research centers


Search results: Found 5

Listing 1 - 5 of 5
Sort by

Article
Detoxification of inorganic contaminants in transgenic Arabidopsis thaliana

Authors: Raghad Mohammed --- Kadhim Ibrahim --- Norrya Ali --- Antonious Al-Daoude
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2017 Volume: 20 Issue: 1 Pages: 99-107
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

In detoxification, the plant takes up the contaminant of concern from soil, water, or a mixture of both, converts it to a volatile form, and releases it to the atmosphere, usually through the leaf stomata. This technique is only suitable for contaminants that do not pose a significant air pollution hazard. Contaminants taken up by the roots pass through the roots to the leaves and are volatized through stomata where gas exchange occurs. This experimental work examines the ability of transgenic Arabidopsis thaliana with P4502E1 gene from rabbit to detoxify for many soil contaminants. The P450 2E1 enzyme controls the rate-limiting step in the metabolism of multiple environmental pollutants. The percentage of transformation increased at the less diluted cultures of Agrobacterium tumefaciens. The ability of transgenic plants were tested for their potential in remediation of metals such as Sodium (Na), Magnesium (Mg), Potassium (K), Calcium (Ca), Manganese (Mn), Iron (Fe), Copper (Cu), Zinc (Zn), and Nickel (Ni). In the present work, transgenic plants were more efficient achieving 31, 46, 42, 48, 33, 51, 35, 29 and 39% contribution of each to the total value of detoxification contaminants. [DOI: 10.22401/JNUS.20.1.14]


Article
Expression of Recombinant Human Glucocerebrosidase Protein in Sunflowers
التعبير الجيني للانزيم البشري المركب Glucocerebrosidase في دوار الشمس

Authors: Zainab Tuama Al-Dallee زينب طعمه خلف الدلي --- Mohamad Abdulmuhsin Al-Hajaj محمد عبد المحسن الحجاج
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2019 Volume: 16 Issue: 1 Pages: 18-33
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Molecular farming has become one of the most significant implementations of modern biotechnology to generate modified plant crops to produce medicinal proteins. Agrobacterium is one plant genetic engineering tool that integrates genes of interest inside a host plant. In recent years, the need to produce recombinant proteins as therapeutics has growing rapidly, and human glucocerebrosidase is one of the proteins that is need to treat disease. In this study, specific primers were designed to amplify Hu-GBA1 gene from constructed pGEM-GBA plasmid which was cloned into the plant expression vector pCAMBIA1304. The generated recombinant pCAMBIA1304-GBA plasmid was used to transform A. tumefaciens LBA4404 and applied for transformation of sunflower cotyledon explants. Colony PCR technique was used to confirm the presence of Hu-GBA1 gene in transformed A. tumefaciens. Agrobacterium containing pCAMBIA1304-GBA was suspended in Infection Medium (IM) supplement with 200 mM acetosyringone. A bacterial suspension was used to transform sunflower cotyledons. After infection, cotyledons were co-cultivated in Co-cultivation medium (CCM), supplied with 200 mM acetosyringone without antibiotics. The cotyledons were then transferred to selection media containing 7.5 mg/L Hygromycin and 250 mg/L Cefotaxime and grown for additional 14 days at 25℃ in photoperiod of 16h L/8h D. The transformed sunflower cotyledons were successfully generated complete plant with used 6-Benzylaminopurine and Naphthalene acetic acid as growth hormones. The presence of the Hu-GBA1 gene in the genomic DNA of transgenic sunflower plant was proven by PCR as a band of 1561bp size. The GBA mRNA expression in modified sunflowers was detected by qRT-PCR compared with control GBA mRNA. Enzyme Linked Immunoassay was done on crude recombinant protein that extracted from transformed sunflower using Human Glucosylceramide ELISA Kit, the Elisa test results confirmed the production of recombinant glucocerebrosidase and the concentration of crude recombinant enzyme extracted from transformed sunflower with GBA1 gene was 0.45 ng/µl

تعد الزراعة الجزيئية واحدة من أهم تجارب التقنيه الحيويه لانتاج محاصيل نباتية معدلة وراثيا لإنتاج بروتينات طبية وان بكتريا Agrobacterium واحدة من أدوات الهندسة الوراثية التي تستخدم لادخال الجينات المرغوبه داخل النبات. في السنوات الأخيرة زادت الحاجه لإنتاج بروتينات علاجيه بطرق الهندسة الوراثية، ويعد انزيم الــ Glucocerebrosidase المستخدم لعلاج المرض الوراثي Gaucher disease واحد من تلك البروتينات. في الدراسة الحاليه تم تصميم بادئات خاصة لتضخيم الجين البشري Hu-GBA1 المسؤل عن انتاج انزيم Glucocerebrosidase من البلازميد المركب pGEM-GBA بعدها تم كلونه الجين المضخم في ناقل التعبير النباتي pCAMBIA1304 للحصول على ناقل كلونة يحمل الصفه الوراثيه لتشفير انزيم Glucocerebrosidase. استخدام البلازميد المركب الناتج pCAMBIA1304-GBA لتحويل بكتريا Agrobacterium tumefaciens LBA4404 الى بكتريا حامله للبلازميد المركب. اكدت النتائج الحصول على بكتريا محورة وراثيا حامله للجين البشري GBA1 بواسطة PCR Colony . علقت بكتريا Agrobacterium المحوره في وسط Infection Medium (IM) الحاوي على200 ميليمولارمن acetosyringone واستخدم هذا العالق لتحويل فلقات نبات دوار الشمس الى فلقات محورة وراثيا حاوية على الجين البشري GBA1 ، اذ نميت الفلقات الحاوية على العالق البكتيري في الوسط الزرعي (Co-Cultivation Medium CCM) الخالي من المضادات مع 200 ميليمولارمن acetosyringone ، بعد ذلك تم نقل الفلقات إلى وسط اختيار( Selection Medium SM)) يحتوي على 7.5 مليغرام / لتر من Hygromycin و 250 مليغرام / لترمن Cefotaximeوالتي نميت لمدة 14 يومًا إضافية بدرجه حرارة25م⁰ لفترة 16 ساعة ضوء و8 ظلام .اذ تم بنجاح إستزراع نبات دوار الشمس من الفلقات المحور وراثيا وقد ثبت وجود الجين 1Hu-GBA في الحمض النووي للنبات المحور النامي بواسطه PCR حيث كانت نتيجة التظخيم حزمة بقياس 1561زوج قاعدي. كما تم الكشف عن التعبير الجيني للـ GBA1في دوار الشمس المحور بواسطة الريال تايم PCR مقارنه معGBA1gene القياسي. استخدم الاختبار المناعي المرتبط بلانزيم ELISA وباستخدام عدة المحاليل الجاهزة (Human Glucosylceramide ELISA Kit) لتحديد هوية الانزيم المنتج من البروتين الخام المستخلصه من النبات المحور وتحديد تركيزه ايضا، حيث اوضحت النتائج ان تركيز انزيم glucocerebrosidase المستخلص من نبات دوار الشمس المحول بجين GBA1 هو0.45 نانوغرام/ مليلتر


Article
TRANSFER OF RI T-DNA GENES OF AGROBACTERIUM RHIZOGENES R1601 VIA DIRECT MICROINJECTION AND CO_CULTIVATION TO CARROT, DAUCUS CAROTA L. TISSUE AND PRODUCTION OF TRANSFORMED HAIRY ROOT CULTURES
إنتقال جيناتT-DNA المحمولة على بلازميدات Ri من بكتريا Agrobacterium rhizogenes R1601 بوساطة الحقن المباشر والزراعة المرافقة الى أنسجة الجزر Daucus carota L. وتكوين مزارع الجذور الشعرية المحورة وراثياً

Author: Mozahim K. Al-Mallah
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 227-239
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The present study detected the optimal requirements to produce hairy roots on stem segments and root discs of carrot, Daucus carota L., by the natural vector for genetic transformation A.rhizogenes R1601. Direct inoculation of stems segment by bacterial inoculum of density 96x108cell/ml was efficient and sustained the initiation of hairy roots after 10-15 days. They developed on inoculated and non-inoculated sites at percent reached up to 49.9% with a mean of 5.6 hairy roots /segment. Hairy roots excised were as single or clusters of roots and placed on agar-solidified MS medium. They were transferred to MS medium supplemented with gradual concentrations 100, 200, 300 mg/L of antibiotic Cefotaxime through several subsequent transfer to eliminate bacteria. Finally, cultures of hairy roots free from bacteria was developed on MS medium which considered as selection medium. This phenotype of hairy roots was fast growing, brown in color, lacking of root hairs and negatively geotropism. Also, hairy roots were formed on carrot discs, via Co_cultivation with A. rhizogenes R1601 for 8 hours which appeared the best time, after 25 days at a percent of 17.8% and a ratio of 3 hairy root/disc. This phenotype of hairy root was slow in growth, white in colour and express less branching. Paper electrophoresis results demonstrated the present of agropine in both phenotype of hairy roots which proved the incidence of genetic transformation of these roots compared with the normal root (control).

كشفت الدراسة الحالية المتطلبات المثلى لإنتاج الجذور الشعرية Hairy roots على قطع سيقان بادرات وأقراص جذور الجزر Daucus carota L.بإستعمال بكتريا A.rhizogenes R1601 ناقلاً طبيعياً لإحداث التحول الوراثي. نجحت عملية تلقيح قطع السيقان بالحقن المباشر باللقاح ذي الكثافة 108×96خلية/مليلتر التي عدت الأفضل في نشوء الجذور الشعرية خلال 10-15 يوماً في مواقع الحقن فضلاً عن بزوغها في مواقع أخرى. وبلغت نسبة تكوينها 49.9% وبمعدل 5.6 جذر شعري/قطعة. أستؤصلت الجذور الشعرية النامية على قطع السيقان منفردة أو على هيئة خصل ووضعت على سطح وسط MS الصلب وإدامتها من خلال نقلها عدة نقلات متتالية على أوساط MS الصلب الحاوية على تراكيز متدرجة تصاعدياً (100،200،300) ملغم/لتر من المضاد الحيوي Cefotaxim لحين الحصول على مزارع الجذور الشعرية الخالية من البكتريا النامية على وسط MS الصلب بإعتباره وسطاً إنتخابياً. أتصف نمط الجذور الشعرية المتكونة بنموها السريع وكثرة تفرعاتها وإنعدام الشعيرات الجذرية عليها ولونها الأبيض المصفر وسلبيتها للإنتحاء الارضي (negative geotropism). كما تكونت الجذور الشعرية على أقراص جذور الجزر بتحضينها مرافقة للمعلق البكتيري (Co_cultivation) لمدة 8 ساعات والتي اظهرت أفضليتها عن بقية فترات التحضين الاخرى، وبزغت الجذور الشعرية بعد 25 يوماً وسجلت نسبة 17.8% وبمعدل 3 جذور شعرية/ قرص. إمتاز نمط الجذور الشعرية المتكونة بنموها البطيء ولونها الأبيض وقلة تفرعاتها و كثافة شعيراتها الجذرية. أكدت نتائج الترحيل الكهربائي لاختبار الأكروبين Agropine test لهذين النمطين من الجذور الشعرية كشفاً موجباً يبرهن حدوث التحول الوراثي لهذهِ الجذور قياساً بعينة الجذور الاعتيادية (المقارنة).


Article
Phenotypic Expression in Catharanthus roseus Explants Inoculated with Agrobacterium Strains Locally Isolated
التعبير المظهري على الأجزاء النباتية المفصولة من نبات عين البزون Catharanthus roseous الناتج من التلقيح بعزلات من بكتيريا .Agrobacterium sp المعزولة محليا

Author: Sabah Mehdi Hadi صباح مهدي هادي
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2016 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 84-88
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Agrobacterium species were isolated from local soil in Jadirrya, Baghdad, Iraq, twenty one strains were isolated, most of them were identified as Agrobacterium rhizogen . All the isolated strains show the ability to production catalase, peroxidase and H2S, salt tolerance for NaCl (2%). Most isolated strains were confirmed as biovair 2 because they can grow on New and Kerr medium. The pathogenicity of these bacteria was tested using leaf explants of Catharanthus roseus cultured in B5 medium supplemented with 30 gl sucrose and hormone free. Agrobacterium rhizogens showed the ability to induce and form hairy roots on the explants while the Agrobacterium tumefaciens showed the ability to induce crown gall tumors after inoculation with the bacterial spp.

عزلت بكتيريا تابعة للجنس .Agrobacterium sp من التربة المحلية في الجادرية, بغداد-العراق وتم تشخيصها باستخدام الاوساط الانتقائية والفحوصات الكيموحيوية, تم الحصول على 21 عزلة معظمها كانت تابعة للنوع rhizogens Agrobacterium. اظهرت جميع العزلات قدرتها على انتاج الكاتاليزوالاوكسديزوغاز H2S والنمو في الوسط الملحي 2% كلوريد الصوديوم, معظم العزلات كانت تابعة للنمط الحيوي 2 وذلك لتمكنها من النمو في الوسط الزرعي .New and Kerr اختبرت القدرة الآمراضية للبكتيريا بوساطة تقنية زراعة الآنسجة النباتية وباستخدام اوراق نبات عين البزون Catharanthus roseous وزراعتها في الوسط الزرعي B5والحاوي على 30 ملغم /لتر سكروز والخالي من منظمات النمو. أظهرت عزلات النوع rhizogens.A قدرتها على أحداث مرض التجذر الشعري في الآوراق اما النوع A. tumefaciens فأظهر قدرته على احداث مرض التورم التاجي بعد اصابتها بالبكتيريا.


Article
PUTATIVE GENETICALLY MODIFIED CALLUS DERIVED FROM TRANSFORMED HAIRY ROOTS INDUCED ON SUGARBEET (BETA VULGARIS) EXPLANTS BY AGROBACTERIUM RHIZOGENES 1601 HARBOURING RI-PLASMID
تكوين الكالس المعدل وراثياً المشتق من الجذور الشعرية المحولة وراثياً المتكونة على أوراق البنجر السكري Beta vulgaris ببكتريا Agrobacterium rhizogenes 1601 الحاوية على بلازميدات Ri

Author: Mzahem K. Al-Mallah
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 455-463
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Hairy roots were induced on leaf explants excised from sugarbeet (Beta vulgaris) plants when inoculated by Agrobacterium rhizogenes R1601. Paper electrophoresis proved the presence of agropine, the unusual amino acid in these roots which demonstrated the transformation of these tissues. Transformed hairy roots were easily grown on agar-solidified Murashige and Skoog, 1962 (MS) medium containing 0.5mgl-1 2,4dichlorophenoxy acetic acid (2,4-D) or B5 medium supplemented with a mixture of 0.7 mgl-1 Benzyl Adenine (BA) and 0.7 mgl-1 (2,4-D). Callus produced from these hairy roots grown on MS medium was of friable and white in color, while brown in color on B5 medium. Calli were grown efficiently in liquid B5 medium provided with a mixture of 1.0 mgl-1 kinetine (Kin.) and 1.0 mgl-1 2,4-D. These results may contribute in transformation of sugarbeet plants.

تكونت الجذور الشعرية على أوراق نباتات البنجر السكري (Beta vulgaris)، المفصولة من نباتات نامية في الحقل، في المواقع الملقحة ببكتريا Agrobacterium rhizogenes R1601 . وأكدت نتائج الترحيل الكهربائي للكشف عن الاكروبين، الحامض الأميني غير الاعتيادي، نجاح التحول الوراثي في هذه الأنسجة. وإامتاز الكالس المتكون من هذه الجذور بسهولة نموه على وسط MS الصلب الحاوي على 0.5 ملغم لتر-1 2,4-D وعلى وسط B5 الصلب المجهز بـ 0.7 ملغم لتر-1 BA و 0.7 ملغم لتر-1 2,4-D وأتصف بقوامه الهش ولونه الابيض على وسط MS ولونه البني على وسط B5. وسلك الكالس في نموه سلوكاً مماثلاً على وسط B5 السائل الحاوي على 1.0 ملغم لتر-1 Kin. و 1.0 ملغم لتر-1 2,4-D . هذه النتائج مهمة جداً في مجالات التقانة الحيوية للنباتات لان مزارع الكالس المتكونة تعد خطاً خلوياً مهما في إنتاج نباتات بنجر سكري محولة وراثياً مباشرة من هذا الكالس.

Listing 1 - 5 of 5
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (5)


Language

English (3)

Arabic (2)


Year
From To Submit

2019 (1)

2017 (1)

2016 (1)

2012 (2)