research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
DETECTION OF SALINITY TOLERANCE CAPABILITY IN SOME GENOTYPES OF SUGAR BEET BASED ON PCR TECHNIQUE
الكشف عن وجود قابلية تحمل الملوحة في بعض تراكيب البنجر السكري باستخدام تقانة PCR

Author: Majid Sh. Hamdalla ماجد شايع حمدالله
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2013 Volume: 44 Issue: 2 Pages: 194-199
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

DNA was extracted from eight cultivars of Sugar beet (Beta vulgars), six of them are grown in Michigan state(EL-AO 13698, EL-AO 21483, EL-AO 22799, EL-AO 22438, EL-AO 15037, EL-AO 15028) one is wild and the last is introduced with five primers for five loci of salinity tolerance which are imported from Integrated DNA Technology company at the laboratories of the College of Plant and Soil Science/Michigan State University. The objective was to identify some salinity tolerance genes and estimate the genetic diversity based on PCR technique for the tested genotypes. Genetic diversity was estimated and cluster analysis was applied based on agglomerative method which accumulated the tested genotypes into groups according to resemblance of their responses. Twenty seven polymorphic bands were produced. The rate of bands was 4-7 for each genotype and maximum bands were produced by primer BVU07582-m and BVU07582-U. The tested genotypes grouped in three sets according to their alleles, the group A includes the genotypes EL-AO 22799, EL-AO 22438,and EL-AO 15028, group B includes the genotypes EL-AO 13698, EL-AO 21483, EL-AO 15037, and Swiss, while group C contain the genotype Wild. The genotype Wild was the most diversity, while the genetic diversity for group A was equal and faint and gave bands for all used primers. This may explain the responses similarity of genotypes of A group for the used primers, while no bands were formed for genotype Wild except primer F100-p49296-L. The genotypes EL-AO 22799, EL-AO 22438, and EL-AO 15028 have all the sequences of primers which code for salinity genes.

أُستخلص DNA من بادرات ثمانية اصناف من البنجر السكري (Beta vulgaris), ستة منها تُزرع في ولاية مشيغن ( EL-AO 13698و EL-AO 21483 وEL-AO 22799 و EL-AO 22438 وEL-AO 15037 وEL-AO 15028) وصنف مستورد (Swiss) وتركيب بري (Wild) بأستخدام خمسة بادئات لخمسة مواقع جينية تتصف بأنها جينات متحملة للملوحة تم انتاجها من شركةIntegrated DNA Technology Company (IDT) في مختبرات كلية علوم النبات والتربة/ جامعة مشيغن الاميركية في العام 2011. كان الهدف من تطبيق التجربة تشخيص وجود بعض جينات تحمل الملوحة وتقدير درجة البعد الوراثي للتراكيب الوراثية بأستخدام تقانة PCR. تم حساب درجة التباعد الوراثي ثم انشىء الشكل العنقودي (cluster) بالأعتماد على طريقة agglomerative لتبسيط البيانات عن طريق تجميع التراكيب الوراثية في مجاميع للصفات المدروسة حسب تشابه نمط الأستجابة. ادى استخدام البادئات الى تكوين 27 حزمة كانت جميعها من نوع polymorphic. اختلف عدد الحزم المنتجة من 7-4 حسب البادئ وانتج البادئان BVU07582-m وBVU07582-U اعلى عدد من الحزم. توزعت التراكيب الوراثية المدروسة الى ثلاث مجاميع عند تطبيق التحليل العنقودي حسب تشابه واختلاف مواقعها الاليلية, اذ ضمت المجموعة الأولى (A) ثلاثة تراكيب هي EL-AO 22799 و EL-AO22438 وEL-AO 15028 والمجموعة الثانية (B) اربعة تراكيب وراثية هي EL-AO 13698 وSWiss وEL-AO 15037 وEL-AO 21483 والثالثة (C) تركيب وراثي واحد هو Wild. كان التركيب Wild الأبعد وراثيا عن جميع التراكيب المدروسة. كانت نسبة البعد الوراثي منخفضة ومتساوية بين تراكيب المجموعةA واعطت حزما لجميع البادئات وهذا يعكس استجابة هذه التراكيب بشكل متماثل لجميع البادئات المستخدمة في حين لم تتكون اي حزمة للتركيب Wild بأستثناء حزمة واحدة نتجت من البادئF100-p49296-L . يمكن استخدام التراكيب EL-AO 22799 و EL-AO 22438 وEL-AO 15028 في برامج التربية لنقل صفة الملوحة الى تراكيب اخرى لامتلاكها جميع تتابعات البادئات المستخدمة لتشخيص جينات الملوحة.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

Arabic (1)


Year
From To Submit

2013 (1)