research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Genetic variation between wild type and auxotrophic mutant isolates of Sinorhizobiummeliloti by using RAPD-PCR technique
التباين الوراثي بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي في بكتيريا Sinorhizobium melilotiبأعتماد تقانةRAPD-PCR

Loading...
Loading...
Abstract

SGI2 wild type isolate of Sinorhizobiummeliloti was isolated from Medicagosativa (alfalfa) plant which was obtained from Al-Tarmiaa region / Baghdad. Nine auxotrophic mutants were obtained from the SGI2 wild type isolate by mutagenesis with Nitrous acid (HNO2). The SGI2 wild type and the all auxotrophic mutant isolates had two Megaplasmids; pSymA and pSymB. No genetic variations in plasmid number and size were detected when gel electrophoresis was done for plasmid profile detection. Genetic variations by using RAPD-PCR technique were obtained between wild type and auxotrophic mutant isolates. One band was detected in SGI6 gel profile with 1.5 Kb size when OPY-04 primer was used. Using OPB7 primer by using RAPD-PCR technique showed large variation between all the isolates. Two bands were obtained from the SGI2 wild type isolate with 800 bases and 1.5 Kb in size. These bands were absent from the auxotrophic mutant isolates. The band with 800 bases was also found in SGI10 isolate. The other auxotrophic mutant isolates have different bands with size ranging from 200 bases and more than 1.5 Kb for the SGI6 isolate. No bands were detected in SGI8, SGI9 and SG12 isolates. The large differences in bands number and size suggested that the variation is clear at the genes level of the total genome and not at plasmid level as a result after nitrous acid mutagenesis.

عزلت عزلة برية SGI2 لبكتيريا Sinorhizobiummeliloti من نبات الجتMedicago sativa (alfalfa) الذي حصلنا عليه من منطقة الطارمية / محافظة بغداد، وتم الحصول على 9 طافرات عوز غذائي من العزلة البرية SGI2 بالتطفير مع حامض النيتروز Nitrous acid. امتلكت جميع العزلات البرية والطافرة بلازميدين كبيرين هما pSymA وpSymB ولم يظهر الترحيل الكهربائي لهما أي تغيرات نتيجة التطفير بحامض النيتروز. أظهرت التباينات الوراثية بأعتماد تقانة RAPD-PCR بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي وجود حزمة واحدة في العزلة SGI6 بحجم أكبر من 1.5 كيلو قاعدة عند أستعمال البادئ OPY-04، وعند أستعمال البادئ OPB7 أظهر تباينات كبيرة بين العزلة البرية وعزلات طافرات العوز الغذائي. تم مشاهدة حزمتين في العزلة البرية SGI2 بحجم 800 قاعدة و1.5 كيلو قاعدة وعدم ظهورها في العزلات الطافرة الأخرى. أظهرت الحزمة التي بحجم 800 قاعدة في العزلة الطافرة SGI10فحسب،في حين أظهرت بقية العزلات الطافرة حزماً تباين حجمها من 200 قاعدة إلى أكثر من 1.5 كيلو قاعدة كما في العزلة SGI6. ولم تظهر أي حزم عند أستعمال هذا البادئ في العزلات SGI8، SGI9 و SGI12. إن ظهور هذه الحزم يوضح مدى التباين الوراثي على المستوى الجيني للجينوم الكلي وليس على مستوى البلازميد نتيجة التطفير الكيمياوي بأستعمال حامض النيتروز.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2014 (1)