة فعاليتها السمية من خلال تقييم تأثيرها على خط الخلايا الليفية الجنينية للجرذ بوقت تعرض 24 ساعة وبثلاث تراكيز مختلفة لكل مركب وبثلاث مكررات لكل منها سمية المركبات النقية قيد الدراسة فعالة والتأثير السمي واضح بفرق معنوي عند مستوى الاحتمالية(P≤0.05) تحت ظروف التجربة وكان هذا التأثير متباين بين التراكيز المختلفة لكل مركب من المركبات النقية، نسبة تثبيط نمو خط الخلايا اليفية لجنين الجرذ يزداد تدريجيا مع زيادة تركيز المركب.


Article
Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis to investigation of genetic diversity, and relationships among a set of clinical Aspergillus fumigatus isolates
استخدام مؤشرات ال RAPD في تشخيص التغايرات الوراثية والعلاقة بين عزلات سريرية من الرشاشيات الدخناء

Loading...
Loading...
Abstract

This study is an attempt to determine the genetic diversity and relationships among fourteen local isolate isolated from patients with Aspergillosis (Aspergillus fumigatus) by using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. Twelve universal primers used in this study produced 94 bands across fourteen isolates. Of these bands, 67 bands or 71.2% were polymorphic. The size of the amplified bands ranged between 100-2000 bp. The genetic polymorphism value of each primer was determined and ranged between 33-100%. In terms of unique banding patterns, determine the finger print for six isolates the most characteristic banding pattern was for the (AFU1, AFU2, AFU3, AFU4, AFU8 and AFU14) with primer (OP F-16 , OP I-06, OP F-16, OP X-01, OP X-01and OP A-06). Genetic distances ranged from 0.12419 to 0.64404 among A. fumigatus isolates. Cluster analyses were performed to construct a dendrogram among studied A. fumigatus isolates. The cluster analysis places most of the A.fumigatus isolates isolated from patient come from yhe same area into a close relation (subcluster) showing a high level of genetic relatedness and were distinct from isolates from another area (the other subcluster). Interestingly, a number of isolates originating from the same sources did form well defined groups, indicating association between the RAPD patterns and the geographic origin of the isolates. The information generated from this study can be used in the future for controlling of Aspergillosis programs.

في هذه الدراسة محاولة لتحديد التغايرات الوراثية والقرابة الوراثية بين 14 عزلة من الرشاشيات الخضراء معزولة من مرضى يعانون من داء الرشاشيات باستخدام مؤشرات مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا المتعدد الأشكال وقد استخدم 12 بادئ في هذه الدراسة وانتجت 94 حزمة رئيسية للعزلات الأربعة عشر من هذه الحزم 67 حزمة متباينة ويترواح الوزن الجزيئي للحزم المتضاعفة بين 100-2000 زوج قاعدي قيمة التغايرات الوراثية تراوحت بين 33-100% نمط الحزمة الفريدة استخدم لتحديد بصمة الدنا وفي دراستنا استطعنا تحديد البصمة لستة عزلات والتي تحمل الرمز AFU1,AFU2,AFU3, FU4,AFU8 and AFU14)) وكانت البادئات التي أعطت الأكثر تمييزا هي OP I-06, OP F-16, OP X-01, OP X-01and OP A-06) (OP F-16, . البعد الوراثي تراوح بين 0.12419 - 0.64404 بين عزلات الرشاشيات الدخناء المدروسة وقد تجمعت العزلات الأربعة عشر في المخطط الشجري في ثلاث مجموعات رئيسة،ضمت المجموعة الاولى اعتمادا على مكان سكن المريض الذي تم عزل الفطر منه وقد تجمت العزلات المعزولة من مرضى من مناطق متقارب في مجموعات متقاربة ، المعلومات التي حصلنا عليها في دراستنا ممكن أن تستخدم في السيطرة على المرض .


Article
Improving Conditions for Gliotoxin Production by Local Isolates of Aspergillus fumigatus
تحسين الظروف من عزلات محلية من الفطر Aspergillus fumigatus لأنتاج مستويات عالية من الكلايوتوكسين

Loading...
Loading...
Abstract

Thirty two isolates of Aspergillus fumigatus were obtained from a total of 44 samples of sputum, nose swab and tracheal aspirate from suspected patient with aspergillosis were also collected from February 2014 to June 2014. A morphological examination of A. fumigatus was first made with naked eye and at low magnification power of microscope after that detailed examination was done by measuring the dimensions of the microscopic structures, photographing the microscopic structures and using relevant literature. Results appeared conical-shaped terminal vesicles, uniseriate row of phialides on the upper two thirds of the vesicle, conidiophore stipes were short, phialides arrange uniseriate upper vesicle conidia and parallel to axis of conidiophore, produced in chains of spore basipetally from phialides, the chains of spore were borne directly in the absence of metulae and represented by septet and branching hyphae. The ability of A. fumigatus for GT production was investigated using thin layer Chromatography (TLC) and High Performance Liquid Chromatography (HPLC) techniques and results showed that GT was produced by 81.25% of A. fumigatus isolates. Optimum conditions for GT production by A. fumigatus 16 (AF-16) isolate were determined by submerged fermentation using Yeast extract sucrose medium. Results indicated that AF-16 isolate was the highest GT producer on Yeast Exract Sucrose medium with inoculum size 2×107 conidium and incubation at 32ºC for 15 days and the concentration of gliotoxin was (4511µg mL-1).

جمعت عينات من المرضى المتوقع أصابتهم بداء الرشاشيات إذ حصل على 32 عزلة من مجموع 44 عينة من القشع ومسحات الانف والقصبة الهوائية للمرضى المتوقع اصابتهم بهذا الداء جمعت العينات للفترة من كانون الثاني للعام 2014 لغاية حزيران 2014.عملت فحوصات مظهرية بالعين المجردة وعلى القوة الصغرى للمجهر لفطر Aspergillus fumigatus ثم تلاها الفحص الدقيق للفطر من خلال قياس أبعاد التراكيب المجهرية وتصويرها بالاعتماد على مصادر سابقة. أظهرت النتائج بوجود تراكيب مخروطية الشكل ذات نهابة حوصلية ذات صف واحد من الفياليدات (تسمى احيانا بالذنيبات) مرتبة على الثلث الثاني من الحوصلة، يتميز الحامل الكونيدي بكونه قصير وتترتب الكونيدات على الفياليدات في أعلى الحوصلة وتكون موازية للحامل الكونيدي، وتتولد الأخيرة (الكونيدات) بشكل سلسلة من الفياليدات إذ تتولد سلسلة السبورات هذه مباشرة بغياب الذنيبات الأبتدائية اذ تتكون بحاجز وهايفات متفرعة. كشف عن قابلية Aspergillus fumigatus على إنتاج الغلايوتوكسين بإستخدام تقنية كروموتوغرافيا الطبقة الرقيقة. أظهرت النتائج قابلية 25 عزلة(81.25%) من عزلات A. fumigatusعلى إنتاج السم بينما لم تظهر عزلات الكانديدا جميعها القابليةعلى الإنتاج. تمثلت الظروف المثلى لإنتاج الغلايوتوكسين لتخمرات الحالة السائلة بإستخدام وسط خلاصة الخميرة كمادة أساس للعزلة المنتجة الأكفأ التي يرمز لهاAF-16وحجم اللقاح 2×710سبوربدرجة حرارة 32 ºم لمدة 15 يوما" إذ كان تركيزالغلايوتوكسين 4511ميكروغرام مل-1بإستخدام تقنية الكروموتوغرافيا السائلة ذات الإداء العالي.

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

English (5)


Year
From To Submit

2017 (1)

2015 (1)

2014 (1)

2013 (1)

2012 (1)