research centers


Search results: Found 4

Listing 1 - 4 of 4
Sort by

Article
Extended spectrum ß-lactamase (ESBL) mediated resistance to third generation cephalosporins in urinary tract infection isolates of Klebseilla pneumonia

Authors: Suad Abdul-Hadi --- Zainab Jabir Hadi --- Ali Muhsin Almohana
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2010 Volume: 6 Issue: 9 Pages: 142-158
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Purpose: To examine the dissemination of extended spectrum ß-lactamase (ESBL) producing isolates of Klebseilla pneumoniae obtained from patients with significant bacteriuria.
Methods: ESBL and multiantibiotic resistance were studied in a total of 25 isolates of K. pneumoniae.
Results: all isolates found resistance to at least five of the antibiotics used in this study. All the isolates were found sensitive to the antibiotic imipenem. 5 (22.7%) of these isolates were ESBL producing. The ESBL producing isolates were more resistant to antibiotics than non-ESBL isolates. The ESBL activity could be experimentally transferred to recipient Escherichia coli MM294.
Conclusions: present study has found the occurrence of ESBL producing K. pneumoniae isolates in Najaf hospitals. Test for the detection of ESBL producing bacterial isolates should be carried out in all diagnostic laboratories routinely and the therapeutic use of all the third generation cephalosporins should be avoided against bacterial isolates that appear resistant to any third generation antibiotic.

الغرض من الدراسة: التحري عن انتشار بكتريا Klebsiella pneumoniaeالمنتجة لأنزيمات ألبيتا لاكتاميز واسعة الطيف المعزولة من المرضى الذين لديهم نسبة ملحوظة من البكتريا في الإدرار.طرائق العمل: تم دراسة المقاومة لمضادات ألبيتا لاكتام واسعة الطيف والمقاومة المتعددة للمضادات الحيوية ل 25 عزلة K. pneumoniae.النتائج: وجد أن جميع العزلات كانت مقاومة على الأقل لخمس أنواع من المضادات الحيوية المستخدمة في هذه الدراسة بينما أظهرت جميعها حساسية إلى الامبينيم. بينت النتائج إن 5 ( (22.7%من العزلات منتجة لأنزيمات ألبيتا لاكتاميز واسعة الطيف. إن العزلات المنتجة لأنزيمات واسعة الطيف كانت أكثر مقاومة للمضادات الحيوية من العزلات الغير منتجة. كما إن صفة إنتاج أنزيمات ألبيتا لاكتاميز واسعة الطيف تم نقلها عمليا إلى السلالة المستلمة Escherichia coli MM294. الاستنتاجات: بينت الدراسة الحالية ظهور عزلات من K. pneumoniae منتجة لأنزيمات ألبيتا لاكتاميز ذات الطيف الواسع في مستشفيات النجف. إن استخدام الفحوصات الخاصة بالكشف عن هذه العزلات يجب أن تجرى في جميع المختبرات التشخيصية الروتينية وكذلك تجنب استخدام كافة مضادات الجيل الثالث من السيفالوسبورين لعلاج البكتريا المعزولة والتي تظهر مقاومة لأي مضاد منها.

Keywords


Article
Isolation and Identification of Acinetobacter baumannii Clinical Isolates using Novel Methods

Authors: Zuhair Sadiq Al Sehlawi --- Ali Muhsin Almohana --- Azhar Ammran Al Thahab
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2014 Volume: 22 Issue: 3 Pages: 1041-1050
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Acinetobacter baumannii has emerged over the last decade as a significant opportunistic pathogen. Although it is generally associated with benign colonization of hospitalized patients. The purpose of this study was undertaken to isolate and identify of A. baumannii from clinical infections using different laboratory methods. A total of 520 clinical samples (wound pus, urine, respiratory secretion, blood) were collected from February to June, 2011. A. baumannii isolates were preliminary identified according to the morphological characteristics and traditional biochemical test. Then confirmed by using API 20E and API 20 NE multi-test system. Isolates were further identified on molecular level using 16S rRNA specific gene by polymerase chain reaction (PCR). All PCR positive isolates were examined to grow on CHROMagar Acinetobacter/MDR medium and their antibiotics susceptibility. A total of 335 Gram negative bacilli isolates were obtained according to the morphological characteristics and traditional biochemical test. Only 23(6.8%) were identified as suspected A. baumannii. Ten (43.4%) isolates revealed very good identification level by API 20E system. While, API 20 multi-test system for non enteric bacteria identified only 12(52.1%) isolates belonged to A. baumannii. The same isolates harbored positive bands in PCR experiments with specific primers for16S rRNA gene. A. baumannii isolates were distributed as 6(50% ) recovered from urine, 4(33.3%) from lower respiratory secretion and only two (25%) were obtained from wound pus, no A. baumannii isolates were isolated from blood samples in this study. Hence, 6 (50%) of isolates were gave overnight pure growth on CHROMagar Acinetobacter/MDR medium with resistant to representatives of three or more classes of antibiotics. The present findings suggest that the PCR using16S rRNA gene CHROMagar were gold standard method for detection of multi-drug resistant A. baumannii isolates among patients in Najaf hospitals.

هدفت الدراسة إلى عزل وتشخيص بكتريا Acinetobacter baumannii من إصابات سريريه مختلفة باستخدام الطرق المختبرية التقليدية والجزيئية والعزل على الأوساط الخاصة. جمعت 520 عينة سريريه (مسحات الجروح, الادرار, افرازات المجاري التنفسية, الدم) خلال الفترة من شباط إلى حزيران من العام 2011 من المرضى الراقدين والمراجعين لثلاث مستشفيات رئيسية في النجف . تم التشخيص الأولي لعزلات بكتيريا A. baumannii اعتمادا على الخصائص المظهرية للبكتريا وفعاليتها الكيموحيوية . كما تم إجراء الفحوصات التأكيدية للتشخيص باستخدام أنظمة التشخيص للاختبارات الكيموحيوية المتعددة API 20E و API 20 NEالخاصة بالبكتريا المعوية وغير المعوية . تم تشخيص بكتريا A. baumannii ولأول مرة على المستوى الجزيئي باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل PCR للتحري عن وجود ألجين الوراثي المشفر للجزء الرايبوسومي S16 من الحامض النووي rRNA الخاص بهذه البكتريا. زرعت العزلات الحاملة للجين على الوسط التشخيصي CHROMagar Acinetobacter/MDR كطريقة تأكيدية وتشخيصية للعزلات المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية بالمقارنة مع طريقة الاقراص. تم عزل 335 عزلة بكتيرية سالبة لصبغة غرام حسب نتائج الفحوصات المظهرية والكيموحيوية . كان من بينها 23 (6.8%) عزلة مشتبه بها تابعة لبكتريا A. baumannii . أبدت نتائج التشخيص باستخدام نظام API 20E إن 10 (43.4 %) كانت تابعة لنفس البكتريا وبمستوى تشخيصي عالي , في حين أظهرت 12(52 %) عزلة نتائج موجبة باستخدام نظام API 20NE. كما كشفت تجربة PCR للتحري عن ألجين الوراثي 16S rRNA إن العزلات الموجبة لفحص API 20NE كانت حاملة لهذا الموروث. ستة عزلات (50%) منها كانت مقاومة لاكثر من ثلاث اصناف من المضادات الحياتية ,كما و أعطت نموا واضح على الوسط التشخيصي CHROMagar Acinetobacter/MDR . خلصت الدراسة إلى وجود بكتريا A. baumannii كمسبب مرضي بين المرضى في مستشفيات النجف, و اعتبر كل من تقنيتي PCR و CHROMagar طرق مثلى لتشخيص بكتريا A. baumannii المتعددة المقاومة للمضادات الحيوية.

Keywords


Article
Occurrence and Detection of Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae Clinical Isolates in Najaf Hospitals
حدوث والكشف عن Carbapenemase المنتجة للالكلبسيلة الرئوية عزلات السريرية في مستشفيات النجف

Loading...
Loading...
Abstract

Resistance to carbapenems is emerging, and it is a great problem to therapeutics. Carbapenemase producing Klebsiella pneumoniae have been reported to be important cause of nosocomial infections. There is no information available on carbapenemase producing K. pneumoniae from Najaf. The purpose of this study was undertaken to determine the occurrence of carbapenmase including metallo β-lactamases (MBLS), Klebsiella pnuemoniae carbapenemase (KPC) and GES-β-lactamase producing K. pneumoniae. A total of 770 clinical samples were collected from April to July, 2010. The K. pneumoniae isolates were identified according to API 20E system. Phenotypic detection of carbapenemase was performed by using the imipenem-EDTA disk method and confirmed by the modified Hodg test. KPC was detected on KPC CHROMagar medium. The isolates were subjected to polymerase chain reaction (PCR) assays with specific primers for blaIMP, blaVIM blaKPC. blaCTX-M and blaAmpC. Only 108 (14.%) K. pneumoniae isolates were recovered from clinical infections. only 95 (88%) isolates were β-lactam resistant (resistant to both ampicillin and amoxicillin). Of the β-lactam resistant isolates, 4/95 (4.2%) were found to be carbapenem disk resistant, of which,2 (50%) gave positive result with the imipenem-EDTA test, 4 (100%) gave positive result with modefied Hodg test and all isolates (100%) gave heavy growth on KPC CHROMagar. In PCR experiments using specific primers for blaIMP, blaVIM and blaKPC genes, the results were negative among all isolates. All isolate were harbored blaCTX-M and blaAmpC genes. The present findings suggest that the spread of carbapenemases in isolates is high in Najaf.

تعتبر مقاومة مضادات الكاربابنيم من المشاكل التي تواجه العلاجات الدوائية حاليا. والذي يتوسطه في كثير من الأحيان إنتاج إنزيمات الكاربابنيميز الذي تنتجه بكتريا الكلبسيلا الرئوية والمسببة لعدوى المستشفيات المكتسب. ولعدم وجود أي معلومات تفيد عن انتشار البكتريا المنتجة لهذا الانزيم والمقاومة لمضادات الكاربابنيم في مستشفيات النجف, جاء هدف هذه الدراسة لتحديد انتشار هذه البكتريا في محافظة النجف. جمعت 770 عينة سريرية من مستشفبات النجف للفترة بين نيسان وتموز لعام 2010. استخدمت الاختبارات المظهرية التأكيدية لإنزيمات الكاربابنيميز والتي أكدت باستخدام تقنية تفاعلات البلمرة PCR للتحري عن الجينات المنتجة لهذا الإنزيم. تم تشخيص 108)14.0%) عزلة تابعة لبكتريا الكليبسيلا الرئوية. وجد إن 95 (88%) منها كانت مقاومة لمضادات البيتالاكتام بشكل عام . أربعة عزلات (4.2%) فقط أبدت مقاومة مظهرية لمضادات الكاربابنيم بطريقة انتشار القرص لكيربي-باور, منها عزلتان (50%) أعطت فحصا موجبا لاختبار imipenem-EDTA test. كما ان جميع العزلات المقاومة للكالربابنيم كانت موجبة لاختباري modefied Hodg test و KPC CHROMagar. كانت نتيجة PCR سلبية لجميع جينات الكاربابنيميز blaIMP, blaVIM blaKPC قيد الدراسة. في حين أعطت هذه العزلات نتيجة ايجابية للجينات المنتجة لإنزيمات البيتالاكتانيز واسعة الطيف CTX-M وجين AmpC.


Article
Prevalence of Plasmid-Mediated Quinolone Resistance Genes (qnr) in Clinical Isolates of K. pneumoniae in Najaf
انتشار جينات مقاومة الكينولون بوساطة البلازميد (qnr) في العزلة السريرية للالتهاب الرئوي K في النجف

Authors: Ali Muhsin Almohana علي محسن المحنة --- Samer Abdulsahib Mahammad Hassein سامر عبد الصاحب محمد --- Zainab Jaber Hadi زينب جابر هادي
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2016 Volume: 12 Issue: 22 Pages: 155-160
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Introduction: The main purpose of this study was to investigating the presence of qnr-genes among clinical isolates of K. pneumoniae recovered from Najaf hospitals. Material and methods: A total of 1590 clinical specimens were obtained from three main hospitals. The Klebsiella spp. were identified by traditional biochemical tests, and confirmed by API 20E system.Theisolates that exhibited reduce susceptibility to quinolones were examined for the presence of PMQR qnr (qnrA, qnrB, and qnrS qnrC, and qunD). Results: The qnr genes were detected in 20 (63.5%) isolates qnrB, qnrA and qnrS were identified in 17 (23%), 2 (2.7%) and 1 (1.4%) respectively. Conclusion: K. pneumoniae isolates harboring PMQR are currently widely distributed in Najaf hospitals.

مقدمة: كان الهدف الرئيسي من هذه الدراسة هو التحقيق في وجود جينات qnr بين العزلات السريرية للالتهاب الرئوي K. المستردة من مستشفيات النجف.المواد والطرق: تم الحصول على ما مجموعه 1590 عينة سريرية من ثلاثة مستشفيات رئيسية. و Klebsiella النيابة. تم التعرف عليها من خلال الاختبارات الكيميائية الحيوية التقليدية ، وأكدها نظام API 20E. تم فحص المواد العازلة التي عرضت تقليل قابلية الكينولون لوجود PMQR qnr (qnrA ، qnrB ، و qnrS qnrC ، و qunD).النتائج: تم اكتشاف جينات qnr في 20 (63.5 ٪) تم تحديد qnrB ، qnrA و qnrS في 17 (23 ٪) ، 2 (2.7 ٪) و 1 (1.4 ٪) على التوالي.الخلاصة: إن العزلات الرئوية المزمنة التي تؤوي PMQR يتم توزيعها على نطاق واسع في مستشفيات النجف.

Listing 1 - 4 of 4
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (4)


Language

English (4)


Year
From To Submit

2016 (1)

2014 (1)

2013 (1)

2010 (1)