research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
Determination of Activation Parameters for the Oxidation of Single Ionic Species of Aminoacids

Author: Mahmoud S. Saieed
Journal: JOURNAL OF EDUCATION AND SCIENCE مجلة التربية والعلم ISSN: 1812125X Year: 2006 Volume: 18 Issue: 13 Pages: 20-31
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

In this work the oxidation of five a-aminoacids (glycine, alanine, valine, leucine and norleutine) by permanganate ion in an aqueous phosphate buffer solution were studied. The results showed that the reaction proceed in two pathways. The first is noncatalyzed and the second is autocatalyzed by the colloidal manganese dioxide resulted from the first pathway. The dependences of the noncatalyzed oxidation reaction on the pH of the medium was utilized in calculation of the rate constant for the oxidation of zwitter ionic (kHA) and anionic (kA) forms.

في هذا البحث تم دراسة حركية التاكسد لخمسة احماض امينية وهي الكلايسين والفالين واللوسين والنورليوسين والالنين بوساطة ايون البرمنكنات في محلول مائي. اظهرت التائج ان التفاعل يحدث بمسارين، الاول غير محفز والثاني محفز ذاتيا عن طريق ثاني اوكسيد المنغنيز الغروي الناتج من المسار الاول للتفاعل . ومن اعتماد سرعة التفاعل على درجة الحرارة تم حساب قيمة ثابت سرعة التفاعل غير المحفز (kn) وثابت سرعة التفاعل المحفز (kc). ومن اعتماد سرعة التفاعل غير المحفز على الاس الهيدروجيني للوسط تم حساب ثابت سرعة التأكسد لكل من الايون المزدوج (kHA) والايون السالب (KA) للحامض الاميني. ومن اعتماد الثوابت KHA و KA على درجة الحرارة تمكنا ولأول مرة من حساب الدوال الثيرموداينميكية التنشيطية لاكسدة كل من الايون المزدوج والايون السالب للحامض الاميني.وبعد ذلك نوقشت الدوال الثيرموداينميكية استنادا للميكانيكية المقترحة للتفاعل. وأظهرت ان القيم المحسوبة اعتماد على ثوابت السرعة الظاهرية (Kn) للتفاعل غير المحفز.

Keywords


Article
Additional Factors Affecting the Rate and Mechanism of Ring Opening Reaction

Author: Mahmoud S.Saieed
Journal: JOURNAL OF EDUCATION AND SCIENCE مجلة التربية والعلم ISSN: 1812125X Year: 2005 Volume: 17 Issue: 7 Pages: 18-29
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The reactions of thiosulphate ion with some bromoalkylamines of structure RR'N-(CH2)n-Br, where n = 2,3,4,5 or 6 and R - R1 - H, methyl, ethyl or isopropyl, were studied kinetically in an aqueous solution at different pH, The kinetic results for these reactions in basic medium gave explicit evidence in favour of the formation of cyclic intermediate during the reaction course. The rate of these reactions depends mainly on the reactivity of the cyclic intermediate. It has been found that thereactivity of large ring intermediate is mainly controlled by the energy of ring strain relief. As the ring size becomes small (smaller than five members) the rate of the reaction becomes very fast and can't be explained on the bases of ring strain relief only, In order to explain this observation other factors may affect the reactivity of the cyclic intermediate are taken into account, such as the electron density at the nitrogen atom, the sterochemical situation at the reaction centre and the probability of a successful reaction. Taking into account these factors gave a better explanation for the high reactivity of small ring are given, On the other hand, it has been observed that the reaction in acidic medium proceed with a different mechanism in which the reaction occurs by a direct attackment of the nucleophile on the methylene group attached to the bromo group. The dependence of the rate constants on temperature were studied in order to estimate the thermodynamic parameters which were utilized in the discussion of the factors affecting the rate of ring opening reaction.

في هذا البحث تم دراسة حركية التفاعل بين الثايوسلفات ومشتقات البرومو الكيل امين ذات التركيب RR'N-(CH2)n-Br حيث ان n تأخذ القيم 2 و 3 و4 و 5 و6 وان H=R'=R او مثيل او اثيل او الازوبروبيل وذلك في محلول مائي عند اسس هيدروجينية مختلفة. ان النتائج في المحيط القاعدي اعطت ادلة واضحة على ان التفاعل يسير من خلال تكوين مركب وسطي حلقي وان سرعة التفاعل تعتمد على فعالية هذا المركب الوسطي والتي بدورها تعتمد بشكل اساسي على طاقة الشد الحلقي في الحلقات الكبيرة. ان التفاعلات التي يتكون فيها حلقات صغيرة (اقل من حلقة خماسية) تكون سرعتها عالية جداً لايمكن تعليلها على اساس الشد الحلقي فقط. فقد تم الاخذ بنظر الاعتبار عوامل اخرى مثل الكثافة الالكترونية عند ذرة النايتروجين وعامل الاعاقة عند مركز التفاعل وذلك احتمالية حدوث تفاعل ناجح وعند ادخال العوامل اعلاه اصبح بالامكان تعليل سبب السرعة العالية للتفاعلات ذات المركب الوسطي الصغير. ومن جهة اخرى لوحظ ان ميكانيكية التفاعل تختلف في الوسط الحامضي ويحدث التفاعل عن طريق المهاجمة المباشرة للنيوكلوفيل على مجموعة المثيل المرتبط بالبروم. كذلك تم دراسة سرعة التفاعل عند درجات حرارية مختلفة من اجل حسبا الثوابت الثيرموداينميكية والتي استخدمت في مناقشة العوامل المؤثرة على سرعة وميكانيكية التفاعل.

Keywords


Article
Study of the Relation Between the Theoretical Descriptors Derived From Ab-initio Calculations with the Carcinogenity of Some Poly Aromatic Hydrocarbons

Authors: Mahmoud S. Saieed --- Zaheda A. Najim
Journal: JOURNAL OF EDUCATION AND SCIENCE مجلة التربية والعلم ISSN: 1812125X Year: 2012 Volume: 25 Issue: 63 Pages: 1-11
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract:The various types of descriptors such as ionization energy, molecular hardness, electrophilicity, frontier molecular orbital energies together with electron densities of each atom for the optimized geometries of the molecule of different polyaromatic hydrocarbons (PAHs) were estimated by employing on ab-initio method expressed by Hartree – Fock (HF) model performed at the (3-21G) level of theory. After that these theoretical parametrs were related to the activity carcinogenity of these compounds as carcinogenic agents. The results showed that two factors can be related to carcinogenity of these compounds; the first one is the carbon atoms of low electron densities (i.e the position of electrophilic atoms), the second is the hardness of these compounds.We have also used electron density to highlight the possible strengths of interactions of PAHs with DNA of living cells. On the bases that the main metabolic pathway for activation of these compounds involves formation of bay-region diol epoxide, then, the benzylic carbocations generated from these electrophilic diol epoxide by opening of the epoxide ring are capable of forming covalent adducts with the nucleophilic site in DNA which represent the main factors of carcinogenity of these compounds since adduct is accepted as a critical step in the mechanism by which (PAHs) can cause a genetic mutation resulting inductions of cancer.

الخلاصة:تضمن البحث دراسة ووصف الفعالية لبعض المركبات الهيدروكربونية متعددة الحلقات (PAHs) من خلال حساب الطاقة الايونية، الصلادة، مستويات الطاقة الجزيئية إضافة إلى الكثافة الالكترونية لكل ذرة من ذرات المركبات متعددة الحلقات حيث تم تطبيق احد طرق الحسابات الأساسية (Ab-initio level) من نوع هارتري- فوك والمنجزة عند مستوى نظري (3-21G).أظهرت النتائج ان اهم العوامل المؤثرة على العلاقة بين قوة تأثير هذه المركبات كمسببات للأمراض السرطانية هي الكثافة الالكترونية العالية لذرة الكربون في المواقع الفعالة أولاً، إضافة الى عامل الصلادة ثانيا حيث تم استخدام الكثافة الالكترونية كمؤشر لقوة الترابط بين مركبات (PAHs) مع مادة (DNA) للخلايا الحية عن طريق عملية الايض حيث تشمل العملية تكوين مركب دايول ايبوكسيد ثم مركب ايون البنزيليك الموجب وعن طريق فتح حلقة الايبوكسيد التي يتم إضافتها الى الجانب الباحث عن النواة في مادة (DNA) ومن خلال هذه العملية يظهر تأثير هذه المركبات المسرطنة على الخلايا الحية مع اختلاف تراكيبها.

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

English (3)


Year
From To Submit

2012 (1)

2006 (1)

2005 (1)