research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Molecular Identification and Phylogenetic Analysis of Rotavirus in Children Suffered from diarrhea under Five Years Old in Thi-Qar Provience, of Iraq
تشخيص جزيئي و تحليل الشجرة الوراثية لفيروس الدوار المعزول من الاطفال دون سن الخامسة في محافظة ذي قار

Authors: Basim A. Jarullah2 --- Mohammed N. Fenjan
Journal: Journal of Education for Pure Science مجلة التربية للعلوم الصرفة ISSN: 20736592 Year: 2019 Volume: 9 Issue: 1 Pages: 82-91
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

AbstractThe objective of this study is to determine the frequency of the one most important enteric viruses (rotavirus group A) in stool specimens of children aged less than five years, The age ,sex related distribution, seasonal pattern and clinical symptoms. A total of 100 fecal specimens (including 63 males and 37 females) are collected from infants and children under five years of age in Thi-Qar Province south of Iraq during Five Months (From November 2017 To March2018). According to diarrhea suffered children which revealed that 45% are caused by Rotavirus, the frequency of male children patients with diarrhea caused by rotavirus was higher than their female. The samples are categorized into eight groups according to the age of the children: 1-5 months, 6-10 months, 11-15months, 16-20 months, 21-25 months, 26-30 months, 31-35 months and 36-40 months. Age specific frequency in children patients with diarrhea, caused by rotavirus is high in aged 11-15 months. According to results the percentage of infection with rotavirus show that 16 (35.6%) children are fed on Breast feeding, 22 (48.9%) children are fed on bottle feeding and 7 (15.6%) children are fed on mixed feeding. RT-qPCR is performed for detection of Rotavirus based on VP6 gene. Also RT-PCR technique is performed on some positive isolates in RT-qPCR method that used for Rotavirus genotyping by using DNA sequencing analysis. In Rotavirus phylogenetic tree analysis, results are show that the local Rotavirus isolate (IQ-C1) are closed related to NCBI-Blast Rotavirus (JQ069617.1) (EF472951.1).

الخلاصةهذه الدراسة صممت لتحديد واحد من الفيروسات المعوية الأكثر أهميةrotavirus) ) في عينات البراز في الأطفال الذين تقل أعمارهم عن خمس سنوات. وزعت العينات تبعا للعمر,الجنس,الموسم,مكان المعيشة والعلامات السريرية. المجموع الكلي لعينات البراز كان 100عينة(63 ذكور و 37إناث) والتي جمعت من الأطفال والرضع في محافظة ذي قار جنوب العراق خلال 5أشهر من شهر تشرين الثاني 2017إلى آذار 2018. وجد ان نسبة الأطفال الذين يعانون من الإسهال الناتج عن الإصابة ب rotavirus كانت 45% حيث ان الإصابة الأكثر تكرار كانت في الذكور مقارنة مع الإناث. صنفت العينات الى 8 مجموعات تبعا الى اعمار الاطفال من 5-1شهر, من 10-6 شهر 15-11شهر, 20-16شهر,25-21 شهر, 30-26 شهر, 35-31 شهر, 40-36 شهر حيث ان العمر الأكثر عرضة للاصابة بهذا الفايروس كان 11-15 شهر. تبعا للنتائج كانت نسبة الإصابة ب rotavirus بالاعتماد على نوع التغذية ((16 طفل (35.6%) تغذيتهم كانت طبيعية, (22) طفل 48.9%)) كانت تغذيتهم صناعية و(7) أطفال (15.6%) كانت تغذيتهم مختلطة. تم استخدام جهاز RT-qPCR لتحديد الفايروس بالاعتماد على جينات المحفظة للفيروس وأيضا استخدمت تقنية conventional RT.PCR على العينات التي كانت موجبة باستخدام تقنية RT.qPCR لمعرفة التتابع النيوكليوتيدي بطريقة DNA sequencing. اظهرت نتائج تحليل الشجرة الوراثية لل rotavirusللعزلات المحلية علاقة مقربة منNCBl-Blast rotavirus (JQ069617.1)(EF472951.1).

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)