research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Evaluation of SDS-Polyacrylamide gel electrophoresis and immunostrip technique for detection of Tobacco mosaic virus and Cucumber mosaic virus in IRAQ
تقويم كفاءة الترحيل الكهربائي على هلام الاكريلامايد وتقنية الأشرطة المناعية في الكشف عن فيروسي موزاييك التبغ وموزاييك الخيار في العراق

Authors: Rakib A. Al-Ani رقيب عاكف العاني --- Mustafa A. Adhab مصطفى علي عذاب
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2011 Volume: 5 Issue: 2 Pages: 85-94
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

his study was carried out to evaluate the efficiency of electrophoresis on SDS- poly acrylamide slap gel and immunostrip techniques for detection of Tobacco mosaic virus (TMV, genus Tobamovirus) and Cucumber mosaic virus (CMV, genus Cucumovirus, family Bromoviridae), compared with symptoms on diagnostic plants for the two viruses. The results obtained showed that the two methods were effective. The analysis of samples of purified CMV, total proteins from infected cucumber plants, and extracts from infected plants with or without chlorophyll, by electrophoresis on 10% polyacrylamide slap gel containing 0.1% SDS showed two bands of 24 and 26 kd in size, and absent in samples of total protein or extracts of healthy plants. These two proteins represent the coat protein (CP) of CMV. In addition, one 18 kd protein band appeared on SDS- polyacrylamide gel profile which represent the CP of TMV, when samples of purified virus, total protein of infected plants, and plant extracts with or without chlorophyll were analyzed. This band was absent in similar samples from healthy plants. The test of immunostrip specific for CMV showed positive reaction with extracts from melon, cucumber, winter squash, and zucchini infected plants. Similarly, a positive reaction with immunostrip specific for TMV appeared with extracts from tobacco, tomato infected with TMV. No reaction was obtained with healthy plants extract. These results were similar to those obtained from indicator plants for the two viruses.

أجريت هذه الدراسة بهدف تقويم كفاءة تقنيتي الترحيل الكهربائي على هلام الاكريلامايد بوجود دوديسيل سلفات الصوديوم (SDS) واستعمال تقنية الأشرطة المناعية Immunostrips ومقارنتها بدراسة الأعراض على النباتات المشخصة في الكشف عن فيروسين هما: فيروس موزاييك التبغ ( TMV، جنسTobamovirus ) وفيروس موزاييك الخيار CMV)، جنس Cucumovirus، عائلة (Bromoviridae. أظهرت النتائج كفاءة الطريقتين في الكشف عن الفيروسين . إذ اظهر نمط الترحيل الكهربائي على هلام الاكريلامايد 10 % مع 0.1 % SDS لعينة من فيروس موزاييك الخيار حزمتين بروتينيتين أوزانها الجزيئية (24 ، 26(كيلو دالتون . وظهرت نفس الحزم في عينة البروتينات المستخلصة من نبات خيار مصاب بالفيروس وأخرى لمستخلص نبات مصاب حاوي أو خالي من الكلوروفيل تمثل بروتين الغلاف للفيروس . ولم تظهر مثل هذه الحزم في عينة بروتينات مستخلصة من نبات سليم أو مستخلص نبات سليم حاوي أو خالي من الكلوروفيل . وظهرت حزمة بروتينية وزنها الجزيئي 18 كيلو دالتون في نمط الترحيل الكهربائي لعينات فيروس موزاييك التبغ ، ولعينة من البروتين الكلي المستخلصة من نبات مصاب ، ولعينة من مستخلص نبات مصاب أزيل منها الكلوروفيل أو حاوية عليه تمثل بروتين الغلاف الفيروسي ، ولم تظهر مثل هذه الحزمة في نمط الترحيل لبروتينات النبات السليم أو مستخلص منه. واظهر الاختبار المصلي بالأشرطة المناعية الخاصة بفيروس موزاييك الخيار تفاعلاً موجباً مع مستخلص نباتات الخيار والبطيخ والقرع والكوسة ، كما أظهر اختبار الأشرطة المناعية الخاصة بفيروس موزاييك التبغ تفاعلا موجبا مع مستخلص نباتات التبغ والطماطة المصابة بفيروس موزاييك التبغ . ولم يظهر مستخلص النباتات السليمة لهذه الأنواع تفاعلاً موجباً مع هذه الأشرطة . وكانت النتائج متطابقة مع نتائج دراسة الأعراض على النباتات المشخصة بإصابتها بهذين الفيروسين .


Article
Evaluation the efficiency of different techniques for extraction and purification of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV)
تقويم كفاءة تقنيات مختلفة لاستخلاص وتنقية فايروس تجعد واصفرار أوراق الطماطة TYLCV

Authors: Samir A.H. Hamad سمير عبد الرزاق حسن حمد --- Mustafa A. Adhab مصطفى علي عذاب --- Rakib A. AlAni رقيب عاكف العاني
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2011 Volume: 8 Issue: 1عدد خاص بمؤتمر علوم الحياة Pages: 447-452
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to evaluate the efficacy of different techniques for extraction and purification of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV). An isolate of the virus free of possible contamination with other viruses infecting the same host and transmitted by the same vector Bemisia tabaci Genn. was obtained. This was realized by indicator plants and incubation period in the vector. Results obtained revealed that the virus infect Nicotiana glutinosa without visible symptoms, while Nicotiana tabaccum var. White Burley was not susceptible to the virus. The incubation period of the virus in the vector was found to be 21 hrs. These results indicate that the virus is TYLCV. Results showed that Butanol was more effective in clarification the sap and eliminate of plant proteins and chlorophyll. The use of citrate buffer at pH 8 amended with reducing agents and EDTA to prevent the oxidation of phenolic compound was found to be suitable in maintaining the biological activity of the virus during extraction. The quantity of the virus obtained was 3.05 mg/100 gm leaves with absorption ratio of 1.4 at 260/280 nm which represent standard value for TYLCV.

تهدف الدراسة الى تقويم كفاءة طرق مختلفة في استخلاص وتنقية فايروس تجعد واصفرار أوراق الطماطة (TYLCV). وقد أمكن الحصول على عزلة نقية للفايروس خالية من أي احتمال للتلوث بفايروسات أخرى تصيب العائل نفسه وتنقل بالناقل نفسه Bemisia tabaci Genn. باعتماد النباتات المشخصة ومدة حضانة الفايروس في جسم الناقل. أظهرت النتائج إن الفايروس موضوع البحث يصيب نباتات التبغ البري Nicotiana glotinosa بدون ظهور أعراض مرئية على النبات ، وعدم استجابة نباتات التبغ Nicotiana tabaccum var. White Burley للإصابة بالفايروس. بلغت مدة حضانة الفايروس في جسم الناقل 21 ساعة، مما يشير إلى أن الفايروس هو Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV). وأظهرت النتائج كفاءة عالية للمذيب العضوي كحول البيوتانول في ترويق العصارة وتخليصها من المادة الخضراء والبروتينات النباتية ، كما أن استعمال محلول دارئ الاستخلاص سترات الصوديوم بدالة حامضية 8 مدعما بمواد مختزلة مانعة لأكسدة المواد الفينولية ومواد مخلبية EDTA كان ملائما للحفاظ على حيوية الفايروس ومنع تكتله أو تحطمه أثناء الاستخلاص. بلغت كمية الفايروس التي تم الحصول عليها من 100 غم أنسجة نباتية مصابة 3.05 ملغم ، ونسبة امتصاص 1.4 على الطولين الموجيين 260 : 280 وتعد هذه النسبة قياسية لهذا الفايروس.


Article
Identification of Celery mosaic potyvirus, study its biological properties and identified its vector
تشخيص فايروس موزائيك الكرفس ودراسة خصائصه البايولوجية وتحديد ناقله

Authors: Farah A. Abdul-Jabbar فرح عبد الستار عبد الجبار --- Mustafa A. Adhab مصطفى علي عذاب --- Rakib A. Al-Ani رقيب عاكف العاني
Journal: ANBAR JOURNAL OF AGRICULTURAL SCIENCES مجلة الأنبار للعلوم الزراعية ISSN: PISSN: 19927479 / EISSN: 26176211 Year: 2010 Volume: 8 لمؤتمر - عدد خاص - الجزء الا Issue: 4 Pages: 438-445
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

Celery mosaic potyvirus (CeMV, Genus: Potyvirus, Family: Potyviridae) was identified on the basis of symptoms on indicator plants, Apium graveolens L., Datura stramonium L., Datura metel L., Hibiscus esculentum L., Vigna unguiculata L., Chenopodium amaranticolor Cost & Reyn., mechanically inoculated by extract from Apium graveolens L. showing mottle and yellow streak symptoms. Vein clearing turned to yellow mottle then to yellow streaks on the leaves associated with color breaking-like pattern, leaves deformations and stunting of entire plant were manifested on inoculated A. graveolens plants. D. stramonium was found exhibited mosaic symptoms on uninoculated leaves 8 days after inoculation, then small chlorotic spots developed on the other leaves accompanying with green vein banding. D. metel responded to the inoculation by mosaic after 8 days of inoculation. Small chlorotic spots were developed on the inoculated leaves of Ch. amaranticolor after 10 days of inoculation, chlorotic spots on the uninoculated leaves of Hibiscus esculentum after 14 days of inoculation and systemic mosaic on Vigna unguiculata after 10 days of inoculation were observed. The dilution end point, thermal inactivation point, longevity invitro for the virus were found to be, 10-2 – 10-3, 60˚C, and 6 days respectively. Mottle and yellow streak symptoms were manifested on A. graveolens leaves exposed to viruliferous aphids Myzus persicae Sulz., Aphis faba, Aphis gossypii for 1 minute (aphids were given an acquisition period of 15 minutes). CeMV was found to be transmitted by A. graveolens and D. metel seeds.

شخص فايروس موزائيك الكرفس Celery mosaic virus (CeMV، جنس Potyvirus، عائلة Potyviridae) اعتمادا على الأعراض على النباتات الكاشفة: الكرفس Apium graveolens L. الداتورة Datura stramonium L. والداتورة D. metel L. والزربيح Chenopodium amaranticolor Coste & Reyn. والباميا Hibiscus esculentus L. واللوبيا Vigna unguiculata L. ، اعديت ميكانيكيا بمستخلص من أوراق الكرفس تبدي أعراض تبرقش وتخطط اصفر. ظهرت على الأوراق المعداة أعراض توضح عروق تطورت إلى تبرقش اصفر ثم إلى تخطط اصفر رافقها أعراض تكسر الألوان وتشوه الأوراق وتقزم نباتات الكرفس المعداة. ظهرت على نباتات الداتورة D. stramonium L. أعراض موزائيك على الأوراق غير المعداة بعد 8 أيام من العدوى، ثم ظهرت بقع صغيرة شاحبة على الأوراق الأخرى مرافقة لتحزم اخضر حول العروق. استجابت نباتات الداتورة D. metel L. للعدوى بظهور أعراض موزائيك بعد 8 أيام من العدوى. ظهرت بقع صغيرة شاحبة على الأوراق المعداة لنبات الزربيح بعد 10 أيام من العدوى، وظهرت بقع شاحبة على الأوراق غير المعداة لنباتات البامية بعد 14 يوما من العدوى ، وأعراض موزائيك جهازي على نباتات اللوبيا بعد 10 أيام من العدوى. وجد أن نقطة التخفيف النهائية للفايروس، ودرجة الحرارة المميتة للفايروس ، والتعمير في العصير الخام لمستخلص الفايروس خارج الخلية الحية 10-2 – 10-3 ، 60˚س ، 6 أيام بالتتابع بدرجة حرارة المختبر. ظهرت أعراض تبرقش وتخطط اصفر على أوراق نباتات الكرفس المعرضة لحشرات من حاملة للفايروس للأنواع Myzus persicae Sulz. ، و Aphis faba و Aphis gossypii مدة دقيقة واحدة (تركت الحشرات تتغذى على نبات مصاب مدة 15 دقيقة لاكتساب الفايروس). وجد أن فايروس موزائيك الكرفس ينتقل ببذور الكرفس والداتورة.


Article
IDENTIFICATION AND MOLECULAR STUDIES ON Cucumber mosaic VIRUS IN IRAQ.
ي العراق . Cucumber mosaic virus دراسة تشخيصيه وجزيئية لفايروس موزائيك الخيار

Loading...
Loading...
Abstract

The objective of the study is to characterize new strain of Cucumbermosaic cucumovirus (CMV), based on symptoms on indicator plants,serological characteristics and the molecular weight of virus coat proteinson SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Leaves from symptomaticcucumber plants were extracted with 0.01 M phosphate buffer andmechanically inoculated on cucumber plants, and those exhibited mosaicsymptoms were used as virus source. A number of indicator plants weremechanically inoculated with an extract of symptomatic leaves. The viruswas extracted and purified from cucumber infected plants. Samples frompure virus preparation were analyzed on polyacrylamide gel containingSDS by electrophoresis. A part of symptomatic leaves was treated withanti-CMV polyclonal antibodies by Immunocromatography. Resultsshowed that the virus induced chlorotic local lesions on the inoculatedleaves of Nicotiana tabacum cv. Xanthi, and mosaic on beans. Aprecipitation line was appeared on the Immunostrip treated withsymptomatic leaf extracts, this line is absent on immunostrip treated withasymptomatic leaves. The analysis of purified virus and on SDSpolyacrylamidegel electrophoresis revealed two protein bands of 24 and26 Kd. These results indicate that the virus under study is CMV. Theresponded of N. tabacum Xanthi to virus inoculation by chlorotic lesions,and the apparition of 2 protein bands on acrylamide gel representing themolecular weights of virus coat protein indicates a new strain of CMV inIraq.

اعتمادا على (CMV) هدفت الدراسة الى تشخيص سلالة جديدة لفايروس موزائيك الخيارالاعراض على النباتات المشخصة والصفات المصلية والوزن الجزيئي لبروتينات الغلافالفايروسي. جمعت عينات من أوراق نباتات خيار تظهر عليها اعراض موزائيك وسحقت معمحلول دارئ فوسفاتي 0.01 مولاري في هاون خزفي، واعديت بالمستخلص نباتات خيارواعتمدت النباتات التي ظهرت عليها اعراض موزائيك مصدرا للفايروس. اعديت بمستخلص مناوراق الخيار المصابة مجموعة من النباتات المشخصة (الكاشفة) ميكانيكيا. استخلص الفايروسونقي من النباتات المصابة ، وحللت عينات منه بتقنية الترحيل الكهربائي على هلام الاآريلامايدعومل جزء من المستخلص مع الاشرطة المناعية الحاوية .(SDS-PAGE) SDS الحاوي علىاوضحت النتائج انه من بين العوائل .CMV على اجسام مضادة متعددة الكلون لفايروسبتكوين بقع Nicotiana tabacum Xanthi المشخصة للفايروس ، استجابت نباتات التبغ صنفموضعية صفراء على الاوراق المعداة انتقلت جهازيا الى الاوراق الحديثة بمرور الوقت، آماظهرت اعراض موزائيك على نباتات الفاصوليا. ظهر خط ترسيب على الاشرطة المناعيةالمعاملة بمستخلص اوراق خيار مصابة ولم يظهر مثل هذا الخط مع الاشرطة Immunostripالمعاملة بمستخلص من اوراق سليمة. اوضح نمط الترحيل الكهربائي على هلام الاآريلامايدحزمتين بروتينيتين اوزانهما الجزيئية 24 و 26 آيلو دالتون تمثل بروتينات الغلاف SDS بوجودالفايروسي. تؤآد هذه النتائج الى ان عزلة الفايروس موضوع الدراسة هي عزلة من فايروسXanthi وان ظهور بقع موضعية صفراء بدل الموزائيك على نبات التبغ CMV موزائيك الخياروآذلك ظهور حزمتين بروتينيتين في نمط الترحيل الكهربائي تمثل الوزن الجزيئي لبروتيناتالغلاف يشير الى سلالة جديدة من الفايروس تشخص لاول مرة في العراق.


Article
RESPONSE OF SOME IMPORTED POTATO CULTIVARS TO INFECTION BY POTATO VIRUS Y (PVY) UNDER FIELD CONDITIONS.
استجابة أصناف البطاطا المستوردة للاصابة بفايروس البطاطا واي PVY تحت ظروف الحقل.  

Loading...
Loading...
Abstract

This experiment was conducted in the field of plant protection department, College of Agriculture, University of Baghdad, to evaluate the response of potato cultivars, AR99, Arizona, Monaco, Avalon, Ambition, Disserie, Rudolph, Savanna, Saviola, Sinora, and Manitou to infection by Potato virus Y (PVY). The virus was isolated from infected potato plants and identified by means of symptoms on indicator plants sap inoculated by the virus, serological immunostrip reaction, and transmission by aphids Myzus persicae. Results showed that the virus induced chlorotic local lesions on inoculated leaves of Chenopodium amaranticolor, mild mottle followed by leaf necrosis and dropping on potato Solanum tuberosum. Nicotiana tabacum Samsun, Nicotiana glutinosa developed vein clearing followed by mild mottle on the new leaves. Mild mottle was developed on tomato leaves which disappeared within few days. Positive reaction on immunostrip containing PVY-polyclonal antibodies with extracts from infected plants was detected. No reaction was observed with extracts from healthy plants. Results of susceptibility of potato cultivars, exposed to natural PVY-infection by Myzus persicae from infected potato plants placed at different sites of the field, showed that two cultivars, Disserie and Rudolph were susceptible to PVY as proved by symptoms developed on these cultivars and test plants and positively reacted with PVY-polyclonal antibodies on immunostrip. The cultivars, AR99, Arizona, Monaco, Avalon, Ambition, Savanna, Saviola, Sinora, and Manitou were found to be resistant as proved by no symptoms were developed on these cultivars in the field and on test plants sap inoculated by extracts from these cultivars as well as no virus was detected in these cultivars by serological immunostrip.

أجريت التجربة في الحقل التابع لقسم وقاية النبات / كلية الزراعة - جامعة بغداد بهدف دراسة قابلية اصناف البطاطا AR 99 ، اريزونا ، موناكو، افلونا ، امبيشن ، ديزري ، رودولف ، سافانا ، سافيولا ، سينورا ، مانتو للاصابة بفايروس البطاطا واي PVY في الحقل. عزل الفايروس من نباتات بطاطا مصابة وشخص اعتمادا على الأعراض على النباتات المشخصة والاختبار المصلي بطريقة الأشرطة المناعية Immunostrips والنقل بواسطة حشرة المن Myzus persicae. استجابت نباتات الزربيح Chenopodium amaranticolor للعدوى بمستخلص نبات بطاطا مصاب ببقع موضعية صفراء اللون على الأوراق المعداة فقط ، وظهر على نباتات البطاطا Solanum tuberosum المعداة تبرقش خفيف وأعراض تنخر على الاوراق ثم سقوط الاوراق. استجابت نباتات التبغ Nicotiana tabacum Samsun والتبغ البري Nicotiana glutinosa للعدوى بالفايروس باعراض جهازية تمثلت بشفافية عروق أعقبها تبرقش طفيف على الاوراق الحديثة ، واستجابت نباتات الطماطة Lycopersicon esculentum بتبرقش طفيف اختفى بعد فترة قصيرة. اظهر الاختبار المصلي بواسطة الأشرطة المناعية الخاصة بفايروس البطاطا واي تفاعلا موجبا مع مستخلصات من نباتات بطاطا مصابة وسالبا مع مستخلصات من نباتات بطاطا سليمة. عرضت الاصناف للإصابة الطبيعية في الحقل بزراعة درنات بطاطا مصابة بفايروس البطاطا واي عليها حشرات من Myzus persicae لنقل الفايروس من المصدر إلى نباتات البطاطا. أخذت عينات من أوراق نباتات أصناف البطاطا المزروعة من مناطق مختلفة من الحقل بعد أسبوعين من الانبات وكرر أخذ العينات كل اسبوعين وأخضعت العينات للاختبار الحيوي على نباتات بطاطا والاختبار المصلي والنقل بالمن للتأكد من وجود الفايروس فيها. ظهرت على أوراق نباتات البطاطا المعداة ميكانيكيا بمستخلص من أوراق نباتات أصناف البطاطا ديزري ورودولف أعراض تبرقش طفيف وتنخر، وظهرت نفس الأعراض على نباتات بطاطا عرضت لحشرات من Myzus persicae سبق تغذيتها على هذه الأصناف. اثبت الاختبار المصلي بواسطة الأشرطة المناعية احتواء هذه الأصناف على الفايروس. لم تظهر أعراض إصابة على نباتات اختبار اعديت ميكانيكيا بمستخلص من أوراق الأصناف AR 99 ، اريزونا ، موناكو، افلونا ، امبيشن ، سافانا ، سافيولا ، سينورا ، مانتو أو عرضت لحشرات من سبق تغذيتها على هذه الأصناف، ولم يظهر الاختبار المناعي احتواؤها على الفايروس مما يشير إلى مقاومتها للفايروس.

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

Arabic (3)

Arabic and English (2)


Year
From To Submit

2013 (1)

2012 (1)

2011 (2)

2010 (1)