research centers


Search results: Found 4

Listing 1 - 4 of 4
Sort by

Article
تشخيص فايروس موزائيك الخيار CMV على الفلفل باستخدام النباتات الكاشفة والأشرطة المناعية وتقنية تفاعل البلمرة التسلسلي العكسي (PCR RT-)
Detection of cucumber mosaic virus on pepper by indicator plant immune strip and RT- polymerase chain reaction

Authors: Ammar Alhares عمار سعدي ناصر الحارس --- Fdhel AL-Fadhel فضل عبد الحسين الفضل
Journal: Kufa Journal for Agricultural Sciences مجلة الكوفة للعلوم الزراعية ISSN: 20727798 23128186 Year: 2017 Volume: 9 Issue: 4 Pages: 73-91
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to identify cucumber mosaic virus (CMV) on pepper plants and determine the host range and the source of primary infection, by using indicator plants, immune strip test and PCR. The infection was done by using the sap. of pepper plants containing CMV upon of some indicator plants like cucumber (Cucumis sativus L),tomato(Lycopersicon esculentum Mill) , zucchini ( Cucurbita pepo L) , Pumpkin (Cucurbita maxima L) , eggplant (Solanum melongena L.) cowpea (Vigna unguiculata ) tobacco (Nicotiana tabacum cv.samsun , Nicotiana rustica )and Wall goosefoot(Chenopodium murale L.)The results showed that all above-mentioned plants were infected with CMV .The symptoms of infection were mosaic , Malformation and stunting in cucumber ,while tomato leaves changed to filiform shape. The symptoms of zucchini , Pumpkin and eggplant were in the form of systemic mosaic and stunting of egg plants , while the symptoms upon cowpea plants were pale local lesion leaves .and in the Wall goosefoot plants the symptoms were unorganized spots. The two varieties of tobacco showed vein clearing. Symptom. The test of immune strip showed the existence of CMV in cucumber, tomato , pepper and cowpea plants by clear precipitation line compare to control plants.The diagnosis of CMV virus was confirmed by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). The plant specimens collected from areas under study were gave positive results, the RT-PCR reaction with primer CMV1 and CMV2 for CMV-coat protein gene (CMV-cp Gene) yielded 486-488 base pair DNA bands while the specimens from non- infected plants amplified no bands. These results indicated that the CMV virus detected in present study belong to subgroup I.

اجريت هذه الدراسة بهدف تشخيص فايروس موزائيك الخيار Cucumber Mosaic Virus CMV) ) على الفلفل وتحديد المدى العائلي ومصدر الإصابة الأولية لة باستخدام النباتات الكاشفة Indicator Plants والاشرطة المناعية Immunostrip فضلا عن تقنية تفاعل البلمرة التسلسلي العكسي ((RT-PCR Reverse , Transcriptase - Polymerase Chain Reaction . اجريت العدوى باستخدام عصير نبات فلفل مصاب بفايروس CMV على عدد من النباتات الكاشفة من الادغال وبعض المحاصيل الاقتصادية ومنها الفلفل capsicum) annuum )الخيار (Cucumis sativus L.)، الطماطة (Lycopersicon esculentum Mill.) ، قرع الكوسا (Cucurbita pepo L. ) ، اليقطين( Cucurbita maxima L.) ، الباذنجان (Solanum melongena L.) ، اللوبيا Vigna unguiculata L.) ) ، التبغ (Nicotiana tabacum cv.samsun ، Nicotiana rustica ).) ، الرغيلة (Chenopodium murale L.) .اظهرت النتائج اصابة جميع هذه النباتات بالفايروس CMV اذ كانت الاعراض على نبات الفلفل هي تحزم العروق وتشوه الأوراق مع ظهور أعراض موزائيك وتبرقش وانحناء الأوراق الحديثة للأسفل واختزال في أعناق الأوراق بينما كانت على شكل موزائيك مع تشوه وتقزم في نبات الخيار بينما تحولت اوراق الطماطة الى الشكل الخيطي نتيجة الاصابة . في حين ظهرت الاعراض على نبات قرع الكوسا واليقطين والباذنجان بشكل موزائيك جهازي مع تقزم نباتات الباذنجان، بينما كانت الاعراض بشكل بقع موضعية شاحبة على اوراق نبات اللوبيا وبقع غير منتظمة الشكل على نباتات الرغيلة ،اما التبغ بنوعية فكانت الاعراض على شكل توضح لعروق الاوراق vein clearing .وكان اختبار الاشرطة المناعية Test Immunostrips موجبا للعينات المصابة بفايروسCMV في كل من نباتات الخيار، اللوبياء ، الفلفل ، الطماطة وعلى شكل خط ترسيب واضح مقارنة مع النباتات السليمة . تم تاكيد تشخيص الفايروس بواسطة تفاعل البلمرة العكسي (RT-PCR) اذ ان جميع النباتات المستخدمة في الدراسة كانت موجبة للاختبار المذكور حيث وجد عند تضخيم قطعة مستقيمة لجينات الحامض النووي التي تكون غلاف فايروس CMV مع برايمرCM2,CM1 ظهور حزم DNA واضحة بحجم (bp 486- 488 ) مقارنة مع النباتات السليمة التي لم تعطي اي حزمة للحامض النووي المذكور، مما يؤكد ان الفايروس المستخدم في الدراسة هو فايروس موزائيك الخيار CMV على الفلفل والذي يقع تحت المجموعة ( I ) للفايروس المذكور، وتعدهذه الدراسة الاولى في العراق التي استخدمت التشخيص الجيني لفايروس CMV على الفلفل.


Article
Induced systemic resistance in pepper plant aginst pepper mosaic virus by using biological control agents
استحثاث المقاومة الجهازية لنبات الفلفل ضد فايروس موزائيك الفلفل باستخدام بعض الاحياء الحيوية

Authors: Fdhel AL-Fadhel فضل عبد الحسين الفضل --- Ammar Alhares عمار سعدي ناصر الحارس
Journal: Kufa Journal for Agricultural Sciences مجلة الكوفة للعلوم الزراعية ISSN: 20727798 23128186 Year: 2017 Volume: 9 Issue: 4 Pages: 108-134
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted in order to determine the possibility of stimulating systemic resistance in pepper plants against cucumber mosaic virus (CMV) using two types of bacteria Pseudomonas fluorescens and Azotobacter chroococcum, and salicylic acid with two types of fungi Trichoderma Koningii and/or T. hamatum to evaluate the effectiveness of each treatment individually or in combination in suppressing CMV. Results of Irrigation treatments using bacterial bio control agents reduced infection and increased the chlorophyll content where the chlorophyll content was the highest (226.04 mg/100g fresh weight (FW)) when plants treated with P. fluorescens mixed with A. chroococcum followed by (174.51 and 141.56) mg/100gFW from plants irrigated with A. chroococcum and P. fluorescens, respectively with using the bacterial mix also improved all plant growth indicators and resulted in 44.93 cm, 34.40 cm, 16.73 g, 20.33 g, 6.59 g and 16.20 g for shoot and root length, shoot and root fresh weigh, shoot dry weight and root dry weight, respectively. There was no significant difference between irrigation and dipping with bacterial mix.

اجريت هذه الدراسة بهدف تحديد امكانية تحفيز المقاومة الجهازية في نبات الفلفل ضد فايروس موزائيك الخيار على الفلفل باستعمال نوعين من البكتريا Pseudomonas fluorescens و Azotobacter chroococcum وحامض السالسالك المدعم بنوعين من الفطريات الاحيائية هما Trichoderma Koningii و hamatum Trichoderma وحامض السالسالك ومعرفة فاعلية كل منهم على انفراد وفاعلية الخليط المزدوج لكل منهما في مقاومة الفايروس CMV. اظهرت معاملة السقي بالانواع البكتيرية وخليطهما المزدوج خفضا معنويا واضحا في الاصابة اذ كانت نسبة الكلوروفيل 226.04 ملغم100غم وزن طري للخليط البكتيري بينما كانت نسبة الكلوروفيل في المقارنة الملقحة بالفايروس 12.33 ملغم100غم وزن طري وكذلك ظهرت زيادة معنوية في معايير نمو نباتات الفلفل المعاملة قياسا بمعاملتي المقارنة ، وتفوقت معاملات السقي بالخليط البكتيري على المعاملات بالبكتريا مفردة من حيث نسبة الكلوروفيل واطوال واوزان المجموع الخضري والجذري الرطب والجاف وزيادة معايير النمو . تلتها معاملة حامض السالسالك لرشتين والمدعمة بخليط الفطريات الاحيائية اذ بلغت نسبة الكلوروفيل فيها 211.73 ملغم100غم وزن طري.ان معاملة خليط البكتريا P. fluorescens و chroococcum A.سقيا تفوقت على بقية المعاملات في زيادة معايير النمو فقد كان اطوال المجموعين الخضري والجذري 44.93 سم و 34.40 سم على التوالي ، الوزن الرطب للمجموعين الخضري والجذري 16.73غم و20.33غم على التوالي ، الوزن الجاف للمجموعين الخضري والجذري 6.59 غم و 16.20غم على التوالي ولا توجد فروقات معنوية واضحة للخليط البكتيري بالسقي والتغطيس.


Article
Detection of Cucumber Mosaic Virus by Immunestrips and Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
التحري عن فايروس موزائيك الخيارCMV باستخدام الأشرطة المناعية وتقنية تفاعل البلمرة التسلسلي العكسيPCRRT-

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to detect the cucumber mosaic virus (CMV) on cucumber plants , determine the hostrange and the source of primary infection ,by using indicator plants, immunostrips test and RT- PCR.The infection was done by using the sap. of cucumber plants containing CMV including some indicator plants like cucumber (Cucumis sativus L.),tomato(Lycopersicon esculentum Mill), zucchini ( Cucurbita pepo L), Pumpkin (Cucurbita maxima L.), eggplants (Solanum melongena L.)cowpea (Vigna unguiculata L.) tobacco (Nicotiana tabacum cv. samsun, Nicotiana rustica and Nicotiana tabacum cv. Russian ) Pumpkin (Cucurbita maxima L) Wall goosefoot(Chenopodium murale L.).The results showed that all above-mentioned plants were infected with CMV. The symptoms of infection were mosaic, Malt formation and stunting of cucumber, tomato leaves changed to filiform shape. The symptoms of zucchini, Pumpkin and eggplant in form of systemic mosaic and stunting of eggplants, while the symptoms upon cowpea plants were pale local lesion leaves, in the wall goosefoot plants, the symptoms were unorganized spots. The three varieties of tobacco showed vein clearing . The test of immunostrip showed the existence of CMV in cucumber plants, tomato plants, pumpkin plant and cowpea plants. by clear deposition line compare to control plants.The diagnosis of CMV virus was confirmed by Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT--PCR). The plant specimens collected from areas understudy were given positive results, as the RT-PCR reaction with primer CMV1 and CMV2 for CMV-coat protein gene (CMV-cp Gene)yielded 486-488 base pair DNA bands while the specimens from non- infected plants amplified no products. These results indicated that the CMV virus detected in present study belong to subgroup I. This study is the first in the region that have been used genetic diagnosis of CMV virus.

أجريت هذه الدراسة بهدف تشخيص فايروس موزائيك الخيارCucumber Mosaic Virus CMV)(وتحديد المدى العائلي ومصدر الاصابة الاولية له باستخدام النباتات الكاشفة Indicator Plants والاشرطة المناعية Immunostrip اضافة الى تقنية تفاعل البلمرة التسلسلي العكسي, ((RT-PCR Reverse Transcriptase- Polymerase Chain Reaction،اجريت العدوى باستخدام عصير نبات خيار مصاب بفايروس CMV على عدد من النباتات الكاشفة من الادغال وبعض المحاصيل الاقتصادية ومنها الخيار (Cucumis sativus L.)، الطماطة ( Lycopersicon esculentum Mill) ، قرع الكوسا (Cucurbita pepo L. ) ، اليقطين Cucurbita maxima L.)) ، الباذنجان (Solanum melongena L.) ، اللوبيا Vigna unguiculata L.)) ، التبغ (Nicotiana tabacum cv. samsun ، Nicotiana rustica ،Nicotiana tabacum cv. Russian) ، الرغيلة(Chenopodium murale L. ) . النتائج اصابة جميع هذه النباتات بالفايروس CMV حيث ظهرت الأعراض واضحة شكل موزائيك مع تشوه وتقزم الخيار بينما تحولت اوراق الطماطة الى الشكل الخيطي نتيجة الاصابة ، في حين ظهرت الاعراض على نبات قرع الكوسا واليقطين والباذنجان بشكل موزائيك جهازي مع تقزم نباتات الباذنجان، بينما كانت الاعراض بشكل بقع موضعية شاحبة علىاوراق نبات اللوبيا وبقع غير منتظمة الشكل على نباتات الرغيلة ،اما التبغ بانواعه الثلاثة فكانت الاعراض على شكل توضح لعروق الاوراق vein clearing .اظهر اختبار الاشرطة المناعية Immunostrip Test وجود فايروس CMV في كل من نباتات الخيار، ،قرع الكوسا ، اليقطين ، الطماطة ، الباذنجان ، التبغ والرغيلة على شكل خط ترسيب واضح مقارنة مع النباتات السليمة . تم تأكيد تشخيص الفايروس بواسطة تفاعل البلمرة العكسيReverse Transcriptase –Polymerase Chain Reaction) ،RT-PCR) حيث ان جميع النباتات المستخدمة في الدراسة كانت موجبة للاختبار المذكور عند تضخيم قطعة مستقيمة لجينات الحامض النووي التي تكون غلاف فايروس CMV مع برايمر CM1,CM2 فقد ظهرت حزم Bands DNA واضحة بحجم (bp 486- 488 ) مقارنة مع النباتات السليمة التي لم تعطِ اي حزمة للحامض النووي المذكور . مما يؤكد ان الفايروس المستخدم في الدراسة هو فايروس موزائيك الخيارCMV والذي يقع تحت المجموعة ( I) للفايروس المذكور، و تعد هذه الدراسة الأولى في المنطقة التي استخدمت التشخيص الجيني لفايروس CMV.


Article
Inducing the systemic resistance in cucumber plants (Cucumis saivus L.) against cucumber mosaic virus by using some kind of biotic bacterial agents
استحثاث المقاومة الجهازية في نبات الخيار(. Cucumis sativus L) ضد فايروس موزائيك الخيارCMV باستخدام بعض انواع العوامل الحيوية البكتيرية

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to determine the ability of inducing systemic resistance in cucumber plants against cucumber mosaic virus (CMV) by using three genus of bacteria Bacillussubtilis , Pseudomonas fluorescens and Azotobacter chroococcum and determine the activity of each one individually and as a mixture to control the virusThe plastic pots experiment included five treatments as they are 1- Immerse cucumber seeds in Bacillus subtilis suspension 2×109 CFU, Pseudomonas fluorescens suspension 5×1010 CFUand Azotobacter chroococcum suspension 2×1010 CFU individually and as a mixture of two genus for 30 and 60 min. , 2- Treatment of Irrigate cucumber plants 2 days before treatment with CMV with above bacteria suspension individually and as a mixture 3- immerse cucumber seeds in Bacillus subtilis suspension 2×109 CFU, Pseudomonas fluorescens suspension 5×1010 CFU and Azotobacter chroococcum suspension 2×1010 CFUfor 30 and 60 min. , then Irrigate cucumber plants 2 days before treatment with CMV with the same bacteria suspension individually and as a mixture 4-Infected control treatment. 5-control treatment . The evaluation of treatment were estimated depending upon the infection percentage , infection severity percentage and determination of some growth parameters .The immerse of seeds by the above three genus of bacteria individually and as a mixture for 30 and 60 min. , showed significant reduction in percentage of infection and severity , which was ranged between 17.0 -55.5 % and 11.1 – 26.6 % respectively , compared to infected control treatment which was percentage of infection 100% and the severity 88.83 % respectively . Significant increase in growth parameters were appeared in comparison to the control treatments . The treatment of immersing seeds in mixed bacteria over –powered upon other treatments individually through 30 and 60 min. , in the percentage of infection and disease severity and in case of increase growth parameters .The mixture of Bacillus subtilis and Azotobacter chroococcum for 30 and 60 min. without treatment with virus over-powered upon other treatment in : the length of vegetative growth was 52.0 and 53.5 cm , the length of roots which was 46.1-54.5 cm , fresh weight of vegetative parts which was 23.0 and 24.1 gm. , the fresh weight of roots which was 10.7 and 11.5 gm. , dry weight of roots was 1.7 and 2.5 gm. respectively. The irrigation treatment lead to clear decrease in percentage and severity of infection and improve the plant growth parameters in comparison to infected control .The treatment of mixed bacteria over-powered in the individual bacteria treatment in term of reduction in percentage and severity of infection ,and plant growth parameters the incidence of infection was ranged between 17.0 -27.8 % while severity infection 8.9 -17.8 % compared to infected control 100% incidence infection with 88.8 % severity infection . The treatment of immersing cucumber seeds for 30 and 60 min. , then irrigated by three genus of the above suspension bacteria individually or as mixture gave protection to cucumber plants against CMV through reduction in the infection percentage and its severity.There was significant differences between using the mixed bacteria followed by irrigation of the same mixture or using the three genus of bacteria individually for two periods (30 and 60 min.) , the percentage of infection in the mixture was 17.0- 26.8 % and the infection severity was 11.1-20.0 % , while the infection percentage was 30.5-43.7 % and the infection severity was 22.2-31.3 % in the individual bacteria treatment, compared to infection percentage 100% of infected control and the infection severity was 95.5% respectively .

اجريت هذه الدراسة بهدف معرفة امكانية تحفيز المقاومة في نبات الخيار ضد فايروس موزائيك الخيار باستعمال ثلاث اجناس مختلفة هيPseudomonas fluorescens وsubtilis Bacillusو Azotobacter chroococcum ومعرفة فاعلية كل منهم على انفراد وفاعلية خليط جنسين منهما في مقاومة الفايروس .تضمنت تجارب الاصص البلاستيكية خمسة معاملات وهي 1- تجربة غمر بذور الخيار بمعلق بكترياPseudomonas fluorescens بتركيز 1010×5، Bacillussubtilisبتركيز 109×2و Azotobacter chroococcumبتركيز 1010×2بشكل مفرد وخليط جنسين منها ولمدة 30 و60 دقيقة , 2-تجربة سقي نباتات الخيار قبل يومين من اجراء العدوى بفايروسCMVبالمعلق البكتيري وخليط جنسين من معلق الاجناس الثلاثة المذكورة انفا ، 3- تجربة غمر بذور الخيار بمعلق البكتريا نفسها وخليط جنسين منها لمدة 30 و60 دقيقة ثم سقي النباتات الناتجة بمعلق البكتريا الآنفة الذكر وخليط جنسين منها قبل يومين من اجراء العدوى بالفايروس ، 4- تجربة المقارنة المعداة بالفايروس ، 5- تجربة المقارنة السليمة. قيمت المعاملات على اساس النسبة المئوية للاصابة والنسبة المئوية لشدة الاصابة وكذلك قياس بعض معايير النمو وهي اطوال المجموع الجذري والخضري وكذلك الاوزان الرطبة والجافة للمجموعين الخضري والجذر بحيث اظهرت معاملة غمر البذور بالاجناس البكتيرية الثلاث وخليطهما وللفترتين 30 و60 دقيقة خفض معنويا في نسبة وشدة الاصابة حيث تراوحت نسب الاصابة بين 17.0- 31.10% وشدة الاصابة مابين 11.1-26.6 % بينما كانت النسبة المئوية وشدة الاصابة في المقارنة المعداة بالفايروس100% وشدة اصابة 88.8% على التوالي وكذلك ظهرت زيادة معنوية في معايير نمو نباتات الخيار المعاملة قياسا الى معاملتي المقارنة ، وتفوقت معاملات غمر البذور بمعلق الخليط البكتيري على معاملات غمر البذور بمعلق البكتريا مفردة وبالفترتين 30 و60 دقيقة من حيث نسبة وشدة الاصابة وزيادة معايير النمو . ان معاملة خليط معلق البكتريا B. subtilis و chroococcum A.ولمدة 30 و60 دقيقة بدون اجراء العدوى بالفايروس تفوقت على بقية المعاملات في زيادة معايير النمو فقد كان طول المجموع الخضري 52.0سم و 53.5 سم على التوالي ،طول المجموع الجذري 46.1 سم و 54.5 سم على التوالي ، الوزن الرطب للمجموع الخضري 23.0 غم و24.1 غم على التوالي ،الوزن الرطب للمجموع الجذري 10.7 غم و11.5 غم على التوالي ،الوزن الجاف للمجموع الخضري 2.9 غم و 3.7 غم على التوالي والوزن الجاف للمجموع الجذري 1.7 غم و2.5 غم على التوالي .اما تجربة سقي التربة فان جميع المعاملات اعطت خفض واضح في نسبة وشدة الاصابة وكذلك تحسين معايير نمو النباتات المعاملة قياسا بمعاملة المقارنة المعداة بالفايروس وقد تفوقت معاملات الخليط البكتيري على معاملات معلق البكتريا المنفردة في خفض نسبة وشدة الاصابة وكذلك في مؤشرات النمو.حيث تراوحت نسب الاصابة في الخليط ما بين 17.0 -27.8 % وشدة اصابة من 8.9-17.8 % بينما كانت في المقارنة المعداة بالفايروس نسبة الاصابة 100% و شدة اصابة 88.8% .بينما وفرت معاملة غمر البذور لمدة 30 و60 دقيقة ثم السقي بالاجناس البكتيرية الثلاث كل على انفراد او معا حمايةلجميع المعاملات حماية لنباتات الخيار ضد فايروس موزائيك الخيار من خلال الخفض الحاصل في نسبة وشدة الاصابة ، ووجد ان هناك فروقا معنوية بين استعمال معلق الخليط البكتري ثم السقي بنفس الخليط او استعمال اجناس البكتريا الثلاثة بشكل مفرد وللفترتين 30 و60 دقيقة ثم السقي بنفس معلق الاجناس البكتيرية حيث تراوحت نسبة الاصابة في الخليط بين 17.0-27.8 % وشدة الاصابة بين 11.1- 20.0 % في حين تراوحت نسب الاصابة بين 30.5-43.7% و شدة الاصابة 22.2-31.3 % في معاملة معلق البكتريا بشكل منفرد ، في حين بلغت نسبة وشدة الاصابة بمعاملة المقارنة المعداة بالفايروس 100% و95.5% على التوالي .

Listing 1 - 4 of 4
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (4)


Language

Arabic and English (4)


Year
From To Submit

2017 (2)

2016 (2)