research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Study of genetic variation of Fusarium solani isolates infected cucumber plants roots in Basrah city by using RAPD-PCR technique
دراست التببين الوراثي لعزلاث Fusarium solani الذي يصيب جذور خيبر القثبء في هذينت البصزة ببستخذام تقنيت التضخيم العشوائي متعدد الاشكال لقطع DNA

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out at genetic engineering lab, college of agriculture, Basrah university.Twenty four samples were analyzed by random amplified polymorphic DNA (RAPD) to investigate geneticsimilarity and diversity among and within three Fusarium solani represented in Basrah. three Fusariumsolani isolates isolated from infected cucumber plants roots. Ten random primers were used to amplify DNAfragments in isolates. 11 primers (OPA-01 to OPA-11) generated bands and polymorphic DNA fragments inall tested isolates and reproducible bands. RAPD primers gave good results through the successfulamplification of DNA for all Fusarium solani isolates, each primer succeeded in distinguishing betweenisolates, as appeared polymorphic and monomorphic bands. A total of 192 bands were obtained, 124 of themwere polymorphic. The number of polymorphic bands in each isolate was found to be different and washigher in the third isolate than in first and second (48, 43 and 33) bands, respectively. The primer OPA-07showed highly efficient in total number of bands (29), while less primers efficiency were OPA-01 and OPA-04 gave the lowest number of bands (12). The number of polymorphic fragments per primer was 11.3. Thesize of amplification DNA fragments generated with the RAPD primers ranged from 0.1 to 2.0 kb. Theprobability of obtaining identical fingerprints was observed to be the lowest in primer OPA-03.

أجريت ىذه الد ا رسة في مختبر اليندسة الو ا رثية، كمية الز ا رعة، جامعة البصرة. ت تحميؿ اربع وعشروف عينة بوساطة تقنية التضخيالعشوائي متعدد الاشكاؿ لقطع DNA لتحقيؽ التنوع الو ا رثي و التشابو بيف و داخؿ ثلاثة عزلات مف الفطر Fusarium solani في محافظةالبصرة. حصؿ عمى عزلات الفطر F. solani الثلاثة مف جذور نبات الخيار المصابة. و قد استعمؿ 11 بادئ عشوائي في تضخي الحامضالنووي ال ا ريبوزي منقوص الاوكسجيف لجميع عزلات الفطر F. solani . نجحت جميع ىذه البادئات في تضخي DNA مف جميع العزلاتالمختبرة. اعطت جميع ىذه البادئات نتائج جيدة لجميع العزلات المختبرة. نجح كؿ بادئ في التمييز بيف العزلات كما ظيرت حز متعددةالاشكاؿ و وحيدة الشكؿ. وبمغ عدد الحز الكمي التي ت الحصوؿ عمييا 192 حزمة، كانت 124 حزمة منيا متعددة الاشكاؿ. وت الحصوؿعمى الحز المتعددة الاشكاؿ في جميع العزلات. ت الحصوؿ عمى اعمى عدد مف ىذه الحز في العزلة الثالثة ث الاولى ث الثانية ) 48 و 43و 33 ( عمى التوالي. أظير البادئ OPA-07 كفاءة عالية في العدد الكمي لمحز ) 29 ( في حيف اعطت البادئات OPA-04 و OPA-04اقؿ كفاءة في عدد الحز ) 12 (. كاف معدد عدد الحز متعدد الاشكاؿ في كؿ بادئ 11.3 . و ت ا روحت حج قطع DNA المضخمة بوساطةتقنية RAPD 2.0 0.1 كيموبايت. حصؿ عمى اقؿ عدد مف حز - DNA متماثمة عند التضخي بالبادئ OPA-03

Keywords


Article
Genetic Diversity of Fusarium oxysporum f.sp cucumerinum Isolates from Cucumber: Differentiation by Using Random Amplified Polymorphic DNA
التنوع الو ا رثي لعزلات الفطر Fusarium oxysporum f.sp cucumerinum المعزول من نباتاث الخيار باستعمال تقنيت التضخيم العشوائي متعدد الاشكال لقطع DNA

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted at the Molecular Genetics laboratory, college of agriculture, university of Basrah (UOB) which is aimed to detect the genetic biodiversity by using random amplified polymorphism DNA markers (PCR-RAPD) between the isolates of Fusarium oxysporum f.sp cucumerinum isolated from infected plants stems cucumber which has been obtained from the different regions of Basrah province. Stages of the work included the extraction DNA from isolates F. o. f.sp cucumerinum depending on the CTAB Buffer method and using 8 primers imported from Operon company, U.S.A. to measure their efficiency. The results of DNA extraction, which extracted by using CTAB Buffer method from all isolates of F. o. f.sp cucumerinum it was good quality, since it has proved its efficiency in the following tests. RAPD primers gave good results through the successful amplification of DNA for all F. o.f.sp cucumerinum isolated from the infected plants stems cucumber and each primer succeeded in distinguishing between isolates, as appeared polymorphic and monomorphic bands. The primer OPB-08 Showed highly efficient in total number of bands (35) and less primers efficiency is OPB-14 gave the lowest number of bands (17). The number of polymorphic fragments per primer was 18.5. The size of amplification DNA fragments generated with the RAPD primers ranged from 0.1 to 1.6 kb. The results of this study indicated that PCR-based technique could be used to differentiate the F. o.f.sp cucumerinum isolates from cucumber plants.

أجريت ىذه الد ا رسة في مختبر الو ا رثة الجزيئية، كمية الز ا رعة، جامعة البصرة التي ىدفت الى الكشؼ عف التنوع الو ا رثيباستعماؿ تقنية التضخي العشوائي متعدد الاشكاؿ لقطع DNA بيف عزلات الفطر Fusarium oxysporum f.sp cucumerinumالمعزولة مف نباتات الخيار المصابة والتي ت الحصوؿ عمييا مف مناطؽ مختمفة مف محافظة البصرة. تضمنت م ا رحؿ العمؿ استخلاصDNA مف عزلات الفطر F. o. f.sp cucumerinum بالاعتماد عمى طريقة CTAB Buffer و استعماؿ 8 بادئات استوردت مفشركة Operon الامريكية لقياس كفاءتيا. تشير نتائج استخلاص DNA الذي استخمص بطريقة CTAB Buffer و مف جميع عزلاتالفطر F. o. f.sp cucumerinum المدروسة انو كاف ذو نوعية جيدة، إذ انو أثبت كفاءتو في الاختبا ا رت اللاحقة. اعطت بادئاتتقنية RAPD نتائج جيدة مف خلاؿ النجاح في عممية تضخي DNA لجميع عزلات الفطر F. o. f.sp cucumerinum المعزولة مفسيقاف نباتات الخيار المصابة، كما نجح كؿ باديء في التمييز بيف العزلات، إذ ظيرت الحز المتشكمة و ا رثيا Polymorphic bands والحز غير المتشكمة و ا رثيا Monomorphic bands . أظيرت النتائج وجود التشكؿ الو ا رثي )التبايف الو ا رثي( بيف كؿ العزلات المدروسة،إذ اظير الباديء OPB-08 كفاءة عالية مف حيث عدد الحز الكمية ) 35 ( حزمة واقؿ البادئات كفاءة ىو الباديء OPB-14 الذياعطى اقؿ عدد مف الحز والبالغة 17 حزمة فقط. ت ا روح معدؿ الحز المتشكمة و ا رثيا لكؿ ب ا ريمر 18.5 بينما ت ا روح حج الحز المنتجةبتقنية RAPD مف 0.1 الى 1.6 كيمو قاعدة. أشارت نتائج ىذه الد ا رسة أف تقنية التضخي العشوائي متعدد الاشكاؿ لقطع DNA ممكفاف تستخد لمتمييز بيف عزلات الفطر Fusarium oxysporum f.sp cucumerinum المعزولة مف نباتات الخيار.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (2)


Year
From To Submit

2013 (2)