research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Pathogenicity islands of Escherichia coli isolated from clinical samples

Authors: Mohammad Sabri Abdul-Razzak محمد صبري عبد الرزاق --- Lamees Abdul-Razzak Abdul-Lateef لازم عبد الرزاق عبد اللطيف
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2011 Volume: 7 Issue: 12 Pages: 129-141
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Background:- Pathogenicity islands (PAI) are located on the chromosome; however, they can also be part of bacterial plasmid and phages . PAIs were first described in uropathogenic E. coli (UPEC).Gene encoding for hemolysin, P pili, S fimbriae have been found on various PAIs in different E. coli strains of UTI .Objective:- The aim of this study to investigate the some of pathogenicity islands markers of E.coli isolated from clinical samples by using molecular primer.Patients and methods:- In a total, 12 E.coli strains were collected in this study. Strains were isolated from various clinical samples by standard bacteriological methods. PCR was conducted to determine the PAIs of the isolates by using primers papC, papG(I, II), sfa, hlyC/A , iucC and PAi. The PCR amplification product were visualized by electrophoresis on 1% agarose gels for 45min at 60v. the size of the amplicons were determined by comparison to the 100 bp allelic ladder.Results: In this study, 12 isolates of Escherichia coli were genotypically characterized by PCR assay. Among isolates studies it was found that PAi is found in only one isolates (urine). PapGI is absent from all isolates while papGII is present in ten isolates mostly in urine (n=3) and vagina(n=3), papC is present in only one isolate include urine, sfa is present only in three isolates. Also, the gene hlyC/A is present in five isolates, mostly in urine(n=3), also, these positive isolates had the ability to produce extracellular hemolysin, and aerobactein gene iucC is present in eight isolates mostly in stool(n=3) and rectal(n=3).Conclusion: Each steps in the infection process can be mediated by a number of alternative virulence factors and each strain may have a unique combination of these factors.Recommendation:- Direct molecular identification of E. coli in clinical samples.

الجزر المرضية توجد على الكروموسوم البكتيري, ومع ذلك توجد ايضا على البلازميد البكتيري. وقد تم اكتشاف الجزر المرضية لبكتريا القولون المعوية التي تصيب الجهاز البولي.الكشف عن بعض الجزر المرضية لبكتريا القولون المعوية المعزولة من عينات سريرية مختلفة.تم دراسة اثنا عشر عزلة من البكتريا المعوية معزولة من عينات سريرية مختلفة شخصت بالطرق البكتريولوجية. وقد استخدم جهاز PCRللكشف عن بعض انواع الجزر المرضية. وقد استخدم جهاز الترحيل الكهربائي بفولطية60 ولمدة 45 دقيقة.في هذه الدراسة اثنا عشر عزلة من البكتريا المعوية خضعت للدراسة الوراثية للكشف عن وجود بعض الجزر المرضية باستخدام جهاز PCR وقد اظهرت الدراسة بان الجين PAi موجود في عزلة واحدة فقط وهي الادرار. وقد لوحظ ايضا ان papGII موجودة في عشر عزلات اغلبها تعود الى عزلات الادرار والمسحات المهبلية بينما papGI غير موجود في جميع العزلات. كما لوحظ ان papC موجود في عزلة واحدة فقط هي الادرار. من عوامل الالتصاق الاخرى هي sfa وقد لوحظ وجودها في ثلاثة عزلات فقط. وقد اظهرت الدراسة ايضا الهيمولايسين موجود في خمس عزلات اغلبها تعود الى عزلات الادرار وقد وجد ايضا ان لهذه العزلات لها القدرة على انتاج الهيمولايسين في الوسط الزرعي. وقد لوحظ ايضا ان جين iucC موجود في ثمان عزلات تعود اغلبها الى مسحات المستقيم وعزلات الخروج.كل خطوة من عملية الاصابة تكون بواسطة مجموعة من عوامل الضراوة, وكل عزلة تمتلك مجموعة من هذه العوامل

Keywords


Article
Synthesis of homoserine lactone from Aspartic acid and induction of quorum sensing by E. coli isolates

Loading...
Loading...
Abstract

Homoserine L-lactone was synthesized by E. coli through using aspartic acid which was added to the culture media at a final concentration 1%. Homoserine lactone production was checked at different intervals of incubation (after 2, 3, 4, 5, 6 and 24 hr.) where 0.01% of KCN is added to show the time of HSL appearance in the bacterial growth. It was found that the best interval for accumulation of homoserine lactone was after 4 hours. of incubation in which the homoserine lactone reached at optimal level. When one drop of culture supernatant was added to fresh growth of E. coli on slide, aggregation or quorum sensing was seen as indicator of HSL production.

في هذه الدراسة تم تصنيع Homoserine- L- lactone بواسطة بكتريا القولون المعوية من خلال اضافة حامض الأسبارتيك اسد الى الوسط الزرعي بتركيز نهائي 1 ٪. وقد تم فحص انتاج- L- lactone Homoserine في فترات مختلفة من الحضانة (بعد 2، 3 ، 4، 5 ، 6 و 24 ساعة.) حيث تم إضافة 0.01 ٪ من KCN لمعرفة الوقت الذي يلاحظ فيه HSL في النمو البكتيري. وقد وجد أن أفضل فترة لتراكم homoserine- L- lactone هو بعد 4 ساعات من الحضانة التي وصل فيها homoserine lactone الى المستوى الأمثل. وعندما تمت إضافة قطرة واحدة من النمو البكتيري من بكتريا القولون المعوية على الشريحة قد لوحظ تجمع للبكتريا دلالة على انتاجها ل HSL

Keywords

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2012 (1)

2011 (1)