research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
enotypical and phenotypical detection of hemolysin enzyme of Escherichia coli causing urinary tract infections
التحري المظھري والوراثي عن انزیم الھیمولایسین المنتج من بكتریا coli Escherichia المعزولة من المسالك البولیة

Author: Azhar N. Hussein ازھار نوري حسین الموسوي
Journal: journal of al-qadisiyah for pure science(quarterly) مجلة القادسية للعلوم الصرفة (فصلية). ISSN: 19972490 Year: 2017 Volume: 22 Issue: 1 Pages: 118-128
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

The present study included isolation and diagnosis of the bacteria Escherichia coli frompatients suffering urinary tract infection symptoms in different ages and both sexes, which wastaken from the consulting patients in Maternal Hospital, and General Teaching Hospital in ALDiwianyia city during the period from 1/3/2012 till 1/8/2012 . The results of morphological and biochemical tests appeared that 94 isolates belong to bacteriaE. coli , among them 40 (42.6%) isolates were hemolysis on blood agar plates containing humanblood ( A, B, AB, O ) and were production percentage of hemolysin (55%, 72.5%, 20%, and 40%)respectively . Some virulence factors, which bacteria have, were studied in both phenotypical and genotypical .Such as hemolysin production . The results showed that all the bacterial samples 40 (100%) werehemolysin production phenotypically as well as had the chromosomal genes hlyA and hlyB 40(100%) and also had the plasmid gene hlyA plasmid 36 (90%) by using the polymerase chainreaction for detection about these genes . The results of electrophoresis on Agarose gel showed that most of the bacterial isolates containplasmid bands between one to three 36 (90%) . All isolates contained one plasmid band large insize, it molecular weight was about 1200 bp 36 (90%) isolate, the plasmid bands distributed amongone plasmid band 14 (35%) isolates, two plasmid band 19 (47.5%) isolates, and three plsmid band 3(7.5%) isolates . The results of bacterial conjugation showed the possibility of transmitting of plasmids amongE.coli giving isolates and E.coli MM294 receiving strain in complete process . The features of theconjugation cells were studied as having virulence factor phenotypically included hemolysinproduction, and also were detected about hlyA plasmid the results showed that isolates werecontained of that gene .

جمعت 282 عینة ادرار وسطي من مرضى یعانون من اعراض أخماج المسالك البولیة بفئات عمریة مختلفة ولكلا الجنسین ، من المرضى المراجعین الى المستشفى التعلیمي العام ومستشفى الاطفال والولادة التعلیمي في مدینة الدیوانیة وللمدة من /3 /20121 لغایة 1 / 8 /2012 ، أظھѧرت النتѧائج عائدیѧة 94 عزلѧة لبكتریѧا coli.E . تѧم التحѧري عѧن قابلیѧة العѧزلات علѧى انتѧاج أنѧزیم الھیمولایسین في اطباق اكار الدم الحاویة على فصائل الدم البشري الاربع ( O ,AB ,B ,A ) ، اذ وجد ان 40 عزلة ( 6.42% ) كانت قادرة على انتاج انزیم الھیمولایسین على اطباق اكار الدم ، وكانت نسѧبة انتѧاج الھیمولایسѧین ( , 5.72% , 20% , 40%55% ) على التوالي لفصائل الدم المختلفة ، اذ استعملت ھذه العزلات لدراسة الخصائص المظھریة والوراثیѧة فیمѧا یتعلѧق بانتѧاج الھیمولایسѧین . اذ تѧم اختبѧار عѧزلات بكتریѧا coli.E المنتجѧة للھیمولایسѧین مظھریѧا للتأكѧد مѧن امتلاكھѧا للجینѧین hlyB , hlyAالكروموسѧومیین ، والجѧین plasmid hlyA البلازمیѧدي باسѧتعمال تقنیѧة سلسѧلة تفاعѧل انѧزیم البلمѧرة Chain Polymerase( PCR ) Reaction ، اذ أظھѧѧرت 40 عزلѧѧة القѧѧادرة علѧѧى انتѧѧاج الھیمولایسѧѧین احتوائھѧѧا علѧѧى الجینѧѧین hlyB , hlyAالكروموسومیین وبنسبة ( 100% ) ، في حین احتوت 36 عزلѧة ( 90% ) علѧى الجѧین plasmid hlyA البلازمیѧدي . أظھѧر الترحیل الكھربائي على ھلام الأكѧاروز احتѧواء معظѧم العѧزلات البكتیریѧة قیѧد الدراسѧة علѧى حѧزم بلازمیدیѧة تراوحѧت بѧین حزمѧة بلازمیدیة واحدة الى ثلاث حزم ( 90% ) 36 عزلة ، اذ احتوت جمیع العѧزلات علѧى حزمѧة بلازمیدیѧة كبیѧرة الحجѧم بلѧغ حجمھѧاالجزیئي 1200bp بنسبة ( 90% ) 36 عزلѧة توزعѧت الحѧزم البلازمیدیѧة مѧابین حزمѧة بلازمیدیѧة واحѧدة ( 35% ) 14 عزلѧة ، حزمتین بلازمیدیتین ( 5.47% ) 19 عزلة ، وثلاث حزم بلازمیدیة ( 5.7% ) 3 عѧزلات . فیمѧا بѧین الاقتѧران البكتیѧري امكانیѧة انتقال البلازمیدات بین عزلات بكتریا 12 coli.E , 6 coli.E , 2 coli.E الواھبة وسلالة MM294 coli.E المستلمة بشѧكل كلي ، اذ درست صفات الخلایا الاقترانیة من حیث انتاجھا لانزیم الھیمولایسین مظھریا" ، اذ تم التحري عن ھذا العامل المشفر لھبلازمیدیا" المتمثل بالجین plasmid hlyA ، اذ بینت النتائج احتواء الخلایا الاقترانیة على الجین اعلاه .


Article
Sequencing characterization of housekeeping genes among Klebsiella pneumoniae isolated from burn patients

Authors: Abbas Atyia Hammoudi --- Azhar N. Hussein
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 2 Pages: 111-119
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Burn wound infections are one of the most important impairments that occur in the acute period following injury and colonization by the pathogenic agents, including gram-positive, gram-negative bacteria and yeasts. The study included 210 clinical swab samples have been collected from burn- wound patients and cultured on blood agar, MacConkey agar and Eosin methylene blue agar, the period from 1/3/2016 to 30/8/2016 at different hospitals in Baghdad city. By microscopic characterizations, morphological and biochemical reactions, the results showed that 42 (37.5 %) isolates belong to Klebsiella pneumoniae. The analysis of (10) clinical origin of Klebsiella pneumoniae isolates by multilocus sequence typing show the relationship between the local and global isolates which belonged to 7 housekeeping genes (rpoB;beta-subunit of RNA polymerase, gapA; glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, mdh; malate dehydrogenase, pgi; phosphoglucose isomerase, phoE; phosphorine E, infB; translation initiation factor 2, tonB; periplasmic energy transducer). The present study the results showed the 10 isolates of K. pneumoniae were identified into different sequence type (ST): ST 14 and 15 for (IQK1, IQK2, IQK3, IQK4, IQK5, IQK6 and IQK7), ST 266, 54, 709, 728 and 1177 for (IQK8 and IQK9) and ST 665, 975 and 2149 for (IQK10). In addition, the result showed 100% identities with previously reported genes. There was no information on the sequence type (ST) (an allelic profile) of K. pneumoniae in Iraq. According to the results of the present study, the most occurrence clones found in Baghdad hospitals were endemic ST14 and 15, which accounted for 70% of the isolates (n=10). The presence of the ST14 and 15 clones in Iraq which came closer to global (14 and 15 STs) clones might be indicating intercontinental transmission because these clones were added to the list of the strains that isolated from different countries.

Keywords


Article
Curing of plasmid contents of Proteus spp. isolated from urinary tract infections in AL- Diwaniyah city

Authors: Ali A. AL-Nashaa' --- Azhar N. Hussein --- Adnan H. AL-.Hamadan
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2007 Volume: 2 Issue: 3 Pages: 160-169
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

This study included isolation and identification of Proteus spp . from urinary tract infections of Gynecology and padiatrics Hospital teaching in Diwaniyah cityand investigated the virulence factors connected with pathogenicity of this bacteria. It aims also at curing of plasmid contact by means of using some chemical materials. The bacteria Proteus spp. Isolates formed 16% which belong P. mirabilis and P. vulgaris from bacterial causes of urinary tract infection in children. The isolates of this bacteria has some physiological characteristics which represent virulence factors related to the ability of bacteria to make infection .It seems that 80% from these isolates were capable to Haemagglutination of RBCs . These isolates produce also Haemolysine enzyme. It was found that percentage of production was 60% . As for B- lactamase enzyme production 40% of these bacteria isolates showed ability to produce his enzyme. Moreover, only 20% from Proteus isolates showed ability to produce bacteriocin production. All these isolates were not able to produce capsule production.When testing the resistance of Proteus isolates toward 8 different commonly used antibiotics in treatment of urinary tract infection, results showed that the isolates have different resistance depending on the type of antibiotic and the strain of the isolates. All these isolates were completely resistance Nitrofurantion in 100% while the least resistance toward Nalidixic acid and Gentamicin reached 20% for both.The results showed that there were DNA plasmid in 3 bacteria isolates but there was no relationship between the plasmid bands and resistance toward antibiotics. The P. mirabilis isolate which contained 4 plasmid bands was treated with SDS and Ethidiun bromide in an attempt to curing plasmid bands. The result showed that this isolate lost the ability to produce the majority of virulence factors that caused this disease and lost its resistance for som antibiotics especially Nalidix acid , Ampicillin and Choramphenicol. The ethidium bromide was the most effective in curing process since the resultant strain aest all plasmid bands.

شملت الدراسة عزل وتشخيص بكتريا Proteus spp. من اخماج المسالك البولية من الأطفال المراجعين لمستشفى النسائية والأطفال في مدينة الديوانية، والتحري عن عوامل الضراوة المرتبطة بامراضية هذه البكتريا، والعمل على تحييد المحتوى البلازميدي باستخدام بعض المواد الكيميائية. شكلت عزلات بكتريا Proteus Spp. 16% والعائدة للنوعين P. mirabilis و P. vulgaris من المسببات الجرثومية لخمج المسالك البولية في الأطفال . تميزت عزلات هذه البكتريا بمجموعة من الخصائص الفسلجية التي تمثل عوامل ضراوة ترتبط بقدرة البكتريا على أحداث الخمج حيث أظهرت 80% من عزلاتها قدرة على تلازن كريات الدم الحمر، كما كانت هذه العزلات منتجة لأنزيم الهيمولايسين الذي يحلل الدم وبنسبة 60%، أما أنتاج أنزيمات البيتالاكتاميز فقد أظهرت 40% من عزلات هذه البكتريا قدرتها على إنتاج هذه الأنزيمات . ولم تظهر ألا 20% من عزلات بكتريا Proteus spp قدرتها على أنتاج البكتريوسين، كانت جميع هذه العزلات غير قادرة على تصنيع المحفظة. عند اختبار مقاومة عزلات البكتريا Proteus spp تجاه ثمانية مضادات شائعة الاستخدام في علاج اخماج المسالك البولية، أظهرت عزلاتها مقاومات متفاوتة حسب طبيعة المضاد ونوع العزلة، فقد كانت جميع العزلات مقاومة للمضاد Nitrofurantion وبنسبة 100% بينما أظهرت أدنى مقاومة تجاه المضادين Nalidixic acid و Gentamicin بلغت 20% لكليهما. ظهر وجود الدنا البلازميدي في ثلاثة عزلات بكتيرية، لكن لوحظ عدم وجود علاقة بين عدد الحزم البلازميدية التي تمتلكها العزلة وعدد المضادات التي قاومتها . عوملت العزلة P. mirabilis التي تحتوي على أربع حزم بلازميدية بمادتيSDS وبروميد الاثيديوم في محاولة لتحييد محتواها البلازميدي، وقد تبين أن هذه العزلة فقدت قدرتها لإنتاج معظم عوامل الضراوة المسببة للمرض، كما أنها فقدت مقاومتها لبعض مضادات الحياة خاصة Nalidixic acid و Ampicillin و Chloralmphnicol وكانت مادة بروميد الاثيديوم هي الأكثر فعالية في عملية التحييد، إذ فقدت السلالة الناتجة جميع حزمها البلازميدية.

Keywords

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

English (2)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2017 (2)

2007 (1)