research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Genetic variation between wild type and auxotrophic mutant isolates of Sinorhizobiummeliloti by using RAPD-PCR technique
التباين الوراثي بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي في بكتيريا Sinorhizobium melilotiبأعتماد تقانةRAPD-PCR

Authors: Ihsan A. Hussein إحسان عرفان حسين --- Salwa A. Ganim سلوى علي غانم
Journal: Ibn Al-Haitham Journal For Pure And Applied Science مجلة ابن الهيثم للعلوم الصرفة والتطبيقية ISSN: 16094042/25213407 Year: 2014 Volume: 27 Issue: 3 Pages: 118-130
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

SGI2 wild type isolate of Sinorhizobiummeliloti was isolated from Medicagosativa (alfalfa) plant which was obtained from Al-Tarmiaa region / Baghdad. Nine auxotrophic mutants were obtained from the SGI2 wild type isolate by mutagenesis with Nitrous acid (HNO2). The SGI2 wild type and the all auxotrophic mutant isolates had two Megaplasmids; pSymA and pSymB. No genetic variations in plasmid number and size were detected when gel electrophoresis was done for plasmid profile detection. Genetic variations by using RAPD-PCR technique were obtained between wild type and auxotrophic mutant isolates. One band was detected in SGI6 gel profile with 1.5 Kb size when OPY-04 primer was used. Using OPB7 primer by using RAPD-PCR technique showed large variation between all the isolates. Two bands were obtained from the SGI2 wild type isolate with 800 bases and 1.5 Kb in size. These bands were absent from the auxotrophic mutant isolates. The band with 800 bases was also found in SGI10 isolate. The other auxotrophic mutant isolates have different bands with size ranging from 200 bases and more than 1.5 Kb for the SGI6 isolate. No bands were detected in SGI8, SGI9 and SG12 isolates. The large differences in bands number and size suggested that the variation is clear at the genes level of the total genome and not at plasmid level as a result after nitrous acid mutagenesis.

عزلت عزلة برية SGI2 لبكتيريا Sinorhizobiummeliloti من نبات الجتMedicago sativa (alfalfa) الذي حصلنا عليه من منطقة الطارمية / محافظة بغداد، وتم الحصول على 9 طافرات عوز غذائي من العزلة البرية SGI2 بالتطفير مع حامض النيتروز Nitrous acid. امتلكت جميع العزلات البرية والطافرة بلازميدين كبيرين هما pSymA وpSymB ولم يظهر الترحيل الكهربائي لهما أي تغيرات نتيجة التطفير بحامض النيتروز. أظهرت التباينات الوراثية بأعتماد تقانة RAPD-PCR بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي وجود حزمة واحدة في العزلة SGI6 بحجم أكبر من 1.5 كيلو قاعدة عند أستعمال البادئ OPY-04، وعند أستعمال البادئ OPB7 أظهر تباينات كبيرة بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي. تم مشاهدة حزمتين في العزلة البرية SGI2 بحجم 800 قاعدة و1.5 كيلو قاعدة وعدم ظهورها في العزلات الطافرة الأخرى. أظهرت الحزمة التي بحجم 800 قاعدة في العزلة الطافرة SGI10فحسب،في حين أظهرت بقية العزلات الطافرة حزماً تباين حجمها من 200 قاعدة إلى أكثر من 1.5 كيلو قاعدة كما في العزلة SGI6. ولم تظهر أي حزم عند أستعمال هذا البادئ في العزلات SGI8، SGI9 و SGI12. إن ظهور هذه الحزم يوضح مدى التباين الوراثي على المستوى الجيني للجينوم الكلي وليس على مستوى البلازميد نتيجة التطفير الكيمياوي بأستعمال حامض النيتروز.


Article
Genetic diversity of Capsicum annuum L. in local and imported samples in Iraq by using RAPD-PCR
التباين الوراثي لثمار الفلفل الحلو Capsicum annuum L. لعينات محلية ومستوردة في العراق باعتماد تقانة RAPD-PCR

Authors: Ihsan A. Hussein إحسان عرفان حسين --- Shaymaa S. Mahdi شيماء صباح مهدي
Journal: Ibn Al-Haitham Journal For Pure And Applied Science مجلة ابن الهيثم للعلوم الصرفة والتطبيقية ISSN: 16094042/25213407 Year: 2015 Volume: 28 Issue: 3 Pages: 383-398
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Genetic variation was studied in 22 local and imported samples collected from local Iraqi market by using random amplified polymorphic DNA (RAPD-PCR). Five randomly primers set were used in this study. These primers produced 292 bands. Molecular weights of these bands ranged between 1.8 Kb (1800 bp) to 150 bp. The percentage of polymorphic bands is 100%, with one distinguished band which is produced by using C52 primer. The other primers did not produce any distinguished band. The results of Dendrogram of the studied samples depended on RAPD-PCR results by using Jaccard coefficient for genetic similarity was distributed the samples into 8 groups. This Dendrogram revealed a higher similarity between Iraqi/Yousifia green bell pepper and Jordanian yellow bell pepper with 0.84 values. This value is the highest between samples in comparison with lowest values (0.0) which are found between Iranian yellow bell pepper and the other samples. There are another high values were revealed between Italian orange and red bell pepper with 0.74 values. Also, other high similarity values revealed between Spanish red bell pepper and Italian green bell pepper with 0.73 values; Iranian red bell pepper and Jordanian green bell pepper with 0.72 values; Iraqi/Souwyera green bell pepper and Iraqi/Yousifia green bell pepper with Jordanian yellow bell pepper (the last two samples in same subgroup) with 0.69 values, and last between Iraqi/Balad green bell pepper and Chinese red bell pepper with 0.61 values. The genetic distance between studied samples by using Euclidean coefficient revealed the highest values between Chinese yellow bell pepper and Iranian green bell pepper with 5.0 values, in comparison with the lowest genetic distance between Spanish green bell pepper and Italian yellow bell pepper with 1.0 value.

درس التباين الوراثي في 22 عينة محلية ومستوردة من ثمار الفلفل الحلو التي جمعت من السوق المحلية العراقية باعتماد تقانة الدنا متعدد الأشكال المضخم عشوائياً Random amplified polymorphic DNA (RAPD-PCR). أستعملت خمس بادئات عشوائية في هذه الدراسة وأن هذه البادئات قد أنتجت 292 حزمة تراوحت أحجامها الجزيئية بين 1.8 كيلو زوج قاعدة (1800 زوج قاعدي) و 150 زوج قاعدي. كانت نسبة التعدد الشكلي لجميع البوادئ 100% مع ظهور حزمة متميزة واحدة وبحجم جزيئي 1.8 كيلو زوج قاعدة عندما أستعمل البادئ C52، بينما لم تنتج البادئات الأخر أي حزم متميزة. نتائج شجرة القرابة الوراثية التي رسمت بإلأعتماد على النتائج المتحصل عليها من استعمال البادئات العشوائية وبالأعتماد على مقياس Jaccard للتشابه الوراثي قد وزعت العينات ضمن التحليل العنقودي إلى ثماني مجاميع رئيسة. أظهرت شجرة القرابة وجود تشابه عال بين ثمار الفلفل الحلو العراقي/اليوسفية الأخضر وثمار الفلفل الحلو الأردني الأصفر بنسبة 0.84 وهي أعلى قيمة تشابه، بالمقارنة مع تشابه وبقيمة صفر بين ثمار الفلفل الحلو الأيراني الأصفر وبين عينات ثمار الفلفل الحلو الأخرى. نسبة التشابه العالية ظهرت أيضاً بين ثمار الفلفل الحلو الأيطالي البرتقالي والأحمر وبقيمة 0.74 وكذلك بين ثمار الفلفل الحلو الأسباني الأحمر وثمار الفلفل الحلو الأيطالي الأخضر وبقيمة 0.73 وبين ثمار الفلفل الحلو الأيراني الأحمر والأردني الأخضر وبقيمة 0.72 وبين ثمار الفلفل الحلو العراقي/الصويرة الأخضر وبين ثمار الفلفل الحلو العراقي/يوسفية الأخضر وثمار الفلفل الحلو الأردني الأصفر (يقعان في نفس تحت المجموعة) وبقيمة 0.69. ثمار الفلفل الحلو العراقي/بلد الأخضر وثمار الفلفل الحلو الصيني الأحمر قد أظهرا تشابهاً وراثياً وبقيمة 0.61. أظهرت قيم البعد الوراثي بين عينات ثمار الفلفل الحلو المدروسة أعلى قيمة كانت بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الصيني الأصفر والأيراني الأخضر وبقمة 5.0، بينما كان أقل بعد وراثي بين عينتي ثمار الفلفل الحلو الأسباني الأخضر والأيطالي الأصفر إذ كانت القيمة مساوية إلى 1.0

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic and English (1)

English (1)


Year
From To Submit

2015 (1)

2014 (1)