research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Using ISSR markers to build a phylogenetic of Barley Genotypes
استخدام مؤشرات التفاعل الضمني البسيط لبناء الشجرة الوراثية لأصناف الشعير

Author: Zeina S. M. Al_Hadeithi زينه سيف الدين محمد الحديثي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 2C Pages: 1682-1688
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study is attempts to build a phylogenetic between nine Iraqi barley genotypes based on ISSR-PCR analysis by determine the level of genetic similarity among them. Nine issr primers used in this study produced 41 bands across nine studied varieties. Of these bands, 28 bands were polymorphic and the remaining monomorphic bands were 13. The average polymorphic rate was 70.5% ranged between 25%-100% , and average of polymorphic bands /primer was 4.5.The size of the amplified bands ranged 140-1600 bp. It was generated a 5 unique bands in this study, these bands can be used as a DNA profiling of all studied genotypes. The results were showed Genetic distances ranged between (0.0854-0.9897) among barley varieties. Based on phylogenic tree, a dendrogram were constructed among studied barley varieties, cluster analysis grouped the nine varieties into two main clusters depending on their ancestors and their morphological traits. The use of cultivars from various clusters and sub clusters offer the possibility of obtaining an appropriate genetic variability in hybrid population.

هدفت الدراسه الحاليه الى محاولة بناء شجرة السلالات الوراثية اعتماداً على تسعة مورثات لنبات الشعير العراقي, حيث استعملت المؤشرات الوراثية للتتابع الضمني لتحديد مستوى التشابه الوراثي للأصناف المدروسة. استعملت تسع بادئات ولوحظ ظهور 41 حزمه للأصناف المدروسه, كانت 28 حزمة متباينه في الحجم الجزيئي و 13 حزمة متماثله. وتراوحت نسب التباينات الوراثية بين 25%-100% وبمتوسط 70.5 % وكان معدل الحزم المتباينه لكل بادئ 4.5. تراوح الحجم الجزيئي للحزم المضخمه بين 140-1600 زوج قاعدي, وقد لوحظ ظهور خمس حزم فريده في هذه الدراسه يمكن استخدامها كمؤشر وراثي لدراسة اصناف الشعير المختلفه. اظهرت النتائج قيم البعد الوراثي اذ تراوحت بين (0.0854- 0.9897) لأصناف الشعير المدروسه. واعتمادا على شجرة تطور الطرز الجينية فقد تم بناء التحليل العنقودي لأصناف الشعير والذي جمع الأصناف التسع في مجموعتين رئيستين اعتمادا على اسلافهم وسماتهم الشكليه. استخداما لأصناف من مجاميع متنوعه ومجموعات فرعية توفر إمكانية الحصول على التباين الوراثي المناسب في المجتمع الهجين لنبات الشعير.


Article
Detection of Genetic Polymorphism in Iraqi Barley using SSR-PCR Analysis
الكشف عن تعدد الأشكال الوراثية في الشعير العراقي باستخدام تحليل التكرار التسلسلي البسيط

Author: Zeina S. M. Al-Hadeithi زينه سيف الدين محمد الحديثي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 2B Pages: 1158-1164
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Nine Iraqi varieties of barley (Hordeum vulgare L.) has been differentiated and diagnosed using simple sequence repeat markers to detect their genetic polymorphism. Six SSR primers were used for genetic screening of barley samples (IPA 265, IPA 99, Tuwaitha, Hitra, Rayhan, Shuaa, Bawadi, Samir and Al_khair). These primers generated total PCR product (11) bands divided to 8 polymorphic bands 3 monomorphic bands. the percentage of polymorphism 80% ranged between (50-100%). a mean value of polymorphic band per primer was 1.6 . these primers produced amplification fragment at Molecular weight between 75-900 bp. One unique band was generated at size 200bp, this band can be used as a DNA profiling of all studied genotypes. These results appeared genetic distances ranged between (0.01098-0.99708) among studied varieties. Using the unweighed pair-group method using arithmetic averages (UPGMA) cluster analysis, nine barley landraces were clustered into two main clusters depending on their ancestors and to their spike type (two-row and six-row barley). These results will be useful for barley germplasm management in terms of biodiversity protection and breeder’s rights protection.

تسعة أصناف من الشعير العراقي تم تمييزها وتشخيصها باستخدام مؤشرات التكرار التسلسلي البسيط للكشف عن التباين الوراثي فيما بينها. استخدمت ستة بادئات خاصة في الفحص الجيني لعينات الشعير (اباء 265, اباء 99, تويثة, الحضر, ريحان, شعاع, بوادي, سمير, الخير). أنتجت تلك البادئات 11 حزمة قسمت الى 8 حزم متباينة و 3 منها حزم متماثلة. وبلغ التباين الوراثي 80% و تراوح بين (50-100%). وكان معدل الحزم المتباينة لكل بادئ 1.6. هذه البادئات أنتجت حزم مضخمه بوزن جزيئي بين 75-900 زوج قاعدي. ظهرت حزمة فريدة واحدة بوزن 200 زوج قاعدي, هذه الحزمة يمكن استخدامها كمؤشر وراثي للأصناف المدروسة. أظهرت هذه النتائج نسبة البعد الوراثي بين (0.01098- 0.99708) للأصناف المدروسة. استخدام التحليل العنقودي جمع الأصناف التسع في مجموعتين رئيسيتين اعتمادا على أسلافهم و نوع السنبلة (2 صف و6 صف) وهذه النتائج تفيد في إدارة الأصول الوراثية من حيث حماية التنوع البيولوجي وحماية حقوق المربي.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2016 (1)

2015 (1)