research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Antifungal Activity of Alkaloids and Phenols Compounds extracted from black pepper Piper nigrum against some pathogenic fungi
فعالية مركبات القلويدات والفينولات المستخلصه من الفلفل الأسود ضد بعض الفطريات الممرضه

Author: Batol Imran Dheeb بتول عمران ذيب
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2015 Volume: 9 Issue: 2 Pages: 46-54
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

This study focused on the production of alkaloids and phenols from dry black pepper Piper nigrum fruit; and its effect on thirteen species of fungi isolated from dermal infection. The antifungal activity of different concentrations alkaloids and phenols were evaluated using agar dilution method. Statistics revealed different inhibition percentages; that are gradually increased with the increasing in the concentration of the used compound. Minimal inhibitory concentration MIC and maximum fungicidal concentration MFC were obtained 0.4, 0.002 mg/ml respectively. Confirming the presence of alkaloids and phenols were done by fast liquid chromatography; showed the presence of two types of alkaloids and ten types of phenols.

ركزت هذه الدراسه على انتاج القلويدات والفينولات من ثمار الفلفل الأسود ودراسة تأثيرها على 13 نوع من الفطريات المعزوله من اصابات جلديه، قُيمت فعالية القلويدات والفينولات المحضرة بتراكيز مختلفه من خلال طريقة المزج بالأكار و أظهرت نسب تثبيط مختلفه تزداد مع زيادة تركيز المركب المستخدم بعد تحليل النتائج احصائيا.تم الحصول على قيمة التركيز المثبط الأدنى والتركيز الأعلى القاتل للممرضات المستخدمه في التجربه وكان 0.002, 0.4ملغم/ مل على التوالي تم التحليل والكشف عن القلويدات والفينولات باستخدام الكرموتوغرافيا السريعه السائلة وأظهر التحليل وجود نوعين من القلويدات و عشرة أنواع من الفينولات في المستخلص الذي تم تحضيره والكشف عنه.


Article
Molecular Identification of Aspergillus fumigatus Using ISSR and RAPD Markers
ألتشخيص ألجزيئي لعزلات A.fumigatus بواسطه مؤشرات ال ISSR و الRAPD

Authors: Nawras Kadhim Rassin نورس كاظم رسن --- Neamat J. Al- judy نعمت جميل عبد الباقي --- Batol Imran Dheeb بتول عمران ذيب
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 4A Pages: 2788-2797
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this stud to isolate and identified of A. fumigatus from different sources and study the genetic diversity among these isolates by using RAPD and ISSR markers.Collected 20 samples from 7samples were isolated A. fumigatusisolates were characterized depending on its morphological, then extracted DNA from its.RAPD markersrandomly bandingwith sitesof genome more than ISSR markers where the primer OPN-07 achieved discriminative power (19.1) and 43 bands, while ISSR6 achieved discriminative power (17.1) with 32 bands.ISSR were more efficiency in specific binding then RAPD, ISSR primers has great a binding to production unique band, when 9 primers from 10 primers, ISSR9 was produce (5) unique bands, while RAPD markers was low ability to production unique bands, 3primers from 9 primers were produced unique bands.The dendrogram of RAPD was reverted than isolates number 5 and 7 had the great genetic diversity 0.33361 while the isolates number 5 and 6 had the lowest genetic similarity 0.98521 in contrast with ISSR markers was show isolates number1 and 2 greats genetic diversity 0.97826whilethe isolates number 5 and 7 had the lowest genetic similarity 0.10253.

هدفت هذا الدراسه الى عزل وتشخيص فطر A. fumigatusمن مصادر مختلف ودراسهالتغايرات الوراثيه بين هذا العزلات بٳستخدام مؤشرات التفاعل العشوائي المتعدد ٳلاشكال لسلسله ٲلدنا RAPD ومؤشرات إعاده ٲلسلسله ٲلبسيطه ISSR تم جمع 20 عينه من A. fumigatus من مصادر مختلفه وتم تشخيصها ٳعتماد على صفات المظهر الخارجي. وتم استخلاص الدنا من جميع العينات ولكن تم اختيار 7 عزلات فقط لاجراء تفاعلات ال RAPDوال ISSRعليها.ٳظهرت مؤشرات ال RAPD بٲنها ذات ارتباط عشوائي بمواقع التركيب الجيني اكثر من مؤشرات ال ‚ISSRحيث ان البادئ OPN-07حقق طاقه تمييزيه بلغت 19.1 وناتج عدد حزم عشوائيه بلغ 43 مقارنه مع البادئ ISSR6 الذي حقق طاقه تمييزيه بلغت 17.1و32 حزم عشوائيه .ٲظهرت بادئات مؤشر الISSR قدره عاليه على ٳنتاج حزم مفرده حيث ان 7 بادئات من اصل 9 اظهرت حزمه منفرد بينما كان البادئ ISSR9 هو الاكثر إنتاج للحزم)5 (حزم منفرده بينما بادئات مؤشر الRAPD كانت ذات قدره اقل على إنتاج الحزم المنفرده حيث انتج 3 بادئات فقط من اصل 9 اظهرت حزم منفرده وكان البادئات OPM-20 ,OPL-05 الاكثر ٳنتاج للحزم المنفرده بعدد 2 وهذا يدل على ان مؤشراتISSR ذات كفاءه اعلى من مؤشرات RAPD في الارتباط اكثر تخصص بمواقع مميزه ,اظهرت المخططاتلشجيريه لتقنيه الRAPD اضهرت ان العزله رقم 5مع عزله رقم 7 هي الاكثر تنوع جينيه بلغت 0.33361 بينما العزله رقم 5 مع عزلة رقم 6 كانت الاقل مسافه جينيه بلغت 10.9852 اما في مايخص تقنية ISSRإضهرت أن العزلة رقم 1 وعزلة رقم 2 هي الاكبر تنوع جيني 0.97826 بينما العزلة رقم 5 و عزله رقم 7 هي الاقل تشابه جيني 0.10253.


Article
Studying the candida resistance and sensitivity for some antifungals
دراسة مقاومة المبيضات و حساسيتها لبعض المضادات الفطرية

Loading...
Loading...
Abstract

Back ground: The current study included 150 samples from patients with Candida from a hospital of Medical City / education labs - Baghdad, and ranged in age from (10 – 65(years for both sexes, all isolates taken from different sources (Lower respiratory tract, Urine, Skin, Vaginal and Oral thrux), where the number of males (55(as a percentage (37%) while the number of females (95) as a percentage (63%).The objective: The objectives of this study are studying resistance and sensitivity of candida spp to some antifungals.Material and methods: All the required material which used for the study, and the direct examination was conducted using potassium hydroxide KOH 10%, As well as microscopic examination and laboratory transplantation for all samples, for the purpose of investigating the candidiasis. Also Vitek System examination was conducted on all positive samples for microscopy and laboratory culturing; and so to be diagnosed on the species level, and this study included using (3) anti-fungal equipped from Himedia (India), an (Fluconazole, Clotrimazole and Nystatin), anti-fungal used by standard disk Diffusion to know the resistance of Candida and its sensitivity toward used anti-fungal.The results: The results of direct examination were vaginal swab (50), Sputum (28), Oral swab (34), Urine (21) and Skin swab (17).Conclusion: Candidiasis was more common in female patients as well as from medical units, where the rate of infection in females more than in males, Candida species were identified by the manual and automated methods and we found that the automated method by using VITEK2 YST Card was the best for species identification.

الخلفية عن الموضوع : تضمنت الدراسة الحالية 150 عينة مرضية من مرضى مصابين بداء المبيضات Candida spp من مدينة الطب – المختبرات الطبية / بغداد ولأعمار تراوحت بين (10-65) سنة، ولكلا الجنسين، تم جمعها من مصادر مختلفة (القناة التنفسية السفلى، القناة المهبلية، الجلد، البول، والفم)، حيث كان عدد الذكور 55 وبنسبة 37%، بينما كان عدد الاناث 95 وبنسبة 63%.الهدف: كان الهدف من الدراسة الحالية هو معرفة مقاومة و حساسية الكانديدا لبعض المضادات الفطرية.المواد وطرق العمل: حيث تم اجراء الفحص المباشر باستخدام هيدروكسيد البوتاسيوم KOH بتركيز 10% ، كما تم اجراء الفحص المجهري والزرعي الختبري لجميع العينات. بعد ذلك تم فحص العينات التي اظهرت زرعا موجبا بواسطة جهاز الفايتك لتحديد العينات على مستوى النوع. كما تم اختبار 3 انواع من المضادات الفطرية وهي (الفلوكونازول بتركيز 25 مايكروغرام، الكلوتريمازول بتركيز 10 مايكروغرام والنستاتين بتركيز 100 UN)) حيث اجرى الاختبار باستخدام الاقراص الجاهزة المصنعة من الشركة الهندية Himedia.النتائج: كانت النتائج متباينة ، اظهرت النتائج ايضا وجود (50) عينة للمسحة المهبلية، (28) من القناة التنفسية السفلى، (34) مسحة من السلاق الفموي، (21) عينة بول و(17) مسحة جلد. كما وتبين من خلال النتائج 90 عينة مقاومة للمضادات المستخدمة وبنسبة 60% ، بينما كانت العزلات الاخرى حساسة للمضادات الفطرية المستخدمة وبلغ عددها 40 عينة وبنسبة 27%، وذلك بالمقارنة مع المعايير العالمية.الاستنتاجات: المبيضات أكثر شيوعًا في المرضى الإناث، حيث كان معدل الإصابة في الإناث أكثر من الذكور، تم التعرف على أنواع المبيضات من خلال طرق التشخيص الاولية والكيميائية ووجد أن الطريقة الحديثة باستخدام الفايتك كانت الأفضل لتحديد الأنواع.


Article
Improving Conditions for Gliotoxin Production by Local Isolates of Aspergillus fumigatus
تحسين الظروف من عزلات محلية من الفطر Aspergillus fumigatus لأنتاج مستويات عالية من الكلايوتوكسين

Loading...
Loading...
Abstract

Thirty two isolates of Aspergillus fumigatus were obtained from a total of 44 samples of sputum, nose swab and tracheal aspirate from suspected patient with aspergillosis were also collected from February 2014 to June 2014. A morphological examination of A. fumigatus was first made with naked eye and at low magnification power of microscope after that detailed examination was done by measuring the dimensions of the microscopic structures, photographing the microscopic structures and using relevant literature. Results appeared conical-shaped terminal vesicles, uniseriate row of phialides on the upper two thirds of the vesicle, conidiophore stipes were short, phialides arrange uniseriate upper vesicle conidia and parallel to axis of conidiophore, produced in chains of spore basipetally from phialides, the chains of spore were borne directly in the absence of metulae and represented by septet and branching hyphae. The ability of A. fumigatus for GT production was investigated using thin layer Chromatography (TLC) and High Performance Liquid Chromatography (HPLC) techniques and results showed that GT was produced by 81.25% of A. fumigatus isolates. Optimum conditions for GT production by A. fumigatus 16 (AF-16) isolate were determined by submerged fermentation using Yeast extract sucrose medium. Results indicated that AF-16 isolate was the highest GT producer on Yeast Exract Sucrose medium with inoculum size 2×107 conidium and incubation at 32ºC for 15 days and the concentration of gliotoxin was (4511µg mL-1).

جمعت عينات من المرضى المتوقع أصابتهم بداء الرشاشيات إذ حصل على 32 عزلة من مجموع 44 عينة من القشع ومسحات الانف والقصبة الهوائية للمرضى المتوقع اصابتهم بهذا الداء جمعت العينات للفترة من كانون الثاني للعام 2014 لغاية حزيران 2014.عملت فحوصات مظهرية بالعين المجردة وعلى القوة الصغرى للمجهر لفطر Aspergillus fumigatus ثم تلاها الفحص الدقيق للفطر من خلال قياس أبعاد التراكيب المجهرية وتصويرها بالاعتماد على مصادر سابقة. أظهرت النتائج بوجود تراكيب مخروطية الشكل ذات نهابة حوصلية ذات صف واحد من الفياليدات (تسمى احيانا بالذنيبات) مرتبة على الثلث الثاني من الحوصلة، يتميز الحامل الكونيدي بكونه قصير وتترتب الكونيدات على الفياليدات في أعلى الحوصلة وتكون موازية للحامل الكونيدي، وتتولد الأخيرة (الكونيدات) بشكل سلسلة من الفياليدات إذ تتولد سلسلة السبورات هذه مباشرة بغياب الذنيبات الأبتدائية اذ تتكون بحاجز وهايفات متفرعة. كشف عن قابلية Aspergillus fumigatus على إنتاج الغلايوتوكسين بإستخدام تقنية كروموتوغرافيا الطبقة الرقيقة. أظهرت النتائج قابلية 25 عزلة(81.25%) من عزلات A. fumigatusعلى إنتاج السم بينما لم تظهر عزلات الكانديدا جميعها القابليةعلى الإنتاج. تمثلت الظروف المثلى لإنتاج الغلايوتوكسين لتخمرات الحالة السائلة بإستخدام وسط خلاصة الخميرة كمادة أساس للعزلة المنتجة الأكفأ التي يرمز لهاAF-16وحجم اللقاح 2×710سبوربدرجة حرارة 32 ºم لمدة 15 يوما" إذ كان تركيزالغلايوتوكسين 4511ميكروغرام مل-1بإستخدام تقنية الكروموتوغرافيا السائلة ذات الإداء العالي.


Article
RAPD and ISSR analyses of Saccharomyces cerevisiae isolates from different sources
تحليل RAPD وISSR ل Saccharomyces cerevisiae المعزولة من مصادر مختلفة

Loading...
Loading...
Abstract

The purpose of this study was to isolate the Saccharomyces cerevisiae present on different fruits and performing RAPD and ISSR analyses to know the genetic interrelationship between different S. cerevisiae isolates. Some fruits namely apple, plum, dates, and peach were used as natural sources for S. cerevisiae isolation. The isolated S. cerevisiae was designated as SUC1, SUC2, SUC3, SUC4, SUC5 respectively. Amplicon fingerprints for the isolated species were obtained by RAPD assay using six different primers and ISSR assay using six different primers. RAPD assay showed the lowest genetic distance (0.1559) between SUC2 and SUC3 isolates whereas ISSR assay showed the lowest genetic distance (0.06899) between SUC4 and SUC5 isolates. Both genetic markers showed the highest genetic distance for SUC1 when compared to the other isolates.

الغرض من هذه الدراسة هو استخدام التحليل الجزيئي RAPD وISSR لعزل الخمائر Saccharomyces cerevisiae الموجودة على ثمار مختلفة تمامًا وتحليل RAPD وISSR من أجل فهم العلاقة الجينية بين العزلات المختلفة. استخدمت بعض الفواكه وعلى وجه التحديد التفاح والبرقوق والتمر والخوخ كمصادر طبيعية لعزل S. cerevisiae بالإضافة الى خميرة الخبز. تم الحصول على بصمات وراثية للأنواع المعزولة بواسطة اختبار RAPD باستخدام ستة بادئات مختلفة تمامًا واجراء تحليل ISSR باستخدام ثمانية أنواع مختلفة من البادئات. تحليل ال RAPD اظهر ان العزلات المأخوذة من خميرة الخبز والتفاح لها اقل بعد وراثي 0.1559. تحليل ال ISSR اظهر ان العزلات المأخوذة من البرقوق والخوخ لها اقل بعد وراثي 0.06899. كلا المؤشرين اظهر ان العزلات المأخوذة من التمر لها اعلى بعد وراثي مع العزلات الأخرى.

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

English (4)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (1)

2017 (1)

2015 (2)