research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
Detection of antibiotics resistance genes in clinical isolates of Klebsiellapneumonia
التحري عن المورثات المشفره لصفهالمقاومهللمضادات الحيويهفي عزلات سريرية لبكترياKlebsiellapneumonia

Author: WasanW.Albassam وسن وائل البصام
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 1B Pages: 407-416
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Total of 46 isolates ofKlebsiella pneumoniae were collected from patients attending (Al-Yarmook Hospital and Education Labs / medical city), and isolates were re-identified,depending on morphology and biochemical tests. Disk diffusion method was employed to determine antibiotic susceptibility of forty six isolates by using eleven antibiotics.The results revealed the sensitivity of six isolates (9.3%) to Imipenem and Meropenem. On the other hand the isolates were showed 23.9% resistant against Ciprofloxacin, while some isolates shown higher resistant against several antimicrobial agents such as 65.2%, 69.0% for Amikacin and Cefepime consequently , 71.1%, 71.7 % for Amoxicillin -Clauvulanic acid and Gentamicin and 82.6% against Piperacillin , Nitrofurantoin and Ceftazidime.The isolates also appeared high level of resistance against Cefotaxime at a percentage 91.3% .Depending on the obtained results 6 isolates were selected assigned (K21, K32, K33, K37, K38, K43) for detection of blaTEM,blaSHV, blaKPC and AmpCbecause of its resistance of almost chosen antibiotics.The selected isolates were PCR-positive for blaTEM which showed bands in 209 pb.,on the other hand the resultrevealed that the isolates K33,K32possesencoding to blaSHVof 509pbin size,. In regard to blaKPC gene only K37 (16%)gave 811pb. All selected isolate gave negative results to AmpC.The selected isolates were detected of beta-lactamase productionby using acidimetric tests (tube method) , all isolates gave positive result.

جمعت ( 46) عزلهلKlebsiellapneumoniae منمستشفى اليروموك والمختبرات التعليميه في مدينه الطب . اعيد تشخيصها اعتمادا على الاختبارات الكيموحيوية .اظهرت نتائج اختبارحساسيه العزلات تجاه احدى عشر مضاد حيوي وتضمنت مقاومه 9.3% لكل منImipenem وMeropenemو3.9% مقاومه لمضادCiprofloxacinفضلا عن امتلاك العزلات مقاومه عاليه للعديد من المضادات شملت 65.2% لمضادAmikacinو69.0% لمضاد Cefepime و71.1% لمضاد Amoxicillin-Clavulanic acidو71.7 %لمضاد Gentamicin و82.6% لكل من Piperacillin ,itrofurantoinوCeftazidimeفي حين اظهرت العزلات91.3% مقاومه للمضاد Cefotaxime . وبناءا على نتائج اختبار الحساسيه اختيرت 6عزلات(K21, K32, K33, K37, K38, K43) والتي تمثل الاكثر مقاومه لمعظم المضادات البكتيريه المستعمله . تم استخدام تقنيه PCR للتحري عن امتلاك العزلات 6 المختاره على المورثات المشفرهbla TEM blaSHV, blaKPC,AmpC. اظهرتالعزلات جميعها امتلاكهاللمورث المشفرbla TEM ذو حجم 209زوج قاعديوامتلاك العزلتين 33,32 للمورث المشفرblaSHVذو حجم 509 زوج قاعدي واظهرت عزله واحده امتلاكها للمورث المشفر bla KPC ذوحجم 811 زوج قاعديولكن جميع العزلا ت لم تمتلك المورث المشفرAmpC.اختبرت قابليه العزلاتعلى انتاجها لانزيم البتالاكتميز باستخدام طريقه acidimetric tests (tube method) اظهرت النتائج ان جميع العزلات منتجه لانزيم البيتالاكتميز.


Article
تحديد العوامل الوراثية المسؤولة عن صفة المقاومة للمضادات الحيوية في جرثومة STAPHYLOCOCCUS SCIURI
INVESTIGATING OF THE GENETIC FACTORS RESPONSIBLE FOR ANTIBIOTICS RESISTANCE IN Staphylococcus Sciuri

Author: Fatima A. Ali
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 182-195
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

For investigating the genetic factors responsible for antibiotics resistance for Staph. sciuri transformation experiments were carried out with standard strain Escherichia coli JM83 using DNA plasmid purified from 5 strains of Staph. scriui posses predominant resistance differences between (6-24) antibiotics. The mechanism responsible for antibiotic resistance was tested to produc Extend Spectrum Beta lactamase (ESBLs) after using electrophoresis technique using Polyacrylamide gel with sodium dodocyl sulfate (SDS – PAGE) for BLs extracted from the 5 strains produced it and it revealed (1-3) bands with m.wt. between (20-26) KDa...As regard responsible for It was found that this genes are located on plasmid DNA molecules and these results were supported by electrophoresis of DNA purified from plasmid transformed colonies of laboratory strains of E. coli JM83, a single band of plasmid DNA on agarose gel appeared to have between (1-4) bands according to the types of the strains. On the other hand, one strain couldn't give any band which may indicate the occurrence of gene code for antibiotic resistance may be carried by the chromosome too.

لغرض التعرف على العوامل الوراثيه البلازميدية المسؤوله عن مقاومة أفراد النوع Staph.sciuri لبعض المضادات الحيوية تم إنجاز تجارب التحول الوراثي لسلالة قياسية مختبرية هي Escherichia coli JM83 بإستعمال الـ DNA البلازميدي المعزول والمنقى من 5 عزلات لجرثومة Staph.sciuri تمتلك مديات مقاومة متباينة إزاء المضادات الحيوية والتي تراوحت بين مقاومة(6-24)مضاداً، وأختبرت آلية مقاومتها من حيث قابليتها على إنتاج أنزيم البتا لاكتاميز واسع الطي Extened Spectrum Beta Lactamase (ESBLs). أستعملت تقنية الهجرة الكهربائية في هلام الاكريلامايد المتعددPolyacrylamide Electrophoresis بوجود SDS لأنزيم البيتالاكتاميز BLs المستخلص من هذه العزلات للانزيم وأسفرت النتائج عن الحصول على حزم متباينة تراوحت بين 1-3 حزم وقدرت أوزانها الجزيئية بإستعمال البروتينات القياسية التي تراوحت ما بين 20-56 كيلو دالتون. أظهرت النتائج أن هذه المورثات المدروسة لعزلات جرثومة Staph. sciuri واقعة على DNA البلازميدي الخاص بتعين مواقع المورثات المانحة لصفة المقاومة للمضادات الحيوية. وقد دعمت هذه النتائج بالهجرة الكهربائية و للـ DNA البلازميدي المحضر وبطريقة التحليل القاعدي من المستعمرات المتحولة لسلالة E. coli JM83 المختبرية والذي ظهرعلى هيئة حزم متعددة ومفصولة على هلام الاكاروز تراوحت ما بين 1-4 حزم وحسب نوع السلالة.


Article
THE PATTERN OF BACTERIAL PATHOGENS & THEIR ANTIBIOTICS SENSITIVITY AMONG PATIENTS WITH RESPIRATORY TRACT INFECTIONS

Author: Abdul-Munim N Mohammed د. عبد المنعم ناجي محمد
Journal: IRAQI JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES المجلة العراقية للعلوم الطبية ISSN: P16816579,E22244719 Year: 2013 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 181-186
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Background:Knowing the bacterial pathogens and their antibiotic sensitivity is an important way of establishing a suitable guideline of treatment of infection.Objectives:To isolate bacterial pathogens from patients with respiratory tract infections (RTI), and to determine the antibiotic sensitivity of isolates.Methods:Sputum specimens were collected from 145 patients with RTI admitted to Al-Kindy Teaching Hospital from March 2011 to January 2012. Out of these, 88 (60.7%) patients (age rang 17-59 years) had an established bacterial etiology, and of these, 57 (64.8%) were males and 31 (35.2%) females. All isolates were diagnosed according to bacteriological and biochemical standard methods. For identified of antimicrobial susceptibility used from Kirby Bauer method according to (NCCLS).Results:Klebsiella species and Pseudomonas aeruginosa were the most common isolates among the Gram negative pathogens (26.2% and 11.7% respectively), followed by Escherichia coli and Proteus species, while Streptococcus pneumonia was the most common isolate among the Gram positive organisms, identified in (15.2%) followed by Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes. High rates of resistance to Amoxicillin and Cephalothin were demonstrated by all bacteria, whereas most isolates were found to be highly sensitive to Amikacin, Ciprofloxacin and Tobramycin. In contrast, Cefotaxim, Tetracyciln, Gentamycin and Erythromicin were less effect against most of isolates.Conclusions:Klebsiella spp. was the most common pathogens, whereas Streptococcus pneumonia which ranks as second common pathogens from patients with RTI in the present study. Amikacin, Ciprofloxacin and Tobramycin were the most effect antibiotics in vitro against tested bacteria. Conversely, no or less effect of other antibiotic agents was obtained making them not to be considered the drugs of choice in treatment of patients with RTI.Keywords:Bacterial pathogens, Antibiotics resistance, Patients RTIs.


Article
Molecular determination of extended spectrum b-lactamases antibiotics resistance genes in E.coli isolated from diarrhea in cattle

Authors: Ghassan Khudhair Ismaeel --- Hassan Hachim Nasser
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 1 Pages: 64-69
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

None response to the treatment by an antibiotic called antibiotics resistance result from some genes called resistance genes .This mechanism is widespread in most of the bacteria, like E.coli . All of the extended resistance genes called (ESBIS) is a typical example for study of some genes that resistance beta-lactam antibiotic is subject of this research. Fifty feces sample were collected from cattle suffering from diarrhea in alqaissiyah city were cultured on selective media for E.coli , then DNA was extracted from all E.coli isolates for antibiotic resistance gene detection by PCR ; The results of this study revealed the prevalence of B-lactamase gene four B-lactamases genes in E.coli blaAmpc gene were (91.4%), the blactx-m gene were (80%), blaTem were (62.8%) and finally and blaSHV gene were (22%) among isolates E.coli ; blaAMPC gene has high prevalence than others genes while blaSHV was a lower percentage than other genes .


Article
Antibiotics Resistance of Isolated Bacteria from Patients with Urinary Tract Infection
مقاومة البكتيريا المعزولة من المرضى المصابين بالتهاب المجاري البولية للمضادات الحيوية

Author: Abbas Atyia Hammoudi عباس عطية حمودي
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2017 Volume: 13 Issue: 4 - part 1 Pages: 233
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

From the period of March to thirty August 2015, 210 urine samples were collected from patients with signs and symptoms of UTIs with an age range of 20-60 years, who referred to outpatient department of AlKarama teaching hospital, Baghdad. Out of 210 samples of urine 150(71.43%) were positive culture and 50(23.81%) were negative culture while 10 (4.76%) were showed contaminated urine culture. The common isolated bacteria were E. coli 45 (30%), K. pneumonia 33(22%)as Gram negative bacteria respectively, while Gram positive bacteria was Staphylococcus aureus 42(28%). The other bacteria were Enterobacter spp.20 (13.3%), Proteus spp. 6(4%), and Pseudomonas aeruginosa4 (2.7%). Susceptibility testing were used with the following antibiotic disks: Ciprofloxacin, Amikacin, Nitrofurantion, Trimethoprim-Sulfamethoxazol, Gentamicin, Pipracillin , Nalidixic acid , Tetracycline , Imipenem , Ceftriaxone , and Cefotaxime. The percentage of susceptibility showed variable susceptibility to the antibiotics used. All bacteria showed (100%) susceptible to Imipenem while all bacteria showed (100%) resistant to Tetracycline. Pseudomonas aeruginosa isolated bacteria was showed multidrug resistant (MDR); seven antibiotics: Nitrofurantion, Trimethoprim-Sulfamethoxazol, Pipracillin, Nalidixic acid, Tetracycline, Ceftriaxone and Cefotaxime.

جمعت 210 عينة ادرار للفترة من شهر نيسان ولغاية شهر اب 2015 من المرضى الذين يعانون من اعراض وعلامات لالتهاب المجاري البولية الذين يراجعون العيادة الخارجية في مستشفى الكرامة التعليمي. تم تشخيص 45 عزلة(30%) للاشيريشيا القولونية و33 عزلة للكليبسيلا الرئوية و42 (28%) عزلة للعنقوديات الذهبية و20 (13.3%)عزلة لجنس البكتيريا المعوية و 6 (4 %) عزلات لجنس البروتيس و 4 (2.7%) عزلات للزوائف الزنجارية.اظهرت العزلات حساسية متباينة للمضادات الحيوية المستخدمة .اظهرت جميع العزلات حساسية للمضاد اميبينيم بينما اظهرت جميع العزلات مقاومة للمضاد تتراسايكلين. اظهرت بكتيريا الزوائف الزنجارية مقاومة متعددة للمضادات الحيوية :سبعة مضادات حيوية: نايتروفيوريشن, تراي ميثوبريم-سلفاميثوكسازول,ببراسلين,نالديسك اسد,تتراسايكلين ,سيفترياكسون و سيفوتاكسيم .


Article
Identification of Pseudomonas aeruginosa From Clinical Specimen by Using 16S rDNA Gene.
تشخيص بكتريا Pseudomonas aeruginosa من عينات سريرية باستخدام جين 16S rDNA

Authors: Rana M. Abdullah رنا مجاهد عبدالله --- Abbas F. Mehdi عباس فالح مهدي
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2016 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 45-49
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Seventy- Five isolates of Pseudomonas aeruginosa were isolated from 100 isolates of clinical cases. 16S rDNA gene was detected by using polymerase chain reaction (PCR) and found that all isolates possess this gene, with 956 base pair. The isolates showed different sensitivity against antibiotics, all isolates were resistant to Kanamycin 100% most of isolate shown resistance to Ceftazidime 81.33%, Gentamicin 46.66 %, Tobramycin 38.66% and Piperacillin and Ofloxacin 37.33% each of them, and some isolates showed less resistance to Ciprofloxacin and Norfloxacin 34.66% each of them, and Aztreonam 22.66% and finally to Imipenem 17.33%. Virulence factors analysis showed 75 (100%) isolates were produced β-hemolytic, 61 (81.33%) were Protease activity, and 59 (78.66%) isolates had Pyocyanin and Amylase, and 54 (72%) isolates showed its ability to produce Biofilm.

تم الحصول على 75 عزلة تعود الى بكتريا Pseudomonas aeruginosa من اصل 100 عزلة جمعت من حالات مرضية مختلفة. كشف عن وجود جين 16S rDNA وباستعمال تفاعل البلمرة المتسلسل ( PCR) ووجد ان 100 % من العزلات تمتلك هذا الجين والذي بلغ حجمه 956 زوج قاعدة. اجري فحص الحساسية للمضادات الحيوية المختلفة حيث كانت جميع العزلات مقاومة لمضاد Kanamycin بنسبة 100%، فيما اظهرت مقاومة اقل لكل من مضادات Ceftazidime بنسبة 81.33%، ولمضاد Gentamicin 46.66% ولمضاد Tobramycin 38.66% ولمضادات Piperacillin و Ofloxacin بنسبة 37.33 % لكل منهما، واظهرت العزلات مقاومة بنسبة 34.66 % لكل من مضادي Ciprofloxacin و Norfloxacin، واظهرت العزلات اقل مقاومة لمضاد Aztreonam بنسبة 22.66% ولمضاد Imipenem بنسبة 17.33%. تم التحري عن بعض عوامل الضراوة التي تمتلكها البكتريا، واظهرت النتائج ان جميع العزلات تمتلك الانزيم الحال للدم Hemolysin بنسبة 100%، في حين اظهرت 61 عزلة 1.33% قابليتها على انتاج انزيم المحلل للبروتينProtease ، وكانت اغلب العزلات لها قابليه لانتاج صبغة البايوسيانين Pyocyanin بنسبة 78.66% وبلغت نسبة العزلات التي اثبتت قدرتها على انتاج انزيم المحلل للنشا Amylase 78.66 %، اظهرت 54 عزلة 72% قابليتها على انتاج Biofilm.

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

English (4)

Arabic (2)


Year
From To Submit

2017 (2)

2016 (1)

2015 (1)

2013 (1)

2012 (1)