research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
THE GENETIC DISTANCE OF ROSA SPP. USING RAPD
البعد الوراثي لأنواع ورد باستخدام RAPD

Author: Janan K. Hussein جَنان قاسم حسين
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2011 Volume: 42 Issue: 2 Pages: 71-79
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The study was carried out at biotechnology laboratories- GCSAR- Syria in summer season-2010. The random amplified polymorphic DNA (RAPD) based on Polymerase Chain Reaction (PCR) with ten primers were applied, used to estimate fingerprinting and Genetic Distance for six cultivars of Rosa spp. (Tea R., Musk R. , Hybrid perpetuls R. , Climber R. , Miniature R. , French R.). Phases of work included the isolation and purification of DNA plant parts and DNA polymorphisms were scored within amplified fragements by electrophoresis. The results of RAPD analysis were clear differences in the number of DNA amplified fragments and molecular weights depending on the primers user . A total number of polymorphic amplified 68 fragments for all primers used . Genetic Distance for rose cultivars genetic variability found in it. High Genetic Distance Rose cultivars (40.3%) in RAPD markers was registered between the two cultivars (Hybrid perpetuls R. X Climber R.) and lowest Genetic Distance (18.9%) between (Tea R. X Climber R.). Rose cultivars gave genetical and morphological variations confirmed by genetic distance. High genetic differences between rose cultivars could be attributed to the geographical locations they were grown as well as plant breeding made to it.

نفذت التجربة في مختبرات التقانات الاحيائية–الهيئة العامة للبحوث العلمية الزراعية-الجمهورية العربية السورية في صيف 2010. استخدمت تقانة التضاعف العشوائي المتعدد الاشكال لسلسة DNA (RAPD) Randomly Amplified Polymorphic DNAالمعتمدة على تقانة PCR Polymerase Chain Reaction وبعشرة بادئات, لايجاد البصمة الوراثية والنسبة المئوية للبعد الوراثي لستة اصناف من الورد Rosa spp. تعود لستة انواع(ورد الشاي,ورد المسك,الورد الدائمي الهجين,الورد المتسلق,الورد المتقزم,الورد الفرنسي). تضمنت خطوات العمل عزل وتنقية DNAالاوراق الحديثة النمو للاصناف الداخلة بالبحث والكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل صنف بعد ترحيل العينات بجهاز الترحيل الكهربائي في تفاعلاتRAPD. بينت نتائج التحليل الوراثي بمؤشرات RAPD اختلافا واضحا في عدد حزم الـDNA المتضاعفة وأوزانها الجزيئية وذلك تبعا للبادئ المستخدم إذ بلغ العدد الكلي للحزم المتباينة 68 حزمة لكافة البادئات المستخدمة . أعطت انواع الورد تغايرات مظهرية ووراثية مختلفة أكدتها النسبة المئوية للبعد الوراثي الناتجة عن تحليل نتائج مؤشرات RAPD التي بلغت أعلاها 40.3% بين الورد الدائمي الهجين والورد المتسلق, واقلها 18.9% بين ورد الشاي والورد المتسلق, وبعد حساب النسبة المئوية للبعد الوراثي بين الاصناف وجد تغايرات وراثية فيها ربما تعود الاختلافات الوراثية العالية بين انواع الورد إلى المواقع الجغرافية التي تنتمي إليها إضافة إلى عمليات التربية والتحسين التي أجريت عليها.

Keywords


Article
MOLECULAR AND MORPHOLOGIGAL CHARACTERIZATION FOR SOME CARNATIONSPECIES(Dianthusspp.).
التوصيف الجزيئي والمظهري لبعض انواع القرنفل

Author: Janan K. Hussein جَنان قاسم حسين
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2015 Volume: 46 Issue: 5 Pages: 793-801
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The study includedtwo phases, the first one was carried out at one of Baghdad nurseries on 15/9/2013 sowing the seeds of 12 species ofDianthusspp.( D.caryophyllus, D. chinensis, D. gratianopolitanus, D. barbatus, D. balbisii, D. repens, D. alpinus, D. monspessulanus, D. pavonius, D. deltoids, D. japonicas and D. seguieri)to study some of the qualities phenotypic, and the second phase was carried out atbiotechnology and tissue culture laboratories /College of Agriculture/University ofRazi/Kermanshah/Iran . TheAmplified Fragment Length Polymorphism(AFLP) based on Polymerase Chain Reaction (PCR) with seven primers was implemented. The results of the phenotypic characteristics of the species studied, and there are considerable differences between them where the variation coefficient (C.V.)was very high in all the traits and reached the top rated 85.09 for a number of branches /plant , 57.66 for the number of flowers / plant, 45.08 flower diameter, 32.51 for plant height and 28.66 dry weight of vegetative part . DNA analysis showed that the primers gave a 397 bands including 324 polymorphic bandsand 81.59% polymorphic bands, this confirms the existence of Genetic Distance between the species of Dianthus studied . High Genetic Distance 0.28% D. barbatu and D. caryophyllusand lowest Genetic Distance0.08% betweenD. chinensis and D. japonicas.

تضمنت الدراسة مرحلتين الاولى حقلية نفذت في احد مشاتل بغداد بتاريخ 013-9-152 بزراعة بذور 12نوع من القرنفلspp.Dianthus(D. caryophyllus,D. chinensis, D. gratianopolitanus, D. barbatus, D. balbisii, D. repens, D. alpinus , D. monspessulanus , D. pavonius , D. deltoids ,D. japonicasوD. seguieri)لدراسة بعض الصفات المظهرية لها, والمرحلة الثانية مختبرية نفذت في مختبرات الزراعة النسيجية والتقانات الاحيائية-كلية الزراعة-جامعة الرازي-كرمنشاه-ايران.استخدمت تقانة تبايناتاطوال القطعالمتضاعفة (AFLP)Amplified Fragment Length Polymorphism المعتمدة على تقانة PCRPolymerase Chain Reactionوبسبعة توليفات من البادئات. بينت نتائج الصفات المظهرية للأنواع المدروسة وجود اختلافات كبيرة فيمابينها حيث كان معامل التغاير(C.V.)عالي جدا في جميع الصفات المدروسةوبلغ اعلاها 85.09 لعدد الافرع الرئيسة, 57.66لعدد الازهار-نبات, 45.08قطر الزهرة , 32.51لارتفاع النبات و 28.66للوزن الجاف للمجموع الخضري. اظهر تحليل البصمة الوراثية ان توليفة البادئات السبعة المعتمدة اعطت397 حزمة كان منها 324حزمة متباينة وبنسبة تباين 81.59% وهذا يؤكد وجود تباعد وراثي بين انواع القرنفل المدروسة اذ بلغ اعلاها0.28% بين النوعين D. barbatusوD.caryophyllusفي حين اعطى النوعين D. chinensis و D. japonicas اقل نسبة للبعد الوراثي وبلغت 0.08%.


Article
EARLY DETECTION OF CHROMOSOMAL POLYPLOIDY RESULTING FROM EFFECT OF THE COLCHICINE ON Cassia angustifolia
الكشف المبكر عن التضاعف الكروموسومي الناتج عن تاثير الكولشسين في نبات الكاسيا angustifolia

Author: Janan K. Hussein جَنان قاسم حسين
Journal: Diyala Journal of Agricultural Sciences مجلة ديالى للعلوم الزراعية ISSN: 20739524 Year: 2016 Volume: 8 Issue: 2 Pages: 50-57
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

The study was carried out at biotechnology and Tissue culture laboratories /College of Agriculture / University of Al-Razi / Kermanshah / Iran in summer season-2014. For early detection of chromosomal polyploidy, resulting from soaking the seeds cultured of Cassia angustifolia in three Colchicine solution concentrations (0.01 , 0.025 , 0.05 %) and three periods( 6 , 12 , 24 hour). The study aimed to detect the presence of chromosomal polyploidy depending on the Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD), Results confirmed the chromosomal polyploidy of plants which gave higher Genetic Distance counts the number of chromosomes in the cells of the roots tops. The results of RAPD analysis were clear differences in the number of DNA amplified fragments and molecular weights depending on the primers user, 9 primers gave 78 bands (35 similar bands and 43 polymorphic bands) and estimated the contrast ratio to 55.43% . Highest Genetic Distance was in Colchicine treatment T6 (0.025% X24 hour) 0.39%, followed by plants treatment T3 (0.01 X 24 hours)( 0.35% ) and T7 (0.05 X 6 hours)( 0.33%). The results showed laboratory to calculate the number of chromosomes occur chromosomal polyploidy (4N = 56) in some plants transactions T6, T3, T7, The highest rate chromosomal polyploidy 64.71% in plants treated T7 followed T6 (57.14%) and T3 (26.09%) .

نفذت التجربة في مختبرات الزراعة النسيجية والتقانات الاحيائية-كلية الزراعة - جامعة الرازي -كرمنشاة- ايران. خلال الموسم الصيفي لعام 2014, للكشف المبكر عن حدوث التضاعف الكروموسومي الناتج عن نقع البذور المستنبتة لنبات الكاسيا في ثلاثة تراكيز من الكولشسين هي 0.01 , 0.025 , 0.05 % ولثلاث فترات زمنية هي 6 , 12 , 24 ساعة. تم الكشف عن وجود التضاعف الكروموسومي بالاعتماد على مؤشرات التضاعف العشوائي المتعدد الاشكال لسلسلة DNA (RAPD) Randomly Amplified Polymorphic DNA, واكدت نتائج التضاعف الكروموسومي للنباتات التي اعطت اعلى بعد وراثي بحساب عدد الكروموسومات لها في خلايا اطراف الجذور. بينت نتائج تقانة (RAPD) وجود تغايرات وراثية بين معاملات الكولشسين, حيث اعطت 9 بادئات 78 حزمة (35 حزمة متشابهة و 43 حزمة متباينة) وقدرت نسبة التباين ب55.43% , اعطت معاملة الكولشسين T6(0.025% X24 ساعة) اكبر بعد وراثي 0.39% وتلتها نباتات المعاملات T3(0.01 X 24ساعة) و T7(0.05 X 6 ساعة) وبنسبة بعد وراثي 0.35% و 0.33% على الترتيب. بينت النتائج المختبرية لحساب عدد الكروموسومات حدوث تضاعف كروموسومي( 4N=56 ) في بعض نباتات المعاملات T6 ,T3 ,T7 , اذ كانت اعلى نسبة تضاعف كروموسومي64.71% في نباتات المعاملة T7 تلتها نباتات المعاملات T6 (57.14%) و T3(26.09%).


Article
THE EFFECT OF ELECTRIC SHOCK ON DNA STRUCTURE OF Antirrhinum majus
تأثير الصعق الكهربائي في DNA نبات حلق السبع

Loading...
Loading...
Abstract

The experiment was conducted in the lathhouse of Horticulture Department – College of Agriculture – Baghdad University in fall season of 2006 to investigate the effect of electric shock (E.S.) on DNA of Antirrhinum majus.Three levels of E.S. severity AC (6,8,10 Ampere) and three timings of treating (2,4,6 minutes ) were tested plus the control. A special electric apparatus was prepared for this purpose. Sprouted seeds and seedlings were soaked (before the E.S. treatments) for 3h in a 1% NaCl solution. Then they soaked in a fresh water for the same period ( 3h ) before they planted in the soil. The genetic study included DNA finger printing for some selected plants of Antirrhinum majus. Testing Genetic Distance by using two DNA markers based on Polymerase Chain Reaction (PCR) was applied. Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) were employed. The study was carried out at International Center for Agricultural Research in the Dry Areas (ICARDA)-Aleppo-Syria. Antirrhinum majus showed clear morphological differences on either the vegetative or flowering growth. The genetic analyses by RAPD or AFLP and Genetic Distance for selected treated plants comparing to untreated (control) was performed. Highest Genetic Distance (42%) by RAPD markers and 27.5% by AFLP markers was recorded on plants that their sprouted seeds were treated by (8A X 6mins).

نفذت التجربة في الظلة الخشبية التابعة لقسم البستنة كلية الزراعة جامعة بغداد, خلال الموسم الخريفي2005.كان ذلك لمعرفة تأثير الصعق الكهربائي في التركيب الوراثي لنبات حلق السبع Antirrhinum majus.استخدمت شدة تيار (AC) (10,8,6 أمبير) لمدة (6,4,2 دقائق) فضلاً عن معاملة عدم الصعق(القياس) باستخدام جهاز صمم لهذا الغرض. عوملت الأجزاء النباتية البذور المستنبتة والشتلات لنباتات حلق السبع بالمعاملات آنفة الذكر بعد نقعها بمحلول ملح الطعام 1% لثلاث ساعات. زرعت البذور المستنبتة والشتلات في التربة بعد غسلها بالماء العادي لثلاث ساعات أيضاً. تضمنت الدراسة الوراثية أيجاد البصمة الوراثية لعدد من النباتات المنتخبة لحلق السبع وإيجاد النسبة المئوية للبعد الوراثي باستخدام نوعين من مؤشرات الـDNA (DNA markers) المعتمدة على تقانةPCR وهي مؤشرات التضاعفي العشوائي المتعدد الاشكال لسلسلة DNA(RAPD) Randomly Amplified Polymorphic DNAومؤشرات تباينات أطوال القطع المتضاعفة بأختبار(AFLP) Amplified Fragment Length Polymorphismوذلك في مختبرات التقانات الحيوية في المركز الدولي للبحوث الزراعية في المناطق الجافة (ICARDA) في الجمهورية العربية السورية. تضمنت مراحل العمل عزل وتنقيةDNAالاجزاء النباتية ثم الكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل نبات منتخب بعد ترحيل العينات بجهاز الترحيل الكهربائي في تفاعلاتRAPD أوAFLP. أعطت نباتات حلق السبع المنتخبة تغايرات مظهرية واضحة سواء في المجموع الخضري أو الزهري وقد بينت نتائج التحليل الوراثي بمؤشرات RAPD و AFLP وبعد حساب النسبة المئوية للبعد الوراثي بين النباتات المنتخبة ونبات القياس وجود تغايرات وراثية فيها, أذ بلغت أعلى نسبة للبعد الوراثي 42% في مؤشرات RAPD و27.5% في مؤشرات AFLP لنفس النبات المنتخب التي عوملت بذوره المستنبتة بالمعاملة

Keywords


Article
THE GENETIC VARIATIONS INDUCED IN Mathiola incana BY ELECTRIC SHOCK AS TESTED BY RAPD
التغايرات الوراثية للشبوي الناتجة عن الصعق الكهربائي باستخدامتقانة RAPD

Loading...
Loading...
Abstract

The study was conducted in the lathhouse of Horticulture Department – College of Agriculture – Baghdad University in fall season 2005 to investigate the effect of electric shock on DNA of Mathiola incana.Three levels of electric current severity AC (6,8,10 Ampere) and three timings of electric shock (2,4,6 minutes ) were tested plus the control treatment. A special electric apparatus was prepared for this purpose. Sprouted seeds and seedlings were soaked before the treatments for 3hrs in a 1% NaCl solution. Then they soaked in a fresh water for the same period ( 3hrs ) before they planted in the soil. The genetic study included DNA finger printing for some selected plants of Mathiola incana. The Genetic Distance by using Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD based on Polymerase Chain Reaction (PCR) were applied. The study was carried out at International Center for Agricultural Research in the Dry Areas (ICARDA)-Aleppo-Syria. Mathiola incana showed clear morphological differences on either the vegetative or flowering growth. The genetic analyses by using RAPD and Genetic Distance for selected treated plants comparing to untreated plants(control) was performed. High Genetic Distance of Mathiola incana plants(35%) in RAPD markers was registered on plants which the sprouted seeds were treated by (10A X 4mins).

نفذت التجربة في الظلة الخشبية التابعة لقسم البستنة كلية الزراعة جامعة بغداد, خلال الموسم الخريفي2005. لمعرفة تأثير الصعق الكهربائي في التركيب الوراثي لنبات الشبوي Mathiola incana.استخدمت شدة تيار (AC) (10,8,6 أمبير) لمدة (6,4,2 دقائق) فضلاً عن معاملة عدم الصعق(القياس) باستخدام جهاز صمم لهذا الغرض. عوملت الأجزاء النباتية البذور المستنبتة والشتلات لنبات الشبوي بالمعاملات آنفة الذكر بعد نقعها بمحلول ملح الطعام 1% لثلاث ساعات.زرعت البذور المستنبتة والشتلات في التربة بعد غسلها بالماء العادي لثلاث ساعات أيضاً. تضمنت الدراسة الوراثية أيجاد البصمة الوراثية لعدد من النباتات المنتخبة للشبوي وإيجاد النسبة المئوية للبعد الوراثي باستخدام مؤشرات التضاعفي العشوائي المتعدد الاشكال لسلسلة DNA (RAPD) Randomly Amplified Polymorphic DNA المعتمدة على تقانة PCR وذلك في مختبرات التقانات الحيوية في المركز الدولي للبحوث الزراعية في المناطق الجافة (ICARDA) في الجمهورية العربية السورية. تضمنت مراحل العمل عزل وتنقيةDNA الاجزاء النباتية ثم الكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل نبات منتخب بعد ترحيل العينات بجهاز الترحيل الكهربائي في تفاعلاتRAPD. أعطت نباتات الشبوي المنتخبة تغايرات مظهرية واضحة سواء في المجموع الخضري أو الزهري. بينت نتائج التحليل الوراثي بمؤشرات RAPD وبعد حساب النسبة المئوية للبعد الوراثي بين النباتات المنتخبة ونبات القياس وجود تغايرات وراثية فيها . أعطت نباتات الشبوي المنتخبة تغايرات مظهرية ووراثية مختلفة أكدتها النسبة المئوية للبعد الوراثي الناتجة من تحليل نتائج مؤشرات RAPD التي بلغت أعلاها 35% في أحدى نباتات المعاملة (10أمبيرX 4دقائق) عند معاملة بذورهِ المستنبتة .

Keywords

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

Arabic (4)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2016 (1)

2015 (1)

2011 (1)

2009 (1)

2008 (1)