research centers


Search results: Found 7

Listing 1 - 7 of 7
Sort by

Article
Use of chromogenic Agar in detection of urinary tract pathogens and antimicrobial Susceptibility

Authors: Shaymaa L. Salman --- Rana M. Abdullah --- Arwa M. Abdullah
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: 00419419 Year: 2009 Volume: 51 Issue: 1 Pages: 39-42
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Background: HROM agar Orientation is a chromogenic medium used for the detection and differentiation of Gram’s negative and Gram’s positive pathogenic microorganisms in urine samples.
Evaluation of CHROM agar Orientation for identification of urinary pathogens and susceptibility determinations in comparison to the ordinary media used.
Patients and Methods: A total of 375 midstream urine sample collected from patients with urinary tract infection (UTIs). CHROM agar Orientation, blood agar and macConkey agar media were used for direct inoculation.
Results: CHROM agar Orientation succeeded in detecting all the urine pathogens that were detected by the reference media, and antimicrobial Susceptibility tests were performed directly from primary isolates in all cases without the need for subcultures.Conclusion: HROM agar Orientation medium excellent detection of urinary pathogens and antimicrobial Susceptibility tests without the need for subcultures. Therefore, can replace the standard primary plating media used in routine diagnosis of urinary tract infection.


Article
Detection of lasB Gene of Pseudomonasaeruginosa Causing Different Infection

Authors: Rana M. Abdullah Al-Shwaikh --- Abbas Falih Al-Arnawtee
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2019 Volume: 00 Issue: 2 Pages: 48-52
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

The result obtained 75 isolate of Pseudomonasaeruginosa included: 28 isolates from otitis media, 23 isolates from burn infections, 10 isolates from wound infections, 8 isolates from urinary tract infections and 6 isolates from blood. The isolates were identified by culturing on MacConkey agar, Blood agar, Cetrimide agar, Pseudomonas agar and CHROMagar Orientation then identified by performing biochemical tests including (oxidase test and catalase test) and further identification by using a API20E system. The result obtained Pseudomonasaeruginosa that have Las B included : 23 isolates from otitis media 82.14%, 19 isolates from burn infections 82.60%,10 isolates from wound infections 100%, 5 isolates from urinary tract infections 62.5 % and 6 isolates from blood 100%.The result revealed that the lasB gene was present in 63 isolates 84% of Pseudomonasaeruginosa. The gel electrophoresis showed that the molecular weight of alg D gene was 300bp.


Article
A STUDY OF THE EFFECT OF COMBINATION OF CEFTAZIDIME AND EDTA ON SOME TYPE OF BACTERIA ISOLATED FROM INFECTED WOUND.
دراسة التأثير الخلطي لمضاد السيفتازديم مع EDTA على بعض انواع البكتريا المسببة لالتهابات الجروح .

Authors: ARWAM. ABDULLAH اروى مجاهد عبدالله --- RANA M.ABDULLAH رنا مجاهد عبدالله
Journal: Journal of university of Anbar for Pure science مجلة جامعة الانبار للعلوم الصرفة ISSN: ISSN: 19918941 Year: 2009 Volume: 3 Issue: 3 Pages: 31-36
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

:A total of 100 swab samples were obtained from patients suffering from woundinfection. The isolates were identified using different microscopical cultural characteristics andbiochemical tests. Final identification of gram negative bacteria were performed by using API 20 Esystem. The most common bacteria isolates was Pseudomonas aeruginosa (37.64 %) followed byStaphylococcus aureus (23.52%). Escherichia coli and Klebsiella spp. (14.11%) each of them.Followed by Proteus mirabilis (8.23%), finally Enterococcus faecalis and Serratia marcesence(1.17%) each of them.Sensitivity of the isolates to antibiotic leveled high resistance to Amoxicillin,cefotaxime, ceftazidime, Gentamicin and Tobramycin. To less extent was the resistance toCiprofloxacin, Amikacin, Cefepime, imipenem, norfloxacin, P-ofloxacin and Azitromycin.Combination of EDTA and ceftazidime gave interesting results against the local bacterial isolates.Itwas concluded from this study the possibility of using a combination of Ceftazidime with EDTA totreat infected wounds with high success rate

جمعت (100) مسحة اخذت من مرضى يعانون من التهابات الجروح .زرعت هذه العينات على الاوساط الزرعية الاغنائية والتفريقية لغرض عزل المسببات البكتيرية ، ومن ثم أخضعت المزارع البكتيرية الى الفحوصات المجهرية والبايوكيميائية لغرض تشخيصها. تم استخدام عدة التشخيص api20E لغرض التشخيص النهائي للبكتريا السالبة لصبغة كرام.اظهرت النتائج ان بكترياPseudomonas aeruginosa الممرض السائد حيث كانت النسبة (37.64%)، تليها كل من بكتريا Staphylococcus aureus (%23.52) وبكتريا Escherichia coli وKlebsiella spp. وبنسبة(%14.11) لكل منهما. تليها بكتريا Proteus mirabilis (%8.23) ، واخيرا Enterococcus faecalis و Serratia marcesence (%1.17) لكل منهما .أظهرت العزلات تباينا واضحا وبنسب مختلفة في مقاومتها للمضادات الحيوية. أظهرت اغلب العزلات مقاومة لمضادات الاموكسسلين والسيفاتكسيم والسيفتازديم والجنتاميسين والتوبرمايسين في حين اظهرت العزلات حساسية عالية لمضادات السيفابيم والامبينيم والسبروفلوكساسين والازترونام والبيفلوكساسين والنورفلوكساسين والاميكاسين .اظهرت البكتريا حساسية عالية عند خلط مضاد السيفتازديم مع EDTA مقارنة مع استعمال مضاد السيفتازديم لوحده . وقد استنتج من الدراسة امكانية استعمال خليط السيفتازديم و EDTAفي علاج الجروح وبكفاءة عالية.


Article
Study the Inhibitory effect of Rose and blossom bitter orange flowers extracts against different types of bacteria isolated from the oral cavity
دراسة التاثيرالتثبيطي لمستخلصات زهورالروز وقداح نبات النارنج على انواع مختلفة من البكتريا المعزولة من بطانة الفم

Authors: Rana M. Abdullah رنا مجاهد عبدالله --- Israa A.Ibrahim اسراء عبد الجبارإبراهيم
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2014 Volume: 11 Issue: 2 عدد خاص بالمؤتمر النسوي الثاني Pages: 795-802
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The study in duded isolation and identification of microbial isolates from oral cavity to 10 volunteers, diagnosed within the three groups: Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Streptococcus spp. and Candida albicans . The sensitivity test of all isolates bacteria Streptococcus spp. , S. aureus and S. epidermidis showed high resistance to Ampicillin(100)%,followed Methicillin (88.88)% and Amoxicillin / clavulanic acid(77.77)%, while the resistance for each of Vancomycin and Amoxicillin were (66.66)%, and the resistance to Erythromycin and Pencillin (55.55)% to each of them. The results showed less resistance to Trimethoprim (22.22)% and Cefalotine (11.11)% of all bacteria isolate. Investigation of the presence of active compounds in each of the hot and cold (water and alcoholic) extracts flowers Rose and flowers blossom bitter orange ( new preparatory 2012) (Alkaloids, Quartet alkaloids, sugars, Saponine, Flavones and comarins ) was carried out includes. While it was all kinds of extracts does not contain resins. The results showed the presence of active compounds (Sugars, Flavones and comarins) in old extracts that preparation after a year (2011). PH values of the plant extracts hot and cold (water and alcoholic) for each of orange flowers blossom and Rose flowers (Old and new preparatory) with a wide range ranging between (3.6 -6.4). All extracts hot and cold (alcoholic) (new preparatory 2012) showed most effective towards Streptococcus spp., S. epidermidis and Candida albicans, while the extracts show weak effective against S. aureus. Hot alcohol extracts of Rose (old preparatory 2011) showed most effective towards S. aureus and S. epidermidis only, while the other extracts of old perpetration show weak effective against Streptococcus spp. and C. albicans.

تضمنت الدراسة عزل وتشخيص عزلات مايكروبية من بطانة الفم لعشر متطوعين ، شخصت ضمن ثلاث مجاميع بكتيرية Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis ، Streptococcus Spp.والفطرCandida albicans. اجري فحص الحساسية للمضادات الحيوية المختلفة لجميع العزلات البكتيرية قيد الدراسة ، حيث اظهرت جميع عزلات البكتريا Streptococcus spp. ، S. aureus وS. epidermidis مقاومة عالية لمضاد Ampicillin وبنسبة (100)% ، تليها كل من مضاد Methicillin (88.88)% ومضاد Amoxicillin/clavulanic acid (77.77 )% ، في حين بلغت نسبة المقاومة لكل من مضادي Vancomycin و Amoxicillin نسبة (66.66)% لكل منهما ، وبلغت نسبة المقاومة لمضادي Erythromycin وPencillin (55.55) % لكل منها. وقد اظهرت النتائج اقل نسبة مقاومة كانت لمضادي Trimethoprim و Cefalotine (22.22) % و(11.11)%على التوالي. تم الكشف عن بعض المواد الفعالة في كل من المستخلصات المائية والكحولية البارده والساخنه لزهورالروز وزهور قداح النارنج ذات التحضيرالجديد(2012)، وقد وجد احتواء هذه المستخلصات على كل من (القلويدات ، القلويدات الرباعية ، السكريات ، الصابونيات ، الفلافونات و الكومارينات) في حين كانت جميع انواع المستخلصات غيرحاوية على الراتنجات. واظهرت النتائج وجود المواد الفعالة (السكريات، الفلافونات والكومارينات)في المستخلصات القديمة بعد سنه من التحضير (2011)، وكانت قيم الرقم الهيدروجيني للمستخلصات النباتية الكحولية والمائية البارده والساخنة لكل من زهور قداح النارنج وزهورالروز القديمة والجديده ذات مدى واسع تتراوح بين (3.6 – 6.4). واظهرت اغلب مستخلصات القداح الكحولي البارد والساخن (التحضيرالجديد 2012) فعالية تجاه كل من بكتريا S. epidermidis ، Spp. Streptococcus وC. albicans في حين كانت هذه المستخلصات ذات فعالية ضعيفة تجاه بكتريا S. aureus عند استخدام طريقة الانتشار باستعمال الاقراص فيما اعطت طريقة الحفر نتيجة افضل للتثبيط. اما المستخلص زهورالروزالكحولي الساخن (التحضير القديم 2011) فقد كان فعال تجاه بكتريا S. epidermidis وبكتريا S. aureusفقط ،في حين كانت بقية الانواع من المستخلصات القديمة ذات فعالية ضعيفة تجاه كل من بكتريا Spp. Streptococcus وفطر C. albicans.


Article
Identification of Pseudomonas aeruginosa From Clinical Specimen by Using 16S rDNA Gene.
تشخيص بكتريا Pseudomonas aeruginosa من عينات سريرية باستخدام جين 16S rDNA

Authors: Rana M. Abdullah رنا مجاهد عبدالله --- Abbas F. Mehdi عباس فالح مهدي
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2016 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 45-49
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Seventy- Five isolates of Pseudomonas aeruginosa were isolated from 100 isolates of clinical cases. 16S rDNA gene was detected by using polymerase chain reaction (PCR) and found that all isolates possess this gene, with 956 base pair. The isolates showed different sensitivity against antibiotics, all isolates were resistant to Kanamycin 100% most of isolate shown resistance to Ceftazidime 81.33%, Gentamicin 46.66 %, Tobramycin 38.66% and Piperacillin and Ofloxacin 37.33% each of them, and some isolates showed less resistance to Ciprofloxacin and Norfloxacin 34.66% each of them, and Aztreonam 22.66% and finally to Imipenem 17.33%. Virulence factors analysis showed 75 (100%) isolates were produced β-hemolytic, 61 (81.33%) were Protease activity, and 59 (78.66%) isolates had Pyocyanin and Amylase, and 54 (72%) isolates showed its ability to produce Biofilm.

تم الحصول على 75 عزلة تعود الى بكتريا Pseudomonas aeruginosa من اصل 100 عزلة جمعت من حالات مرضية مختلفة. كشف عن وجود جين 16S rDNA وباستعمال تفاعل البلمرة المتسلسل ( PCR) ووجد ان 100 % من العزلات تمتلك هذا الجين والذي بلغ حجمه 956 زوج قاعدة. اجري فحص الحساسية للمضادات الحيوية المختلفة حيث كانت جميع العزلات مقاومة لمضاد Kanamycin بنسبة 100%، فيما اظهرت مقاومة اقل لكل من مضادات Ceftazidime بنسبة 81.33%، ولمضاد Gentamicin 46.66% ولمضاد Tobramycin 38.66% ولمضادات Piperacillin و Ofloxacin بنسبة 37.33 % لكل منهما، واظهرت العزلات مقاومة بنسبة 34.66 % لكل من مضادي Ciprofloxacin و Norfloxacin، واظهرت العزلات اقل مقاومة لمضاد Aztreonam بنسبة 22.66% ولمضاد Imipenem بنسبة 17.33%. تم التحري عن بعض عوامل الضراوة التي تمتلكها البكتريا، واظهرت النتائج ان جميع العزلات تمتلك الانزيم الحال للدم Hemolysin بنسبة 100%، في حين اظهرت 61 عزلة 1.33% قابليتها على انتاج انزيم المحلل للبروتينProtease ، وكانت اغلب العزلات لها قابليه لانتاج صبغة البايوسيانين Pyocyanin بنسبة 78.66% وبلغت نسبة العزلات التي اثبتت قدرتها على انتاج انزيم المحلل للنشا Amylase 78.66 %، اظهرت 54 عزلة 72% قابليتها على انتاج Biofilm.


Article
DNA Sequences Analysis of tox A Gene Isolated from Pseudomonas aeruginosa Bacteria.
تحليل تسلسل الحامض النووي لجين tox A المعزول من بكتريا Pseudomonas aeruginosa

Loading...
Loading...
Abstract

75 isolates of Pseudomonas aeruginosa was obtained from different clinical conditions. The result showed that 54 isolates which were related to P. aeruginosa have tox A gene will a ratio (72%), while 21 isolates will a ratio (28%) from the isolates didn’t have this gene and when we compared the duplicated bands with a suitable DNA marker, the size of the gene was found to be 352 base pair. The analysis of nucleotide sequence for tox A genes of P. aeruginosa was revealed there was some mutations in the DNA of this gene occurred in the nitrogen base sequence which almost included substitution type and insertion. The percentage of identities 96 and 99 % with the original gene. DNA sequencing analysis of amino acid translation of tox A genes revealed that most isolates display different point mutation as compared with NCBI data. Point mutation was detection in P. aeruginosa tox A causes conversion of Alanine to Threonine, Alanine to Glutamine, Alanine to Glycine, Leucine to Valine and Arginine to Leucine.

تم الحصول على (75) عزلة تعود الى بكتريا Pseudomonas aeruginosa جمعت من حالات سريرية مختلفة. أظهرت النتائج وجود 54 عزلة التي تعود لبكتيريا P. aeruginosa تمتلك الجين tox A وبنسبة 72% ، في حين كانت 21 عزله وبنسبة 28 % من العزلات لاتمتلك هذا الجين ، وعند مقارنة الحزم المتضاعفة مع الدليل الحجمي وجد أن الحزم ذات وزن جزيئي 352 زوج قاعدة حللت تسلسل الحمض النووي لجين tox A في بكتريا P. aeruginosa وبينت النتائج ان هنالك طفرات وراثية في DNA لجين tox A حدثت هذه الطفرات في تسلسل القواعد النتروجينية وكانت اغلبها من نوع الاستبدال والاضافة وكانت نسبة التطابق 96 و 99% مع الجين الاصلي. عند تحليل نتائج الترجمه للاحماض الامينية للجين tox A مع نتائج الترجمة للحامض الاميني الاصلي حسب موقع NCBI وجد ان الطفرات نقطية الحاصلة في الجين غيرت في مسار ترجمة البروتين حيث تم تحول الحامض الاميني من الالانين Alanine (Ala) A الى ثريونين Threonine (Thr) Tوتغيير الحامض الاميني الالانين Alanine (Ala) A الى الحامض الاميني جلوتامين Glutamine (Glu) E وتحول الحامض الاميني الالانين Alanine (Ala) A الى الحامض الاميني كلايسين Glycine (Gly) G، وتحول الحامض الاميني ليوسين Leucine (Leu) L الى الحامض الاميني فالين Valine (Val) V وتحول الحامض الاميني ارجنين Arginine (Arg) R الى الحامض الاميني ليوسين Leucine (Leu) L.


Article
Genotyping of Pseudomonas Aeruginosa Isolated from Different Clinical Samples by Using ERIC Method
التنميط الجيني لبكتيريا الزوائف الزنجارية المعزولة من حالات سريرية مختلفة باستخدام طريقة ERIC

Authors: Abbas Falih Al-arnawtee عباس فالح الأرنؤطي --- Rana M. Abdullah رنا مجاهد عبد الله
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2019 Volume: 15 Issue: 02 Pages: 107-117
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

This study included 100 clinical samples collected as following: 33, 27, 15, 14 and 11 samples from patients with otitis media, burn infections, urinary tract infections, wound infections, and bacteremia, respectively, during the period from September to December, 2014. Seventy-five Pseudomonas aeruginosa isolates were identified. To determine the genetic relatedness of different isolates, Pseudomonas aeruginosa has been typed using Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR) and dendrogram analysis. Results showed that there was a genetic relatedness among Pseudomonas aeruginosa isolates in 19 clones, while 8 isolates contained different genotyping. In conclusion. The results inducted that ERIC-PCR is a practical, useful and easy method for typing Pseudomonas aeruginosa isolates.

شملت هذه الدراسة 100 عينة تم جمعها من مصادر سريرية مختلفة شملت 33 عزلة من المرضى الذين يعانون من التهاب الأذن الوسطى و 27 عزلة من المرضى المصابين بالتهابات الحروق و 15 عزلة من مرضى التهابات المسالك البولية و 14 عزلة من المرضى المصابين بالتهابات الجروح و 11 عزلة من مرضى تجرثم الدم خلال الفترة من سبتمبر إلى ديسمبر 2014. بعد اجراء تشخيص العينات تم الحصول على 75 عزلة تعود لبكتريا Pseudomonas aeruginosa . استخدمت طريقة (ERIC-PCR). لتحديد علاقة الانماط الوراثيه لعزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa. أوضحت النتائج وجود علاقة وراثية بين عزلات بكتريا Pseudomonas aeruginosa في 19 نسيلة، بينما كانت 8 عزلات تحتوي على أنماط وراثية مختلفة ، بينت النتائج ان طريقة التنميط الوراثي باستخدام طريقة ERIC-PCR هي عملية مفيدة وسهلة لدراسة العلاقات الوراثية بين عزلات Pseudomonas aeruginosa.

Listing 1 - 7 of 7
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (7)


Language

Arabic (4)

English (3)


Year
From To Submit

2019 (2)

2016 (2)

2014 (1)

2009 (2)