research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Analysis of Genetic Diversity in Maize(Zeamays L.)Varieties Using Simple Sequence Repeat(SSR)Markers

Authors: Nidhal AbdulHusseinAl-Badeiry --- Ali Hmood Al-Saadi --- Thamer Khadhair Merza
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2014 Volume: 22 Issue: 6 Pages: 1768-1779
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 41 alleles were detected among the tested varieties using 10 Simple Sequence Repeat (SSR) loci distributed on 9 chromosomes of maize.The molecular size of bands obtained from amplification of SSR products ranged from 91 to 288 bp. Alleles ranged from one in umc1653 to ten in bnlg1189 loci. The values of heterozygosity for each locus varied from 0.46 for umc1641 and umc1069 loci to 0.88 for bnlg1189 locus with a mean of 0.55. The polymorphic information content (PIC) values for the SSR loci ranged from 0.17 to 0.85, with an average of 0.44. The highest PIC values were observed in primers bnlg1017 (0.85) and umc1038 (0.79) and the lowest PIC values was observed in primer umc1946 (0.17).The study revealed that, the lowest genetic distance was (0.2410) between varieties IPA 5011 (lane 6) and Sarah (lane 8), while, the highest genetic distance was (0.7853) between varieties DKC 6120 (lane 15) and Manlcet (lane 19). The genetic similarity values ranging from (0.2147 to 0.7590) depending upon the genetic distance values that ranging from (0.2410 to 0.7853), which indicate the larger diversity with percentage of (24 to 78%) among the tested varieties. Analysis of the obtained results from genetic distances and Neighbor-joining dendrogram (unrooted tree) revealed that, the 20 tested maize varieties can be grouped into two major groups: one small cluster A containing 4 varieties and a large cluster B containing 16 varieties. The results obtained in this study may assist maize cultivation and in maize breeding programes.

تم الكشف عن 41 من الأليلات بين الأصناف باستعمال 10 من المواقع الوراثية ذات التتابع المتكرر البسيط (SSR) Simple Sequence Repeat والمنتشرة على تسعة من كروموسومات الذرة الصفراء. وتراوح الحجم الجزيئي للحزم الناتجة من تضاعف المواقع الوراثية للـ SSR من 91 إلى 288 زوج قاعدي. وتراوح عدد الأليلات في المواقع الوراثية من أليل واحد في umc1653 إلى عشرة أليلات في الموقع الوراثي bnlg1189. ووجد أن قيم التغاير الزايكوتي heterozygosity لكل موقع تراوح من0.46 في (umc1641) إلى 0.88 في (bnlg1189) وبمعدل قدره 0.55. تراوحت قيم محتوى المعلومات متعددة الأشكال (PIC) polymorphic information content لكل موقع وراثي من0.17 إلى 0.85، وبمعدل قدره 0.44. ولوحظ أن أعلى قيمة للــ PIC كانت للبادئين bnlg1017 (0.85) وumc1038 (0.79) في حين كانت أقل قيمة في البادئ umc1946 (0.17). توصلت الدراسة من خلال هذا المؤشر الجزيئي إلى أن أقل بعد وراثي هو(0.2410) والذي حصل بين الصنفينIPA 5011 (رقم 6) والصنف سارة (رقم 8)، بينما وجدت أكبر بعد وراثي هو (0.7853) بين الصنفين DKC 6120 (رقم 15) و Manlcet (رقم 19). وعلى أساس قيم البعد الوراثي تم إيجاد قيم التشابه الوراثي التي تراوحت من 0.2147 إلى 0.7590، والتي تشير الى التنوع الكبير الذي نسبته (24 إلى 78%) بين الأصناف المدروسة. كشف تحليل النتائج التي تم الحصول عليها من البعد الوراثي وشجرة العلاقة الوراثية Neighbor-joining dendrogram إلى أن كل الأصناف قيد الدراسة توزعت إلى مجموعتين رئيسيتين: مجموعة واحدة صغيرة تدعى A تحتوي على أربعة أصناف، ومجموعة كبيرة تدعى B تحتوي على ستة عشر صنفا. النتائج التي تم الحصول عليها في هذه الدراسة يمكن أن تساعد في زراعة الذرة الصفراء وبرامج تربيتها.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2014 (1)