research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Isolation and identification of fungi from two hospitals in Baghdad city and effect of disinfectants on some fungi
عزل وتشخيص الفطريات من مستشفييين في مدينة بغداد وتاثير المطهرات على بعض الفطريات

Authors: Sadiq R. Mohammed صادق رحيم محمد --- Mona H. AL-Jibouri منى حمودي الجبوري
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 1C Pages: 673-682
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Swabs from two hospitals at Baghdad city were collected from the period 28-October-2013 to 31-March-2014, to found out the prevalence and distribution of fungi. These isolates were collected from hospitals' environment and most of the items used for hospital work in order to detect the nosocomial pathogens persistent. All fungal isolates were identified depending on the morphological and microscopic examinations as well as biochemical tests. Out of 220 environmental samples, 146 fungal isolates was obtained, Aspergillus flavus was more frequency and occurrence 23.29% and 15.45% respectively, followed Aspergillus niger was 15.57% and 10.45% then Penecillium spp. was 13.27% and 8.64%. In Al -Yarmouk Teaching Hospital more places contamination was burns 75%, followed dialysis 72.72% then RCU units 69.23%, while more places contamination in Imam Ali General Hospital was wards 70%, followed burns and Kitchen 58.33% then operation hall 57.14%. Determining the minimum inhibitory concentration for five types of disinfectants which are used in hospitals, the MIC values of disinfectants against fungal isolate were Chlorhexidin 7.5%, Chloroxylenol 1.25%, Formaldehyde 1.25%, Povidine iodine 10% and Sodium hypochlorite 7.5%. Chloroxylenol had significantly the most effective compound on fungi, followed formaldehyde then Sodium hipochlorite. This study found that hospitals contain different fungal species and genus, antiseptics and disinfectants have an effect on the fungus if it used correctly and permanent change in the use of antiseptics and disinfectants to avoid resistance of fungi.

تم جمع عزلات فطرية بطريقة اخذ المسحات من مستشفيين في مدينة بغداد للفترة من 28-10-2013 الى 31-3-2014 للتعرف على مدى تلوثها وانتشار وتوزيع الفطريات فيها. تم اخذ العينات البيئية من اماكن مختلفة في المستشفى شملت معظم الوحدات والاجهزة الطبية, للكشف عن تواجد الفطريات التي تسبب عدوى المستشفيات. تم تشخيص الفطريات اعتمادا على المظهر الخارجي والفحص المجهري والاختبارات البايوكيميائية. تم الحصول على 146 عزلة فطرية مختلفة من 220 مسحة المجموع الكلي للعينات البيئية الماخوذة, كان Aspergillus flavus الاكثر ظهورا وترددا بنسبة 23.29% و 15.45% على التوالي, تليها Aspergillus niger بنسبة 15.57% و 10.45% ثم Penecillium spp. بنسبة 13.27% و 8.64%. في مستشفى اليرموك التعليمي كان اكثر الاماكن تلوثا هي وحدة الحروق 75% تليها وحدة غسيل الكلى 72.72% ثم وحدة الانعاش 69.23%, اما في مستشفى الامام علي العام فان الاكثر تلوثا كانت ردهات رقود المرضى 70%, تليها وحدة الحروق والمطبخ 58.33% ثم صالة العمليات 57.14%. كانت قيم التركيز المثبط الادنى Chlorhexidin 7.5% و Chloroxylenol 1.25% و Formaldehyde 1.25% و Povidine iodine 10% و Sodium hypochlorite 7.5%. وجدت هذه الدراسة ان المستشفيات تحتوي على انواع واجناس فطرية مختلفة, وان المطهرات لها تاثيرا على الفطريات فيما لو استخدمت بشكل صحيح, ويجب التغيير المستمر في نوعية المطهرات المستخدمة لتجنب مقاومة الفطريات لهذه المطهرات.


Article
Species Identification and Strain Differentiation of Dermatophyte by (GACA)4-Primer based PCR
تشخيص انواع الفطريات الجلدية وتمايز سلالاتها باستخدام التفاعل التسلسلي (GACA)4للبوليمراز المعتمد على البادئ

Loading...
Loading...
Abstract

Dermatophytes are a group of morphologically and physiologically related molds some of which cause well defined infections: dermatophytoses (tineas or ringworm). The present study aims at identification of dermatophytes species and varieties from patients in Wasit province-Iraq using molecular approach based PCR fingerprint.The short oligonucleotide (GACA)4 is a microsatellite primer was used in this study for identification of dermatophyte isolates. The results identified different species and varieties among dermatophytes. The numbers of resulting PCR bands ranged from 1 to 4 (size range, 600bp to 1600bp) for each species. The resulting patterns were distinct for Trichophyton and Microsporum species and varieties. Trichophyton soudanense and Trichophyton verrucosum revealed distinguishable profiles with four largest bands (800bp to 1900bp) among Trichophyton species. (GACA)4 is able to amplify all species of Microsporum producing intraspecies variation which is observed with Microsporum canis (rough strain) and Microsporum canis (smooth strain), all of which had different band pattern. We conclude that (GACA)4-based PCR has utility as a rapid method for identification of dermatophytes species as well as its utility for differentiation of Trichophyton and Microspmoru species and varieties.

تعد الفطريات الجلدية اعفان مرتبطة من الناحيتين الشكلية والوظيفية ويسبب بعضها أصابات واضحة منها القوباء الحلقية. تهدف هذه الدراسة الى تشخيص انواع وضروب الفطريات الجلدية المعزولة من مرضى محافظة واسط في العراق باستخدام طريقة البصمة الوراثية المعتمدة على التفاعل التسلسلي للبوليمراز. اظهر التشخيص الوراثي على المستوى الجزيئي باستخدام البصمة الوراثية انماط للحامض النووي منقوص الاوكسجين DNA لكل نوع من الفطريات الجلدية: أستخدم البادئ القصير قليل النيوكليوتيدات (GACA)4 لإيجاد البصمة الوراثية بوصفه بادئا لتشخيص عزلات الفطريات الجلدية. شخصت بهذه الطريقة انواع وضروب مختلفة بين الفطريات الجلدية وتراوح عدد حزم التفاعل التسلسلي للبوليمراز الناتجة من 1-4 حزمة لكل نوع ومدى حجم تراوح ما بين 600 زوج قاعدي الى 1600 زوج قاعدي. كانت نماذج الحزم الناتجة متميزة لأنواع وضروب الـ Trichophytonو Microsporumالتي شخصت بهذه الطريقة. أظهر الـنوعين soudanense Trichophyton و Trichophyton verrucosumطرز متميزة بأربع حزم كبيرة (800 زوج قاعدي الى 1900 زوج قاعدي)بين أنواع الـ .Trichophyton وتمكن البادئ (GACA)4 من تضخيم جميع انواع الـ Microsporum وادى ذلك الى ظهور اختلافات ضمن النوع الواحد والذي لوحظ في النوع M. canis بين سلالته الخشنة والملساء والتي اظهر كل منها حزم مختلفة. نستنتج ان طريقة البصمة الوراثية باستخدام البادئ (GACA)4 طريقة سريعة لتشخيص الفطريات الجلدية كما لها الفائدة في التمايز بين انواع وضروب الجنسين .Trichophyton, Microsporum

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2015 (1)

2014 (1)