research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
Revealed of A novel Allele in Wasit – Iraqi Population
الكشف عن اليلات جديدة في المجتمع العراقي / محافظة واسط

Loading...
Loading...
Abstract

The developments in forensic DNA technology have led us to perform this study in Iraqi population as reference database of autosomal Short Tandem Repeat (aSTR) DNA markers . A total of 120 unrelated individuals from Wasit province were analyzed at 15 STR DNA markers. Allele frequencies of DNA typing loci included in the AmpFlSTR1 IdentifilerTM PCR Amplification Kit panel from Applied Biosystems (D3S1358, vWA, FGA, D8S1179, D21S11, D18S51, D5S818, D13S317, D7S820, TH01, TPOX, CSF1PO, D19S433, D2S1338, D16S539) and several forensic efficiency statistical parameters were estimated from all the sample. the combined Matching Probability (CMP) using the 15 STR genetic loci in Iraqi population was estimated at 1 in 2.08286E-18 and the Combined Discrimination Power (CDP) was greater than 0.9999999 ,Combined Exclusion Probability (CEP) was 0.98350917 which should be sufficient for the identification of any individual.

التطور السريع الذي حدث في التقنيات المتعلقة بالحمض النووي العدلي في العالم يدفعنا لاجراء البحوث التي تدعم هذا التوجه سيما وان الابحاث في العراق التي تخص هذا الموضوع لا تواكب التطور العالمي الحديث , لذا بدأنا بمحافظة واسط ببناء قاعدة بيانات للكشف عن المؤشرات الجسمية الخاصة بهذه الشريحة من المجتمع العراقي autosomal Short Tandem Repeat (STR) .تم جمع 120 عينة من متطوعين (لا تربطهم اي صلة قرابة ) حصرا من محافظة واسط الجنوبية , المؤشرات التي تم تحليلها هي 15 موقع منتشر على الكروموسومات الجسمية هذه المواقع هي: (D3S1358, vWA, FGA, D8S1179, D21S11, D18S51, D5S818, D13S317, D7S820, TH01, TPOX, CSF1PO, D19S433, D2S1338, D16S539). عدة قوانين اساسية استعملت في التحليل النتائج على جميع المواقع منها درجة التقارب بين العينات (CMP), وكانت النتائج تشير الى 1 من اصل 2.08286E-18 وكذلك وقوة التطابق بين العينات 0.999999. كما كانت دقة الاحتمالية كانت 0.98350917 وهذه النتائج يجب ان تكون مطابقة عند اي عمل .


Article
Effects of Hair dyes on Sequence Analysis of Hair Mitochondrial DNA Hypervariable Region 1
تأثير اصباغ الشعرعلى نتائج تحليل التتابعات الوراثية للحمض النووي المايتوكونديري لمنطقة السيطرة Hypervariable Region 1

Loading...
Loading...
Abstract

Hair can be a valuable source of DNA especially in forensic casework and for noninvasive studies of human, when blood samples not available. This study emphasizes the impact of hair dyes on DNA sequence analysis. Samples collected from forty Iraqi families; each sample was divided in to two parts hair follicles and hair shaft. DNA extracted by using two different techniques, Phenol-chloroform (organic) method and prepFiler forensic DNA extraction kit. After quantification of DNA by real time PCR to confirm the exact DNA yield, Mitochondrial DNA (MtDNA) hypervariable region 1 successfully amplified from (50% of samples include hair follicle and 20% samples include shaft only), which all extracted by organic method. Whereas by using prepFiler kit the ratio of amplification success reach to 95% of samples included hair follicles, but there wais no DNA outcome from hair shaft by using this kit. Our results demonstrate that treated hair by dyed or henna had a significant influence on the sequence analysis results. Organic method was an appropriate method for extraction DNA from hair shaft, since this method used for extracting the old and degraded samples. While prepFiler DNA extraction kit was more convenient for isolation DNA from, hair samples included follicles only with excellent result

الشعر يمكن أن يكون مصدرا قيما للحمض النووي خاصة في الدعاوى القضائية والطب الشرعي وللدراسات البشرية الوراثية التي لا تتوفر فيها نماذج من الدم. وتؤكد هذه الدراسة تأثير صبغات الشعر على نتائج التتابعات الوراثية. العينات التي تم جمعها تعود الى أربعين عائلة عراقية وكل عينة قسمت إلى قسمين الاولى تحتوي على بصيلات الشعر والثانية على عمد الشعر فقط. تم استخلاص الحمض النووي بطريقتين مختلفتين بالتقنية وهي: طريقة المذيبات العضوية (الفينول كلوروفورم)، وطريقة استخدام العدد المختبرية الخاصة بعزل الحمض النووي (الطب الشرعي). قيس التركيز للعينات المستخلصة من الشعر باستخدام تقنية Real time PCR للتأكد بدقة من العدد الكمي للحامض النووي وكانت نسبة نجاح تضخيم وانجاز عمل التتابعات الوراثية للقواعد النايتروجينية لـ MtDNA) hypervariable region 1) هي 50٪ من عينات تشمل بصيلات الشعر و20 عينة٪ لعينات شملت عمد الشعر فقط التي عزلت بطريقة المذيبات العضوية. في حين كانت نسبة نجاح التضخيم 95٪ من عينات شملت بصيلات الشعر فقط باستخدام العدد المختبرية prepFiler، لكن لم نحصل على اي نتيجة من عينات شملت عمد الشعر باستخدام هذه العدد. اظهرت النتائج ان صبغ الشعر او الحناء كان لها تأثيرا كبير في نتائج قراءة التتابعات الوراثية. ويعتبر الاستخلاص بالمذيبات العضوية هوالطريقة المناسبة لاستخراج الحمض النووي من عمود الشعر، وهو الطريقة الانسب لعزل الحمض النووي من العينات القديمة والمتدهورة. في حين ان عدد الـ prepFiler أكثر ملاءمة لعزل الحمض النووي من العينات التي شملت بصيلات فقط.


Article
Identification and quantification of Chimerism in bone marrow transplants leukemic patients
تحديد وتقدير كمية الكايميرا لمرضى نقل نخاع العظم المصابين بابيضاض الدم الحاد

Loading...
Loading...
Abstract

Quantification of chimerism after bone marrow transplantation is essential for evaluation the successful of engraftment after allogenic stem cells transplantation. The aim of this work is to use STR typing test for identification and quantification the chimerism in bone marrow transplant patients. Two patients subjected to bone marrow transplantation were analyzed. DNA extracted from patients (recipient) blood, cheek swabs and donor cheek swabs. Quantifiler Real time PCR kit was used for DNA quantification. Powerplex21 kit was used for amplification STR loci. STR profiling was performed by Genetic analyzer. DNA extraction and quantification were successfully performed with suitable quantity and purity. STR loci fully amplified and analyzed. In both cases recipient and Donor shared alleles with no DNA mixtures. Few loci showed Type 3 chimerism. In conclusion the results showed that the test successfully identify used for identification and quantification of chimerism in recipient patients. List of abbreviation: DNA= Deoxyribonucleic acid, STR- short tandem repeat, SCT= stem cells transplantation.

ان تقدير كمية الكايميرا (Chimerism) بعد عملية نقل النخاع العظمي مهمة لتقييم نجاح النقل بعد نقل الخلايا الجذعية . يهدف البحث الى استخدام فحص STR Typing لتحديد وحساب كمية الكايميرا لمريضين مصابين بمرض ابيضاض الدم الحاد المنقول لهم نخاع العظم . تم عزل وتنقية الحمض النووي من دم المريض (المستلم) ومن الخلايا الظهارية المبطنة للفم . وكذلك من الخلايا الظهارية المبطنة للفم للشخص الواهب. تم قياس كمية الحمض النووي باستخدام تقنية تفاعل البلمرة اللحظي. وتم تضخيم مواقع ال (STR)باستخدام العدة Powerplex 21. تم عزل وتحديد كمية الحمض النووي بنجاح. كذلك تم تضخييم وتحليل المواقع الوراثية بشكل كامل . لوحظ وجود اليلات مشتركة مع عدم وجود اي خليط للواهب والمستلم . اظهرت بعض المواقع النوع الثالث للكايميرا . اظهرت الدراسة نجاح تحديد وتقدير كمية الكايميرا للمرضى .

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

English (3)


Year
From To Submit

2017 (2)

2015 (1)