research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Evaluation of PIK3CA Status in Breast Cancer and their Correlation with ER, PR, and HER-2 expressions in Iraqi female patients
تقييم حالة PIK3CA في سرطان الثدي وعلاقتها بالتعبير الجيني لـجينات ER ، PR و HER-2 في مريضات عراقيات

Author: Rand Muhammed Abdul-Hussain Al-Hussaini
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2-2 Pages: 134-143
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The present study revealed that the PIK3CA, catalytic subunit of phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K), is mutated in breast cancer. This study was carried out in the laboratory of molecular biology in the Department of Biology in the College of Science – Kufa University, during the period from July 2013 through March 2014. Paraffin blocks of thirty one patients with breast carcinoma were included in this study. These samples were collected from laboratory of histopathology in Alsader Teaching Hospital in Al-Najaf governorate. Six samples with normal breast tissues were considered as control group for this study. Their ages ranged from 30 to 65 years, with a mean age of 49.9 years. Carcinoma tissue samples were evaluated previously for ER, PR and HER-2 by Immunohistochemical analysis. The diagnosis was under the supervision of pathologist in the hospital. The clinicopathological assessment revealed that 14 (45.16%) were hormone dependent carcinoma: ER+PR+, 3 (9.67 %) and 9 (16.12%) were probably hormone dependent carcinoma: ER+PR-; ER-PR+, and 5 (29.03%) were hormone independent carcinoma: ER-PR-. HER-2 expression was found in 7(22.58%) of cases. Mutational analysis of PIK3CA was done in 31 breast cancers and, finally, 11 (35.48%) mutations were identified in total. The frequency of PIK3CA mutations in ER-positive tumors was significantly (p < 0.05) higher than that in ER- negative tumors , and the frequency of PIK3CA mutations in PR-positive tumors tended to be higher than that in PR-negative tumors. HER2 expression was not significantly associated with PIK3CA mutations.

أظهرت الدراسة الحالية ان PIK3CA الوحدة الفرعية المحفزة لـ phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) تكون طافر في حالة سرطان الثدي. اجريت هذه الدراسة في مختبر البايولوجي الجزيئي بقسم علوم الحياةص2348 في كلية العلوم جامعة الكوفة، خلال الفترة من تموز 2013 لغاية آذار 2014. تضمنت هذه الدراسة احدى و ثلاثون قالب شمع البارافين لسرطان الثدي. تم جمع هذه العينات من مختبر الامراض النسيجية في مستشفى الصدر التعليمي في محافظة النجف. ستة عينات انسجة ثدي طبيعية اعتبرت كمجموعة سيطرة لهذه الدراسة. تراوحت اعمارهم من 30 الى 65 سنة، بمتوسط عمري بلغ 49.9 سنة، تم تقييم النسيج المسرطن لـ ER، PR، و HER-2 بواسطة التحليل المناعي النسيجي الكيميائي. تم التشخيص باشراف اخصائي علم الامراض في المستشفى. اظهر التقييم المرضي السريري ان 14(45.16%) كانت سرطان معتمد على الهرمون: ER+PR+ ، 3(9.67%) و 9(29.03) كانت من المحتمل سرطان معتمد على الهرمون: ER+PR- ؛ ER-PR+ ، و 5(16.12%) كانت سرطان غير معتمد على الهرمون: ER-PR-. التعبير الجيني لـ HER-2 وجد في 7(22.58%) من الحالات. اجري تحليل طفرة PIK3CA لاحدى وثلاثون حالة سرطان ثدي، و اخيراً 11(35.48%) طفرة تم تشخيصها اجمالاً. كان تكرار طفرات PIK3CA في اورام ER-positive اعلى معنوياً (p < 0.05) من اورام ER- negative، و تكرار طفرات PIK3CA في اورام PR-psitive اعلى نوعاً ما من اورام PR- negative، لم تكن هنالك علاقة معنوية بين الـHER-2 و طفرات PIK3CA .

Keywords

PIK3CA --- Breast cancer --- HER-2 --- ER


Article
The role of single nucleotide polymorphism (C/T) of TGF-β1 gene at position -509 in the promoter region in progression of breast cancer among some Iraqi women

Author: Rand Muhammed Abdul-Hussain Al-Hussaini
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 3 Pages: 108-115
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

: Risk of breast cancer incidence among women can influence by many genes polymorphisms that cause different variations in their expression. Transforming growth factor-β1 (TGF-β1) has clear role in progression and invasion of breast carcinoma. Specific polymorphic variants in TGF-β1 gene correlate with increased its expression or loss of inhibition. This study was aimed to find out if the single nucleotide polymorphism C/T at position -509 in the promoter region of TGF-β1 gene with its genotypes can be considered as predisposing factors of in 58 Iraqi women with confirmed breast cancer who were admitted to Alsader Teaching Hospital in Al-Najaf province. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism technique was used to estimate genotyping of TGF-β1 gene polymorphism in the patients and 30 healthy women without any inflammatory disorders or clinical manifestation of any disease (control group). Genotype distributions of SNP (-509 C/T) showed no significant difference (p˃0.05) between patients (CC: n= 45, 77.58%; CT: n=11, 18.96%; TT: n=2, 3.44%) and controls (CC: n= 25, 83.33%; CT: n=5, 16.66%; TT: n=0). That means the SNP C/T in position 509 in the promoter region of TGF-β1 gene plays no significant role in the progression of breast cancer among Iraqi female patients.


Article
Mutation analyses of bilirubin UGT1A1gene in Neonatal that Associated With Hyperbilirubinemia in Al-Najaf province
تحليل طفرة جين البليروبين UGT1A1 لدى حديثي الولادة والمرتبط مع ارتفاع مستوى بليروبين الدم في محافظة النجف

Author: Rand Muhammed Abdul-Hussain Al-Hussaini رند محمد عبد الحسين الحسيني
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2014 Volume: 6 Issue: 2 Pages: 49 -59
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

The objectives of this study were to determine the frequencies of the mutations in the bilirubin UDP glycosyltransferase _UGT1A1 gene which associated with neonatal hyperbilirubinemia in a group of Iraqi babies in Al-Najaf province and a group of normal controls and to compare the frequencies of this mutation between these groups. The newborns with hyperbilirubinemia in this study were 92 newborns with a total bilirubin level of more than 15 mg/dl serum in the first 7 days of life. They showed no blood group and Rh incompatibility, and no clinically detectable pathology except for hyperbilirubinemia. While control group consists from 20 healthy newborns without hyperbilirubinemia all were without clinical manifestation of any disease. This study was carried out in the laboratory of biochemistry in Al-Zahraa Pediatric and Maternal Teaching Hospital and laboratory of molecular biology in the Department of Biology in the Faculty of Sciences – Kufa University, during the period from July 2013 through March 2014.The distribution of hyperbilirubinemia according to gender showed higher rates in male newborns than female newborns with a significant difference (P < 0.05) between them. The estimated incidence of hyperbilirubinemia increased in the age group (1d-3d) but without a significant difference in comparison with the other groups. The mutation analyses of bilirubin UDP glycosyltransferase _UGT1A1 gene, revealed that the genotypic distribution for G71R mutation among the hyperbilirubinemia group (92) has been found that 11 of 92 newborn had the G71R mutation (heterozygotes), which mean that the UGT1A1 gene mutation was a possible risk factor for the development of neonatal hyperbilirubinemia in Iraq.

هدفت هذه الدراسة لتحديد تكرار الطفرات في جين البيليروبين UDP glycosyltransferase _UGT1A1 المسؤول عن فرط بيليروبين الدم لدى حديثي الولادة في مجموعة من الاطفال العراقيين في محافظة النجف و مجموعة من الاطفال الطبيعيين كمعاملة سيطرة و مقارنة معدل هذه الطفرات بين هاتين المجموعتين. حديثو الولادة المصابون بفرط بيليروبين الدم خلال هذه الدراسة كانو 92 و بلغ مجموع مستوى البيليروبين لديهم اكثر من 15 mg/dl في المصل في السبعة ايام الاولى من الولادة. لم يظهر لديهم عدم تطابق في مجاميع الدم ولا في عامل Rh و لم يكن لديهم اي امراض سريرية عدى فرط بيليروبين الدم. بينما تكونت مجموعة السيطرة من 20 حديثي ولادة سليمين غير مصابين بفرط بيليروبين الدم او اية امراض اخرى.اجريت هذه الدراسة في مختبر الكيمياء الحياتية بمستشفى الزهراء التعليمي للولادة و الاطفال و مختبر البايولوجي الجزيئي بقسم علوم الحياة في كلية العلوم- جامعة الكوفة خلال الفترة من تموز 2013 لغاية آذار 2014. أظهر توزيع فرط بيليروبين الدم حسب الجنس في حديثي الولادة نسبة أعلى في الذكور عنه في الاناث بفارق معنوي (P < 0.05) بينهم. ارتفع مقدار معدل الإصابة بفرط بيليروبين الدم في الفئة العمرية (1 يوم – 3 يوم) لكن بدون فرق معنوي مقارنة مع الفئات العمرية الاخرى. كشف تحليل طفرة جين البيليروبين UDP glycosyltransferase _UGT1A1 ان التوزيع الوراثي للطفرة G71R ضمن مجموعة فرط بيليروبين الدم (92) وجود الطفرة G71R في 11 من اصل 92 حديث ولادة (متباين)، و هذا يعني ان طفرة الجين UGT1A1 هو عامل خطورة محتمل لتطور فرط بيليروبين الدم لدى حديثي الولادة في العراق


Article
Unsecure Access and Lack of Safety Disposal Procedures of Ethidium Bromide in Laboratory of Molecular Biology in Faculty Of Science/Kufa University
وصول غير آمن وعدم وجود إجراءات سليمة للتخلص من بروميد الإيثيديوم في مختبر الأحياءالجزيئي في كلية العلوم/ جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Ethidium bromide (EtBr) is a mutagen and a possible carcinogen. However Ethidium bromide is the most commonly utilized dye throughout the Faculty of Science in Electrophoresis gels for the identification of DNA. These gels will be agarose-based. Ethidium bromide is a highly toxic and potentially mutagenic chemical which may be fatal if swallowed, inhaled, or absorbed through the skin. The waste by-products of the DNA identification process must be managed and disposed in a manner to protect public health and the environment. Unfortunately there is no an appropriate way to discard the agarose gel that containing EtBr. Usually EtBr gels are discarded using the normal trash and aqueous ethidium bromide (EtBr) stock solutions discharge to a sink drain. Even though EtBr is known as mutagen it is still being kept in unsecured storage cabinet with unlimited access by any person who can inters the molecular laboratory in Faculty of Science.

الأثيديوم برومايد هي مادة كيميائية مطفرة و مسرطنة محتملة. مع ذلك فان الثيديوم برومايد هي من اكثر الصبغات المستخدمة شيوعا خلال الترحيل الكهربائي لجل الاكاروز لتشخيص ال DNA في كلية العلوم. ان الأثيديوم برومايد هي مادة عالية السمية و مطفرة و التي قد تكون قاتلة اذا ما ابتلعت او استنشقت او تم امتصاصها عبر الجلد. يجب ان تعامل مخلفات تشخيص DNA و يتم التخلص منها بطريقة ملائمة تضمن حماية الصحة العامة و البيئة. لسوء الحض لا توجد طريقة ملائمة للتخلص من الاكاروز جل المحتوي على الاثيديوم برومايد. حيث بالعادة يتم رميها بسلة المهملات العادية أما المحاليل الحاوية على الاثيديوم برومايد فيتم سكبها في مغسلة المختبر. و بالرغم من معرفة خطورة مادة الاثيديوم برومايد كمادة مطفرة الا انها في الوقت الحاضر تحفظ في خزانة غير مؤمنة يمكن الوصول اليها من قبل اي شخص يدخل المختبر في كلية العلوم.


Article
Study of SNPs in the promoter region of IL-6 gene and other inflammatory markers as predictors of acute appendicitis in Iraqi patients
دراسة تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة في منطقة الباديء لجين IL-6 وغيرها من علامات الالتهاب كمتنبئ لالتهاب الزائدة الدودية الحاد في مرضى عراقيين

Author: Rand Muhammed Abdul-Hussain Al-Hussaini رند محمد عبد الحسين الحسيني
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2016 Volume: 8 Issue: 2 Pages: 383-391
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was done to find out if the SNPs (-174G/C) in the regulatory (promoter) region of IL-6 gene can be considered as helpful marker and contribute in the prediction of acute appendicitis combined with other inflammatory marker like WBC count and serum CRP levels in 86 Iraqi patients admitted to emergency department of Alsader Teaching Hospital in Al-Najaf province with clinical and physical diagnosis of acute appendicitis, and 40 healthy individuals without any inflammatory disorders or clinical manifestation of any disease as control group. The distribution of patients according to gender and age showed higher incidence rates in male and in the second age group (16-22years) respectively, but without significant differences (p˃0.05). This study also showed that the patients had significantly (p<0.05) higher mean WBC counts and CRP when compared to controls. Finally, allelic distributions of SNPs (-174G/C) in the promoter region of IL-6 gene showed no significant difference (p˃0.05) between acute appendicitis patients and controls. That means polymorphism plays no role in acute appendicitis prediction so this SNPs cannot use to confirm the clinical and physical diagnosis of acute appendicitis, while other inflammatory markers (WBC count and serum CRP levels) were useful in the prediction of acute appendicitis in Iraqi population.

أجريت هذه الدراسة لمعرفة ما إذا كان تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (-174 (G / C) في المنطقة التنظيمية (الباديء) لجين IL-6 يمكن اعتباره علامة مفيدة وتسهم في التنبؤ لالتهاب الزائدة الدودية الحاد جنبا إلى جنب مع علامة التهابات أخرى مثل عدد كرات الدم البيضاء ومستويات بروتين CRP في الدم في 86 من المرضى العراقيين الداخلين في قسم الطوارئ في مستشفى الصدر التعليمي في محافظة النجف الذين أظهر التشخيص السريري والجسدي اصابتهم بالتهاب الزائدة الدودية الحاد، و 40 من الأشخاص الأصحاء دون أي اضطرابات التهابية أو مظاهر سريرية من أي مرض كمجموعة سيطرة. أظهر توزيع المرضى وفقا لنوع الجنس والسن ارتفاع معدلات الإصابة في الذكور وفي الفئة العمرية الثانية (16-22 سنة) ولكن دون فرق معنوي(p˃0.05) . كما أظهرت هذه الدراسة أن المرضى لديهم ارتفاع معنوي (p˃0.05) في معدل عدد كريات الدم البيضاء و بروتين CRP بالمقارنة مع السيطرة. وأخيرا أظهرت التوزيعات الأليلية لتعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (-174G / C) في منطقة الباديء لجين IL-6 عدم وجود فرق معنوي (p˃0.05) بين مرضى التهاب الزائدة الدودية الحاد و السيطرة. وهذا يعني أن تعدد الأشكال الجيني لا يلعب أي دور في التنبؤ لالتهاب الزائدة الدودية الحاد لذلك فان تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة لا يمكن استخدامها لتأكيد التشخيص السريري والجسدي لالتهاب الزائدة الدودية الحاد، بينما كانت العلامات الأخرى للالتهاب (معدل اعداد كريات الدم البيضاء و مستويات CRP المصلي) مفيدة في التنبؤ لالتهاب الزائدة الدودية الحاد في المجتمع العراقي.

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

English (5)


Year
From To Submit

2017 (1)

2016 (2)

2014 (2)