research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Antibiotics Resistance and Integron Class 1 among Commonsal Escherichia coli
المضادات الحيوية المقاومة و Integron الدرجة 1 بين المشاع القولونية

Authors: Meraim A. Kazaal مريم عطية خزعل --- Manal M. khadhim منال محمد كاظم
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2017 Volume: 13 Issue: 24 Pages: 30-38
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Normal intestinal microbiota are a reservoir for antibiotic resistance (genes) especially Escherichia coli (E. coli). The goal of this study was to investigate the prevalence of integrons class 1 and antibiotic resistance among commensal E. coli isolates and detect the association of integron class 1 with antibiotic resistance (single or multiple drug resistance) that may be transport horizontally to other bacteria. Three hundred one E. coli isolates from stools were obtained from healthy individuals (age from 1to 80 years). All isolates were tested for their susceptibility against 16 antimicrobial agents using standard disc diffusion method and for the presence of class 1 integrons by PCR. Integrase genes detected in 112 isolates (37%) out of 301 tested isolate. High resistance observed for most antibiotics especially ampicilln, amoxcillin, lincomycin, cephalexin while resistance to amikacin and gentamicin was less common. Furthermore resistance to cefotaxime, ciprofloxacin, oxytetracyclin, tetracycline and trimethoprim significantly associated (p < 0.05) with IntI1 gene positive isolates. All integrons positive isolates are resist to more than five antibiotics and significantly associated with many resistance patterns. In conclusion, increase antibiotic resistance among commensal E. coli in this population that companied with increase frequency of integron class 1 that significantly associated with resistance for single or multiple antibiotic agents.

الميكروبات المعوية الطبيعية هي خزان للمقاومة للمضادات الحيوية (الجينات) وخاصة الإشريكية القولونية (الإشريكية القولونية). كان الهدف من هذه الدراسة هو التحقيق في مدى انتشار فئة integrons من الدرجة الأولى ومقاومة المضادات الحيوية بين E. coli المتعاقبة والكشف عن ارتباط الفئة integron مع المقاومة للمضادات الحيوية (المقاومة الفردية أو المتعددة) التي قد يتم نقلها أفقيا إلى البكتيريا الأخرى. تم الحصول على ثلاثمائة عزلة من الإشريكية القولونية من البراز من الأشخاص الأصحاء (العمر من 1 إلى 80 سنة). تم اختبار جميع العزلات للتأكد من قابليتها للتغلب على 16 من العوامل المضادة للميكروبات باستخدام طريقة الانتشار القياسية للقرص ولوجود عدد صحيح من الصنف 1 من قبل PCR. دمج الجينات المكتشفة في 112 عزلة (37٪) من أصل 301 تم عزلها. لوحظ ارتفاع المقاومة لمعظم المضادات الحيوية وخاصة الأمبيسلين ، الأموكسيلين ، اللينكوميسين ، السيفالكسين بينما كانت مقاومة الأميكاسين والجنتاميسين أقل شيوعًا. علاوة على ذلك ، ترتبط مقاومة السيفوتاكسيم والسيبروفلوكساسين والأوكسيتتراسيكلين والتتراسيكلين والميثوبريم ارتباطًا كبيرًا (P <0.05) بعزل إيجابي الجينات IntI1. تقاوم جميع العزلات الإيجابية الموجودة في أكثر من خمسة مضادات حيوية وترتبط بشكل كبير بالعديد من أنماط المقاومة. في الختام ، قم بزيادة مقاومة المضادات الحيوية بين الإشريكية القولونية التبادلية في هذه الفئة من السكان والتي ترافق مع زيادة وتيرة الفئة الأولى من الإسترون والتي ترتبط بشكل كبير بمقاومة عوامل المضادات الحيوية الفردية أو المتعددة.


Article
Association Between Antibiotic Resistance and Integron Class2 Among Commonsal Escherichia coli Genotypic Groups
العلاقة بين مقاومة المضادات الحيوية و Integron Class 2 بين المجموعات الوراثية للإشريكية القولونية العمودية

Authors: Meraim A. Kazaal مريم عطية خزعل --- Manal M. khadhim منال محمد كاظم
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2018 Volume: 14 Issue: 25 Pages: 19-32
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Antibiotic therapies can not affect only on the pathogenic bacteria, but also commensal microorganisms in the humans gut, which might serve as a reservoir of antimicrobial resistance genes. fecal Escherichia coli (E. coli) is often considered as a good indicator for selection pressure imposed by antimicrobial use. The goal of this study was to determine genotyping groups of commonsal E. coli and investigate the frequency of integrons class 2 and antibiotic resistance among them. So detect the association of integron class2 with antibiotic resistance (single and multiple drug resistance) that may be transport horizontally in bacterial populations. In this study 301isolates of commonsal E. coli were isolated from stools obtained from healthy individuals with age from 1to 80 years. All isolates were tested for their susceptibility against 16 antimicrobial agents and subjected to conventional polymerase chain reactions (PCR) for detection integrons and multiplex PCR for genotyping analysis. Present results showed that group B2 represent the majority of the collected isolates (63%) followed by group A (23%) and D (14%) but no strains were found to belong to group B1. Also results revealed that 10% of isolates have integron class 2 that mainly related to genotypic group B2. High resistance observed for most antibiotics especially ampicilln, amoxcillin, lincomycin, cephalexin while resistance to amikacin and gentamicin was less common. Antibiotic resistance mainly appeared in integron positive isolates. In conclusion, high prevalence of antibiotic resistance especially among integron class 2 positive isolates that

لا يمكن أن تؤثر علاجات المضادات الحيوية فقط على البكتيريا المسببة للأمراض ، ولكنها تؤثر أيضًا على الكائنات الحية الدقيقة المتعايشة في الأمعاء البشرية ، والتي قد تكون بمثابة خزان لجينات مقاومة مضادات الميكروبات. غالبًا ما يُعتبر البراز Escherichia coli (E. coli) مؤشراً جيدًا لضغط الاختيار الذي يفرضه استخدام مضادات الميكروبات. كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد مجموعات التنميط الجيني من القولونية E. القولونية والتحقيق في وتيرة فئة integrons 2 ومقاومة المضادات الحيوية فيما بينها. لذا ، قم بالكشف عن الارتباط بين فئة integron 2 ومقاومة المضادات الحيوية (المقاومة الدوائية المتعددة والمعدية) التي قد تنتقل أفقياً في المجموعات البكتيرية. في هذه الدراسة ، تم عزل 301 من عيوب القولون E. coli من براز تم الحصول عليها من أفراد أصحاء تتراوح أعمارهم بين 1 و 80 عامًا. تم اختبار جميع العزلات للتأكد من قابليتها للتغلب على 16 عاملاً من مضادات الميكروبات وتعرضوا لتفاعلات سلسلة البلمرة التقليدية (PCR) للكشف عن الأنترون و PCR متعدد الإرسال لتحليل التنميط الجيني. أظهرت النتائج الحالية أن المجموعة B2 تمثل غالبية العزلات المجمعة (63٪) تليها المجموعة A (23٪) و D (14٪) ولكن لم يتم العثور على سلالات تنتمي إلى المجموعة B1. كما كشفت النتائج أن 10٪ من العزلات لها فئة انتجرون 2 والتي ترتبط بشكل رئيسي بالمجموعة الوراثية B2. لوحظ ارتفاع المقاومة لمعظم المضادات الحيوية وخاصة الأمبيسلين ، الأموكسيلين ، اللينكوميسين ، السيفالكسين بينما كانت مقاومة الأميكاسين والجنتاميسين أقل شيوعًا. ظهرت مقاومة المضادات الحيوية بشكل رئيسي في العزلات الإيجابية المتكاملة. في الختام ، فإن ارتفاع معدل مقاومة المضادات الحيوية وخاصة بين فئة integron الإيجابية يعزل ذلك


Article
Evaluation of A Disintegrin and Metalloprotein33 Gene Polymorphism in Bronchial Asthma

Authors: Manal M. khadhim منال محمد كاظم --- Ali T. AL-Damerchi علي طالب الدامرجي --- Meraim A. Kazaal مريم عطية خزعل
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2015 Volume: 11 Issue: 19 Pages: 1-9
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: A disintegrin and metalloprotein 33 (ADAM33) gene is the first asthma candidate gene identified by positional cloning, may be associated with lung function decline and bronchial hyperresponsiveness. However, replication results have been inconclusive in smaller previous study populations probably due to inconsistence in asthma phenotypes or yet unknown environmental influences. This study aimed to further elucidate the role of ADAM33 polymorphisms (SNPs) in a genetic analysis of our case- control. Materials and methods: One polymorphic sites (V4) of ADAM33 gene was genotyped in 69 patients with bronchial asthma, and 20 healthy controls. Genotypes were determined by the polymerase chain restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Data were analyzed using the chi-square test and SPSS version 20 computer software (Statistical Package for Social Sciences) in association with Microsoft Excel 2010. Results: The single nucleotide polymorphisms V4 G/C, of the ADAM33 gene may be participate in the susceptibility of bronchial asthma in the Iraqi population. Conclusion: Although ADAM33-V4 polymorphism not associated with asthma in many population, our study confirmed significant correlation between ADAM33-V4 and asthma. Keywords: Asthma; Genetic; A disintegrin and metalloprotein 33; Polymorphism; Genotype; Allele.

الربو هو مرض اللتهابي مزمن، ينتج بصورة رئيسية عن التفاعل ْ بين العواملِ الوراثيةِ والبيئيةِ. أجرتْ هذه الدراسةِ على (69) مريض (48 أنثى و 21 ذكر) مصاب بالربو القصبيِ, تتراوح اعمارهم من (18-70) سَنَة، مع (20) شخص معافى (11 أنثى و9 ذكورِ)ْ كمجموعة تحكم, راى في مستشفى الديوانية التعليمي من كانون الأولِ 2012 إلى كانون الثّاني 2013. عينات الدم جمعت من كلتا المجموعتين, الحمض النووي استخرج من الكريات البيض للكشف عن وجود أي ارتباطات بين تعدد الإشكال الجينية ل ADAM33 في الموقع 4 واستعداد الإصابة بالربو القصبي بواسطة تفاعلات البلمرة المتسلسله وتقنية الأجزاء المتكسرة المتعدد باستخدام إنزيم PstI والتي تعطي أجزاء ذات حجوم جزيئيه مختلفة تعبر عن تراكيب جينية معينة. بينتْ نَتائِجَ الدراسة بأنّ 31.9 % من المرضى في فئة عمر من (20-35) سَنَة و 27.5 % من المرضى كَانَ ُ في فئة عُمرَ (20>) سَنَة, كذلك الدراسة بينت 69.6 % من المرضى كانوا إناث. كشفتْ دراسة ايضا ان نسبةَ إنتشارَ النكليوتيدِات الوحيدِة المتعدد الاشكال V4-ADAM33 كَانتْ عاليةَ جداً بين حالاتِ الربو P < 0.001)) ووَجدتْ ان ترددات التراكيب الوراثية متخالف اللواقح GG و متحول متماثل اللواقحCG والاليل المخالف G كَانتْ عالية جداً في المرضى المصابون بالرَّبوِ (P <0.001, P = 0.023, P <0.001 على التوالي) على النقيض من ذلك التركيب الوراثي متماثل اللواقح الطبيعي CC (P= 0.451) والاليل C(P=0.6) لَيْسَ لَها علاقة واضحة مَع المرضى المصابون بالرَّبوِ. اظهرت البياناتَ بأنّ 65.2 % مِنْ المرضِى المصابون بالرَّبوِ يمتلكُون تأريخُ عائلي إيجابيُ وبينت بأنّ التركيب الوراثي متخالف اللواقح GG والاليل G إرتبطَ بشكل ملحوظ بالمرضى الذين يمتلكون تأريخ عائلي للربو (56.70 % و75 % على التوالي) كما هو مُقارن مَع المرضى بدون تأريخ عائلي للربو (21.70 % و47.8 %)، بينما التركيب الوراثي متماثل اللواقح الطبيعي CC و التركيب الوراثي متحول متماثل اللواقح CG و الاليل Cليس مرتبط مَع المرضى المصابون بالرَّبوِ الذين امتلكوا تأريخِ عائلي ( 8.7% ,32.6 % و25% على التوالي).

Keywords


Article
The Role of Protamine 1 Gene Polymorphism and Anti FSH Antibody in Infertile Couples

Authors: Manal M. Khadhim منال محمد كاظم --- Taghreed S. Al-quizwini تغريد القزويني --- Thaer A. Hussian ثائر حسين
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2015 Volume: 11 Issue: 20 Pages: 85-91
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Infertility is a worldwide problem which affects approximately 15% of all couples, and is defined as, inability to conceive after twelve months of contraceptive-free unprotected intercourse. Materials and methods: Optical density of anti follicle stimulation hormone antibody in the serum was detected by enzyme–linked immunosorbent assay technique and from which anti follicle stimulation hormone antibody concentrations were evaluated according to cut-off. One polymorphic sites of Protamine 1 Gene was genotyped on 72 couples suffering from infertility. Another group consist of 20 couples apparently healthy individuals. Genotypes were determined by the polymerase chain restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Results: Anti FSH antibody result demonstrated differences in antibody values between the patients and the control group with significant statistically, the frequency of the reported SNP was no significantly different compared to normal fertile males, which suggest that such SNP may not serve as a good molecular marker for genetic diagnosis of male infertility. Conclusion: The SNP G197T are completely absent and are not associated with male infertility with aforementioned, therefore these SNPs may not represent as a molecular marker for the diagnosis of genetic cause of male infertility in our studied population.

الهدف من هذه الدراسة هو تقدير دور جين 1 Protamine المتعدد الاشكال في عقم الرجال وكذلك تقدير الأجسام المضادةللهرمون المحفز للجر يبات في دم النساء؟اجريت هذه الدراسة على ( 72 ) زوج 72) من الذكور، 72 من الاناث ( يعانون من العقم وبمدى عمر بين 52-18) ( سنه, شوهدت الحالات في مستشفى الديوانية التعليمي بمدينة الديوانية في الفترة من كانون الاول 2012 وحتى ايار 2013 ،ومجموعة اخرى ( 20 ) زوج اصحاء ) 20 ذكور , 20 اناث ( كمجموعة سيطرة . تم جمع عينات الدم من كلتاالمجموعتين وتم استخلاص الحامض النووي الجيني (DNA) من كريات الدم البيضاء في الدم المحيطي , ولمزيد منالدراسة الجزيئية للكشف عن أي ارتباط بين الطفرات الوراثية في جين ( G197T ( وعلاقة ذلك بعقم الرجال تم استخدامتقنية انزيم البلمرة المتسلسل ) (PCR-RFLP لهذا الغرض وهضم الحامض النووي المستخلص بواسطة انزيم (BSeRI)الذي اعطى قطع مختلفة الاحجام الجزيئية التي تعبر عن الانماط الوراثية .أظهرت نتائج الدراسة ان ( 46 %(من الرجال العقيمين هم ضمن الفئة العمريه ) 29 - 20 ( و) 40 %( ضمن الفئه العمريه( 39 - 30 ( سنة بينما ) 68 %( من النساء العقيمات ضمن الفئه العمريه ) 29 - 20 ) .بخصوص العلامات المناعية المختارة . وجد ارتباط معنوي في مصل الدم في مستوى الاجسام المضاده للهرمون المحفزللجريبات للنساء العقيمات ) P0.32 ) . ولم يظهر للجين protamine 1 اي علاقه بعقم الرجال


Article
The Role of Protein Tyrosine Phosphatase Nonreceptor Type 22 Gene polymorphism in Patients With Type 1 Diabetes Mellitus
دور البروتين Tyrosine Phosphatase Nonreceptor type 22 تعدد الأشكال الجينية في المرضى الذين يعانون من داء السكري من النوع 1

Authors: Fadhil H. Khleif فاضل حنظل خليف --- Nasma N Al-Hajjiah نسمة ناجي الحجية --- Manal M. Khadhim منال محمد كاظم
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2016 Volume: 12 Issue: 22 Pages: 12-18
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Type 1 diabetes mellitus (T1DM) is an autoimmune multifactorial disease characterized by progressive destruction of pancreatic beta cells by genetic and environmental factors which leads to an absolute dependence of insulin for survival and maintenance of health. Materials and methods: One polymorphic sites of PTPN22 gene was genotyped in 64 patients with T1DM, and 25 healthy controls. Genotypes were determined by the polymerase chain restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Results: The single nucleotide polymorphisms T/T, of the PTPN22 gene may be participate in the susceptibility of T1DM in the Iraqi population. Conclusion: Although PTPN22-T/T polymorphism not associated with T1DM in many population, our study confirmed significant correlation between PTPN22 and T1DM.

مرض السكر النوع الاول(T1DM) هو مرض المناعة الذاتية الذي يتميز با لتدمير التدريجي لخلايا بيتا في البنكرياس بسبب عوامل وراثية وبيئية مما يؤدي الى الاعتماد المطلق على الانسولين للبقاء على قيد الحياة والمحافظة على الصحة . هناك جين جديد نسبيا من مرض السكر هو(PTPN2) الذي يشفر الى بروتين التايروسين فوسفاتيز اللمفاوي (LYP) .الهدف من هذه الدراسة هو التحقيق فيما اذا كان التطور المظهري (C1858T),( T1858T) متضمنا في امراضية السكري النوع الاول. أجرتْ هذه الدراسةِ على (64) مريض (37 ذكور,27 أناث) مصاب بمرض الداء السكري النوع الاول , تتراوح اعمارهم من (1-18) سَنَة، مع (25) شخص معافى (13 أنثى و12 ذكورِ)ْ كمجموعة تحكم, تم مشاهدتها في مستشفى الاطفال في كربلاء من كانون الأولِ 2012 إلى كانون الثّاني 2013. عينات الدم جمعت من كلتا المجموعتين, الحمض النووي استخرج من الكريات البيض للكشف عن وجود أي ارتباطات بين تعدد الإشكال الجينية ل PTPN22 واستعداد الإصابة بمرض السكري النوع الاول بواسطة تفاعلات البلمرة المتسلسله وتقنية الأجزاء المتكسرة المتعدد باستخدام إنزيم Rsa1 والتي تعطي أجزاء ذات حجوم جزيئيه مختلفة تعبر عن تراكيب جينية معينة. أظهرت نتائج الدراسة ان ( 36%) من المرضى هم ضمن الفئة العمرية (11-15) سنة, وكان 32.8% من المرضى ضمن الفئة العمرية (6-10) سنة ,21.8% من المرضى كانوا في الفئة العمرية اقل اويساوي 16 سنة, ومشاهدة 9.4% في الفئة العمرية اقل من 6 سنوات .كذلك كشفت النتائج ان 57.81 % من المرضى الذكور ولم يلاحظ ارتباط ذو اهمية احصائية مع الجنس والعمربين المرضى والاصحاء (قيمة (p) = 0.170,0.274 على التوالي).

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

English (5)


Year
From To Submit

2018 (1)

2017 (1)

2016 (1)

2015 (2)